RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000335523.7

VSTM2B-201, Transcript of V-set and transmembrane domain containing 2B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene VSTM2B, Length 1,488 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM2B-201ENST00000335523 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP27■■□□□ 1.91
VSTM2B-201ENST00000335523 IQSEC2Q5JU85 1478 aa26.98■■□□□ 1.91
VSTM2B-201ENST00000335523 ROBO2Q9HCK4 1378 aa26.98■■□□□ 1.91
VSTM2B-201ENST00000335523 QRICH2Q9H0J4 1663 aa26.98■■□□□ 1.91
VSTM2B-201ENST00000335523 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa26.97■■□□□ 1.91
VSTM2B-201ENST00000335523 FBXO41Q8TF61 875 aa26.97■■□□□ 1.91
VSTM2B-201ENST00000335523 CPS1P31327 1500 aa26.96■■□□□ 1.91
VSTM2B-201ENST00000335523 KNDC1Q76NI1 1749 aa26.96■■□□□ 1.91
VSTM2B-201ENST00000335523 KCNA6P17658 529 aa26.96■■□□□ 1.91
VSTM2B-201ENST00000335523 PTCH1Q13635 1447 aa26.95■■□□□ 1.9
VSTM2B-201ENST00000335523 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP26.92■■□□□ 1.9
VSTM2B-201ENST00000335523 CDK19Q9BWU1 502 aa26.92■■□□□ 1.9
VSTM2B-201ENST00000335523 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP26.91■■□□□ 1.9
VSTM2B-201ENST00000335523 WASLO00401 505 aaPredicted RBP26.89■■□□□ 1.9
VSTM2B-201ENST00000335523 CABP2Q9NPB3 220 aa26.89■■□□□ 1.9
VSTM2B-201ENST00000335523 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP26.88■■□□□ 1.89
VSTM2B-201ENST00000335523 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP26.87■■□□□ 1.89
VSTM2B-201ENST00000335523 ANP32CO43423 234 aa26.87■■□□□ 1.89
VSTM2B-201ENST00000335523 PANK3Q9H999 370 aa26.87■■□□□ 1.89
VSTM2B-201ENST00000335523 TULP4Q9NRJ4 1543 aa26.86■■□□□ 1.89
VSTM2B-201ENST00000335523 ATAD2Q6PL18 1390 aa26.85■■□□□ 1.89
VSTM2B-201ENST00000335523 TMC1Q8TDI8 760 aa26.85■■□□□ 1.89
VSTM2B-201ENST00000335523 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP26.84■■□□□ 1.89
VSTM2B-201ENST00000335523 MIER1Q8N108 512 aa26.83■■□□□ 1.89
VSTM2B-201ENST00000335523 NINLQ9Y2I6 1382 aa26.81■■□□□ 1.88
VSTM2B-201ENST00000335523 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP26.81■■□□□ 1.88
VSTM2B-201ENST00000335523 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa26.8■■□□□ 1.88
VSTM2B-201ENST00000335523 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP26.77■■□□□ 1.88
VSTM2B-201ENST00000335523 NWD1Q149M9 1564 aa26.77■■□□□ 1.88
VSTM2B-201ENST00000335523 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP26.76■■□□□ 1.87
VSTM2B-201ENST00000335523 KNSTRNQ9Y448 316 aa26.76■■□□□ 1.87
VSTM2B-201ENST00000335523 CCDC61Q9Y6R9 512 aa26.75■■□□□ 1.87
VSTM2B-201ENST00000335523 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP26.75■■□□□ 1.87
VSTM2B-201ENST00000335523 C14orf37Q86TY3 774 aa26.74■■□□□ 1.87
VSTM2B-201ENST00000335523 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP26.74■■□□□ 1.87
VSTM2B-201ENST00000335523 ADGRB2O60241 1585 aa26.74■■□□□ 1.87
VSTM2B-201ENST00000335523 TERF2IPQ9NYB0 399 aa26.74■■□□□ 1.87
VSTM2B-201ENST00000335523 CABP1Q9NZU7 370 aa26.73■■□□□ 1.87
VSTM2B-201ENST00000335523 STRCP1A6NGW2 1772 aa26.71■■□□□ 1.87
VSTM2B-201ENST00000335523 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP26.7■■□□□ 1.87
VSTM2B-201ENST00000335523 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP26.7■■□□□ 1.87
VSTM2B-201ENST00000335523 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa26.69■■□□□ 1.86
VSTM2B-201ENST00000335523 CARD14Q9BXL6 1004 aa26.68■■□□□ 1.86
VSTM2B-201ENST00000335523 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP26.68■■□□□ 1.86
VSTM2B-201ENST00000335523 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa26.68■■□□□ 1.86
VSTM2B-201ENST00000335523 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa26.68■■□□□ 1.86
VSTM2B-201ENST00000335523 MYOM1P52179 1685 aa26.67■■□□□ 1.86
VSTM2B-201ENST00000335523 LRRC7Q96NW7 1537 aa26.67■■□□□ 1.86
VSTM2B-201ENST00000335523 C19orf44Q9H6X5 657 aa26.67■■□□□ 1.86
VSTM2B-201ENST00000335523 PRR36Q9H6K5 1346 aa26.66■■□□□ 1.86
VSTM2B-201ENST00000335523 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa26.65■■□□□ 1.86
VSTM2B-201ENST00000335523 NUTM2FA1L443 756 aa26.65■■□□□ 1.86
VSTM2B-201ENST00000335523 TMEM94Q12767 1356 aa26.64■■□□□ 1.86
VSTM2B-201ENST00000335523 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP26.64■■□□□ 1.86
VSTM2B-201ENST00000335523 RALBP1Q15311 655 aa26.64■■□□□ 1.86
VSTM2B-201ENST00000335523 PLEKHG3A1L390 1219 aa26.63■■□□□ 1.85
VSTM2B-201ENST00000335523 ANKARQ7Z5J8 1434 aa26.63■■□□□ 1.85
VSTM2B-201ENST00000335523 CCER2I3L3R5 266 aa26.62■■□□□ 1.85
VSTM2B-201ENST00000335523 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP26.62■■□□□ 1.85
VSTM2B-201ENST00000335523 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP26.62■■□□□ 1.85
VSTM2B-201ENST00000335523 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP26.62■■□□□ 1.85
VSTM2B-201ENST00000335523 ATP7BP35670 1465 aa26.62■■□□□ 1.85
VSTM2B-201ENST00000335523 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa26.62■■□□□ 1.85
VSTM2B-201ENST00000335523 A0A1W2PP64 1363 aa26.6■■□□□ 1.85
VSTM2B-201ENST00000335523 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP26.6■■□□□ 1.85
VSTM2B-201ENST00000335523 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa26.6■■□□□ 1.85
VSTM2B-201ENST00000335523 NSD3Q9BZ95 1437 aa26.6■■□□□ 1.85
VSTM2B-201ENST00000335523 CGNL1Q0VF96 1302 aa26.59■■□□□ 1.85
VSTM2B-201ENST00000335523 TOM1O60784 492 aa26.59■■□□□ 1.85
VSTM2B-201ENST00000335523 ATF3P18847 181 aa26.58■■□□□ 1.85
VSTM2B-201ENST00000335523 UBAP1LF5GYI3 381 aa26.57■■□□□ 1.84
VSTM2B-201ENST00000335523 CD163L1Q9NR16 1453 aa26.56■■□□□ 1.84
VSTM2B-201ENST00000335523 NALCNQ8IZF0 1738 aa26.55■■□□□ 1.84
VSTM2B-201ENST00000335523 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP26.55■■□□□ 1.84
VSTM2B-201ENST00000335523 CADPS2Q86UW7 1296 aa26.55■■□□□ 1.84
VSTM2B-201ENST00000335523 ACEP12821 1306 aa26.54■■□□□ 1.84
VSTM2B-201ENST00000335523 MSH6P52701 1360 aa26.54■■□□□ 1.84
VSTM2B-201ENST00000335523 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP26.54■■□□□ 1.84
VSTM2B-201ENST00000335523 DCCP43146 1447 aa26.53■■□□□ 1.84
VSTM2B-201ENST00000335523 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP26.52■■□□□ 1.84
VSTM2B-201ENST00000335523 PARD3Q8TEW0 1356 aa26.52■■□□□ 1.84
VSTM2B-201ENST00000335523 FMN2Q9NZ56 1722 aa26.52■■□□□ 1.84
VSTM2B-201ENST00000335523 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa26.52■■□□□ 1.84
VSTM2B-201ENST00000335523 PHF8Q9UPP1 1060 aa26.51■■□□□ 1.83
VSTM2B-201ENST00000335523 NSD2O96028 1365 aa26.51■■□□□ 1.83
VSTM2B-201ENST00000335523 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP26.5■■□□□ 1.83
VSTM2B-201ENST00000335523 ESCO1Q5FWF5 840 aa26.49■■□□□ 1.83
VSTM2B-201ENST00000335523 USP32Q8NFA0 1604 aa26.48■■□□□ 1.83
VSTM2B-201ENST00000335523 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP26.48■■□□□ 1.83
VSTM2B-201ENST00000335523 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP26.48■■□□□ 1.83
VSTM2B-201ENST00000335523 MORC1Q86VD1 984 aa26.48■■□□□ 1.83
VSTM2B-201ENST00000335523 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa26.46■■□□□ 1.83
VSTM2B-201ENST00000335523 FYB1O15117 783 aa26.46■■□□□ 1.83
VSTM2B-201ENST00000335523 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP26.46■■□□□ 1.83
VSTM2B-201ENST00000335523 ITSN1Q15811 1721 aa26.45■■□□□ 1.82
VSTM2B-201ENST00000335523 NLRP13Q86W25 1043 aa26.44■■□□□ 1.82
VSTM2B-201ENST00000335523 C1orf167Q5SNV9 1468 aa26.43■■□□□ 1.82
VSTM2B-201ENST00000335523 USP6P35125 1406 aa26.42■■□□□ 1.82
VSTM2B-201ENST00000335523 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa26.42■■□□□ 1.82
VSTM2B-201ENST00000335523 ORAI2Q96SN7 254 aa26.42■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.7 ms