RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284957.9

RABGEF1-201, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,733 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-201ENST00000284957 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP12.76□□□□□ -0.37
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RABGEF1-201ENST00000284957 BCANQ96GW7 911 aa12.76□□□□□ -0.37
RABGEF1-201ENST00000284957 CARD14Q9BXL6 1004 aa12.76□□□□□ -0.37
RABGEF1-201ENST00000284957 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP12.76□□□□□ -0.37
RABGEF1-201ENST00000284957 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP12.76□□□□□ -0.37
RABGEF1-201ENST00000284957 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa12.75□□□□□ -0.37
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RABGEF1-201ENST00000284957 SLC26A8Q96RN1 970 aa12.74□□□□□ -0.37
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RABGEF1-201ENST00000284957 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP12.69□□□□□ -0.38
RABGEF1-201ENST00000284957 CD163L1Q9NR16 1453 aa12.68□□□□□ -0.38
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RABGEF1-201ENST00000284957 NRKQ7Z2Y5 1582 aa12.52□□□□□ -0.41
RABGEF1-201ENST00000284957 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP12.51□□□□□ -0.41
RABGEF1-201ENST00000284957 NME9Q86XW9 330 aa12.5□□□□□ -0.41
RABGEF1-201ENST00000284957 ANKARQ7Z5J8 1434 aa12.5□□□□□ -0.41
RABGEF1-201ENST00000284957 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP12.5□□□□□ -0.41
RABGEF1-201ENST00000284957 ZRANB1Q9UGI0 708 aa12.5□□□□□ -0.41
RABGEF1-201ENST00000284957 USP6P35125 1406 aa12.49□□□□□ -0.41
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