RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489475.5

HOXB3-210, Transcript of homeobox B3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXB3, Length 1,845 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-210ENST00000489475 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP36.66■■■■□ 3.46
HOXB3-210ENST00000489475 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP36.64■■■■□ 3.46
HOXB3-210ENST00000489475 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP36.63■■■■□ 3.45
HOXB3-210ENST00000489475 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP36.63■■■■□ 3.45
HOXB3-210ENST00000489475 CABP2Q9NPB3 220 aa36.62■■■■□ 3.45
HOXB3-210ENST00000489475 KNSTRNQ9Y448 316 aa36.62■■■■□ 3.45
HOXB3-210ENST00000489475 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa36.61■■■■□ 3.45
HOXB3-210ENST00000489475 TMC1Q8TDI8 760 aa36.61■■■■□ 3.45
HOXB3-210ENST00000489475 PTPRUQ92729 1446 aa36.61■■■■□ 3.45
HOXB3-210ENST00000489475 ROBO2Q9HCK4 1378 aa36.6■■■■□ 3.45
HOXB3-210ENST00000489475 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa36.59■■■■□ 3.45
HOXB3-210ENST00000489475 RALBP1Q15311 655 aa36.58■■■■□ 3.45
HOXB3-210ENST00000489475 PIK3R4Q99570 1358 aa36.58■■■■□ 3.45
HOXB3-210ENST00000489475 CDK19Q9BWU1 502 aa36.57■■■■□ 3.44
HOXB3-210ENST00000489475 ATAD2Q6PL18 1390 aa36.56■■■■□ 3.44
HOXB3-210ENST00000489475 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa36.56■■■■□ 3.44
HOXB3-210ENST00000489475 NINLQ9Y2I6 1382 aa36.54■■■■□ 3.44
HOXB3-210ENST00000489475 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP36.52■■■■□ 3.44
HOXB3-210ENST00000489475 PTCH1Q13635 1447 aa36.51■■■■□ 3.44
HOXB3-210ENST00000489475 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP36.51■■■■□ 3.44
HOXB3-210ENST00000489475 PARD3Q8TEW0 1356 aa36.5■■■■□ 3.43
HOXB3-210ENST00000489475 WASLO00401 505 aaPredicted RBP36.48■■■■□ 3.43
HOXB3-210ENST00000489475 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP36.48■■■■□ 3.43
HOXB3-210ENST00000489475 CARD14Q9BXL6 1004 aa36.48■■■■□ 3.43
HOXB3-210ENST00000489475 MRS2Q9HD23 443 aa36.47■■■■□ 3.43
HOXB3-210ENST00000489475 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP36.47■■■■□ 3.43
HOXB3-210ENST00000489475 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP36.46■■■■□ 3.43
HOXB3-210ENST00000489475 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa36.46■■■■□ 3.43
HOXB3-210ENST00000489475 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa36.45■■■■□ 3.43
HOXB3-210ENST00000489475 CCDC184Q52MB2 194 aa36.44■■■■□ 3.42
HOXB3-210ENST00000489475 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa36.44■■■■□ 3.42
HOXB3-210ENST00000489475 KCNA6P17658 529 aa36.41■■■■□ 3.42
HOXB3-210ENST00000489475 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP36.4■■■■□ 3.42
HOXB3-210ENST00000489475 ADGRB2O60241 1585 aa36.4■■■■□ 3.42
HOXB3-210ENST00000489475 NSD3Q9BZ95 1437 aa36.39■■■■□ 3.42
HOXB3-210ENST00000489475 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP36.39■■■■□ 3.42
HOXB3-210ENST00000489475 TERF2IPQ9NYB0 399 aa36.38■■■■□ 3.42
HOXB3-210ENST00000489475 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP36.38■■■■□ 3.41
HOXB3-210ENST00000489475 NLRP13Q86W25 1043 aa36.35■■■■□ 3.41
HOXB3-210ENST00000489475 CABP1Q9NZU7 370 aa36.35■■■■□ 3.41
HOXB3-210ENST00000489475 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP36.34■■■■□ 3.41
HOXB3-210ENST00000489475 A0A1W2PP64 1363 aa36.33■■■■□ 3.41
HOXB3-210ENST00000489475 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP36.32■■■■□ 3.41
HOXB3-210ENST00000489475 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP36.31■■■■□ 3.4
HOXB3-210ENST00000489475 CGNL1Q0VF96 1302 aa36.31■■■■□ 3.4
HOXB3-210ENST00000489475 HSPA2P54652 639 aa36.3■■■■□ 3.4
HOXB3-210ENST00000489475 USP32Q8NFA0 1604 aa36.3■■■■□ 3.4
HOXB3-210ENST00000489475 CCDC61Q9Y6R9 512 aa36.29■■■■□ 3.4
HOXB3-210ENST00000489475 CD163L1Q9NR16 1453 aa36.28■■■■□ 3.4
HOXB3-210ENST00000489475 ATP7BP35670 1465 aa36.28■■■■□ 3.4
HOXB3-210ENST00000489475 LMTK3Q96Q04 1460 aa36.28■■■■□ 3.4
HOXB3-210ENST00000489475 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa36.27■■■■□ 3.4
HOXB3-210ENST00000489475 FAM9BQ8IZU0 186 aa36.24■■■■□ 3.39
HOXB3-210ENST00000489475 PRR36Q9H6K5 1346 aa36.22■■■■□ 3.39
HOXB3-210ENST00000489475 NSD2O96028 1365 aa36.21■■■■□ 3.39
HOXB3-210ENST00000489475 PPP2R1AP30153 589 aa36.21■■■■□ 3.39
HOXB3-210ENST00000489475 NWD1Q149M9 1564 aa36.19■■■■□ 3.38
HOXB3-210ENST00000489475 MORC1Q86VD1 984 aa36.18■■■■□ 3.38
HOXB3-210ENST00000489475 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP36.17■■■■□ 3.38
HOXB3-210ENST00000489475 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP36.16■■■■□ 3.38
HOXB3-210ENST00000489475 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa36.16■■■■□ 3.38
HOXB3-210ENST00000489475 NUTM2FA1L443 756 aa36.15■■■■□ 3.38
HOXB3-210ENST00000489475 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa36.12■■■■□ 3.37
HOXB3-210ENST00000489475 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP36.11■■■■□ 3.37
HOXB3-210ENST00000489475 NALCNQ8IZF0 1738 aa36.1■■■■□ 3.37
HOXB3-210ENST00000489475 PLEKHG3A1L390 1219 aa36.1■■■■□ 3.37
HOXB3-210ENST00000489475 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa36.09■■■■□ 3.37
HOXB3-210ENST00000489475 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP36.09■■■■□ 3.37
HOXB3-210ENST00000489475 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP36.09■■■■□ 3.37
HOXB3-210ENST00000489475 ANKARQ7Z5J8 1434 aa36.09■■■■□ 3.37
HOXB3-210ENST00000489475 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP36.08■■■■□ 3.37
HOXB3-210ENST00000489475 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP36.08■■■■□ 3.37
HOXB3-210ENST00000489475 ITSN1Q15811 1721 aa36.07■■■■□ 3.37
HOXB3-210ENST00000489475 FYB1O15117 783 aa36.07■■■■□ 3.36
HOXB3-210ENST00000489475 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP36.07■■■■□ 3.36
HOXB3-210ENST00000489475 C14orf37Q86TY3 774 aa36.06■■■■□ 3.36
HOXB3-210ENST00000489475 FMN2Q9NZ56 1722 aa36.06■■■■□ 3.36
HOXB3-210ENST00000489475 GGNBP2Q9H3C7 697 aa36.05■■■■□ 3.36
HOXB3-210ENST00000489475 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP36.04■■■■□ 3.36
HOXB3-210ENST00000489475 AKAP12Q02952 1782 aa36.04■■■■□ 3.36
HOXB3-210ENST00000489475 STRCQ7RTU9 1775 aa36.04■■■■□ 3.36
HOXB3-210ENST00000489475 ACEP12821 1306 aa36.04■■■■□ 3.36
HOXB3-210ENST00000489475 MON2Q7Z3U7 1717 aa36.03■■■■□ 3.36
HOXB3-210ENST00000489475 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP36.03■■■■□ 3.36
HOXB3-210ENST00000489475 KIF20BQ96Q89 1820 aa36.01■■■■□ 3.36
HOXB3-210ENST00000489475 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa36■■■■□ 3.35
HOXB3-210ENST00000489475 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP35.98■■■■□ 3.35
HOXB3-210ENST00000489475 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa35.97■■■■□ 3.35
HOXB3-210ENST00000489475 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP35.95■■■■□ 3.35
HOXB3-210ENST00000489475 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP35.94■■■■□ 3.34
HOXB3-210ENST00000489475 USP6P35125 1406 aa35.94■■■■□ 3.34
HOXB3-210ENST00000489475 STRCP1A6NGW2 1772 aa35.92■■■■□ 3.34
HOXB3-210ENST00000489475 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP35.9■■■■□ 3.344e-9■■□□□ 12.8
HOXB3-210ENST00000489475 NME9Q86XW9 330 aa35.9■■■■□ 3.34
HOXB3-210ENST00000489475 C19orf44Q9H6X5 657 aa35.9■■■■□ 3.34
HOXB3-210ENST00000489475 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa35.89■■■■□ 3.34
HOXB3-210ENST00000489475 TMEM94Q12767 1356 aa35.89■■■■□ 3.34
HOXB3-210ENST00000489475 MTHFSP49914 203 aa35.89■■■■□ 3.34
HOXB3-210ENST00000489475 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa35.89■■■■□ 3.34
HOXB3-210ENST00000489475 NRKQ7Z2Y5 1582 aa35.88■■■■□ 3.33
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