RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587860.1

CTIF-205, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 2

Gene CTIF, Length 2,940 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-205ENST00000587860 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP19.64■□□□□ 0.73
CTIF-205ENST00000587860 ZMYND15Q9H091 742 aa19.64■□□□□ 0.73
CTIF-205ENST00000587860 GGNBP2Q9H3C7 697 aa19.64■□□□□ 0.73
CTIF-205ENST00000587860 STAG3Q9UJ98 1225 aa19.63■□□□□ 0.73
CTIF-205ENST00000587860 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa19.63■□□□□ 0.73
CTIF-205ENST00000587860 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa19.63■□□□□ 0.73
CTIF-205ENST00000587860 ZNF521Q96K83 1311 aa19.62■□□□□ 0.73
CTIF-205ENST00000587860 TNNQ9UQP3 1299 aa19.62■□□□□ 0.73
CTIF-205ENST00000587860 MYOM1P52179 1685 aa19.61■□□□□ 0.73
CTIF-205ENST00000587860 KIF1BO60333 1816 aa19.61■□□□□ 0.73
CTIF-205ENST00000587860 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP19.6■□□□□ 0.73
CTIF-205ENST00000587860 PANK1Q8TE04 598 aa19.6■□□□□ 0.73
CTIF-205ENST00000587860 SYNMO15061 1565 aa19.59■□□□□ 0.73
CTIF-205ENST00000587860 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP19.59■□□□□ 0.73
CTIF-205ENST00000587860 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP19.58■□□□□ 0.73
CTIF-205ENST00000587860 VGFO15240 615 aaPredicted RBP19.58■□□□□ 0.73
CTIF-205ENST00000587860 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP19.58■□□□□ 0.73
CTIF-205ENST00000587860 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP19.58■□□□□ 0.73
CTIF-205ENST00000587860 TCP11L2Q8N4U5 519 aa19.58■□□□□ 0.73
CTIF-205ENST00000587860 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP19.58■□□□□ 0.73
CTIF-205ENST00000587860 CLUAP1Q96AJ1 413 aa19.58■□□□□ 0.73
CTIF-205ENST00000587860 PRAM1Q96QH2 718 aa19.58■□□□□ 0.73
CTIF-205ENST00000587860 CANXP27824 592 aaKnown RBP19.58■□□□□ 0.72
CTIF-205ENST00000587860 WWC1Q8IX03 1113 aa19.58■□□□□ 0.72
CTIF-205ENST00000587860 POGKQ9P215 609 aa19.58■□□□□ 0.72
CTIF-205ENST00000587860 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP19.57■□□□□ 0.72
CTIF-205ENST00000587860 SLC4A3P48751 1232 aa19.57■□□□□ 0.72
CTIF-205ENST00000587860 COG6Q9Y2V7 657 aa19.57■□□□□ 0.72
CTIF-205ENST00000587860 PIK3C2GO75747 1445 aa19.56■□□□□ 0.72
CTIF-205ENST00000587860 MYOM2P54296 1465 aa19.56■□□□□ 0.72
CTIF-205ENST00000587860 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP19.56■□□□□ 0.72
CTIF-205ENST00000587860 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP19.56■□□□□ 0.72
CTIF-205ENST00000587860 C14orf37Q86TY3 774 aa19.55■□□□□ 0.72
CTIF-205ENST00000587860 WAPLQ7Z5K2 1190 aa19.55■□□□□ 0.72
CTIF-205ENST00000587860 ABCC3O15438 1527 aa19.54■□□□□ 0.72
CTIF-205ENST00000587860 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP19.54■□□□□ 0.72
CTIF-205ENST00000587860 MLH3Q9UHC1 1453 aa19.53■□□□□ 0.72
CTIF-205ENST00000587860 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP19.53■□□□□ 0.72
CTIF-205ENST00000587860 EVC2Q86UK5 1308 aa19.53■□□□□ 0.72
CTIF-205ENST00000587860 BACH2Q9BYV9 841 aa19.53■□□□□ 0.72
CTIF-205ENST00000587860 ADGRB3O60242 1522 aa19.53■□□□□ 0.72
CTIF-205ENST00000587860 NEFMP07197 916 aa19.52■□□□□ 0.72
CTIF-205ENST00000587860 HECW2Q9P2P5 1572 aa19.52■□□□□ 0.71
CTIF-205ENST00000587860 CGNL1Q0VF96 1302 aa19.52■□□□□ 0.71
CTIF-205ENST00000587860 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP19.51■□□□□ 0.71
CTIF-205ENST00000587860 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa19.51■□□□□ 0.71
CTIF-205ENST00000587860 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa19.51■□□□□ 0.71
CTIF-205ENST00000587860 E9PSI1 815 aa19.5■□□□□ 0.71
CTIF-205ENST00000587860 IGHDP01880 384 aa19.5■□□□□ 0.71
CTIF-205ENST00000587860 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa19.48■□□□□ 0.71
CTIF-205ENST00000587860 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP19.48■□□□□ 0.71
CTIF-205ENST00000587860 CABP1Q9NZU7 370 aa19.48■□□□□ 0.71
CTIF-205ENST00000587860 NRXN1Q9ULB1 1477 aa19.48■□□□□ 0.71
CTIF-205ENST00000587860 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP19.48■□□□□ 0.71
CTIF-205ENST00000587860 ADGRB1O14514 1584 aa19.47■□□□□ 0.71
CTIF-205ENST00000587860 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa19.47■□□□□ 0.71
CTIF-205ENST00000587860 NUTM2FA1L443 756 aa19.47■□□□□ 0.71
CTIF-205ENST00000587860 RUNDC1Q96C34 613 aa19.47■□□□□ 0.71
CTIF-205ENST00000587860 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP19.46■□□□□ 0.71
CTIF-205ENST00000587860 RLBP1P12271 317 aa19.45■□□□□ 0.7
CTIF-205ENST00000587860 LMTK2Q8IWU2 1503 aa19.45■□□□□ 0.7
CTIF-205ENST00000587860 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa19.45■□□□□ 0.7
CTIF-205ENST00000587860 A0A1W2PP64 1363 aa19.45■□□□□ 0.7
CTIF-205ENST00000587860 KDM2BQ8NHM5 1336 aa19.45■□□□□ 0.7
CTIF-205ENST00000587860 CFAP53Q96M91 514 aa19.45■□□□□ 0.7
CTIF-205ENST00000587860 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP19.44■□□□□ 0.7
CTIF-205ENST00000587860 CDK19Q9BWU1 502 aa19.44■□□□□ 0.7
CTIF-205ENST00000587860 IFT172Q9UG01 1749 aa19.44■□□□□ 0.7
CTIF-205ENST00000587860 QRICH2Q9H0J4 1663 aa19.44■□□□□ 0.7
CTIF-205ENST00000587860 FYB1O15117 783 aa19.43■□□□□ 0.7
CTIF-205ENST00000587860 ZRANB1Q9UGI0 708 aa19.43■□□□□ 0.7
CTIF-205ENST00000587860 TSPOAP1O95153 1857 aa19.43■□□□□ 0.7
CTIF-205ENST00000587860 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP19.43■□□□□ 0.7
CTIF-205ENST00000587860 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa19.43■□□□□ 0.7
CTIF-205ENST00000587860 SLC52A1Q9NWF4 448 aa19.42■□□□□ 0.7
CTIF-205ENST00000587860 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa19.42■□□□□ 0.7
CTIF-205ENST00000587860 PPLO60437 1756 aa19.42■□□□□ 0.7
CTIF-205ENST00000587860 TULP4Q9NRJ4 1543 aa19.41■□□□□ 0.7
CTIF-205ENST00000587860 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa19.41■□□□□ 0.7
CTIF-205ENST00000587860 RSPH6AQ9H0K4 717 aa19.41■□□□□ 0.7
CTIF-205ENST00000587860 INSRP06213 1382 aa19.41■□□□□ 0.7
CTIF-205ENST00000587860 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa19.4■□□□□ 0.7
CTIF-205ENST00000587860 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP19.4■□□□□ 0.7
CTIF-205ENST00000587860 GLI2P10070 1586 aa19.4■□□□□ 0.7
CTIF-205ENST00000587860 RARSP54136 660 aaKnown RBP19.39■□□□□ 0.7
CTIF-205ENST00000587860 TXNDC2Q86VQ3 553 aa19.39■□□□□ 0.7
CTIF-205ENST00000587860 HMOX1P09601 288 aa19.38■□□□□ 0.69
CTIF-205ENST00000587860 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa19.38■□□□□ 0.69
CTIF-205ENST00000587860 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP19.38■□□□□ 0.69
CTIF-205ENST00000587860 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa19.37■□□□□ 0.69
CTIF-205ENST00000587860 NEO1Q92859 1461 aa19.37■□□□□ 0.69
CTIF-205ENST00000587860 SOX12O15370 315 aa19.37■□□□□ 0.69
CTIF-205ENST00000587860 MYO5BQ9ULV0 1848 aa19.37■□□□□ 0.69
CTIF-205ENST00000587860 MS4A1P11836 297 aa19.36■□□□□ 0.69
CTIF-205ENST00000587860 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP19.35■□□□□ 0.69
CTIF-205ENST00000587860 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa19.35■□□□□ 0.69
CTIF-205ENST00000587860 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP19.34■□□□□ 0.69
CTIF-205ENST00000587860 PIK3C2BO00750 1634 aa19.34■□□□□ 0.69
CTIF-205ENST00000587860 C8orf34Q49A92 452 aa19.34■□□□□ 0.69
CTIF-205ENST00000587860 TERF2IPQ9NYB0 399 aa19.34■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.7 ms