RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471759.5

RABGGTB-208, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTB, Length 2,137 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-208ENST00000471759 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
RABGGTB-208ENST00000471759 FSD2A1L4K1 749 aa8.36□□□□□ -1.07
RABGGTB-208ENST00000471759 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
RABGGTB-208ENST00000471759 CPS1P31327 1500 aa8.35□□□□□ -1.07
RABGGTB-208ENST00000471759 PSMD1Q99460 953 aa8.35□□□□□ -1.07
RABGGTB-208ENST00000471759 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
RABGGTB-208ENST00000471759 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
RABGGTB-208ENST00000471759 E9PSI1 815 aa8.35□□□□□ -1.07
RABGGTB-208ENST00000471759 TOM1O60784 492 aa8.35□□□□□ -1.07
RABGGTB-208ENST00000471759 MLH3Q9UHC1 1453 aa8.34□□□□□ -1.07
RABGGTB-208ENST00000471759 ARHGAP5Q13017 1502 aa8.34□□□□□ -1.07
RABGGTB-208ENST00000471759 CCDC66A2RUB6 948 aa8.33□□□□□ -1.08
RABGGTB-208ENST00000471759 SPDYE4A6NLX3 237 aa8.33□□□□□ -1.08
RABGGTB-208ENST00000471759 SLC52A1Q9NWF4 448 aa8.33□□□□□ -1.08
RABGGTB-208ENST00000471759 POGKQ9P215 609 aa8.33□□□□□ -1.08
RABGGTB-208ENST00000471759 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
RABGGTB-208ENST00000471759 ZBED9Q6R2W3 1325 aa8.33□□□□□ -1.08
RABGGTB-208ENST00000471759 NBPF20Q3BBV1 942 aa8.33□□□□□ -1.08
RABGGTB-208ENST00000471759 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
RABGGTB-208ENST00000471759 KIF14Q15058 1648 aa8.33□□□□□ -1.08
RABGGTB-208ENST00000471759 ITSN2Q9NZM3 1697 aa8.33□□□□□ -1.08
RABGGTB-208ENST00000471759 MSNP26038 577 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
RABGGTB-208ENST00000471759 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa8.32□□□□□ -1.08
RABGGTB-208ENST00000471759 PROM2Q8N271 834 aa8.32□□□□□ -1.08
RABGGTB-208ENST00000471759 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
RABGGTB-208ENST00000471759 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
RABGGTB-208ENST00000471759 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
RABGGTB-208ENST00000471759 AFAP1Q8N556 730 aa8.32□□□□□ -1.08
RABGGTB-208ENST00000471759 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
RABGGTB-208ENST00000471759 CARD10Q9BWT7 1032 aa8.32□□□□□ -1.08
RABGGTB-208ENST00000471759 EFCC1Q9HA90 598 aa8.32□□□□□ -1.08
RABGGTB-208ENST00000471759 PTPRKQ15262 1439 aa8.31□□□□□ -1.08
RABGGTB-208ENST00000471759 BECN1Q14457 450 aa8.31□□□□□ -1.08
RABGGTB-208ENST00000471759 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
RABGGTB-208ENST00000471759 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa8.31□□□□□ -1.08
RABGGTB-208ENST00000471759 ALKQ9UM73 1620 aa8.31□□□□□ -1.08
RABGGTB-208ENST00000471759 CEP162Q5TB80 1403 aa8.3□□□□□ -1.08
RABGGTB-208ENST00000471759 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa8.3□□□□□ -1.08
RABGGTB-208ENST00000471759 SHANK2Q9UPX8 1470 aa8.3□□□□□ -1.08
RABGGTB-208ENST00000471759 ABCC1P33527 1531 aa8.3□□□□□ -1.08
RABGGTB-208ENST00000471759 UQCRHLA0A096LP55 91 aa8.3□□□□□ -1.08
RABGGTB-208ENST00000471759 UQCRHP07919 91 aa8.3□□□□□ -1.08
RABGGTB-208ENST00000471759 ZSCAN30Q86W11 494 aa8.3□□□□□ -1.08
RABGGTB-208ENST00000471759 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa8.3□□□□□ -1.08
RABGGTB-208ENST00000471759 RNF123Q5XPI4 1314 aa8.3□□□□□ -1.08
RABGGTB-208ENST00000471759 ZMYM3Q14202 1370 aa8.3□□□□□ -1.08
RABGGTB-208ENST00000471759 CHGAP10645 457 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
RABGGTB-208ENST00000471759 LMOD3Q0VAK6 560 aa8.29□□□□□ -1.08
RABGGTB-208ENST00000471759 AEBP1Q8IUX7 1158 aa8.29□□□□□ -1.08
RABGGTB-208ENST00000471759 NEURL4Q96JN8 1562 aa8.29□□□□□ -1.08
RABGGTB-208ENST00000471759 SOX12O15370 315 aa8.29□□□□□ -1.08
RABGGTB-208ENST00000471759 KIF3AQ9Y496 699 aa8.29□□□□□ -1.08
RABGGTB-208ENST00000471759 PREX2Q70Z35 1606 aa8.29□□□□□ -1.08
RABGGTB-208ENST00000471759 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
RABGGTB-208ENST00000471759 KCNJ4P48050 445 aa8.28□□□□□ -1.08
RABGGTB-208ENST00000471759 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
RABGGTB-208ENST00000471759 EGFL6Q8IUX8 553 aa8.28□□□□□ -1.08
RABGGTB-208ENST00000471759 TIGD1Q96MW7 591 aa8.28□□□□□ -1.08
RABGGTB-208ENST00000471759 A2ML1A8K2U0 1454 aa8.28□□□□□ -1.08
RABGGTB-208ENST00000471759 VWDEQ8N2E2 1590 aa8.28□□□□□ -1.08
RABGGTB-208ENST00000471759 NBPF1Q3BBV0 1214 aa8.27□□□□□ -1.08
RABGGTB-208ENST00000471759 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.08
RABGGTB-208ENST00000471759 BANK1Q8NDB2 785 aa8.27□□□□□ -1.08
RABGGTB-208ENST00000471759 GRPEL1Q9HAV7 217 aa8.27□□□□□ -1.08
RABGGTB-208ENST00000471759 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.08
RABGGTB-208ENST00000471759 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
RABGGTB-208ENST00000471759 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
RABGGTB-208ENST00000471759 IGSF3O75054 1194 aa8.27□□□□□ -1.09
RABGGTB-208ENST00000471759 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
RABGGTB-208ENST00000471759 CCDC173Q0VFZ6 552 aa8.26□□□□□ -1.09
RABGGTB-208ENST00000471759 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
RABGGTB-208ENST00000471759 ERBB4Q15303 1308 aa8.26□□□□□ -1.09
RABGGTB-208ENST00000471759 HS1BP3Q53T59 392 aa8.26□□□□□ -1.09
RABGGTB-208ENST00000471759 TMC1Q8TDI8 760 aa8.26□□□□□ -1.09
RABGGTB-208ENST00000471759 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
RABGGTB-208ENST00000471759 CLIP1P30622 1438 aa8.26□□□□□ -1.09
RABGGTB-208ENST00000471759 SASS6Q6UVJ0 657 aa8.26□□□□□ -1.09
RABGGTB-208ENST00000471759 PANK2Q9BZ23 570 aa8.26□□□□□ -1.09
RABGGTB-208ENST00000471759 C1orf115Q9H7X2 142 aa8.26□□□□□ -1.09
RABGGTB-208ENST00000471759 SYNMO15061 1565 aa8.25□□□□□ -1.09
RABGGTB-208ENST00000471759 CTR9Q6PD62 1173 aa8.25□□□□□ -1.09
RABGGTB-208ENST00000471759 CERS3Q8IU89 383 aa8.25□□□□□ -1.09
RABGGTB-208ENST00000471759 NGEFQ8N5V2 710 aa8.25□□□□□ -1.09
RABGGTB-208ENST00000471759 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa8.25□□□□□ -1.09
RABGGTB-208ENST00000471759 NINLQ9Y2I6 1382 aa8.25□□□□□ -1.09
RABGGTB-208ENST00000471759 SLC4A3P48751 1232 aa8.24□□□□□ -1.09
RABGGTB-208ENST00000471759 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
RABGGTB-208ENST00000471759 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa8.24□□□□□ -1.09
RABGGTB-208ENST00000471759 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
RABGGTB-208ENST00000471759 PLXNC1O60486 1568 aa8.24□□□□□ -1.09
RABGGTB-208ENST00000471759 CBX1P83916 185 aa8.23□□□□□ -1.09
RABGGTB-208ENST00000471759 SATB1Q01826 763 aa8.23□□□□□ -1.09
RABGGTB-208ENST00000471759 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
RABGGTB-208ENST00000471759 NBPF11Q86T75 865 aa8.23□□□□□ -1.09
RABGGTB-208ENST00000471759 GPATCH11Q8N954 259 aa8.23□□□□□ -1.09
RABGGTB-208ENST00000471759 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
RABGGTB-208ENST00000471759 TTC36A6NLP5 189 aa8.23□□□□□ -1.09
RABGGTB-208ENST00000471759 SIN3AQ96ST3 1273 aa8.23□□□□□ -1.09
RABGGTB-208ENST00000471759 STRCP1A6NGW2 1772 aa8.22□□□□□ -1.09
RABGGTB-208ENST00000471759 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 201 ms