RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000249499.7

HOXD9-201, Transcript of homeobox D9, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD9, Length 1,870 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD9-201ENST00000249499 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa30.5■■■□□ 2.47
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HOXD9-201ENST00000249499 ADAMTS8Q9UP79 889 aa30.48■■■□□ 2.47
HOXD9-201ENST00000249499 ATAD2Q6PL18 1390 aa30.47■■■□□ 2.47
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HOXD9-201ENST00000249499 HSPA2P54652 639 aa30■■■□□ 2.39
HOXD9-201ENST00000249499 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP30■■■□□ 2.39
HOXD9-201ENST00000249499 PNPLA6Q8IY17 1366 aa30■■■□□ 2.39
HOXD9-201ENST00000249499 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP30■■■□□ 2.39
HOXD9-201ENST00000249499 ROBO2Q9HCK4 1378 aa30■■■□□ 2.39
HOXD9-201ENST00000249499 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP29.99■■■□□ 2.39
HOXD9-201ENST00000249499 WWC1Q8IX03 1113 aa29.99■■■□□ 2.39
HOXD9-201ENST00000249499 CCDC61Q9Y6R9 512 aa29.99■■■□□ 2.39
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