RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514153.5

FAM149A-215, Transcript of family with sequence similarity 149 member A, humanhuman

APPRIS P2 TSL 5 BASIC

Gene FAM149A, Length 2,070 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM149A-215ENST00000514153 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa41.94■■■■■ 4.3
FAM149A-215ENST00000514153 FAM135BQ49AJ0 1406 aa41.94■■■■■ 4.3
FAM149A-215ENST00000514153 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa41.94■■■■■ 4.3
FAM149A-215ENST00000514153 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP41.93■■■■■ 4.3
FAM149A-215ENST00000514153 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP41.92■■■■■ 4.3
FAM149A-215ENST00000514153 TMC1Q8TDI8 760 aa41.91■■■■■ 4.3
FAM149A-215ENST00000514153 SIRT1Q96EB6 747 aa41.9■■■■■ 4.3
FAM149A-215ENST00000514153 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP41.89■■■■■ 4.3
FAM149A-215ENST00000514153 CDK19Q9BWU1 502 aa41.86■■■■■ 4.29
FAM149A-215ENST00000514153 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa41.86■■■■■ 4.29
FAM149A-215ENST00000514153 CCER2I3L3R5 266 aa41.85■■■■■ 4.29
FAM149A-215ENST00000514153 HSPA2P54652 639 aa41.84■■■■■ 4.29
FAM149A-215ENST00000514153 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP41.84■■■■■ 4.29
FAM149A-215ENST00000514153 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP41.83■■■■■ 4.29
FAM149A-215ENST00000514153 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP41.82■■■■■ 4.29
FAM149A-215ENST00000514153 PIK3R4Q99570 1358 aa41.79■■■■■ 4.28
FAM149A-215ENST00000514153 KCNA6P17658 529 aa41.79■■■■■ 4.28
FAM149A-215ENST00000514153 PTCH1Q13635 1447 aa41.78■■■■■ 4.28
FAM149A-215ENST00000514153 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP41.78■■■■■ 4.28
FAM149A-215ENST00000514153 KNSTRNQ9Y448 316 aa41.78■■■■■ 4.28
FAM149A-215ENST00000514153 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP41.77■■■■■ 4.28
FAM149A-215ENST00000514153 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP41.75■■■■■ 4.27
FAM149A-215ENST00000514153 WASLO00401 505 aaPredicted RBP41.75■■■■■ 4.27
FAM149A-215ENST00000514153 LMTK3Q96Q04 1460 aa41.74■■■■■ 4.27
FAM149A-215ENST00000514153 ATAD2Q6PL18 1390 aa41.74■■■■■ 4.27
FAM149A-215ENST00000514153 CARD14Q9BXL6 1004 aa41.74■■■■■ 4.27
FAM149A-215ENST00000514153 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP41.74■■■■■ 4.27
FAM149A-215ENST00000514153 CCDC184Q52MB2 194 aa41.72■■■■■ 4.27
FAM149A-215ENST00000514153 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP41.67■■■■■ 4.26
FAM149A-215ENST00000514153 ADGRB2O60241 1585 aa41.65■■■■■ 4.26
FAM149A-215ENST00000514153 RALBP1Q15311 655 aa41.65■■■■■ 4.26
FAM149A-215ENST00000514153 PARD3Q8TEW0 1356 aa41.64■■■■■ 4.26
FAM149A-215ENST00000514153 NSD3Q9BZ95 1437 aa41.64■■■■■ 4.26
FAM149A-215ENST00000514153 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa41.63■■■■■ 4.26
FAM149A-215ENST00000514153 NINLQ9Y2I6 1382 aa41.63■■■■■ 4.26
FAM149A-215ENST00000514153 CABP1Q9NZU7 370 aa41.62■■■■■ 4.25
FAM149A-215ENST00000514153 A0A1W2PP64 1363 aa41.59■■■■■ 4.25
FAM149A-215ENST00000514153 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP41.59■■■■■ 4.25
FAM149A-215ENST00000514153 MRS2Q9HD23 443 aa41.59■■■■■ 4.25
FAM149A-215ENST00000514153 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP41.58■■■■■ 4.25
FAM149A-215ENST00000514153 NUTM2FA1L443 756 aa41.57■■■■■ 4.25
FAM149A-215ENST00000514153 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP41.57■■■■■ 4.24
FAM149A-215ENST00000514153 CD163L1Q9NR16 1453 aa41.56■■■■■ 4.24
FAM149A-215ENST00000514153 PRR36Q9H6K5 1346 aa41.54■■■■■ 4.24
FAM149A-215ENST00000514153 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa41.54■■■■■ 4.24
FAM149A-215ENST00000514153 ATP7BP35670 1465 aa41.54■■■■■ 4.24
FAM149A-215ENST00000514153 TERF2IPQ9NYB0 399 aa41.53■■■■■ 4.24
FAM149A-215ENST00000514153 STRCQ7RTU9 1775 aa41.5■■■■■ 4.23
FAM149A-215ENST00000514153 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa41.5■■■■■ 4.23
FAM149A-215ENST00000514153 NWD1Q149M9 1564 aa41.49■■■■■ 4.23
FAM149A-215ENST00000514153 CCDC61Q9Y6R9 512 aa41.49■■■■■ 4.23
FAM149A-215ENST00000514153 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP41.47■■■■■ 4.23
FAM149A-215ENST00000514153 NALCNQ8IZF0 1738 aa41.47■■■■■ 4.23
FAM149A-215ENST00000514153 USP32Q8NFA0 1604 aa41.44■■■■■ 4.22
FAM149A-215ENST00000514153 CGNL1Q0VF96 1302 aa41.44■■■■■ 4.22
FAM149A-215ENST00000514153 NLRP13Q86W25 1043 aa41.41■■■■■ 4.22
FAM149A-215ENST00000514153 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa41.4■■■■■ 4.22
FAM149A-215ENST00000514153 FAM9BQ8IZU0 186 aa41.39■■■■■ 4.22
FAM149A-215ENST00000514153 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP41.38■■■■■ 4.22
FAM149A-215ENST00000514153 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa41.38■■■■■ 4.21
FAM149A-215ENST00000514153 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP41.37■■■■■ 4.21
FAM149A-215ENST00000514153 C14orf37Q86TY3 774 aa41.37■■■■■ 4.21
FAM149A-215ENST00000514153 STRCP1A6NGW2 1772 aa41.37■■■■■ 4.21
FAM149A-215ENST00000514153 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP41.37■■■■■ 4.21
FAM149A-215ENST00000514153 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP41.35■■■■■ 4.21
FAM149A-215ENST00000514153 PPP2R1AP30153 589 aa41.35■■■■■ 4.21
FAM149A-215ENST00000514153 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa41.35■■■■■ 4.21
FAM149A-215ENST00000514153 FMN2Q9NZ56 1722 aa41.34■■■■■ 4.21
FAM149A-215ENST00000514153 ITSN1Q15811 1721 aa41.33■■■■■ 4.21
FAM149A-215ENST00000514153 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP41.33■■■■■ 4.21
FAM149A-215ENST00000514153 MORC1Q86VD1 984 aa41.32■■■■■ 4.21
FAM149A-215ENST00000514153 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP41.31■■■■■ 4.2
FAM149A-215ENST00000514153 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP41.3■■■■■ 4.2
FAM149A-215ENST00000514153 AKAP12Q02952 1782 aa41.29■■■■■ 4.2
FAM149A-215ENST00000514153 GGNBP2Q9H3C7 697 aa41.29■■■■■ 4.2
FAM149A-215ENST00000514153 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa41.28■■■■■ 4.2
FAM149A-215ENST00000514153 ACEP12821 1306 aa41.27■■■■■ 4.2
FAM149A-215ENST00000514153 NSD2O96028 1365 aa41.27■■■■■ 4.2
FAM149A-215ENST00000514153 MON2Q7Z3U7 1717 aa41.27■■■■■ 4.2
FAM149A-215ENST00000514153 PLEKHG3A1L390 1219 aa41.26■■■■■ 4.2
FAM149A-215ENST00000514153 FYB1O15117 783 aa41.26■■■■■ 4.2
FAM149A-215ENST00000514153 ANKARQ7Z5J8 1434 aa41.25■■■■■ 4.19
FAM149A-215ENST00000514153 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP41.24■■■■■ 4.19
FAM149A-215ENST00000514153 KIF20BQ96Q89 1820 aa41.24■■■■■ 4.19
FAM149A-215ENST00000514153 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP41.23■■■■■ 4.19
FAM149A-215ENST00000514153 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP41.21■■■■■ 4.19
FAM149A-215ENST00000514153 TMEM94Q12767 1356 aa41.2■■■■■ 4.19
FAM149A-215ENST00000514153 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP41.2■■■■■ 4.19
FAM149A-215ENST00000514153 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa41.17■■■■■ 4.18
FAM149A-215ENST00000514153 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP41.16■■■■■ 4.18
FAM149A-215ENST00000514153 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP41.15■■■■■ 4.18
FAM149A-215ENST00000514153 NME9Q86XW9 330 aa41.15■■■■■ 4.18
FAM149A-215ENST00000514153 USP6P35125 1406 aa41.13■■■■■ 4.18
FAM149A-215ENST00000514153 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP41.13■■■■■ 4.17
FAM149A-215ENST00000514153 NRKQ7Z2Y5 1582 aa41.12■■■■■ 4.17
FAM149A-215ENST00000514153 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP41.11■■■■■ 4.17
FAM149A-215ENST00000514153 C19orf44Q9H6X5 657 aa41.11■■■■■ 4.17
FAM149A-215ENST00000514153 ZRANB1Q9UGI0 708 aa41.1■■■■■ 4.17
FAM149A-215ENST00000514153 ESCO1Q5FWF5 840 aa41.07■■■■■ 4.17
FAM149A-215ENST00000514153 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa41.07■■■■■ 4.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.6 ms