RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436282.1

TOP3B-206, Transcript of DNA topoisomerase III beta, humanhuman

TSL 2

Gene TOP3B, Length 2,890 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3B-206ENST00000436282 SEC24BO95487 1268 aa19.15■□□□□ 0.66
TOP3B-206ENST00000436282 CARD14Q9BXL6 1004 aa19.15■□□□□ 0.66
TOP3B-206ENST00000436282 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP19.14■□□□□ 0.66
TOP3B-206ENST00000436282 ABCA6Q8N139 1617 aa19.14■□□□□ 0.65
TOP3B-206ENST00000436282 POGKQ9P215 609 aa19.14■□□□□ 0.65
TOP3B-206ENST00000436282 MYOM2P54296 1465 aa19.14■□□□□ 0.65
TOP3B-206ENST00000436282 ERVK-7P63135 1459 aa19.13■□□□□ 0.65
TOP3B-206ENST00000436282 KIF1BO60333 1816 aa19.13■□□□□ 0.65
TOP3B-206ENST00000436282 DMRT2Q9Y5R5 561 aa19.13■□□□□ 0.65
TOP3B-206ENST00000436282 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa19.12■□□□□ 0.65
TOP3B-206ENST00000436282 SLC24A1O60721 1099 aa19.12■□□□□ 0.65
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TOP3B-206ENST00000436282 ZMYM3Q14202 1370 aa19.12■□□□□ 0.65
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TOP3B-206ENST00000436282 MROH2AA6NES4 1674 aa19.1■□□□□ 0.65
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TOP3B-206ENST00000436282 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa19.09■□□□□ 0.65
TOP3B-206ENST00000436282 MLH3Q9UHC1 1453 aa19.09■□□□□ 0.65
TOP3B-206ENST00000436282 LMTK2Q8IWU2 1503 aa19.08■□□□□ 0.65
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TOP3B-206ENST00000436282 WWC1Q8IX03 1113 aa19.08■□□□□ 0.64
TOP3B-206ENST00000436282 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa19.08■□□□□ 0.64
TOP3B-206ENST00000436282 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP19.07■□□□□ 0.64
TOP3B-206ENST00000436282 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP19.06■□□□□ 0.64
TOP3B-206ENST00000436282 NEURL4Q96JN8 1562 aa19.06■□□□□ 0.64
TOP3B-206ENST00000436282 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP19.06■□□□□ 0.64
TOP3B-206ENST00000436282 TBC1D32Q96NH3 1257 aa19.06■□□□□ 0.64
TOP3B-206ENST00000436282 ADGRB3O60242 1522 aa19.05■□□□□ 0.64
TOP3B-206ENST00000436282 HECW2Q9P2P5 1572 aa19.05■□□□□ 0.64
TOP3B-206ENST00000436282 NRXN1Q9ULB1 1477 aa19.04■□□□□ 0.64
TOP3B-206ENST00000436282 MORC1Q86VD1 984 aa19.04■□□□□ 0.64
TOP3B-206ENST00000436282 CYB5RLQ6IPT4 315 aa19.03■□□□□ 0.64
TOP3B-206ENST00000436282 SHPRHQ149N8 1683 aa19.03■□□□□ 0.64
TOP3B-206ENST00000436282 CFAP74Q9C0B2 1584 aa19.02■□□□□ 0.64
TOP3B-206ENST00000436282 ABCC3O15438 1527 aa19.02■□□□□ 0.64
TOP3B-206ENST00000436282 RARSP54136 660 aaKnown RBP19.02■□□□□ 0.64
TOP3B-206ENST00000436282 TBC1D2Q9BYX2 928 aa19.02■□□□□ 0.64
TOP3B-206ENST00000436282 NSD3Q9BZ95 1437 aa19.01■□□□□ 0.63
TOP3B-206ENST00000436282 IDI1Q13907 227 aa19.01■□□□□ 0.63
TOP3B-206ENST00000436282 STK26Q9P289 416 aa19.01■□□□□ 0.63
TOP3B-206ENST00000436282 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa19.01■□□□□ 0.63
TOP3B-206ENST00000436282 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa19.01■□□□□ 0.63
TOP3B-206ENST00000436282 IFT172Q9UG01 1749 aa19.01■□□□□ 0.63
TOP3B-206ENST00000436282 VGFO15240 615 aaPredicted RBP19■□□□□ 0.63
TOP3B-206ENST00000436282 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP19■□□□□ 0.63
TOP3B-206ENST00000436282 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa19■□□□□ 0.63
TOP3B-206ENST00000436282 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa19■□□□□ 0.63
TOP3B-206ENST00000436282 IQSEC2Q5JU85 1478 aa18.99■□□□□ 0.63
TOP3B-206ENST00000436282 NEUROD2Q15784 382 aa18.99■□□□□ 0.63
TOP3B-206ENST00000436282 RLBP1P12271 317 aa18.98■□□□□ 0.63
TOP3B-206ENST00000436282 RUNDC1Q96C34 613 aa18.98■□□□□ 0.63
TOP3B-206ENST00000436282 MYO3AQ8NEV4 1616 aa18.97■□□□□ 0.63
TOP3B-206ENST00000436282 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP18.97■□□□□ 0.63
TOP3B-206ENST00000436282 NEO1Q92859 1461 aa18.97■□□□□ 0.63
TOP3B-206ENST00000436282 YEATS2Q9ULM3 1422 aa18.97■□□□□ 0.63
TOP3B-206ENST00000436282 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP18.97■□□□□ 0.63
TOP3B-206ENST00000436282 CABP2Q9NPB3 220 aa18.97■□□□□ 0.63
TOP3B-206ENST00000436282 WDR63Q8IWG1 891 aa18.96■□□□□ 0.63
TOP3B-206ENST00000436282 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP18.95■□□□□ 0.62
TOP3B-206ENST00000436282 FSD2A1L4K1 749 aa18.95■□□□□ 0.62
TOP3B-206ENST00000436282 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa18.95■□□□□ 0.62
TOP3B-206ENST00000436282 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa18.94■□□□□ 0.62
TOP3B-206ENST00000436282 ADGRB1O14514 1584 aa18.94■□□□□ 0.62
TOP3B-206ENST00000436282 MCM4P33991 863 aa18.94■□□□□ 0.62
TOP3B-206ENST00000436282 TNNQ9UQP3 1299 aa18.94■□□□□ 0.62
TOP3B-206ENST00000436282 EVC2Q86UK5 1308 aa18.94■□□□□ 0.62
TOP3B-206ENST00000436282 TCP11L2Q8N4U5 519 aa18.94■□□□□ 0.62
TOP3B-206ENST00000436282 PPLO60437 1756 aa18.93■□□□□ 0.62
TOP3B-206ENST00000436282 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP18.93■□□□□ 0.622e-7■■■□□ 15.7
TOP3B-206ENST00000436282 MTHFSP49914 203 aa18.93■□□□□ 0.62
TOP3B-206ENST00000436282 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP18.92■□□□□ 0.62
TOP3B-206ENST00000436282 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa18.92■□□□□ 0.62
TOP3B-206ENST00000436282 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa18.92■□□□□ 0.62
TOP3B-206ENST00000436282 CCDC27Q2M243 656 aa18.91■□□□□ 0.62
TOP3B-206ENST00000436282 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa18.91■□□□□ 0.62
TOP3B-206ENST00000436282 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP18.91■□□□□ 0.62
TOP3B-206ENST00000436282 FAM69CQ0P6D2 419 aa18.91■□□□□ 0.62
TOP3B-206ENST00000436282 BCL2L13Q9BXK5 485 aa18.91■□□□□ 0.62
TOP3B-206ENST00000436282 CHMP5Q9NZZ3 219 aa18.91■□□□□ 0.62
TOP3B-206ENST00000436282 QRICH2Q9H0J4 1663 aa18.9■□□□□ 0.62
TOP3B-206ENST00000436282 SLC52A1Q9NWF4 448 aa18.9■□□□□ 0.62
TOP3B-206ENST00000436282 MVPQ14764 893 aaKnown RBP18.9■□□□□ 0.62
TOP3B-206ENST00000436282 STAG3Q9UJ98 1225 aa18.89■□□□□ 0.61
TOP3B-206ENST00000436282 C22orf23Q9BZE7 217 aa18.88■□□□□ 0.61
TOP3B-206ENST00000436282 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP18.88■□□□□ 0.61
TOP3B-206ENST00000436282 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP18.88■□□□□ 0.61
TOP3B-206ENST00000436282 MYH16Q9H6N6 1097 aa18.88■□□□□ 0.61
TOP3B-206ENST00000436282 USP32Q8NFA0 1604 aa18.88■□□□□ 0.61
TOP3B-206ENST00000436282 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa18.87■□□□□ 0.61
TOP3B-206ENST00000436282 GLI2P10070 1586 aa18.87■□□□□ 0.61
TOP3B-206ENST00000436282 CFAP53Q96M91 514 aa18.87■□□□□ 0.61
TOP3B-206ENST00000436282 ARXQ96QS3 562 aa18.87■□□□□ 0.61
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