RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531461.5

ACER3-211, Transcript of alkaline ceramidase 3, humanhuman

TSL 2

Gene ACER3, Length 1,292 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACER3-211ENST00000531461 RXRBP28702 533 aa35.76■■■■□ 3.32
ACER3-211ENST00000531461 KNDC1Q76NI1 1749 aa35.76■■■■□ 3.31
ACER3-211ENST00000531461 PIK3C2GO75747 1445 aa35.75■■■■□ 3.31
ACER3-211ENST00000531461 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP35.75■■■■□ 3.31
ACER3-211ENST00000531461 ABCC11Q96J66 1382 aa35.74■■■■□ 3.31
ACER3-211ENST00000531461 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP35.68■■■■□ 3.3
ACER3-211ENST00000531461 C8orf37Q96NL8 207 aa35.68■■■■□ 3.3
ACER3-211ENST00000531461 NPHP3Q7Z494 1330 aa35.65■■■■□ 3.3
ACER3-211ENST00000531461 STK26Q9P289 416 aa35.64■■■■□ 3.3
ACER3-211ENST00000531461 NRXN1Q9ULB1 1477 aa35.64■■■■□ 3.3
ACER3-211ENST00000531461 WAPLQ7Z5K2 1190 aa35.63■■■■□ 3.29
ACER3-211ENST00000531461 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP35.63■■■■□ 3.29
ACER3-211ENST00000531461 ESCO1Q5FWF5 840 aa35.62■■■■□ 3.29
ACER3-211ENST00000531461 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP35.62■■■■□ 3.29
ACER3-211ENST00000531461 SIRT1Q96EB6 747 aa35.62■■■■□ 3.29
ACER3-211ENST00000531461 MYOM2P54296 1465 aa35.61■■■■□ 3.29
ACER3-211ENST00000531461 PXDNQ92626 1479 aa35.61■■■■□ 3.29
ACER3-211ENST00000531461 TMEM132EQ6IEE7 984 aa35.61■■■■□ 3.29
ACER3-211ENST00000531461 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP35.61■■■■□ 3.29
ACER3-211ENST00000531461 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP35.6■■■■□ 3.29
ACER3-211ENST00000531461 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP35.59■■■■□ 3.29
ACER3-211ENST00000531461 FMN2Q9NZ56 1722 aa35.58■■■■□ 3.29
ACER3-211ENST00000531461 ADAMTS2O95450 1211 aa35.58■■■■□ 3.29
ACER3-211ENST00000531461 NGLY1Q96IV0 654 aa35.58■■■■□ 3.29
ACER3-211ENST00000531461 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa35.58■■■■□ 3.29
ACER3-211ENST00000531461 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa35.56■■■■□ 3.28
ACER3-211ENST00000531461 RGS12O14924 1447 aa35.53■■■■□ 3.28
ACER3-211ENST00000531461 FOXO3O43524 673 aa35.53■■■■□ 3.28
ACER3-211ENST00000531461 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP35.53■■■■□ 3.28
ACER3-211ENST00000531461 KIF1AQ12756 1690 aa35.52■■■■□ 3.28
ACER3-211ENST00000531461 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP35.5■■■■□ 3.27
ACER3-211ENST00000531461 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP35.5■■■■□ 3.27
ACER3-211ENST00000531461 USP21Q9UK80 565 aa35.48■■■■□ 3.27
ACER3-211ENST00000531461 CFAP70Q5T0N1 1121 aa35.47■■■■□ 3.27
ACER3-211ENST00000531461 NUTM2FA1L443 756 aa35.46■■■■□ 3.27
ACER3-211ENST00000531461 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP35.46■■■■□ 3.27
ACER3-211ENST00000531461 DLC1Q96QB1 1528 aa35.43■■■■□ 3.26
ACER3-211ENST00000531461 ATRNO75882 1429 aa35.42■■■■□ 3.26
ACER3-211ENST00000531461 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP35.42■■■■□ 3.26
ACER3-211ENST00000531461 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP35.42■■■■□ 3.26
ACER3-211ENST00000531461 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa35.39■■■■□ 3.26
ACER3-211ENST00000531461 HRCP23327 699 aa35.39■■■■□ 3.26
ACER3-211ENST00000531461 BCL9LQ86UU0 1499 aa35.38■■■■□ 3.25
ACER3-211ENST00000531461 ADGRB1O14514 1584 aa35.38■■■■□ 3.25
ACER3-211ENST00000531461 PRAM1Q96QH2 718 aa35.35■■■■□ 3.25
ACER3-211ENST00000531461 STAC3Q96MF2 364 aa35.34■■■■□ 3.25
ACER3-211ENST00000531461 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP35.34■■■■□ 3.25
ACER3-211ENST00000531461 ADGRB2O60241 1585 aa35.34■■■■□ 3.25
ACER3-211ENST00000531461 KRT28Q7Z3Y7 464 aa35.33■■■■□ 3.25
ACER3-211ENST00000531461 PHF8Q9UPP1 1060 aa35.33■■■■□ 3.25
ACER3-211ENST00000531461 ANKARQ7Z5J8 1434 aa35.3■■■■□ 3.24
ACER3-211ENST00000531461 ATAD2Q6PL18 1390 aa35.29■■■■□ 3.24
ACER3-211ENST00000531461 PSME1Q06323 249 aa35.29■■■■□ 3.24
ACER3-211ENST00000531461 TNS3Q68CZ2 1445 aa35.29■■■■□ 3.24
ACER3-211ENST00000531461 POGKQ9P215 609 aa35.28■■■■□ 3.24
ACER3-211ENST00000531461 USP32Q8NFA0 1604 aa35.28■■■■□ 3.24
ACER3-211ENST00000531461 SLIT2O94813 1529 aa35.27■■■■□ 3.24
ACER3-211ENST00000531461 SBNO1A3KN83 1393 aa35.27■■■■□ 3.24
ACER3-211ENST00000531461 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP35.26■■■■□ 3.24
ACER3-211ENST00000531461 DCAF11Q8TEB1 546 aa35.23■■■■□ 3.23
ACER3-211ENST00000531461 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP35.23■■■■□ 3.23
ACER3-211ENST00000531461 UNC5CLQ8IV45 518 aa35.21■■■■□ 3.23
ACER3-211ENST00000531461 EP400Q96L91 3159 aa35.21■■■■□ 3.23
ACER3-211ENST00000531461 TRAK1Q9UPV9 953 aa35.2■■■■□ 3.23
ACER3-211ENST00000531461 ARHGEF10O15013 1369 aa35.2■■■■□ 3.23
ACER3-211ENST00000531461 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP35.19■■■■□ 3.22
ACER3-211ENST00000531461 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa35.19■■■■□ 3.22
ACER3-211ENST00000531461 ABCA3Q99758 1704 aa35.18■■■■□ 3.22
ACER3-211ENST00000531461 NWD2Q9ULI1 1742 aa35.15■■■■□ 3.22
ACER3-211ENST00000531461 TULP4Q9NRJ4 1543 aa35.15■■■■□ 3.22
ACER3-211ENST00000531461 GLI3P10071 1580 aa35.14■■■■□ 3.22
ACER3-211ENST00000531461 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP35.14■■■■□ 3.22
ACER3-211ENST00000531461 RALGAPBQ86X10 1494 aa35.14■■■■□ 3.22
ACER3-211ENST00000531461 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa35.12■■■■□ 3.21
ACER3-211ENST00000531461 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP35.11■■■■□ 3.21
ACER3-211ENST00000531461 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP35.11■■■■□ 3.21
ACER3-211ENST00000531461 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP35.11■■■■□ 3.21
ACER3-211ENST00000531461 PLCH1Q4KWH8 1693 aa35.11■■■■□ 3.21
ACER3-211ENST00000531461 WASLO00401 505 aaPredicted RBP35.1■■■■□ 3.21
ACER3-211ENST00000531461 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP35.09■■■■□ 3.21
ACER3-211ENST00000531461 PRR36Q9H6K5 1346 aa35.09■■■■□ 3.21
ACER3-211ENST00000531461 ALS2Q96Q42 1657 aa35.09■■■■□ 3.21
ACER3-211ENST00000531461 CCDC125Q86Z20 511 aa35.09■■■■□ 3.21
ACER3-211ENST00000531461 CABLES1Q8TDN4 633 aa35.09■■■■□ 3.21
ACER3-211ENST00000531461 GPRASP1Q5JY77 1395 aa35.06■■■■□ 3.2
ACER3-211ENST00000531461 LMOD2Q6P5Q4 547 aa35.06■■■■□ 3.2
ACER3-211ENST00000531461 VPS72Q15906 364 aa35.05■■■■□ 3.2
ACER3-211ENST00000531461 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa35.04■■■■□ 3.2
ACER3-211ENST00000531461 ITSN1Q15811 1721 aa35.03■■■■□ 3.2
ACER3-211ENST00000531461 BRWD3Q6RI45 1802 aa35.02■■■■□ 3.2
ACER3-211ENST00000531461 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP34.99■■■■□ 3.19
ACER3-211ENST00000531461 ATP7BP35670 1465 aa34.98■■■■□ 3.19
ACER3-211ENST00000531461 FAM83GA6ND36 823 aa34.98■■■■□ 3.19
ACER3-211ENST00000531461 NRAPQ86VF7 1730 aa34.97■■■■□ 3.19
ACER3-211ENST00000531461 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa34.97■■■■□ 3.19
ACER3-211ENST00000531461 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP34.95■■■■□ 3.19
ACER3-211ENST00000531461 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP34.95■■■■□ 3.18
ACER3-211ENST00000531461 PLEKHG5O94827 1062 aa34.93■■■■□ 3.18
ACER3-211ENST00000531461 SEPT12Q8IYM1 358 aa34.93■■■■□ 3.18
ACER3-211ENST00000531461 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP34.92■■■■□ 3.18
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