RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485532.1

PRAME-212, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 3

Gene PRAME, Length 709 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-212ENST00000485532 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa18.79■□□□□ 0.6
PRAME-212ENST00000485532 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP18.78■□□□□ 0.6
PRAME-212ENST00000485532 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa18.78■□□□□ 0.6
PRAME-212ENST00000485532 PIK3C2GO75747 1445 aa18.78■□□□□ 0.6
PRAME-212ENST00000485532 NUTM2FA1L443 756 aa18.78■□□□□ 0.6
PRAME-212ENST00000485532 ADAMTS2O95450 1211 aa18.78■□□□□ 0.6
PRAME-212ENST00000485532 ESCO1Q5FWF5 840 aa18.77■□□□□ 0.6
PRAME-212ENST00000485532 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP18.77■□□□□ 0.6
PRAME-212ENST00000485532 KNDC1Q76NI1 1749 aa18.76■□□□□ 0.59
PRAME-212ENST00000485532 TECPR2O15040 1411 aa18.75■□□□□ 0.59
PRAME-212ENST00000485532 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP18.75■□□□□ 0.59
PRAME-212ENST00000485532 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa18.74■□□□□ 0.59
PRAME-212ENST00000485532 ABCC11Q96J66 1382 aa18.73■□□□□ 0.59
PRAME-212ENST00000485532 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP18.73■□□□□ 0.59
PRAME-212ENST00000485532 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP18.73■□□□□ 0.59
PRAME-212ENST00000485532 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP18.73■□□□□ 0.59
PRAME-212ENST00000485532 PXDNQ92626 1479 aa18.72■□□□□ 0.59
PRAME-212ENST00000485532 FOXO3O43524 673 aa18.72■□□□□ 0.59
PRAME-212ENST00000485532 NGLY1Q96IV0 654 aa18.72■□□□□ 0.59
PRAME-212ENST00000485532 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP18.71■□□□□ 0.59
PRAME-212ENST00000485532 CFAP70Q5T0N1 1121 aa18.71■□□□□ 0.59
PRAME-212ENST00000485532 FMN2Q9NZ56 1722 aa18.71■□□□□ 0.59
PRAME-212ENST00000485532 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP18.71■□□□□ 0.59
PRAME-212ENST00000485532 RGS12O14924 1447 aa18.7■□□□□ 0.58
PRAME-212ENST00000485532 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP18.7■□□□□ 0.58
PRAME-212ENST00000485532 NRXN1Q9ULB1 1477 aa18.7■□□□□ 0.58
PRAME-212ENST00000485532 NPHP3Q7Z494 1330 aa18.7■□□□□ 0.58
PRAME-212ENST00000485532 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP18.69■□□□□ 0.58
PRAME-212ENST00000485532 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP18.68■□□□□ 0.58
PRAME-212ENST00000485532 MYOM2P54296 1465 aa18.67■□□□□ 0.58
PRAME-212ENST00000485532 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP18.66■□□□□ 0.58
PRAME-212ENST00000485532 USP21Q9UK80 565 aa18.66■□□□□ 0.58
PRAME-212ENST00000485532 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP18.65■□□□□ 0.58
PRAME-212ENST00000485532 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP18.64■□□□□ 0.57
PRAME-212ENST00000485532 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP18.64■□□□□ 0.57
PRAME-212ENST00000485532 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP18.63■□□□□ 0.57
PRAME-212ENST00000485532 PRAM1Q96QH2 718 aa18.63■□□□□ 0.57
PRAME-212ENST00000485532 KIF1AQ12756 1690 aa18.63■□□□□ 0.57
PRAME-212ENST00000485532 SIRT1Q96EB6 747 aa18.62■□□□□ 0.57
PRAME-212ENST00000485532 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa18.61■□□□□ 0.57
PRAME-212ENST00000485532 ATRNO75882 1429 aa18.6■□□□□ 0.57
PRAME-212ENST00000485532 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa18.6■□□□□ 0.57
PRAME-212ENST00000485532 KRT28Q7Z3Y7 464 aa18.6■□□□□ 0.57
PRAME-212ENST00000485532 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP18.6■□□□□ 0.57
PRAME-212ENST00000485532 BCL9LQ86UU0 1499 aa18.59■□□□□ 0.57
PRAME-212ENST00000485532 ADGRB1O14514 1584 aa18.59■□□□□ 0.57
PRAME-212ENST00000485532 PLEKHG5O94827 1062 aa18.58■□□□□ 0.56
PRAME-212ENST00000485532 PHF8Q9UPP1 1060 aa18.58■□□□□ 0.56
PRAME-212ENST00000485532 TRAK1Q9UPV9 953 aa18.58■□□□□ 0.56
PRAME-212ENST00000485532 USP32Q8NFA0 1604 aa18.58■□□□□ 0.56
PRAME-212ENST00000485532 DCAF11Q8TEB1 546 aa18.57■□□□□ 0.56
PRAME-212ENST00000485532 POGKQ9P215 609 aa18.57■□□□□ 0.56
PRAME-212ENST00000485532 DLC1Q96QB1 1528 aa18.57■□□□□ 0.56
PRAME-212ENST00000485532 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP18.56■□□□□ 0.56
PRAME-212ENST00000485532 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa18.55■□□□□ 0.56
PRAME-212ENST00000485532 CABLES1Q8TDN4 633 aa18.55■□□□□ 0.56
PRAME-212ENST00000485532 TNS3Q68CZ2 1445 aa18.54■□□□□ 0.56
PRAME-212ENST00000485532 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP18.53■□□□□ 0.56
PRAME-212ENST00000485532 ADGRB2O60241 1585 aa18.53■□□□□ 0.56
PRAME-212ENST00000485532 EP400Q96L91 3159 aa18.53■□□□□ 0.56
PRAME-212ENST00000485532 ABCA3Q99758 1704 aa18.52■□□□□ 0.56
PRAME-212ENST00000485532 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP18.52■□□□□ 0.56
PRAME-212ENST00000485532 SLIT2O94813 1529 aa18.51■□□□□ 0.55
PRAME-212ENST00000485532 LMOD2Q6P5Q4 547 aa18.51■□□□□ 0.55
PRAME-212ENST00000485532 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP18.51■□□□□ 0.55
PRAME-212ENST00000485532 ATAD2Q6PL18 1390 aa18.51■□□□□ 0.55
PRAME-212ENST00000485532 PRR36Q9H6K5 1346 aa18.5■□□□□ 0.55
PRAME-212ENST00000485532 PSME1Q06323 249 aa18.5■□□□□ 0.55
PRAME-212ENST00000485532 GLI3P10071 1580 aa18.5■□□□□ 0.55
PRAME-212ENST00000485532 ANKARQ7Z5J8 1434 aa18.49■□□□□ 0.55
PRAME-212ENST00000485532 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
PRAME-212ENST00000485532 UNC5CLQ8IV45 518 aa18.49■□□□□ 0.55
PRAME-212ENST00000485532 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
PRAME-212ENST00000485532 PLCH1Q4KWH8 1693 aa18.48■□□□□ 0.55
PRAME-212ENST00000485532 RALGAPBQ86X10 1494 aa18.48■□□□□ 0.55
PRAME-212ENST00000485532 SBNO1A3KN83 1393 aa18.48■□□□□ 0.55
PRAME-212ENST00000485532 HRCP23327 699 aa18.48■□□□□ 0.55
PRAME-212ENST00000485532 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
PRAME-212ENST00000485532 TULP4Q9NRJ4 1543 aa18.46■□□□□ 0.55
PRAME-212ENST00000485532 BRWD3Q6RI45 1802 aa18.46■□□□□ 0.55
PRAME-212ENST00000485532 WASLO00401 505 aaPredicted RBP18.45■□□□□ 0.54
PRAME-212ENST00000485532 ALS2Q96Q42 1657 aa18.44■□□□□ 0.54
PRAME-212ENST00000485532 ARHGEF10O15013 1369 aa18.44■□□□□ 0.54
PRAME-212ENST00000485532 NWD2Q9ULI1 1742 aa18.43■□□□□ 0.54
PRAME-212ENST00000485532 FAM83GA6ND36 823 aa18.42■□□□□ 0.54
PRAME-212ENST00000485532 STAC3Q96MF2 364 aa18.41■□□□□ 0.54
PRAME-212ENST00000485532 VPS72Q15906 364 aa18.4■□□□□ 0.54
PRAME-212ENST00000485532 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP18.4■□□□□ 0.54
PRAME-212ENST00000485532 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP18.4■□□□□ 0.54
PRAME-212ENST00000485532 GPRASP1Q5JY77 1395 aa18.4■□□□□ 0.54
PRAME-212ENST00000485532 ATP7BP35670 1465 aa18.39■□□□□ 0.54
PRAME-212ENST00000485532 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP18.39■□□□□ 0.53
PRAME-212ENST00000485532 NRAPQ86VF7 1730 aa18.39■□□□□ 0.53
PRAME-212ENST00000485532 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa18.39■□□□□ 0.53
PRAME-212ENST00000485532 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP18.38■□□□□ 0.53
PRAME-212ENST00000485532 NBPF1Q3BBV0 1214 aa18.38■□□□□ 0.53
PRAME-212ENST00000485532 SEPT12Q8IYM1 358 aa18.38■□□□□ 0.53
PRAME-212ENST00000485532 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP18.38■□□□□ 0.53
PRAME-212ENST00000485532 ITSN1Q15811 1721 aa18.37■□□□□ 0.53
PRAME-212ENST00000485532 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.3 ms