RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293604.10

C6orf136-201, Transcript of chromosome 6 open reading frame 136, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene C6orf136, Length 1,978 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf136-201ENST00000293604 RIMS2Q9UQ26 1411 aa28.83■■■□□ 2.21
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C6orf136-201ENST00000293604 USP32Q8NFA0 1604 aa28.79■■■□□ 2.2
C6orf136-201ENST00000293604 EXOC6Q8TAG9 804 aa28.79■■■□□ 2.2
C6orf136-201ENST00000293604 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP28.78■■■□□ 2.2
C6orf136-201ENST00000293604 TNRQ92752 1358 aa28.78■■■□□ 2.2
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C6orf136-201ENST00000293604 MS4A1P11836 297 aa28.77■■■□□ 2.2
C6orf136-201ENST00000293604 NINLQ9Y2I6 1382 aa28.76■■■□□ 2.19
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C6orf136-201ENST00000293604 ABCC11Q96J66 1382 aa28.64■■■□□ 2.18
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C6orf136-201ENST00000293604 TMEM2Q9UHN6 1383 aa28.62■■■□□ 2.17
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C6orf136-201ENST00000293604 ADAMTS8Q9UP79 889 aa28.59■■■□□ 2.17
C6orf136-201ENST00000293604 C3P01024 1663 aa28.59■■■□□ 2.17
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C6orf136-201ENST00000293604 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP28.58■■■□□ 2.17
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C6orf136-201ENST00000293604 CD163L1Q9NR16 1453 aa28.48■■■□□ 2.15
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C6orf136-201ENST00000293604 MTHFSP49914 203 aa28.35■■■□□ 2.13
C6orf136-201ENST00000293604 ADGRB2O60241 1585 aa28.35■■■□□ 2.13
C6orf136-201ENST00000293604 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP28.35■■■□□ 2.13
C6orf136-201ENST00000293604 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP28.35■■■□□ 2.13
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C6orf136-201ENST00000293604 DIP2AQ14689 1571 aa28.34■■■□□ 2.13
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