RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460558.5

ECHDC1-211, Transcript of ethylmalonyl-CoA decarboxylase 1, humanhuman

TSL 5

Gene ECHDC1, Length 301 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC1-211ENST00000460558 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
ECHDC1-211ENST00000460558 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
ECHDC1-211ENST00000460558 UBR1Q8IWV7 1749 aa6.8□□□□□ -1.32
ECHDC1-211ENST00000460558 MIA2Q96PC5 1412 aa6.8□□□□□ -1.32
ECHDC1-211ENST00000460558 MAP3K1Q13233 1512 aa6.8□□□□□ -1.32
ECHDC1-211ENST00000460558 SYCP2Q9BX26 1530 aa6.8□□□□□ -1.32
ECHDC1-211ENST00000460558 TMEM94Q12767 1356 aa6.8□□□□□ -1.32
ECHDC1-211ENST00000460558 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
ECHDC1-211ENST00000460558 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa6.79□□□□□ -1.32
ECHDC1-211ENST00000460558 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
ECHDC1-211ENST00000460558 AFF2P51816 1311 aa6.78□□□□□ -1.32
ECHDC1-211ENST00000460558 ZMYND10O75800 440 aa6.78□□□□□ -1.32
ECHDC1-211ENST00000460558 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
ECHDC1-211ENST00000460558 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
ECHDC1-211ENST00000460558 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
ECHDC1-211ENST00000460558 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
ECHDC1-211ENST00000460558 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa6.78□□□□□ -1.32
ECHDC1-211ENST00000460558 MSH6P52701 1360 aa6.78□□□□□ -1.32
ECHDC1-211ENST00000460558 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.32
ECHDC1-211ENST00000460558 ABCC3O15438 1527 aa6.77□□□□□ -1.33
ECHDC1-211ENST00000460558 NHSL1Q5SYE7 1610 aa6.77□□□□□ -1.33
ECHDC1-211ENST00000460558 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
ECHDC1-211ENST00000460558 EP400Q96L91 3159 aa6.77□□□□□ -1.33
ECHDC1-211ENST00000460558 YY1P25490 414 aa6.77□□□□□ -1.33
ECHDC1-211ENST00000460558 SMYD5Q6GMV2 418 aa6.77□□□□□ -1.33
ECHDC1-211ENST00000460558 CCDC125Q86Z20 511 aa6.77□□□□□ -1.33
ECHDC1-211ENST00000460558 SLAIN2Q9P270 581 aa6.77□□□□□ -1.33
ECHDC1-211ENST00000460558 NWD1Q149M9 1564 aa6.77□□□□□ -1.33
ECHDC1-211ENST00000460558 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
ECHDC1-211ENST00000460558 NGLY1Q96IV0 654 aa6.76□□□□□ -1.33
ECHDC1-211ENST00000460558 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa6.76□□□□□ -1.33
ECHDC1-211ENST00000460558 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
ECHDC1-211ENST00000460558 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
ECHDC1-211ENST00000460558 CLCN6P51797 869 aa6.75□□□□□ -1.33
ECHDC1-211ENST00000460558 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa6.75□□□□□ -1.33
ECHDC1-211ENST00000460558 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
ECHDC1-211ENST00000460558 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP6.75□□□□□ -1.336e-7■■□□□ 12.9
ECHDC1-211ENST00000460558 SLIT1O75093 1534 aa6.75□□□□□ -1.33
ECHDC1-211ENST00000460558 FMN1Q68DA7 1419 aa6.75□□□□□ -1.33
ECHDC1-211ENST00000460558 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa6.74□□□□□ -1.33
ECHDC1-211ENST00000460558 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
ECHDC1-211ENST00000460558 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
ECHDC1-211ENST00000460558 TRIM35Q9UPQ4 493 aa6.74□□□□□ -1.33
ECHDC1-211ENST00000460558 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa6.74□□□□□ -1.33
ECHDC1-211ENST00000460558 DIP2AQ14689 1571 aa6.74□□□□□ -1.33
ECHDC1-211ENST00000460558 ARHGAP23Q9P227 1491 aa6.73□□□□□ -1.33
ECHDC1-211ENST00000460558 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
ECHDC1-211ENST00000460558 KCNA6P17658 529 aa6.73□□□□□ -1.33
ECHDC1-211ENST00000460558 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP6.73□□□□□ -1.333e-8■■■■■ 29
ECHDC1-211ENST00000460558 BARGINQ6ZT62 677 aa6.73□□□□□ -1.33
ECHDC1-211ENST00000460558 TXNDC2Q86VQ3 553 aa6.73□□□□□ -1.33
ECHDC1-211ENST00000460558 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
ECHDC1-211ENST00000460558 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa6.73□□□□□ -1.33
ECHDC1-211ENST00000460558 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
ECHDC1-211ENST00000460558 FOXK1P85037 733 aa6.72□□□□□ -1.33
ECHDC1-211ENST00000460558 PDIA6Q15084 440 aa6.72□□□□□ -1.33
ECHDC1-211ENST00000460558 ERICH6Q7L0X2 663 aa6.72□□□□□ -1.33
ECHDC1-211ENST00000460558 MICALL2Q8IY33 904 aa6.72□□□□□ -1.33
ECHDC1-211ENST00000460558 SLC24A3Q9HC58 644 aa6.72□□□□□ -1.33
ECHDC1-211ENST00000460558 EMILIN3Q9NT22 766 aa6.72□□□□□ -1.33
ECHDC1-211ENST00000460558 EID1Q9Y6B2 187 aa6.72□□□□□ -1.33
ECHDC1-211ENST00000460558 NCOA2Q15596 1464 aa6.72□□□□□ -1.33
ECHDC1-211ENST00000460558 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa6.71□□□□□ -1.34
ECHDC1-211ENST00000460558 KIF3BO15066 747 aa6.71□□□□□ -1.34
ECHDC1-211ENST00000460558 LTKP29376 864 aa6.71□□□□□ -1.34
ECHDC1-211ENST00000460558 DSG2Q14126 1118 aa6.71□□□□□ -1.34
ECHDC1-211ENST00000460558 DPY19L2Q6NUT2 758 aa6.71□□□□□ -1.34
ECHDC1-211ENST00000460558 C8orf37Q96NL8 207 aa6.71□□□□□ -1.34
ECHDC1-211ENST00000460558 ERVK-7P63135 1459 aa6.71□□□□□ -1.34
ECHDC1-211ENST00000460558 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
ECHDC1-211ENST00000460558 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
ECHDC1-211ENST00000460558 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
ECHDC1-211ENST00000460558 KIF3CO14782 793 aa6.7□□□□□ -1.34
ECHDC1-211ENST00000460558 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
ECHDC1-211ENST00000460558 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
ECHDC1-211ENST00000460558 IER5LQ5T953 404 aa6.7□□□□□ -1.34
ECHDC1-211ENST00000460558 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa6.69□□□□□ -1.34
ECHDC1-211ENST00000460558 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
ECHDC1-211ENST00000460558 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
ECHDC1-211ENST00000460558 CEP152O94986 1710 aa6.69□□□□□ -1.34
ECHDC1-211ENST00000460558 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
ECHDC1-211ENST00000460558 BRWD3Q6RI45 1802 aa6.69□□□□□ -1.34
ECHDC1-211ENST00000460558 CHD4Q14839 1912 aa6.68□□□□□ -1.34
ECHDC1-211ENST00000460558 CCDC18Q5T9S5 1454 aa6.68□□□□□ -1.34
ECHDC1-211ENST00000460558 HRCP23327 699 aa6.68□□□□□ -1.34
ECHDC1-211ENST00000460558 PIK3C2BO00750 1634 aa6.68□□□□□ -1.34
ECHDC1-211ENST00000460558 TET3O43151 1660 aa6.68□□□□□ -1.34
ECHDC1-211ENST00000460558 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa6.67□□□□□ -1.34
ECHDC1-211ENST00000460558 DPYSL4O14531 572 aa6.67□□□□□ -1.34
ECHDC1-211ENST00000460558 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
ECHDC1-211ENST00000460558 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
ECHDC1-211ENST00000460558 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
ECHDC1-211ENST00000460558 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
ECHDC1-211ENST00000460558 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
ECHDC1-211ENST00000460558 MROH1Q8NDA8 1641 aa6.67□□□□□ -1.34
ECHDC1-211ENST00000460558 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa6.67□□□□□ -1.34
ECHDC1-211ENST00000460558 SETD5Q9C0A6 1442 aa6.67□□□□□ -1.34
ECHDC1-211ENST00000460558 BCL9LQ86UU0 1499 aa6.66□□□□□ -1.34
ECHDC1-211ENST00000460558 UNC13BO14795 1591 aa6.66□□□□□ -1.34
ECHDC1-211ENST00000460558 MAST1Q9Y2H9 1570 aa6.66□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 69.4 ms