RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534206.5

ACER3-214, Transcript of alkaline ceramidase 3, humanhuman

TSL 5

Gene ACER3, Length 834 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACER3-214ENST00000534206 STK26Q9P289 416 aa42.24■■■■■ 4.35
ACER3-214ENST00000534206 ABCC11Q96J66 1382 aa42.24■■■■■ 4.35
ACER3-214ENST00000534206 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa42.23■■■■■ 4.35
ACER3-214ENST00000534206 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa42.22■■■■■ 4.35
ACER3-214ENST00000534206 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP42.21■■■■■ 4.35
ACER3-214ENST00000534206 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa42.21■■■■■ 4.35
ACER3-214ENST00000534206 AFF2P51816 1311 aa42.2■■■■■ 4.35
ACER3-214ENST00000534206 NRXN1Q9ULB1 1477 aa42.17■■■■■ 4.34
ACER3-214ENST00000534206 KNDC1Q76NI1 1749 aa42.17■■■■■ 4.34
ACER3-214ENST00000534206 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP42.15■■■■■ 4.34
ACER3-214ENST00000534206 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP42.13■■■■■ 4.34
ACER3-214ENST00000534206 RXRBP28702 533 aa42.11■■■■■ 4.33
ACER3-214ENST00000534206 ESCO1Q5FWF5 840 aa42.1■■■■■ 4.33
ACER3-214ENST00000534206 C8orf37Q96NL8 207 aa42.1■■■■■ 4.33
ACER3-214ENST00000534206 CFAP70Q5T0N1 1121 aa42.08■■■■■ 4.33
ACER3-214ENST00000534206 MYOM2P54296 1465 aa42.08■■■■■ 4.33
ACER3-214ENST00000534206 PXDNQ92626 1479 aa42.07■■■■■ 4.33
ACER3-214ENST00000534206 SIRT1Q96EB6 747 aa42.06■■■■■ 4.32
ACER3-214ENST00000534206 NUTM2FA1L443 756 aa42.04■■■■■ 4.32
ACER3-214ENST00000534206 ADAMTS2O95450 1211 aa42.04■■■■■ 4.32
ACER3-214ENST00000534206 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP42.04■■■■■ 4.32
ACER3-214ENST00000534206 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP42.03■■■■■ 4.32
ACER3-214ENST00000534206 NPHP3Q7Z494 1330 aa42.02■■■■■ 4.32
ACER3-214ENST00000534206 FOXO3O43524 673 aa42.02■■■■■ 4.32
ACER3-214ENST00000534206 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP42■■■■■ 4.31
ACER3-214ENST00000534206 FMN2Q9NZ56 1722 aa42■■■■■ 4.31
ACER3-214ENST00000534206 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP41.99■■■■■ 4.31
ACER3-214ENST00000534206 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP41.98■■■■■ 4.31
ACER3-214ENST00000534206 NGLY1Q96IV0 654 aa41.96■■■■■ 4.31
ACER3-214ENST00000534206 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP41.93■■■■■ 4.3
ACER3-214ENST00000534206 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP41.92■■■■■ 4.3
ACER3-214ENST00000534206 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP41.91■■■■■ 4.3
ACER3-214ENST00000534206 RGS12O14924 1447 aa41.9■■■■■ 4.3
ACER3-214ENST00000534206 HRCP23327 699 aa41.9■■■■■ 4.3
ACER3-214ENST00000534206 ADGRB1O14514 1584 aa41.88■■■■■ 4.3
ACER3-214ENST00000534206 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP41.86■■■■■ 4.29
ACER3-214ENST00000534206 PRAM1Q96QH2 718 aa41.86■■■■■ 4.29
ACER3-214ENST00000534206 DLC1Q96QB1 1528 aa41.85■■■■■ 4.29
ACER3-214ENST00000534206 USP21Q9UK80 565 aa41.84■■■■■ 4.29
ACER3-214ENST00000534206 KIF1AQ12756 1690 aa41.81■■■■■ 4.28
ACER3-214ENST00000534206 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa41.81■■■■■ 4.28
ACER3-214ENST00000534206 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP41.81■■■■■ 4.28
ACER3-214ENST00000534206 ATRNO75882 1429 aa41.78■■■■■ 4.28
ACER3-214ENST00000534206 BCL9LQ86UU0 1499 aa41.78■■■■■ 4.28
ACER3-214ENST00000534206 KRT28Q7Z3Y7 464 aa41.77■■■■■ 4.28
ACER3-214ENST00000534206 DCAF11Q8TEB1 546 aa41.77■■■■■ 4.28
ACER3-214ENST00000534206 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa41.77■■■■■ 4.28
ACER3-214ENST00000534206 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP41.77■■■■■ 4.28
ACER3-214ENST00000534206 PHF8Q9UPP1 1060 aa41.76■■■■■ 4.28
ACER3-214ENST00000534206 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP41.75■■■■■ 4.27
ACER3-214ENST00000534206 USP32Q8NFA0 1604 aa41.73■■■■■ 4.27
ACER3-214ENST00000534206 TRAK1Q9UPV9 953 aa41.72■■■■■ 4.27
ACER3-214ENST00000534206 POGKQ9P215 609 aa41.7■■■■■ 4.27
ACER3-214ENST00000534206 ADGRB2O60241 1585 aa41.7■■■■■ 4.27
ACER3-214ENST00000534206 STAC3Q96MF2 364 aa41.66■■■■■ 4.26
ACER3-214ENST00000534206 TNS3Q68CZ2 1445 aa41.64■■■■■ 4.26
ACER3-214ENST00000534206 ANKARQ7Z5J8 1434 aa41.64■■■■■ 4.26
ACER3-214ENST00000534206 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP41.63■■■■■ 4.25
ACER3-214ENST00000534206 SLIT2O94813 1529 aa41.62■■■■■ 4.25
ACER3-214ENST00000534206 PRR36Q9H6K5 1346 aa41.62■■■■■ 4.25
ACER3-214ENST00000534206 SBNO1A3KN83 1393 aa41.62■■■■■ 4.25
ACER3-214ENST00000534206 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa41.61■■■■■ 4.25
ACER3-214ENST00000534206 PSME1Q06323 249 aa41.59■■■■■ 4.25
ACER3-214ENST00000534206 CABLES1Q8TDN4 633 aa41.59■■■■■ 4.25
ACER3-214ENST00000534206 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP41.59■■■■■ 4.25
ACER3-214ENST00000534206 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP41.56■■■■■ 4.24
ACER3-214ENST00000534206 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP41.56■■■■■ 4.24
ACER3-214ENST00000534206 WASLO00401 505 aaPredicted RBP41.53■■■■■ 4.24
ACER3-214ENST00000534206 UNC5CLQ8IV45 518 aa41.53■■■■■ 4.24
ACER3-214ENST00000534206 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP41.51■■■■■ 4.24
ACER3-214ENST00000534206 EP400Q96L91 3159 aa41.5■■■■■ 4.23
ACER3-214ENST00000534206 TULP4Q9NRJ4 1543 aa41.5■■■■■ 4.23
ACER3-214ENST00000534206 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP41.49■■■■■ 4.23
ACER3-214ENST00000534206 ABCA3Q99758 1704 aa41.49■■■■■ 4.23
ACER3-214ENST00000534206 GLI3P10071 1580 aa41.49■■■■■ 4.23
ACER3-214ENST00000534206 ATAD2Q6PL18 1390 aa41.48■■■■■ 4.23
ACER3-214ENST00000534206 ARHGEF10O15013 1369 aa41.47■■■■■ 4.23
ACER3-214ENST00000534206 RALGAPBQ86X10 1494 aa41.47■■■■■ 4.23
ACER3-214ENST00000534206 PLEKHG5O94827 1062 aa41.44■■■■■ 4.22
ACER3-214ENST00000534206 LMOD2Q6P5Q4 547 aa41.43■■■■■ 4.22
ACER3-214ENST00000534206 ALS2Q96Q42 1657 aa41.42■■■■■ 4.22
ACER3-214ENST00000534206 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP41.41■■■■■ 4.22
ACER3-214ENST00000534206 FAM83GA6ND36 823 aa41.39■■■■■ 4.22
ACER3-214ENST00000534206 PLCH1Q4KWH8 1693 aa41.37■■■■■ 4.21
ACER3-214ENST00000534206 ATP7BP35670 1465 aa41.37■■■■■ 4.21
ACER3-214ENST00000534206 NBPF1Q3BBV0 1214 aa41.37■■■■■ 4.21
ACER3-214ENST00000534206 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP41.36■■■■■ 4.21
ACER3-214ENST00000534206 NWD2Q9ULI1 1742 aa41.35■■■■■ 4.21
ACER3-214ENST00000534206 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa41.35■■■■■ 4.21
ACER3-214ENST00000534206 VPS72Q15906 364 aa41.35■■■■■ 4.21
ACER3-214ENST00000534206 GPRASP1Q5JY77 1395 aa41.34■■■■■ 4.21
ACER3-214ENST00000534206 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP41.33■■■■■ 4.21
ACER3-214ENST00000534206 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP41.29■■■■■ 4.2
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ACER3-214ENST00000534206 CDK19Q9BWU1 502 aa41.29■■■■■ 4.2
ACER3-214ENST00000534206 BRWD3Q6RI45 1802 aa41.29■■■■■ 4.2
ACER3-214ENST00000534206 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa41.29■■■■■ 4.2
ACER3-214ENST00000534206 NRAPQ86VF7 1730 aa41.24■■■■■ 4.19
ACER3-214ENST00000534206 SEPT12Q8IYM1 358 aa41.23■■■■■ 4.19
ACER3-214ENST00000534206 ITSN1Q15811 1721 aa41.23■■■■■ 4.19
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