RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540468.5

CCT7-216, Transcript of chaperonin containing TCP1 subunit 7, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CCT7, Length 1,674 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT7-216ENST00000540468 PTCH1Q13635 1447 aa22.31■■□□□ 1.16
CCT7-216ENST00000540468 WAPLQ7Z5K2 1190 aa22.3■■□□□ 1.16
CCT7-216ENST00000540468 LRRC7Q96NW7 1537 aa22.28■■□□□ 1.16
CCT7-216ENST00000540468 PRAM1Q96QH2 718 aa22.28■■□□□ 1.16
CCT7-216ENST00000540468 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
CCT7-216ENST00000540468 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
CCT7-216ENST00000540468 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa22.26■■□□□ 1.15
CCT7-216ENST00000540468 FAM135BQ49AJ0 1406 aa22.26■■□□□ 1.15
CCT7-216ENST00000540468 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa22.26■■□□□ 1.15
CCT7-216ENST00000540468 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP22.26■■□□□ 1.15
CCT7-216ENST00000540468 SIRT1Q96EB6 747 aa22.26■■□□□ 1.15
CCT7-216ENST00000540468 QRICH2Q9H0J4 1663 aa22.24■■□□□ 1.15
CCT7-216ENST00000540468 TMEM94Q12767 1356 aa22.24■■□□□ 1.15
CCT7-216ENST00000540468 NALCNQ8IZF0 1738 aa22.23■■□□□ 1.15
CCT7-216ENST00000540468 POGKQ9P215 609 aa22.23■■□□□ 1.15
CCT7-216ENST00000540468 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
CCT7-216ENST00000540468 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
CCT7-216ENST00000540468 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
CCT7-216ENST00000540468 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
CCT7-216ENST00000540468 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa22.17■■□□□ 1.14
CCT7-216ENST00000540468 POLR3GLQ9BT43 218 aa22.17■■□□□ 1.14
CCT7-216ENST00000540468 TESK2Q96S53 571 aa22.16■■□□□ 1.14
CCT7-216ENST00000540468 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa22.15■■□□□ 1.14
CCT7-216ENST00000540468 ADGRB2O60241 1585 aa22.15■■□□□ 1.14
CCT7-216ENST00000540468 C14orf37Q86TY3 774 aa22.14■■□□□ 1.14
CCT7-216ENST00000540468 TULP4Q9NRJ4 1543 aa22.13■■□□□ 1.13
CCT7-216ENST00000540468 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa22.12■■□□□ 1.13
CCT7-216ENST00000540468 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa22.11■■□□□ 1.13
CCT7-216ENST00000540468 C19orf44Q9H6X5 657 aa22.11■■□□□ 1.13
CCT7-216ENST00000540468 CERKQ8TCT0 537 aa22.09■■□□□ 1.13
CCT7-216ENST00000540468 FMN2Q9NZ56 1722 aa22.09■■□□□ 1.13
CCT7-216ENST00000540468 MSH6P52701 1360 aa22.09■■□□□ 1.13
CCT7-216ENST00000540468 DISP3Q9P2K9 1392 aa22.08■■□□□ 1.12
CCT7-216ENST00000540468 TMF1P82094 1093 aa22.07■■□□□ 1.12
CCT7-216ENST00000540468 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
CCT7-216ENST00000540468 WASLO00401 505 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
CCT7-216ENST00000540468 CDK19Q9BWU1 502 aa22.06■■□□□ 1.12
CCT7-216ENST00000540468 USP32Q8NFA0 1604 aa22.06■■□□□ 1.12
CCT7-216ENST00000540468 DCCP43146 1447 aa22.05■■□□□ 1.12
CCT7-216ENST00000540468 NUTM2FA1L443 756 aa22.05■■□□□ 1.12
CCT7-216ENST00000540468 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
CCT7-216ENST00000540468 IQSEC2Q5JU85 1478 aa22.04■■□□□ 1.12
CCT7-216ENST00000540468 MRS2Q9HD23 443 aa22.03■■□□□ 1.12
CCT7-216ENST00000540468 CABP2Q9NPB3 220 aa22.03■■□□□ 1.12
CCT7-216ENST00000540468 EVC2Q86UK5 1308 aa22.03■■□□□ 1.12
CCT7-216ENST00000540468 PRR36Q9H6K5 1346 aa22.03■■□□□ 1.12
CCT7-216ENST00000540468 ATF3P18847 181 aa22.02■■□□□ 1.12
CCT7-216ENST00000540468 MST1RQ04912 1400 aa22.02■■□□□ 1.12
CCT7-216ENST00000540468 SLC24A1O60721 1099 aa22.01■■□□□ 1.11
CCT7-216ENST00000540468 CADPS2Q86UW7 1296 aa22.01■■□□□ 1.11
CCT7-216ENST00000540468 ATP7BP35670 1465 aa22■■□□□ 1.11
CCT7-216ENST00000540468 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
CCT7-216ENST00000540468 CDCA8Q53HL2 280 aa21.99■■□□□ 1.11
CCT7-216ENST00000540468 CCDC184Q52MB2 194 aa21.98■■□□□ 1.11
CCT7-216ENST00000540468 C1orf167Q5SNV9 1468 aa21.98■■□□□ 1.11
CCT7-216ENST00000540468 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa21.98■■□□□ 1.11
CCT7-216ENST00000540468 RALBP1Q15311 655 aa21.97■■□□□ 1.11
CCT7-216ENST00000540468 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
CCT7-216ENST00000540468 ANKARQ7Z5J8 1434 aa21.96■■□□□ 1.11
CCT7-216ENST00000540468 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP21.95■■□□□ 1.1
CCT7-216ENST00000540468 SLAIN2Q9P270 581 aa21.95■■□□□ 1.1
CCT7-216ENST00000540468 ORAI2Q96SN7 254 aa21.95■■□□□ 1.1
CCT7-216ENST00000540468 ITSN1Q15811 1721 aa21.94■■□□□ 1.1
CCT7-216ENST00000540468 MYOM1P52179 1685 aa21.94■■□□□ 1.1
CCT7-216ENST00000540468 UBAP1LF5GYI3 381 aa21.93■■□□□ 1.1
CCT7-216ENST00000540468 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
CCT7-216ENST00000540468 ESCO1Q5FWF5 840 aa21.91■■□□□ 1.1
CCT7-216ENST00000540468 FAM9BQ8IZU0 186 aa21.91■■□□□ 1.1
CCT7-216ENST00000540468 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
CCT7-216ENST00000540468 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa21.9■■□□□ 1.1
CCT7-216ENST00000540468 ATAD2Q6PL18 1390 aa21.9■■□□□ 1.1
CCT7-216ENST00000540468 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa21.9■■□□□ 1.1
CCT7-216ENST00000540468 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
CCT7-216ENST00000540468 TOM1O60784 492 aa21.9■■□□□ 1.1
CCT7-216ENST00000540468 CCDC61Q9Y6R9 512 aa21.9■■□□□ 1.1
CCT7-216ENST00000540468 BRINP3Q76B58 766 aa21.89■■□□□ 1.1
CCT7-216ENST00000540468 CABP1Q9NZU7 370 aa21.89■■□□□ 1.1
CCT7-216ENST00000540468 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa21.88■■□□□ 1.09
CCT7-216ENST00000540468 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
CCT7-216ENST00000540468 PIP4K2BP78356 416 aa21.88■■□□□ 1.09
CCT7-216ENST00000540468 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa21.88■■□□□ 1.09
CCT7-216ENST00000540468 PANK3Q9H999 370 aa21.88■■□□□ 1.09
CCT7-216ENST00000540468 PARD3Q8TEW0 1356 aa21.87■■□□□ 1.09
CCT7-216ENST00000540468 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
CCT7-216ENST00000540468 PHF8Q9UPP1 1060 aa21.87■■□□□ 1.09
CCT7-216ENST00000540468 TMC1Q8TDI8 760 aa21.86■■□□□ 1.09
CCT7-216ENST00000540468 KIF1AQ12756 1690 aa21.86■■□□□ 1.09
CCT7-216ENST00000540468 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
CCT7-216ENST00000540468 CD163L1Q9NR16 1453 aa21.85■■□□□ 1.09
CCT7-216ENST00000540468 PLEKHG3A1L390 1219 aa21.85■■□□□ 1.09
CCT7-216ENST00000540468 AKAP12Q02952 1782 aa21.84■■□□□ 1.09
CCT7-216ENST00000540468 ACEP12821 1306 aa21.83■■□□□ 1.08
CCT7-216ENST00000540468 NHSL1Q5SYE7 1610 aa21.82■■□□□ 1.08
CCT7-216ENST00000540468 ZBED9Q6R2W3 1325 aa21.82■■□□□ 1.08
CCT7-216ENST00000540468 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
CCT7-216ENST00000540468 FOXO3O43524 673 aa21.82■■□□□ 1.08
CCT7-216ENST00000540468 NLRP13Q86W25 1043 aa21.82■■□□□ 1.08
CCT7-216ENST00000540468 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
CCT7-216ENST00000540468 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
CCT7-216ENST00000540468 NINLQ9Y2I6 1382 aa21.8■■□□□ 1.08
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