RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000222753.5

HOXA13-201, Transcript of homeobox A13, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXA13, Length 5,030 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13-201ENST00000222753 ESPNB1AK53 854 aa22.51■■□□□ 1.19
HOXA13-201ENST00000222753 WDR63Q8IWG1 891 aa22.51■■□□□ 1.19
HOXA13-201ENST00000222753 TPM1P09493 284 aa22.51■■□□□ 1.19
HOXA13-201ENST00000222753 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
HOXA13-201ENST00000222753 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
HOXA13-201ENST00000222753 IFT57Q9NWB7 429 aa22.5■■□□□ 1.19
HOXA13-201ENST00000222753 GRIN2BQ13224 1484 aa22.49■■□□□ 1.19
HOXA13-201ENST00000222753 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP22.49■■□□□ 1.19
HOXA13-201ENST00000222753 RNF214Q8ND24 703 aa22.49■■□□□ 1.19
HOXA13-201ENST00000222753 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
HOXA13-201ENST00000222753 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
HOXA13-201ENST00000222753 TSPY26PQ9H489 355 aa22.48■■□□□ 1.19
HOXA13-201ENST00000222753 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
HOXA13-201ENST00000222753 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
HOXA13-201ENST00000222753 NBPF1Q3BBV0 1214 aa22.47■■□□□ 1.19
HOXA13-201ENST00000222753 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
HOXA13-201ENST00000222753 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
HOXA13-201ENST00000222753 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
HOXA13-201ENST00000222753 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
HOXA13-201ENST00000222753 ERC2O15083 957 aa22.47■■□□□ 1.19
HOXA13-201ENST00000222753 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
HOXA13-201ENST00000222753 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
HOXA13-201ENST00000222753 HOMER1Q86YM7 354 aa22.47■■□□□ 1.19
HOXA13-201ENST00000222753 PKNOX2Q96KN3 472 aa22.47■■□□□ 1.19
HOXA13-201ENST00000222753 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
HOXA13-201ENST00000222753 RASSF8Q8NHQ8 419 aa22.46■■□□□ 1.19
HOXA13-201ENST00000222753 MAP3K1Q13233 1512 aa22.45■■□□□ 1.19
HOXA13-201ENST00000222753 MVPQ14764 893 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
HOXA13-201ENST00000222753 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa22.45■■□□□ 1.18
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HOXA13-201ENST00000222753 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP22.45■■□□□ 1.18
HOXA13-201ENST00000222753 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa22.44■■□□□ 1.18
HOXA13-201ENST00000222753 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP22.44■■□□□ 1.18
HOXA13-201ENST00000222753 TEFQ10587 303 aa22.43■■□□□ 1.18
HOXA13-201ENST00000222753 NEK4P51957 841 aa22.43■■□□□ 1.18
HOXA13-201ENST00000222753 SETQ01105 290 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
HOXA13-201ENST00000222753 SLFN5Q08AF3 891 aa22.43■■□□□ 1.18
HOXA13-201ENST00000222753 CCDC70Q6NSX1 233 aa22.43■■□□□ 1.18
HOXA13-201ENST00000222753 NEXNQ0ZGT2 675 aa22.43■■□□□ 1.18
HOXA13-201ENST00000222753 ERBINQ96RT1 1412 aa22.43■■□□□ 1.18
HOXA13-201ENST00000222753 GGNBP2Q9H3C7 697 aa22.42■■□□□ 1.18
HOXA13-201ENST00000222753 CREBRFQ8IUR6 639 aa22.41■■□□□ 1.18
HOXA13-201ENST00000222753 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
HOXA13-201ENST00000222753 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa22.41■■□□□ 1.18
HOXA13-201ENST00000222753 PRDM2Q13029 1718 aa22.4■■□□□ 1.18
HOXA13-201ENST00000222753 MNS1Q8NEH6 495 aa22.4■■□□□ 1.18
HOXA13-201ENST00000222753 GNAI3P08754 354 aa22.39■■□□□ 1.18
HOXA13-201ENST00000222753 NCOA1Q15788 1441 aa22.39■■□□□ 1.18
HOXA13-201ENST00000222753 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
HOXA13-201ENST00000222753 TOMM22Q9NS69 142 aa22.39■■□□□ 1.17
HOXA13-201ENST00000222753 DAPK1P53355 1430 aa22.39■■□□□ 1.17
HOXA13-201ENST00000222753 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP22.39■■□□□ 1.17
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HOXA13-201ENST00000222753 TSPYL4Q9UJ04 414 aa22.38■■□□□ 1.17
HOXA13-201ENST00000222753 CPLX1O14810 134 aa22.38■■□□□ 1.17
HOXA13-201ENST00000222753 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
HOXA13-201ENST00000222753 C9orf84Q5VXU9 1444 aa22.38■■□□□ 1.17
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HOXA13-201ENST00000222753 PSMA5P28066 241 aa22.37■■□□□ 1.17
HOXA13-201ENST00000222753 TRIM29Q14134 588 aa22.37■■□□□ 1.17
HOXA13-201ENST00000222753 C1orf141Q5JVX7 400 aa22.37■■□□□ 1.17
HOXA13-201ENST00000222753 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa22.37■■□□□ 1.17
HOXA13-201ENST00000222753 ZSCAN30Q86W11 494 aa22.37■■□□□ 1.17
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HOXA13-201ENST00000222753 DDX58O95786 925 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
HOXA13-201ENST00000222753 CFAP70Q5T0N1 1121 aa22.36■■□□□ 1.17
HOXA13-201ENST00000222753 ZNF428Q96B54 188 aa22.36■■□□□ 1.17
HOXA13-201ENST00000222753 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
HOXA13-201ENST00000222753 CHD1LQ86WJ1 897 aa22.36■■□□□ 1.17
HOXA13-201ENST00000222753 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa22.36■■□□□ 1.17
HOXA13-201ENST00000222753 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
HOXA13-201ENST00000222753 NESP48681 1621 aa22.35■■□□□ 1.17
HOXA13-201ENST00000222753 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
HOXA13-201ENST00000222753 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
HOXA13-201ENST00000222753 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
HOXA13-201ENST00000222753 CNTROBQ8N137 903 aa22.35■■□□□ 1.17
HOXA13-201ENST00000222753 TRIM5Q9C035 493 aa22.35■■□□□ 1.17
HOXA13-201ENST00000222753 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa22.35■■□□□ 1.17
HOXA13-201ENST00000222753 FAM69CQ0P6D2 419 aa22.35■■□□□ 1.17
HOXA13-201ENST00000222753 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
HOXA13-201ENST00000222753 RBM10P98175 930 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
HOXA13-201ENST00000222753 ACBD3Q9H3P7 528 aa22.34■■□□□ 1.17
HOXA13-201ENST00000222753 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
HOXA13-201ENST00000222753 PES1O00541 588 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
HOXA13-201ENST00000222753 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
HOXA13-201ENST00000222753 AFAP1Q8N556 730 aa22.33■■□□□ 1.16
HOXA13-201ENST00000222753 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
HOXA13-201ENST00000222753 SYNJ2O15056 1496 aa22.32■■□□□ 1.16
HOXA13-201ENST00000222753 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
HOXA13-201ENST00000222753 HECW1Q76N89 1606 aa22.32■■□□□ 1.16
HOXA13-201ENST00000222753 CABP2Q9NPB3 220 aa22.32■■□□□ 1.16
HOXA13-201ENST00000222753 HMGXB3Q12766 1538 aa22.31■■□□□ 1.16
HOXA13-201ENST00000222753 PRKAR2BP31323 418 aa22.31■■□□□ 1.16
HOXA13-201ENST00000222753 TOPBP1Q92547 1522 aa22.3■■□□□ 1.16
HOXA13-201ENST00000222753 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
HOXA13-201ENST00000222753 WWC1Q8IX03 1113 aa22.3■■□□□ 1.16
HOXA13-201ENST00000222753 UQCRHLA0A096LP55 91 aa22.3■■□□□ 1.16
HOXA13-201ENST00000222753 UQCRHP07919 91 aa22.3■■□□□ 1.16
HOXA13-201ENST00000222753 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
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