RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547541.1

TARBP2-208, Transcript of TARBP2, RISC loading complex RNA binding subunit, human

TSL 3

Gene TARBP2, Length 430 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TARBP2-208	ENST00000547541	ATAD2	Q6PL18	1390 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TARBP2-208	ENST00000547541	MYBBP1A	Q9BQG0	1328 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
TARBP2-208	ENST00000547541	CPS1	P31327	1500 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TARBP2-208	ENST00000547541	TULP4	Q9NRJ4	1543 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TARBP2-208	ENST00000547541	PARD3	Q8TEW0	1356 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TARBP2-208	ENST00000547541	MYOM1	P52179	1685 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TARBP2-208	ENST00000547541	SENP3	Q9H4L4	574 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
TARBP2-208	ENST00000547541	BRD4	O60885	1362 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
TARBP2-208	ENST00000547541	MINK1	Q8N4C8	1332 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
TARBP2-208	ENST00000547541	SRPK2	P78362	688 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
TARBP2-208	ENST00000547541	SAFB2	Q14151	953 aa	Known RBP eCLIP	13.71	□□□□□ -0.21
TARBP2-208	ENST00000547541	AMER1	Q5JTC6	1135 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
TARBP2-208	ENST00000547541	WAPL	Q7Z5K2	1190 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TARBP2-208	ENST00000547541	SLC26A8	Q96RN1	970 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TARBP2-208	ENST00000547541	CDK19	Q9BWU1	502 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TARBP2-208	ENST00000547541	YTHDC1	Q96MU7	727 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
TARBP2-208	ENST00000547541	MRS2	Q9HD23	443 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TARBP2-208	ENST00000547541	AMOTL2	Q9Y2J4	779 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TARBP2-208	ENST00000547541	ANKRD36B	Q8N2N9	1353 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TARBP2-208	ENST00000547541	WASL	O00401	505 aa	Predicted RBP	13.69	□□□□□ -0.22
TARBP2-208	ENST00000547541	NLRP13	Q86W25	1043 aa		13.69	□□□□□ -0.22
TARBP2-208	ENST00000547541	TMC1	Q8TDI8	760 aa		13.69	□□□□□ -0.22
TARBP2-208	ENST00000547541	SLC12A5	Q9H2X9	1139 aa		13.69	□□□□□ -0.22
TARBP2-208	ENST00000547541	CABP2	Q9NPB3	220 aa		13.69	□□□□□ -0.22
TARBP2-208	ENST00000547541	PTCH1	Q13635	1447 aa		13.68	□□□□□ -0.22
TARBP2-208	ENST00000547541	PTPRU	Q92729	1446 aa		13.68	□□□□□ -0.22
TARBP2-208	ENST00000547541	CARD14	Q9BXL6	1004 aa		13.68	□□□□□ -0.22
TARBP2-208	ENST00000547541	TERF2IP	Q9NYB0	399 aa		13.68	□□□□□ -0.22
TARBP2-208	ENST00000547541	PLEKHH1	Q9ULM0	1364 aa		13.68	□□□□□ -0.22
TARBP2-208	ENST00000547541	CC2D1B	Q5T0F9	858 aa	Known RBP	13.67	□□□□□ -0.22
TARBP2-208	ENST00000547541	ROBO2	Q9HCK4	1378 aa		13.67	□□□□□ -0.22
TARBP2-208	ENST00000547541	CCDC184	Q52MB2	194 aa		13.66	□□□□□ -0.22
TARBP2-208	ENST00000547541	HDGFL2	Q7Z4V5	671 aa	Predicted RBP	13.65	□□□□□ -0.22
TARBP2-208	ENST00000547541	NSD2	O96028	1365 aa		13.65	□□□□□ -0.22
TARBP2-208	ENST00000547541	CGNL1	Q0VF96	1302 aa		13.64	□□□□□ -0.23
TARBP2-208	ENST00000547541	NPHP4	O75161	1426 aa	Predicted RBP	13.64	□□□□□ -0.23
TARBP2-208	ENST00000547541	ADGRB2	O60241	1585 aa		13.64	□□□□□ -0.23
TARBP2-208	ENST00000547541	LMTK3	Q96Q04	1460 aa		13.64	□□□□□ -0.23
TARBP2-208	ENST00000547541	CCDC61	Q9Y6R9	512 aa		13.64	□□□□□ -0.23
TARBP2-208	ENST00000547541	USP32	Q8NFA0	1604 aa		13.64	□□□□□ -0.23
TARBP2-208	ENST00000547541	PNISR	Q8TF01	805 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
TARBP2-208	ENST00000547541	NSD3	Q9BZ95	1437 aa		13.63	□□□□□ -0.23
TARBP2-208	ENST00000547541	ATP7B	P35670	1465 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TARBP2-208	ENST00000547541	XRN1	Q8IZH2	1706 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
TARBP2-208	ENST00000547541	INSR	P06213	1382 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TARBP2-208	ENST00000547541	NUDT16	Q96DE0	195 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
TARBP2-208	ENST00000547541	ZNF692	Q9BU19	519 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
TARBP2-208	ENST00000547541	CABP1	Q9NZU7	370 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TARBP2-208	ENST00000547541	KCNA6	P17658	529 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TARBP2-208	ENST00000547541	PPP2R1A	P30153	589 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TARBP2-208	ENST00000547541	CNGB1	Q14028	1251 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
TARBP2-208	ENST00000547541	FAM9B	Q8IZU0	186 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TARBP2-208	ENST00000547541	CHD2	O14647	1828 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
TARBP2-208	ENST00000547541		A0A1W2PP64	1363 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TARBP2-208	ENST00000547541	SIPA1L2	Q9P2F8	1722 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
TARBP2-208	ENST00000547541	CPSF1	Q10570	1443 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
TARBP2-208	ENST00000547541	PLEKHG3	A1L390	1219 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TARBP2-208	ENST00000547541	CD163L1	Q9NR16	1453 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TARBP2-208	ENST00000547541	NCKAP5L	Q9HCH0	1330 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TARBP2-208	ENST00000547541	HSPA2	P54652	639 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TARBP2-208	ENST00000547541	MORC1	Q86VD1	984 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TARBP2-208	ENST00000547541	PPIP5K1	Q6PFW1	1433 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TARBP2-208	ENST00000547541	ANKAR	Q7Z5J8	1434 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TARBP2-208	ENST00000547541	FYB1	O15117	783 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TARBP2-208	ENST00000547541	HNRNPU	Q00839	825 aa	Known RBP eCLIP	13.55	□□□□□ -0.24
TARBP2-208	ENST00000547541	EDC4	Q6P2E9	1401 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
TARBP2-208	ENST00000547541	PRR36	Q9H6K5	1346 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TARBP2-208	ENST00000547541	POLR3A	O14802	1390 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
TARBP2-208	ENST00000547541	NWD1	Q149M9	1564 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TARBP2-208	ENST00000547541	CDC42BPG	Q6DT37	1551 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TARBP2-208	ENST00000547541	ZBED9	Q6R2W3	1325 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TARBP2-208	ENST00000547541	SCAF1	Q9H7N4	1312 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
TARBP2-208	ENST00000547541	NCOA3	Q9Y6Q9	1424 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TARBP2-208	ENST00000547541	TOPAZ1	Q8N9V7	1692 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TARBP2-208	ENST00000547541	NKTR	P30414	1462 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
TARBP2-208	ENST00000547541	ADGRL3	Q9HAR2	1447 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TARBP2-208	ENST00000547541	CFAP53	Q96M91	514 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TARBP2-208	ENST00000547541	ACE	P12821	1306 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TARBP2-208	ENST00000547541	WDR43	Q15061	677 aa	Known RBP eCLIP	13.49	□□□□□ -0.25
TARBP2-208	ENST00000547541	GGNBP2	Q9H3C7	697 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TARBP2-208	ENST00000547541	ITSN1	Q15811	1721 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TARBP2-208	ENST00000547541	AKAP12	Q02952	1782 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TARBP2-208	ENST00000547541	ANKRD26	Q9UPS8	1709 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TARBP2-208	ENST00000547541	TTC21A	Q8NDW8	1320 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TARBP2-208	ENST00000547541	PROSER2	Q86WR7	435 aa	Predicted RBP	13.48	□□□□□ -0.25
TARBP2-208	ENST00000547541	MON2	Q7Z3U7	1717 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TARBP2-208	ENST00000547541	FMN2	Q9NZ56	1722 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TARBP2-208	ENST00000547541	MTHFS	P49914	203 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TARBP2-208	ENST00000547541	NGEF	Q8N5V2	710 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TARBP2-208	ENST00000547541	USP6	P35125	1406 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TARBP2-208	ENST00000547541	TTC21B	Q7Z4L5	1316 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TARBP2-208	ENST00000547541	NGDN	Q8NEJ9	315 aa	Known RBP	13.46	□□□□□ -0.25
TARBP2-208	ENST00000547541	C19orf44	Q9H6X5	657 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TARBP2-208	ENST00000547541	ADAMTS8	Q9UP79	889 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TARBP2-208	ENST00000547541	BLM	P54132	1417 aa	Predicted RBP	13.46	□□□□□ -0.26
TARBP2-208	ENST00000547541	SSH2	Q76I76	1423 aa		13.46	□□□□□ -0.26
TARBP2-208	ENST00000547541	KIF20B	Q96Q89	1820 aa		13.46	□□□□□ -0.26
TARBP2-208	ENST00000547541	AATK	Q6ZMQ8	1374 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TARBP2-208	ENST00000547541	SUGP2	Q8IX01	1082 aa	Known RBP eCLIP	13.45	□□□□□ -0.26
TARBP2-208	ENST00000547541	COG3	Q96JB2	828 aa		13.45	□□□□□ -0.26

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