RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395833.7

LMO2-202, Transcript of LIM domain only 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LMO2, Length 1,687 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO2-202ENST00000395833 TMC1Q8TDI8 760 aa40.15■■■■■ 4.02
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LMO2-202ENST00000395833 CABP2Q9NPB3 220 aa40.14■■■■■ 4.02
LMO2-202ENST00000395833 DIP2AQ14689 1571 aa40.13■■■■■ 4.02
LMO2-202ENST00000395833 MRS2Q9HD23 443 aa40.13■■■■■ 4.01
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LMO2-202ENST00000395833 TBX22Q9Y458 520 aa40.12■■■■■ 4.01
LMO2-202ENST00000395833 FAM135BQ49AJ0 1406 aa40.11■■■■■ 4.01
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LMO2-202ENST00000395833 ANKLE2Q86XL3 938 aa40.11■■■■■ 4.01
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LMO2-202ENST00000395833 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP40.07■■■■■ 4.01
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LMO2-202ENST00000395833 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa39.98■■■■□ 3.99
LMO2-202ENST00000395833 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa39.96■■■■□ 3.99
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LMO2-202ENST00000395833 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa39.94■■■■□ 3.98
LMO2-202ENST00000395833 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP39.93■■■■□ 3.98
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LMO2-202ENST00000395833 PIK3R4Q99570 1358 aa39.91■■■■□ 3.98
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LMO2-202ENST00000395833 A0A1W2PP64 1363 aa39.82■■■■□ 3.97
LMO2-202ENST00000395833 USP32Q8NFA0 1604 aa39.82■■■■□ 3.96
LMO2-202ENST00000395833 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa39.82■■■■□ 3.96
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LMO2-202ENST00000395833 KCNA6P17658 529 aa39.78■■■■□ 3.96
LMO2-202ENST00000395833 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP39.78■■■■□ 3.96
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LMO2-202ENST00000395833 CD163L1Q9NR16 1453 aa39.76■■■■□ 3.96
LMO2-202ENST00000395833 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP39.75■■■■□ 3.95
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LMO2-202ENST00000395833 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP39.74■■■■□ 3.95
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LMO2-202ENST00000395833 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa39.73■■■■□ 3.95
LMO2-202ENST00000395833 MORC1Q86VD1 984 aa39.69■■■■□ 3.94
LMO2-202ENST00000395833 NSD2O96028 1365 aa39.68■■■■□ 3.94
LMO2-202ENST00000395833 CCDC61Q9Y6R9 512 aa39.68■■■■□ 3.94
LMO2-202ENST00000395833 PRR36Q9H6K5 1346 aa39.66■■■■□ 3.94
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LMO2-202ENST00000395833 NWD1Q149M9 1564 aa39.53■■■■□ 3.92
LMO2-202ENST00000395833 GGNBP2Q9H3C7 697 aa39.53■■■■□ 3.92
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LMO2-202ENST00000395833 AKAP12Q02952 1782 aa39.5■■■■□ 3.91
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LMO2-202ENST00000395833 CFAP53Q96M91 514 aa39.34■■■■□ 3.89
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LMO2-202ENST00000395833 USP6P35125 1406 aa39.33■■■■□ 3.89
LMO2-202ENST00000395833 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP39.33■■■■□ 3.89
LMO2-202ENST00000395833 NRKQ7Z2Y5 1582 aa39.32■■■■□ 3.89
LMO2-202ENST00000395833 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa39.3■■■■□ 3.88
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