RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000357436.4

SH3BP1-201, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP1, Length 2,852 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-201ENST00000357436 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP24.69■■□□□ 1.54
SH3BP1-201ENST00000357436 MYO3AQ8NEV4 1616 aa24.68■■□□□ 1.54
SH3BP1-201ENST00000357436 CCDC146Q8IYE0 955 aa24.68■■□□□ 1.54
SH3BP1-201ENST00000357436 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP24.68■■□□□ 1.54
SH3BP1-201ENST00000357436 WAPLQ7Z5K2 1190 aa24.68■■□□□ 1.54
SH3BP1-201ENST00000357436 POGKQ9P215 609 aa24.68■■□□□ 1.54
SH3BP1-201ENST00000357436 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP24.67■■□□□ 1.54
SH3BP1-201ENST00000357436 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP24.67■■□□□ 1.54
SH3BP1-201ENST00000357436 ZMYM3Q14202 1370 aa24.67■■□□□ 1.54
SH3BP1-201ENST00000357436 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP24.66■■□□□ 1.54
SH3BP1-201ENST00000357436 DUSP27Q5VZP5 1158 aa24.66■■□□□ 1.54
SH3BP1-201ENST00000357436 CRBNQ96SW2 442 aa24.65■■□□□ 1.54
SH3BP1-201ENST00000357436 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa24.64■■□□□ 1.54
SH3BP1-201ENST00000357436 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa24.64■■□□□ 1.53
SH3BP1-201ENST00000357436 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa24.63■■□□□ 1.53
SH3BP1-201ENST00000357436 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP24.63■■□□□ 1.53
SH3BP1-201ENST00000357436 GOLGA2Q08379 1002 aa24.62■■□□□ 1.53
SH3BP1-201ENST00000357436 NSD3Q9BZ95 1437 aa24.62■■□□□ 1.53
SH3BP1-201ENST00000357436 MS4A1P11836 297 aa24.61■■□□□ 1.53
SH3BP1-201ENST00000357436 QRICH2Q9H0J4 1663 aa24.59■■□□□ 1.53
SH3BP1-201ENST00000357436 EVC2Q86UK5 1308 aa24.59■■□□□ 1.53
SH3BP1-201ENST00000357436 C20orf194Q5TEA3 1177 aa24.59■■□□□ 1.53
SH3BP1-201ENST00000357436 SLFN5Q08AF3 891 aa24.58■■□□□ 1.53
SH3BP1-201ENST00000357436 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP24.57■■□□□ 1.52
SH3BP1-201ENST00000357436 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa24.57■■□□□ 1.52
SH3BP1-201ENST00000357436 PDE4AP27815 886 aa24.57■■□□□ 1.52
SH3BP1-201ENST00000357436 MORC1Q86VD1 984 aa24.57■■□□□ 1.52
SH3BP1-201ENST00000357436 AGLP35573 1532 aa24.56■■□□□ 1.52
SH3BP1-201ENST00000357436 A2ML1A8K2U0 1454 aa24.56■■□□□ 1.52
SH3BP1-201ENST00000357436 TXNDC2Q86VQ3 553 aa24.56■■□□□ 1.52
SH3BP1-201ENST00000357436 BACH2Q9BYV9 841 aa24.55■■□□□ 1.52
SH3BP1-201ENST00000357436 RIMS2Q9UQ26 1411 aa24.55■■□□□ 1.52
SH3BP1-201ENST00000357436 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP24.54■■□□□ 1.52
SH3BP1-201ENST00000357436 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP24.54■■□□□ 1.52
SH3BP1-201ENST00000357436 TULP4Q9NRJ4 1543 aa24.54■■□□□ 1.52
SH3BP1-201ENST00000357436 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa24.53■■□□□ 1.52
SH3BP1-201ENST00000357436 GGNBP2Q9H3C7 697 aa24.53■■□□□ 1.52
SH3BP1-201ENST00000357436 FBLN1P23142 703 aa24.52■■□□□ 1.52
SH3BP1-201ENST00000357436 NUTM2FA1L443 756 aa24.52■■□□□ 1.52
SH3BP1-201ENST00000357436 APAF1O14727 1248 aa24.52■■□□□ 1.52
SH3BP1-201ENST00000357436 PPP6R1Q9UPN7 881 aa24.52■■□□□ 1.52
SH3BP1-201ENST00000357436 CDK19Q9BWU1 502 aa24.51■■□□□ 1.51
SH3BP1-201ENST00000357436 KDM2BQ8NHM5 1336 aa24.5■■□□□ 1.51
SH3BP1-201ENST00000357436 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP24.5■■□□□ 1.51
SH3BP1-201ENST00000357436 METP08581 1390 aa24.5■■□□□ 1.51
SH3BP1-201ENST00000357436 NEUROD2Q15784 382 aa24.49■■□□□ 1.51
SH3BP1-201ENST00000357436 CABP1Q9NZU7 370 aa24.49■■□□□ 1.51
SH3BP1-201ENST00000357436 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP24.49■■□□□ 1.51
SH3BP1-201ENST00000357436 DEKP35659 375 aaKnown RBP24.48■■□□□ 1.51
SH3BP1-201ENST00000357436 NGEFQ8N5V2 710 aa24.48■■□□□ 1.51
SH3BP1-201ENST00000357436 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP24.48■■□□□ 1.51
SH3BP1-201ENST00000357436 SLC26A8Q96RN1 970 aa24.48■■□□□ 1.51
SH3BP1-201ENST00000357436 ALKQ9UM73 1620 aa24.48■■□□□ 1.51
SH3BP1-201ENST00000357436 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP24.48■■□□□ 1.51
SH3BP1-201ENST00000357436 ZFYVE9O95405 1425 aa24.47■■□□□ 1.51
SH3BP1-201ENST00000357436 REREQ9P2R6 1566 aa24.47■■□□□ 1.51
SH3BP1-201ENST00000357436 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP24.47■■□□□ 1.51
SH3BP1-201ENST00000357436 PTPRMP28827 1452 aa24.47■■□□□ 1.51
SH3BP1-201ENST00000357436 TNRQ92752 1358 aa24.47■■□□□ 1.51
SH3BP1-201ENST00000357436 MTHFSP49914 203 aa24.47■■□□□ 1.51
SH3BP1-201ENST00000357436 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP24.46■■□□□ 1.51
SH3BP1-201ENST00000357436 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP24.46■■□□□ 1.51
SH3BP1-201ENST00000357436 LTKP29376 864 aa24.46■■□□□ 1.51
SH3BP1-201ENST00000357436 NBR1Q14596 966 aa24.46■■□□□ 1.51
SH3BP1-201ENST00000357436 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa24.45■■□□□ 1.5
SH3BP1-201ENST00000357436 A0A1W2PP64 1363 aa24.45■■□□□ 1.5
SH3BP1-201ENST00000357436 E9PSI1 815 aa24.44■■□□□ 1.5
SH3BP1-201ENST00000357436 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP24.43■■□□□ 1.5
SH3BP1-201ENST00000357436 SKAP1Q86WV1 359 aa24.43■■□□□ 1.5
SH3BP1-201ENST00000357436 CGNL1Q0VF96 1302 aa24.43■■□□□ 1.5
SH3BP1-201ENST00000357436 SHPRHQ149N8 1683 aa24.43■■□□□ 1.5
SH3BP1-201ENST00000357436 DMRT2Q9Y5R5 561 aa24.42■■□□□ 1.5
SH3BP1-201ENST00000357436 USP32Q8NFA0 1604 aa24.42■■□□□ 1.5
SH3BP1-201ENST00000357436 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP24.41■■□□□ 1.5
SH3BP1-201ENST00000357436 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP24.38■■□□□ 1.49
SH3BP1-201ENST00000357436 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa24.38■■□□□ 1.49
SH3BP1-201ENST00000357436 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP24.36■■□□□ 1.49
SH3BP1-201ENST00000357436 BCAR3O75815 825 aa24.36■■□□□ 1.49
SH3BP1-201ENST00000357436 FYB1O15117 783 aa24.36■■□□□ 1.49
SH3BP1-201ENST00000357436 WWC1Q8IX03 1113 aa24.36■■□□□ 1.49
SH3BP1-201ENST00000357436 ZRANB1Q9UGI0 708 aa24.36■■□□□ 1.49
SH3BP1-201ENST00000357436 TMEM2Q9UHN6 1383 aa24.33■■□□□ 1.49
SH3BP1-201ENST00000357436 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP24.32■■□□□ 1.48
SH3BP1-201ENST00000357436 TERF2IPQ9NYB0 399 aa24.32■■□□□ 1.48
SH3BP1-201ENST00000357436 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP24.31■■□□□ 1.48
SH3BP1-201ENST00000357436 RUNDC1Q96C34 613 aa24.31■■□□□ 1.48
SH3BP1-201ENST00000357436 IQSEC2Q5JU85 1478 aa24.3■■□□□ 1.48
SH3BP1-201ENST00000357436 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP24.3■■□□□ 1.48
SH3BP1-201ENST00000357436 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP24.3■■□□□ 1.484e-6■■■■□ 20.8
SH3BP1-201ENST00000357436 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
SH3BP1-201ENST00000357436 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP24.29■■□□□ 1.48
SH3BP1-201ENST00000357436 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP24.28■■□□□ 1.48
SH3BP1-201ENST00000357436 CD163L1Q9NR16 1453 aa24.28■■□□□ 1.48
SH3BP1-201ENST00000357436 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP24.28■■□□□ 1.48
SH3BP1-201ENST00000357436 PDE3AQ14432 1141 aa24.28■■□□□ 1.48
SH3BP1-201ENST00000357436 ATAD2Q6PL18 1390 aa24.27■■□□□ 1.48
SH3BP1-201ENST00000357436 WASLO00401 505 aaPredicted RBP24.27■■□□□ 1.48
SH3BP1-201ENST00000357436 ROBO2Q9HCK4 1378 aa24.27■■□□□ 1.48
SH3BP1-201ENST00000357436 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa24.27■■□□□ 1.48
SH3BP1-201ENST00000357436 NSD2O96028 1365 aa24.26■■□□□ 1.47
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