RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546621.5

CS-204, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 1,513 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-204ENST00000546621 MLECQ14165 292 aa10.5□□□□□ -0.73
CS-204ENST00000546621 RALBP1Q15311 655 aa10.5□□□□□ -0.73
CS-204ENST00000546621 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP10.5□□□□□ -0.73
CS-204ENST00000546621 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa10.5□□□□□ -0.73
CS-204ENST00000546621 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP10.49□□□□□ -0.73
CS-204ENST00000546621 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP10.48□□□□□ -0.73
CS-204ENST00000546621 PANK3Q9H999 370 aa10.48□□□□□ -0.73
CS-204ENST00000546621 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP10.48□□□□□ -0.73
CS-204ENST00000546621 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP10.48□□□□□ -0.73
CS-204ENST00000546621 MYOM1P52179 1685 aa10.48□□□□□ -0.73
CS-204ENST00000546621 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP10.47□□□□□ -0.73
CS-204ENST00000546621 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP10.47□□□□□ -0.73
CS-204ENST00000546621 PARD3Q8TEW0 1356 aa10.47□□□□□ -0.73
CS-204ENST00000546621 QRICH2Q9H0J4 1663 aa10.47□□□□□ -0.73
CS-204ENST00000546621 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP10.47□□□□□ -0.73
CS-204ENST00000546621 ZMYM3Q14202 1370 aa10.47□□□□□ -0.73
CS-204ENST00000546621 TMEM132EQ6IEE7 984 aa10.46□□□□□ -0.74
CS-204ENST00000546621 FAM9BQ8IZU0 186 aa10.46□□□□□ -0.74
CS-204ENST00000546621 TRAK1Q9UPV9 953 aa10.46□□□□□ -0.74
CS-204ENST00000546621 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP10.46□□□□□ -0.74
CS-204ENST00000546621 A2ML1A8K2U0 1454 aa10.46□□□□□ -0.74
CS-204ENST00000546621 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP10.46□□□□□ -0.74
CS-204ENST00000546621 PLEKHG5O94827 1062 aa10.45□□□□□ -0.74
CS-204ENST00000546621 STAG3Q9UJ98 1225 aa10.45□□□□□ -0.74
CS-204ENST00000546621 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa10.45□□□□□ -0.74
CS-204ENST00000546621 TMC1Q8TDI8 760 aa10.43□□□□□ -0.74
CS-204ENST00000546621 RIMS2Q9UQ26 1411 aa10.43□□□□□ -0.74
CS-204ENST00000546621 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP10.43□□□□□ -0.74
CS-204ENST00000546621 NLRP13Q86W25 1043 aa10.43□□□□□ -0.74
CS-204ENST00000546621 KNSTRNQ9Y448 316 aa10.43□□□□□ -0.74
CS-204ENST00000546621 TNRQ92752 1358 aa10.42□□□□□ -0.74
CS-204ENST00000546621 PITPNM1O00562 1244 aa10.42□□□□□ -0.74
CS-204ENST00000546621 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP10.42□□□□□ -0.74
CS-204ENST00000546621 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP10.42□□□□□ -0.74
CS-204ENST00000546621 ALKQ9UM73 1620 aa10.42□□□□□ -0.74
CS-204ENST00000546621 ZBED9Q6R2W3 1325 aa10.41□□□□□ -0.74
CS-204ENST00000546621 NEFLP07196 543 aa10.41□□□□□ -0.74
CS-204ENST00000546621 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP10.4□□□□□ -0.74
CS-204ENST00000546621 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa10.4□□□□□ -0.74
CS-204ENST00000546621 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP10.4□□□□□ -0.74
CS-204ENST00000546621 CCDC136Q96JN2 1154 aa10.4□□□□□ -0.74
CS-204ENST00000546621 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP10.4□□□□□ -0.74
CS-204ENST00000546621 TULP4Q9NRJ4 1543 aa10.39□□□□□ -0.75
CS-204ENST00000546621 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP10.39□□□□□ -0.75
CS-204ENST00000546621 PTPRMP28827 1452 aa10.39□□□□□ -0.75
CS-204ENST00000546621 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa10.39□□□□□ -0.75
CS-204ENST00000546621 PIP4P2Q8N4L2 257 aa10.39□□□□□ -0.75
CS-204ENST00000546621 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP10.39□□□□□ -0.75
CS-204ENST00000546621 EVC2Q86UK5 1308 aa10.39□□□□□ -0.75
CS-204ENST00000546621 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP10.38□□□□□ -0.75
CS-204ENST00000546621 FBXO41Q8TF61 875 aa10.38□□□□□ -0.75
CS-204ENST00000546621 UBR1Q8IWV7 1749 aa10.38□□□□□ -0.75
CS-204ENST00000546621 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa10.38□□□□□ -0.75
CS-204ENST00000546621 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa10.38□□□□□ -0.75
CS-204ENST00000546621 STK26Q9P289 416 aa10.38□□□□□ -0.75
CS-204ENST00000546621 NLRP1Q9C000 1473 aa10.37□□□□□ -0.75
CS-204ENST00000546621 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP10.37□□□□□ -0.752e-6■□□□□ 8.3
CS-204ENST00000546621 SSUH2Q9Y2M2 353 aa10.37□□□□□ -0.75
CS-204ENST00000546621 C3P01024 1663 aa10.37□□□□□ -0.75
CS-204ENST00000546621 DLC1Q96QB1 1528 aa10.37□□□□□ -0.75
CS-204ENST00000546621 HDGFP51858 240 aaKnown RBP10.36□□□□□ -0.75
CS-204ENST00000546621 CARD14Q9BXL6 1004 aa10.36□□□□□ -0.75
CS-204ENST00000546621 PRAM1Q96QH2 718 aa10.35□□□□□ -0.75
CS-204ENST00000546621 INSRP06213 1382 aa10.35□□□□□ -0.75
CS-204ENST00000546621 TMEM2Q9UHN6 1383 aa10.35□□□□□ -0.75
CS-204ENST00000546621 USP32Q8NFA0 1604 aa10.35□□□□□ -0.75
CS-204ENST00000546621 PPP2R1AP30153 589 aa10.34□□□□□ -0.75
CS-204ENST00000546621 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP10.34□□□□□ -0.75
CS-204ENST00000546621 POGKQ9P215 609 aa10.34□□□□□ -0.75
CS-204ENST00000546621 NINLQ9Y2I6 1382 aa10.34□□□□□ -0.75
CS-204ENST00000546621 NSD3Q9BZ95 1437 aa10.34□□□□□ -0.75
CS-204ENST00000546621 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa10.33□□□□□ -0.76
CS-204ENST00000546621 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa10.33□□□□□ -0.76
CS-204ENST00000546621 ABCC11Q96J66 1382 aa10.33□□□□□ -0.76
CS-204ENST00000546621 KNDC1Q76NI1 1749 aa10.33□□□□□ -0.76
CS-204ENST00000546621 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP10.33□□□□□ -0.76
CS-204ENST00000546621 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP10.33□□□□□ -0.76
CS-204ENST00000546621 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP10.33□□□□□ -0.76
CS-204ENST00000546621 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP10.32□□□□□ -0.76
CS-204ENST00000546621 ATAD2Q6PL18 1390 aa10.32□□□□□ -0.76
CS-204ENST00000546621 CABP2Q9NPB3 220 aa10.32□□□□□ -0.76
CS-204ENST00000546621 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP10.31□□□□□ -0.76
CS-204ENST00000546621 METP08581 1390 aa10.31□□□□□ -0.76
CS-204ENST00000546621 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP10.31□□□□□ -0.76
CS-204ENST00000546621 SLIT1O75093 1534 aa10.3□□□□□ -0.76
CS-204ENST00000546621 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa10.3□□□□□ -0.76
CS-204ENST00000546621 TECPR2O15040 1411 aa10.3□□□□□ -0.76
CS-204ENST00000546621 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP10.3□□□□□ -0.76
CS-204ENST00000546621 FKBP8Q14318 412 aa10.3□□□□□ -0.76
CS-204ENST00000546621 CPS1P31327 1500 aa10.3□□□□□ -0.76
CS-204ENST00000546621 NSD2O96028 1365 aa10.3□□□□□ -0.76
CS-204ENST00000546621 FAM135BQ49AJ0 1406 aa10.29□□□□□ -0.76
CS-204ENST00000546621 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa10.29□□□□□ -0.76
CS-204ENST00000546621 ARHGAP23Q9P227 1491 aa10.29□□□□□ -0.76
CS-204ENST00000546621 CGNL1Q0VF96 1302 aa10.29□□□□□ -0.76
CS-204ENST00000546621 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa10.29□□□□□ -0.76
CS-204ENST00000546621 WAPLQ7Z5K2 1190 aa10.28□□□□□ -0.76
CS-204ENST00000546621 SIRT1Q96EB6 747 aa10.28□□□□□ -0.76
CS-204ENST00000546621 BCANQ96GW7 911 aa10.28□□□□□ -0.76
CS-204ENST00000546621 A0A1W2PP64 1363 aa10.28□□□□□ -0.76
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