RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492185.5

NELFE-211, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 2

Gene NELFE, Length 1,786 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-211ENST00000492185 PRAM1Q96QH2 718 aa26.82■■□□□ 1.88
NELFE-211ENST00000492185 HDGFP51858 240 aaKnown RBP26.8■■□□□ 1.88
NELFE-211ENST00000492185 ATAD2Q6PL18 1390 aa26.79■■□□□ 1.88
NELFE-211ENST00000492185 TECPR2O15040 1411 aa26.79■■□□□ 1.88
NELFE-211ENST00000492185 TRHP20396 242 aaPredicted RBP26.79■■□□□ 1.88
NELFE-211ENST00000492185 NUDCQ9Y266 331 aa26.78■■□□□ 1.88
NELFE-211ENST00000492185 CABP2Q9NPB3 220 aa26.76■■□□□ 1.88
NELFE-211ENST00000492185 POGKQ9P215 609 aa26.76■■□□□ 1.87
NELFE-211ENST00000492185 NSD2O96028 1365 aa26.76■■□□□ 1.87
NELFE-211ENST00000492185 CPS1P31327 1500 aa26.75■■□□□ 1.87
NELFE-211ENST00000492185 METP08581 1390 aa26.74■■□□□ 1.87
NELFE-211ENST00000492185 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP26.74■■□□□ 1.87
NELFE-211ENST00000492185 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP26.74■■□□□ 1.87
NELFE-211ENST00000492185 SLIT1O75093 1534 aa26.74■■□□□ 1.87
NELFE-211ENST00000492185 ARHGAP23Q9P227 1491 aa26.74■■□□□ 1.87
NELFE-211ENST00000492185 SIRT1Q96EB6 747 aa26.74■■□□□ 1.87
NELFE-211ENST00000492185 FAM135BQ49AJ0 1406 aa26.73■■□□□ 1.87
NELFE-211ENST00000492185 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP26.73■■□□□ 1.87
NELFE-211ENST00000492185 CD163L1Q9NR16 1453 aa26.72■■□□□ 1.87
NELFE-211ENST00000492185 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa26.72■■□□□ 1.87
NELFE-211ENST00000492185 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa26.72■■□□□ 1.87
NELFE-211ENST00000492185 CGNL1Q0VF96 1302 aa26.72■■□□□ 1.87
NELFE-211ENST00000492185 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP26.71■■□□□ 1.87
NELFE-211ENST00000492185 PDE3BQ13370 1112 aa26.71■■□□□ 1.87
NELFE-211ENST00000492185 ERICH6BQ5W0A0 696 aa26.7■■□□□ 1.86
NELFE-211ENST00000492185 ADAMTS8Q9UP79 889 aa26.7■■□□□ 1.86
NELFE-211ENST00000492185 MED14O60244 1454 aa26.7■■□□□ 1.86
NELFE-211ENST00000492185 A0A1W2PP64 1363 aa26.7■■□□□ 1.86
NELFE-211ENST00000492185 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa26.7■■□□□ 1.86
NELFE-211ENST00000492185 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa26.69■■□□□ 1.86
NELFE-211ENST00000492185 RNF123Q5XPI4 1314 aa26.69■■□□□ 1.86
NELFE-211ENST00000492185 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP26.69■■□□□ 1.86
NELFE-211ENST00000492185 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP26.69■■□□□ 1.86
NELFE-211ENST00000492185 CDK19Q9BWU1 502 aa26.66■■□□□ 1.86
NELFE-211ENST00000492185 SHPRHQ149N8 1683 aa26.66■■□□□ 1.86
NELFE-211ENST00000492185 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP26.66■■□□□ 1.86
NELFE-211ENST00000492185 MORC1Q86VD1 984 aa26.65■■□□□ 1.86
NELFE-211ENST00000492185 WAPLQ7Z5K2 1190 aa26.64■■□□□ 1.86
NELFE-211ENST00000492185 LTKP29376 864 aa26.63■■□□□ 1.85
NELFE-211ENST00000492185 ATP7BP35670 1465 aa26.62■■□□□ 1.85
NELFE-211ENST00000492185 TERF2IPQ9NYB0 399 aa26.62■■□□□ 1.85
NELFE-211ENST00000492185 ADGRB2O60241 1585 aa26.6■■□□□ 1.85
NELFE-211ENST00000492185 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa26.6■■□□□ 1.85
NELFE-211ENST00000492185 KIF20BQ96Q89 1820 aa26.59■■□□□ 1.85
NELFE-211ENST00000492185 BCANQ96GW7 911 aa26.59■■□□□ 1.85
NELFE-211ENST00000492185 DIP2AQ14689 1571 aa26.57■■□□□ 1.84
NELFE-211ENST00000492185 ADAMTSL3P82987 1691 aa26.57■■□□□ 1.84
NELFE-211ENST00000492185 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP26.57■■□□□ 1.84
NELFE-211ENST00000492185 ZNF521Q96K83 1311 aa26.56■■□□□ 1.84
NELFE-211ENST00000492185 WASLO00401 505 aaPredicted RBP26.56■■□□□ 1.84
NELFE-211ENST00000492185 TXNDC2Q86VQ3 553 aa26.56■■□□□ 1.84
NELFE-211ENST00000492185 ROBO2Q9HCK4 1378 aa26.54■■□□□ 1.84
NELFE-211ENST00000492185 EID1Q9Y6B2 187 aa26.54■■□□□ 1.84
NELFE-211ENST00000492185 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP26.54■■□□□ 1.84
NELFE-211ENST00000492185 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP26.53■■□□□ 1.84
NELFE-211ENST00000492185 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP26.53■■□□□ 1.84
NELFE-211ENST00000492185 CABP1Q9NZU7 370 aa26.53■■□□□ 1.84
NELFE-211ENST00000492185 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP26.53■■□□□ 1.84
NELFE-211ENST00000492185 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP26.52■■□□□ 1.84
NELFE-211ENST00000492185 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP26.52■■□□□ 1.84
NELFE-211ENST00000492185 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP26.52■■□□□ 1.84
NELFE-211ENST00000492185 PTPRUQ92729 1446 aa26.52■■□□□ 1.84
NELFE-211ENST00000492185 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP26.51■■□□□ 1.83
NELFE-211ENST00000492185 FYB1O15117 783 aa26.51■■□□□ 1.83
NELFE-211ENST00000492185 NGEFQ8N5V2 710 aa26.51■■□□□ 1.83
NELFE-211ENST00000492185 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa26.5■■□□□ 1.83
NELFE-211ENST00000492185 MON2Q7Z3U7 1717 aa26.5■■□□□ 1.83
NELFE-211ENST00000492185 AKAP12Q02952 1782 aa26.5■■□□□ 1.83
NELFE-211ENST00000492185 TBX22Q9Y458 520 aa26.5■■□□□ 1.83
NELFE-211ENST00000492185 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP26.5■■□□□ 1.83
NELFE-211ENST00000492185 MTHFSP49914 203 aa26.48■■□□□ 1.83
NELFE-211ENST00000492185 CDCA7LQ96GN5 454 aa26.48■■□□□ 1.83
NELFE-211ENST00000492185 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa26.47■■□□□ 1.83
NELFE-211ENST00000492185 PTCH1Q13635 1447 aa26.47■■□□□ 1.83
NELFE-211ENST00000492185 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP26.47■■□□□ 1.83
NELFE-211ENST00000492185 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP26.47■■□□□ 1.83
NELFE-211ENST00000492185 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa26.47■■□□□ 1.83
NELFE-211ENST00000492185 PPP4R2Q9NY27 417 aa26.46■■□□□ 1.83
NELFE-211ENST00000492185 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP26.46■■□□□ 1.83
NELFE-211ENST00000492185 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP26.45■■□□□ 1.83
NELFE-211ENST00000492185 CFAP53Q96M91 514 aa26.45■■□□□ 1.82
NELFE-211ENST00000492185 ITSN1Q15811 1721 aa26.45■■□□□ 1.82
NELFE-211ENST00000492185 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP26.44■■□□□ 1.82
NELFE-211ENST00000492185 GGNBP2Q9H3C7 697 aa26.43■■□□□ 1.82
NELFE-211ENST00000492185 IQSEC2Q5JU85 1478 aa26.43■■□□□ 1.82
NELFE-211ENST00000492185 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP26.43■■□□□ 1.82
NELFE-211ENST00000492185 RCAN3Q9UKA8 241 aa26.43■■□□□ 1.82
NELFE-211ENST00000492185 CCDC146Q8IYE0 955 aa26.41■■□□□ 1.82
NELFE-211ENST00000492185 CCDC61Q9Y6R9 512 aa26.41■■□□□ 1.82
NELFE-211ENST00000492185 APAF1O14727 1248 aa26.41■■□□□ 1.82
NELFE-211ENST00000492185 SLC26A8Q96RN1 970 aa26.41■■□□□ 1.82
NELFE-211ENST00000492185 PRR36Q9H6K5 1346 aa26.4■■□□□ 1.82
NELFE-211ENST00000492185 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP26.39■■□□□ 1.82
NELFE-211ENST00000492185 PIK3R4Q99570 1358 aa26.39■■□□□ 1.82
NELFE-211ENST00000492185 PNPLA6Q8IY17 1366 aa26.38■■□□□ 1.81
NELFE-211ENST00000492185 RRP1P56182 461 aaKnown RBP26.38■■□□□ 1.81
NELFE-211ENST00000492185 GOLGA2Q08379 1002 aa26.38■■□□□ 1.81
NELFE-211ENST00000492185 DUSP27Q5VZP5 1158 aa26.38■■□□□ 1.81
NELFE-211ENST00000492185 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP26.37■■□□□ 1.81
NELFE-211ENST00000492185 NRKQ7Z2Y5 1582 aa26.36■■□□□ 1.81
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