RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000448310.1

CBX4-202, Transcript of chromobox 4, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 3 BASIC

Gene CBX4, Length 718 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX4-202ENST00000448310 C8orf37Q96NL8 207 aa42.01■■■■■ 4.32
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CBX4-202ENST00000448310 WAPLQ7Z5K2 1190 aa42■■■■■ 4.31
CBX4-202ENST00000448310 TECPR2O15040 1411 aa42■■■■■ 4.31
CBX4-202ENST00000448310 RXRBP28702 533 aa41.98■■■■■ 4.31
CBX4-202ENST00000448310 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa41.95■■■■■ 4.31
CBX4-202ENST00000448310 ABCC11Q96J66 1382 aa41.94■■■■■ 4.3
CBX4-202ENST00000448310 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa41.94■■■■■ 4.3
CBX4-202ENST00000448310 ADAMTS2O95450 1211 aa41.94■■■■■ 4.3
CBX4-202ENST00000448310 ESCO1Q5FWF5 840 aa41.94■■■■■ 4.3
CBX4-202ENST00000448310 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP41.94■■■■■ 4.3
CBX4-202ENST00000448310 NUTM2FA1L443 756 aa41.91■■■■■ 4.3
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CBX4-202ENST00000448310 FMN2Q9NZ56 1722 aa41.85■■■■■ 4.29
CBX4-202ENST00000448310 NPHP3Q7Z494 1330 aa41.85■■■■■ 4.29
CBX4-202ENST00000448310 PXDNQ92626 1479 aa41.85■■■■■ 4.29
CBX4-202ENST00000448310 NRXN1Q9ULB1 1477 aa41.85■■■■■ 4.29
CBX4-202ENST00000448310 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP41.84■■■■■ 4.29
CBX4-202ENST00000448310 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP41.84■■■■■ 4.29
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CBX4-202ENST00000448310 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP41.83■■■■■ 4.29
CBX4-202ENST00000448310 MYOM2P54296 1465 aa41.83■■■■■ 4.29
CBX4-202ENST00000448310 CFAP70Q5T0N1 1121 aa41.82■■■■■ 4.29
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CBX4-202ENST00000448310 SIRT1Q96EB6 747 aa41.72■■■■■ 4.27
CBX4-202ENST00000448310 KIF1AQ12756 1690 aa41.71■■■■■ 4.27
CBX4-202ENST00000448310 USP21Q9UK80 565 aa41.71■■■■■ 4.27
CBX4-202ENST00000448310 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP41.7■■■■■ 4.27
CBX4-202ENST00000448310 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP41.67■■■■■ 4.26
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CBX4-202ENST00000448310 PRAM1Q96QH2 718 aa41.65■■■■■ 4.26
CBX4-202ENST00000448310 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP41.62■■■■■ 4.25
CBX4-202ENST00000448310 DLC1Q96QB1 1528 aa41.59■■■■■ 4.25
CBX4-202ENST00000448310 ADGRB1O14514 1584 aa41.59■■■■■ 4.25
CBX4-202ENST00000448310 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa41.58■■■■■ 4.25
CBX4-202ENST00000448310 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa41.58■■■■■ 4.25
CBX4-202ENST00000448310 ATRNO75882 1429 aa41.58■■■■■ 4.25
CBX4-202ENST00000448310 KRT28Q7Z3Y7 464 aa41.57■■■■■ 4.25
CBX4-202ENST00000448310 POGKQ9P215 609 aa41.56■■■■■ 4.24
CBX4-202ENST00000448310 PHF8Q9UPP1 1060 aa41.56■■■■■ 4.24
CBX4-202ENST00000448310 DCAF11Q8TEB1 546 aa41.54■■■■■ 4.24
CBX4-202ENST00000448310 BCL9LQ86UU0 1499 aa41.53■■■■■ 4.24
CBX4-202ENST00000448310 USP32Q8NFA0 1604 aa41.52■■■■■ 4.24
CBX4-202ENST00000448310 TRAK1Q9UPV9 953 aa41.51■■■■■ 4.24
CBX4-202ENST00000448310 ADGRB2O60241 1585 aa41.49■■■■■ 4.23
CBX4-202ENST00000448310 TNS3Q68CZ2 1445 aa41.47■■■■■ 4.23
CBX4-202ENST00000448310 HRCP23327 699 aa41.47■■■■■ 4.23
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CBX4-202ENST00000448310 ANKARQ7Z5J8 1434 aa41.43■■■■■ 4.22
CBX4-202ENST00000448310 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP41.43■■■■■ 4.22
CBX4-202ENST00000448310 ATAD2Q6PL18 1390 aa41.4■■■■■ 4.22
CBX4-202ENST00000448310 CABLES1Q8TDN4 633 aa41.4■■■■■ 4.22
CBX4-202ENST00000448310 ABCA3Q99758 1704 aa41.39■■■■■ 4.22
CBX4-202ENST00000448310 SLIT2O94813 1529 aa41.39■■■■■ 4.22
CBX4-202ENST00000448310 SBNO1A3KN83 1393 aa41.38■■■■■ 4.22
CBX4-202ENST00000448310 LMOD2Q6P5Q4 547 aa41.38■■■■■ 4.21
CBX4-202ENST00000448310 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP41.37■■■■■ 4.21
CBX4-202ENST00000448310 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP41.37■■■■■ 4.21
CBX4-202ENST00000448310 UNC5CLQ8IV45 518 aa41.34■■■■■ 4.21
CBX4-202ENST00000448310 STAC3Q96MF2 364 aa41.34■■■■■ 4.21
CBX4-202ENST00000448310 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP41.34■■■■■ 4.21
CBX4-202ENST00000448310 PRR36Q9H6K5 1346 aa41.33■■■■■ 4.21
CBX4-202ENST00000448310 TULP4Q9NRJ4 1543 aa41.32■■■■■ 4.2
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CBX4-202ENST00000448310 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP41.32■■■■■ 4.2
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CBX4-202ENST00000448310 PLCH1Q4KWH8 1693 aa41.31■■■■■ 4.2
CBX4-202ENST00000448310 RALGAPBQ86X10 1494 aa41.29■■■■■ 4.2
CBX4-202ENST00000448310 WASLO00401 505 aaPredicted RBP41.28■■■■■ 4.2
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CBX4-202ENST00000448310 GPRASP1Q5JY77 1395 aa41.22■■■■■ 4.19
CBX4-202ENST00000448310 BRWD3Q6RI45 1802 aa41.2■■■■■ 4.19
CBX4-202ENST00000448310 ITSN1Q15811 1721 aa41.17■■■■■ 4.18
CBX4-202ENST00000448310 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa41.15■■■■■ 4.18
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CBX4-202ENST00000448310 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP41.15■■■■■ 4.18
CBX4-202ENST00000448310 VPS72Q15906 364 aa41.14■■■■■ 4.18
CBX4-202ENST00000448310 ATP7BP35670 1465 aa41.14■■■■■ 4.18
CBX4-202ENST00000448310 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP41.12■■■■■ 4.17
CBX4-202ENST00000448310 NRAPQ86VF7 1730 aa41.1■■■■■ 4.17
CBX4-202ENST00000448310 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa41.1■■■■■ 4.17
CBX4-202ENST00000448310 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP41.1■■■■■ 4.17
CBX4-202ENST00000448310 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP41.09■■■■■ 4.17
CBX4-202ENST00000448310 SEPT12Q8IYM1 358 aa41.08■■■■■ 4.17
CBX4-202ENST00000448310 NBPF1Q3BBV0 1214 aa41.06■■■■■ 4.16
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