RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000021227.5

Ankrd40-201, Transcript of Ankyrin repeat domain-containing protein 40, mousemouse

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ankrd40, Length 1,215 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd40-201ENSMUST00000021227 MpndQ3TV65 487 aa23.66■■□□□ 1.38
Ankrd40-201ENSMUST00000021227 Smim5Q8BT42 78 aa23.66■■□□□ 1.38
Ankrd40-201ENSMUST00000021227 Ift172Q6VH22 1749 aa23.65■■□□□ 1.38
Ankrd40-201ENSMUST00000021227 Stk26Q99JT2 416 aa23.65■■□□□ 1.38
Ankrd40-201ENSMUST00000021227 Pik3c2bE9QAN8 1632 aa23.64■■□□□ 1.38
Ankrd40-201ENSMUST00000021227 Washc2Q6PGL7 1334 aa23.62■■□□□ 1.37
Ankrd40-201ENSMUST00000021227 Rgs17Q9QZB0 210 aa23.62■■□□□ 1.37
Ankrd40-201ENSMUST00000021227 Plxnc1Q9QZC2 1574 aa23.61■■□□□ 1.37
Ankrd40-201ENSMUST00000021227 Cps1Q8C196 1500 aa23.6■■□□□ 1.37
Ankrd40-201ENSMUST00000021227 Utp14aQ640M1 767 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
Ankrd40-201ENSMUST00000021227 Q3UJC8 639 aa23.59■■□□□ 1.37
Ankrd40-201ENSMUST00000021227 Rgl3Q3UYI5 709 aa23.59■■□□□ 1.37
Ankrd40-201ENSMUST00000021227 Itsn2Q9Z0R6 1659 aa23.59■■□□□ 1.37
Ankrd40-201ENSMUST00000021227 Sipa1l2Q80TE4 1722 aa23.57■■□□□ 1.36
Ankrd40-201ENSMUST00000021227 Farp2Q91VS8 1065 aa23.57■■□□□ 1.36
Ankrd40-201ENSMUST00000021227 Kcna6Q61923 529 aa23.55■■□□□ 1.36
Ankrd40-201ENSMUST00000021227 Rreb1Q3UH06 1700 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
Ankrd40-201ENSMUST00000021227 MaddQ80U28 1577 aa23.53■■□□□ 1.36
Ankrd40-201ENSMUST00000021227 Abcc10Q8R4P9 1501 aa23.53■■□□□ 1.36
Ankrd40-201ENSMUST00000021227 DccP70211 1447 aa23.52■■□□□ 1.36
Ankrd40-201ENSMUST00000021227 Eno4Q8C042 619 aa23.52■■□□□ 1.36
Ankrd40-201ENSMUST00000021227 TonslQ6NZL6 1363 aa23.52■■□□□ 1.36
Ankrd40-201ENSMUST00000021227 Kif20bQ80WE4 1774 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
Ankrd40-201ENSMUST00000021227 Kdm2aP59997 1161 aa23.49■■□□□ 1.35
Ankrd40-201ENSMUST00000021227 Emilin2Q8K482 1074 aa23.49■■□□□ 1.35
Ankrd40-201ENSMUST00000021227 Marf1Q8BJ34 1730 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
Ankrd40-201ENSMUST00000021227 Rims1Q99NE5 1463 aa23.49■■□□□ 1.35
Ankrd40-201ENSMUST00000021227 Tulp4Q9JIL5 1547 aa23.49■■□□□ 1.35
Ankrd40-201ENSMUST00000021227 Slc52a2Q9D8F3 450 aa23.48■■□□□ 1.35
Ankrd40-201ENSMUST00000021227 Ddx54Q8K4L0 874 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
Ankrd40-201ENSMUST00000021227 Acsbg1Q99PU5 721 aa23.47■■□□□ 1.35
Ankrd40-201ENSMUST00000021227 Adamts13Q769J6 1426 aa23.47■■□□□ 1.35
Ankrd40-201ENSMUST00000021227 Usp32F8VPZ3 1604 aa23.46■■□□□ 1.35
Ankrd40-201ENSMUST00000021227 Fan1Q69ZT1 1020 aa23.46■■□□□ 1.35
Ankrd40-201ENSMUST00000021227 Cep170bQ80U49 1574 aa23.45■■□□□ 1.34
Ankrd40-201ENSMUST00000021227 Ifit1bl1D3Z6F0 470 aa23.44■■□□□ 1.34
Ankrd40-201ENSMUST00000021227 Sox12Q04890 314 aa23.44■■□□□ 1.34
Ankrd40-201ENSMUST00000021227 Idi1P58044 227 aa23.43■■□□□ 1.34
Ankrd40-201ENSMUST00000021227 Arhgef1Q61210 920 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
Ankrd40-201ENSMUST00000021227 Tex14Q7M6U3 1450 aa23.43■■□□□ 1.34
Ankrd40-201ENSMUST00000021227 Polr3aB2RXC6 1390 aa23.41■■□□□ 1.34
Ankrd40-201ENSMUST00000021227 Os9Q8K2C7 672 aa23.41■■□□□ 1.34
Ankrd40-201ENSMUST00000021227 N4bp2F8VQG7 1678 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
Ankrd40-201ENSMUST00000021227 Wnk3Q80XP9 1757 aa23.4■■□□□ 1.34
Ankrd40-201ENSMUST00000021227 Puf60Q3UEB3 564 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
Ankrd40-201ENSMUST00000021227 D430041D05RikF6ZGR6 1678 aa23.4■■□□□ 1.34
Ankrd40-201ENSMUST00000021227 Srpk2O54781 681 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
Ankrd40-201ENSMUST00000021227 Cpsf1Q9EPU4 1441 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
Ankrd40-201ENSMUST00000021227 Grwd1Q810D6 446 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
Ankrd40-201ENSMUST00000021227 Neurod1Q60867 357 aa23.37■■□□□ 1.33
Ankrd40-201ENSMUST00000021227 Tmem2Q5FWI3 1383 aa23.37■■□□□ 1.33
Ankrd40-201ENSMUST00000021227 Lrrc59Q922Q8 307 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
Ankrd40-201ENSMUST00000021227 Slc34a2Q9DBP0 697 aa23.35■■□□□ 1.33
Ankrd40-201ENSMUST00000021227 Cep152A2AUM9 1736 aaKnown RBP23.34■■□□□ 1.33
Ankrd40-201ENSMUST00000021227 C5P06684 1680 aa23.34■■□□□ 1.33
Ankrd40-201ENSMUST00000021227 NgefQ8CHT1 710 aa23.33■■□□□ 1.33
Ankrd40-201ENSMUST00000021227 Als2Q920R0 1651 aa23.32■■□□□ 1.32
Ankrd40-201ENSMUST00000021227 Lrrc7Q80TE7 1490 aa23.32■■□□□ 1.32
Ankrd40-201ENSMUST00000021227 Gm20521D3Z5F7 333 aa23.32■■□□□ 1.32
Ankrd40-201ENSMUST00000021227 Psrc1Q9D0P7 329 aa23.32■■□□□ 1.32
Ankrd40-201ENSMUST00000021227 Kdm2bQ6P1G2 1309 aa23.32■■□□□ 1.32
Ankrd40-201ENSMUST00000021227 Camta1A2A891 1682 aa23.32■■□□□ 1.32
Ankrd40-201ENSMUST00000021227 InhbeO08717 350 aa23.31■■□□□ 1.32
Ankrd40-201ENSMUST00000021227 Fam135bQ9DAI6 1403 aa23.3■■□□□ 1.32
Ankrd40-201ENSMUST00000021227 Sgsm1Q8BPQ7 1093 aa23.29■■□□□ 1.32
Ankrd40-201ENSMUST00000021227 Rpgrip1Q9EPQ2 1331 aa23.29■■□□□ 1.32
Ankrd40-201ENSMUST00000021227 PtpruB1AUH1 1446 aa23.28■■□□□ 1.32
Ankrd40-201ENSMUST00000021227 Mug2P28666 1451 aa23.28■■□□□ 1.32
Ankrd40-201ENSMUST00000021227 Atp2b2Q9R0K7 1198 aa23.27■■□□□ 1.32
Ankrd40-201ENSMUST00000021227 Las1lA2BE28 776 aaKnown RBP23.26■■□□□ 1.31
Ankrd40-201ENSMUST00000021227 Mink1Q9JM52 1308 aa23.26■■□□□ 1.31
Ankrd40-201ENSMUST00000021227 Atp7bQ64446 1462 aa23.25■■□□□ 1.31
Ankrd40-201ENSMUST00000021227 Plekhg1F6S200 1446 aa23.25■■□□□ 1.31
Ankrd40-201ENSMUST00000021227 Cadps2Q8BYR5 1297 aa23.24■■□□□ 1.31
Ankrd40-201ENSMUST00000021227 Kif1aP33173 1695 aa23.24■■□□□ 1.31
Ankrd40-201ENSMUST00000021227 Wdr17E9Q271 1322 aa23.23■■□□□ 1.31
Ankrd40-201ENSMUST00000021227 Atp10bB1AWN4 1474 aa23.23■■□□□ 1.31
Ankrd40-201ENSMUST00000021227 Znf316Q6PGE4 1016 aa23.22■■□□□ 1.31
Ankrd40-201ENSMUST00000021227 Slc35g1Q8BY79 368 aa23.22■■□□□ 1.31
Ankrd40-201ENSMUST00000021227 Sirt1Q923E4 737 aa23.22■■□□□ 1.31
Ankrd40-201ENSMUST00000021227 Stard8Q8K031 1019 aa23.21■■□□□ 1.31
Ankrd40-201ENSMUST00000021227 Col22a1E9Q7P1 1613 aa23.21■■□□□ 1.31
Ankrd40-201ENSMUST00000021227 Cdk5rap2Q8K389 1822 aa23.21■■□□□ 1.31
Ankrd40-201ENSMUST00000021227 Ap3b2Q9JME5 1082 aa23.19■■□□□ 1.3
Ankrd40-201ENSMUST00000021227 Stag3O70576 1240 aa23.18■■□□□ 1.3
Ankrd40-201ENSMUST00000021227 Dixdc1Q80Y83 711 aa23.18■■□□□ 1.3
Ankrd40-201ENSMUST00000021227 Abca14E9Q8F8 1683 aa23.17■■□□□ 1.3
Ankrd40-201ENSMUST00000021227 Ccdc6D3YZP9 469 aa23.17■■□□□ 1.3
Ankrd40-201ENSMUST00000021227 IqubQ8CDK3 788 aa23.17■■□□□ 1.3
Ankrd40-201ENSMUST00000021227 RalgapbQ8BQZ4 1484 aa23.17■■□□□ 1.3
Ankrd40-201ENSMUST00000021227 Rundc1Q0VDN7 615 aa23.16■■□□□ 1.3
Ankrd40-201ENSMUST00000021227 Txnrd1Q9JMH6 613 aa23.15■■□□□ 1.3
Ankrd40-201ENSMUST00000021227 Usp40Q8BWR4 1235 aa23.14■■□□□ 1.29
Ankrd40-201ENSMUST00000021227 Card11Q8CIS0 1159 aa23.14■■□□□ 1.29
Ankrd40-201ENSMUST00000021227 Sugp2Q8CH09 1067 aa23.13■■□□□ 1.29
Ankrd40-201ENSMUST00000021227 Nphp4P59240 1425 aa23.13■■□□□ 1.29
Ankrd40-201ENSMUST00000021227 Cdhr2E9Q7P9 1308 aa23.11■■□□□ 1.29
Ankrd40-201ENSMUST00000021227 Sf3b2Q3UJB0 878 aaKnown RBP23.11■■□□□ 1.29
Ankrd40-201ENSMUST00000021227 Robo1O89026 1612 aa23.11■■□□□ 1.29
Ankrd40-201ENSMUST00000021227 Abca15E9PWH4 1668 aa23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 13.6 ms