RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486667.5

SRSF11-215, Transcript of serine and arginine rich splicing factor 11, human

TSL 5

Gene SRSF11, Length 662 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SRSF11-215	ENST00000486667	PARD3	Q8TEW0	1356 aa		14.02	□□□□□ -0.17
SRSF11-215	ENST00000486667	PIK3R4	Q99570	1358 aa		14.02	□□□□□ -0.17
SRSF11-215	ENST00000486667	CENPB	P07199	599 aa	Predicted RBP	14.02	□□□□□ -0.17
SRSF11-215	ENST00000486667	BCAN	Q96GW7	911 aa		14.02	□□□□□ -0.17
SRSF11-215	ENST00000486667	PHF23	Q9BUL5	403 aa	Predicted RBP	14.02	□□□□□ -0.17
SRSF11-215	ENST00000486667	ANKLE2	Q86XL3	938 aa		14.01	□□□□□ -0.17
SRSF11-215	ENST00000486667	ATAD2	Q6PL18	1390 aa		14	□□□□□ -0.17
SRSF11-215	ENST00000486667	SENP3	Q9H4L4	574 aa	Predicted RBP	14	□□□□□ -0.17
SRSF11-215	ENST00000486667	KNSTRN	Q9Y448	316 aa		14	□□□□□ -0.17
SRSF11-215	ENST00000486667	USP32	Q8NFA0	1604 aa		14	□□□□□ -0.17
SRSF11-215	ENST00000486667	XRN1	Q8IZH2	1706 aa	Known RBP	13.99	□□□□□ -0.17
SRSF11-215	ENST00000486667	MYBBP1A	Q9BQG0	1328 aa	Known RBP	13.98	□□□□□ -0.17
SRSF11-215	ENST00000486667	ADGRB2	O60241	1585 aa		13.98	□□□□□ -0.17
SRSF11-215	ENST00000486667	AMER1	Q5JTC6	1135 aa	Predicted RBP	13.98	□□□□□ -0.17
SRSF11-215	ENST00000486667	CHD2	O14647	1828 aa	Known RBP	13.98	□□□□□ -0.17
SRSF11-215	ENST00000486667	PTCH1	Q13635	1447 aa		13.98	□□□□□ -0.17
SRSF11-215	ENST00000486667	PTPRU	Q92729	1446 aa		13.98	□□□□□ -0.17
SRSF11-215	ENST00000486667	BRD4	O60885	1362 aa	Predicted RBP	13.97	□□□□□ -0.17
SRSF11-215	ENST00000486667	MINK1	Q8N4C8	1332 aa	Predicted RBP	13.97	□□□□□ -0.17
SRSF11-215	ENST00000486667	SAFB2	Q14151	953 aa	Known RBP eCLIP	13.97	□□□□□ -0.17
SRSF11-215	ENST00000486667	WAPL	Q7Z5K2	1190 aa		13.97	□□□□□ -0.17
SRSF11-215	ENST00000486667	YTHDC1	Q96MU7	727 aa	Known RBP	13.97	□□□□□ -0.17
SRSF11-215	ENST00000486667	ANKRD36B	Q8N2N9	1353 aa		13.96	□□□□□ -0.17
SRSF11-215	ENST00000486667	PLEKHH1	Q9ULM0	1364 aa		13.96	□□□□□ -0.17
SRSF11-215	ENST00000486667	SLC26A8	Q96RN1	970 aa		13.96	□□□□□ -0.17
SRSF11-215	ENST00000486667	ROBO2	Q9HCK4	1378 aa		13.96	□□□□□ -0.18
SRSF11-215	ENST00000486667	SRPK2	P78362	688 aa	Known RBP	13.95	□□□□□ -0.18
SRSF11-215	ENST00000486667	CDK19	Q9BWU1	502 aa		13.95	□□□□□ -0.18
SRSF11-215	ENST00000486667	CARD14	Q9BXL6	1004 aa		13.95	□□□□□ -0.18
SRSF11-215	ENST00000486667	SLC12A5	Q9H2X9	1139 aa		13.95	□□□□□ -0.18
SRSF11-215	ENST00000486667	MRS2	Q9HD23	443 aa		13.95	□□□□□ -0.18
SRSF11-215	ENST00000486667	CABP2	Q9NPB3	220 aa		13.95	□□□□□ -0.18
SRSF11-215	ENST00000486667	SIPA1L2	Q9P2F8	1722 aa	Predicted RBP	13.95	□□□□□ -0.18
SRSF11-215	ENST00000486667	WASL	O00401	505 aa	Predicted RBP	13.94	□□□□□ -0.18
SRSF11-215	ENST00000486667	CCDC184	Q52MB2	194 aa		13.94	□□□□□ -0.18
SRSF11-215	ENST00000486667	NLRP13	Q86W25	1043 aa		13.94	□□□□□ -0.18
SRSF11-215	ENST00000486667	TMC1	Q8TDI8	760 aa		13.94	□□□□□ -0.18
SRSF11-215	ENST00000486667	AMOTL2	Q9Y2J4	779 aa		13.93	□□□□□ -0.18
SRSF11-215	ENST00000486667	CC2D1B	Q5T0F9	858 aa	Known RBP	13.92	□□□□□ -0.18
SRSF11-215	ENST00000486667	TERF2IP	Q9NYB0	399 aa		13.92	□□□□□ -0.18
SRSF11-215	ENST00000486667	ATP7B	P35670	1465 aa		13.92	□□□□□ -0.18
SRSF11-215	ENST00000486667	NPHP4	O75161	1426 aa	Predicted RBP	13.91	□□□□□ -0.18
SRSF11-215	ENST00000486667	NSD2	O96028	1365 aa		13.91	□□□□□ -0.18
SRSF11-215	ENST00000486667	NSD3	Q9BZ95	1437 aa		13.9	□□□□□ -0.18
SRSF11-215	ENST00000486667	CD163L1	Q9NR16	1453 aa		13.9	□□□□□ -0.18
SRSF11-215	ENST00000486667	ANKRD26	Q9UPS8	1709 aa		13.9	□□□□□ -0.18
SRSF11-215	ENST00000486667	CGNL1	Q0VF96	1302 aa		13.9	□□□□□ -0.19
SRSF11-215	ENST00000486667		A0A1W2PP64	1363 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SRSF11-215	ENST00000486667	PNISR	Q8TF01	805 aa	Known RBP	13.89	□□□□□ -0.19
SRSF11-215	ENST00000486667	AKAP12	Q02952	1782 aa		13.88	□□□□□ -0.19
SRSF11-215	ENST00000486667	TOPAZ1	Q8N9V7	1692 aa		13.88	□□□□□ -0.19
SRSF11-215	ENST00000486667	INSR	P06213	1382 aa		13.88	□□□□□ -0.19
SRSF11-215	ENST00000486667	ITSN1	Q15811	1721 aa		13.88	□□□□□ -0.19
SRSF11-215	ENST00000486667	HDGFL2	Q7Z4V5	671 aa	Predicted RBP	13.88	□□□□□ -0.19
SRSF11-215	ENST00000486667	CNGB1	Q14028	1251 aa	Predicted RBP	13.87	□□□□□ -0.19
SRSF11-215	ENST00000486667	CCDC61	Q9Y6R9	512 aa		13.87	□□□□□ -0.19
SRSF11-215	ENST00000486667	CPSF1	Q10570	1443 aa	Known RBP	13.87	□□□□□ -0.19
SRSF11-215	ENST00000486667	NWD1	Q149M9	1564 aa		13.87	□□□□□ -0.19
SRSF11-215	ENST00000486667	KIF20B	Q96Q89	1820 aa		13.86	□□□□□ -0.19
SRSF11-215	ENST00000486667	PPP2R1A	P30153	589 aa		13.86	□□□□□ -0.19
SRSF11-215	ENST00000486667	NUDT16	Q96DE0	195 aa	Known RBP	13.86	□□□□□ -0.19
SRSF11-215	ENST00000486667	CABP1	Q9NZU7	370 aa		13.86	□□□□□ -0.19
SRSF11-215	ENST00000486667	CDC42BPG	Q6DT37	1551 aa		13.86	□□□□□ -0.19
SRSF11-215	ENST00000486667	MON2	Q7Z3U7	1717 aa		13.86	□□□□□ -0.19
SRSF11-215	ENST00000486667	PPIP5K1	Q6PFW1	1433 aa		13.85	□□□□□ -0.19
SRSF11-215	ENST00000486667	KCNA6	P17658	529 aa		13.85	□□□□□ -0.19
SRSF11-215	ENST00000486667	FAM9B	Q8IZU0	186 aa		13.84	□□□□□ -0.19
SRSF11-215	ENST00000486667	NCKAP5L	Q9HCH0	1330 aa		13.84	□□□□□ -0.19
SRSF11-215	ENST00000486667	FMN2	Q9NZ56	1722 aa		13.84	□□□□□ -0.19
SRSF11-215	ENST00000486667	PLEKHG3	A1L390	1219 aa		13.83	□□□□□ -0.2
SRSF11-215	ENST00000486667	ZNF692	Q9BU19	519 aa	Predicted RBP	13.83	□□□□□ -0.2
SRSF11-215	ENST00000486667	EDC4	Q6P2E9	1401 aa	Known RBP	13.82	□□□□□ -0.2
SRSF11-215	ENST00000486667	ANKAR	Q7Z5J8	1434 aa		13.82	□□□□□ -0.2
SRSF11-215	ENST00000486667	LMTK3	Q96Q04	1460 aa		13.82	□□□□□ -0.2
SRSF11-215	ENST00000486667	NALCN	Q8IZF0	1738 aa		13.82	□□□□□ -0.2
SRSF11-215	ENST00000486667	MORC1	Q86VD1	984 aa		13.82	□□□□□ -0.2
SRSF11-215	ENST00000486667	PRR36	Q9H6K5	1346 aa		13.82	□□□□□ -0.2
SRSF11-215	ENST00000486667	RGPD8	O14715	1765 aa	Predicted RBP	13.81	□□□□□ -0.2
SRSF11-215	ENST00000486667	HNRNPU	Q00839	825 aa	Known RBP eCLIP	13.81	□□□□□ -0.2
SRSF11-215	ENST00000486667	NKTR	P30414	1462 aa	Known RBP	13.8	□□□□□ -0.2
SRSF11-215	ENST00000486667	FYB1	O15117	783 aa		13.8	□□□□□ -0.2
SRSF11-215	ENST00000486667	POLR3A	O14802	1390 aa	Predicted RBP	13.8	□□□□□ -0.2
SRSF11-215	ENST00000486667	ADGRL3	Q9HAR2	1447 aa		13.79	□□□□□ -0.2
SRSF11-215	ENST00000486667	NRK	Q7Z2Y5	1582 aa		13.79	□□□□□ -0.2
SRSF11-215	ENST00000486667	STRC	Q7RTU9	1775 aa		13.78	□□□□□ -0.2
SRSF11-215	ENST00000486667	ZBED9	Q6R2W3	1325 aa		13.78	□□□□□ -0.2
SRSF11-215	ENST00000486667	SCAF1	Q9H7N4	1312 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
SRSF11-215	ENST00000486667	NCOA3	Q9Y6Q9	1424 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SRSF11-215	ENST00000486667	BLM	P54132	1417 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
SRSF11-215	ENST00000486667	STRCP1	A6NGW2	1772 aa		13.75	□□□□□ -0.21
SRSF11-215	ENST00000486667	USP6	P35125	1406 aa		13.74	□□□□□ -0.21
SRSF11-215	ENST00000486667	SSH2	Q76I76	1423 aa		13.74	□□□□□ -0.21
SRSF11-215	ENST00000486667	MAP2	P11137	1827 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
SRSF11-215	ENST00000486667	ACE	P12821	1306 aa		13.74	□□□□□ -0.21
SRSF11-215	ENST00000486667	CERK	Q8TCT0	537 aa		13.74	□□□□□ -0.21
SRSF11-215	ENST00000486667	GGNBP2	Q9H3C7	697 aa		13.74	□□□□□ -0.21
SRSF11-215	ENST00000486667	SHPRH	Q149N8	1683 aa		13.74	□□□□□ -0.21
SRSF11-215	ENST00000486667	TTC21A	Q8NDW8	1320 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SRSF11-215	ENST00000486667	MTHFS	P49914	203 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SRSF11-215	ENST00000486667	HSPA2	P54652	639 aa		13.72	□□□□□ -0.21

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.6 ms