RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000008297.4

Clstn3-201, Transcript of Calsyntenin-3, mousemouse

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene Clstn3, Length 4,014 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn3-201ENSMUST00000008297 PtmaP26350 111 aa11.75□□□□□ -0.53
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Atl3Q91YH5 541 aa11.75□□□□□ -0.53
Clstn3-201ENSMUST00000008297 TnikP83510 1323 aa11.75□□□□□ -0.53
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Rbm25B2RY56 838 aaKnown RBP11.75□□□□□ -0.53
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Sptbn5F6UCX4 1208 aa11.74□□□□□ -0.53
Clstn3-201ENSMUST00000008297 MyclP10166 368 aa11.73□□□□□ -0.53
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Uspl1Q3ULM6 1089 aa11.73□□□□□ -0.53
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Pbrm1Q8BSQ9 1634 aaKnown RBP11.73□□□□□ -0.53
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Ipo4Q8VI75 1082 aa11.73□□□□□ -0.53
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Ythdc2B2RR83 1445 aaKnown RBP11.73□□□□□ -0.53
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Afap1Q80YS6 731 aa11.72□□□□□ -0.53
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Swt1Q9DBQ9 907 aa11.72□□□□□ -0.53
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Slc52a2Q9D8F3 450 aa11.72□□□□□ -0.53
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Duxf3A0A0N4SV92 674 aa11.72□□□□□ -0.53
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Cavin4A2AMM0 362 aa11.72□□□□□ -0.53
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Atf7ipQ7TT18 1306 aa11.72□□□□□ -0.53
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Zfp777B9EKF4 885 aa11.71□□□□□ -0.53
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Ccdc146E9Q9F7 977 aa11.71□□□□□ -0.53
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Stk31Q99MW1 1018 aa11.71□□□□□ -0.53
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Ciz1Q8VEH2 845 aa11.71□□□□□ -0.53
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Tex14Q7M6U3 1450 aa11.71□□□□□ -0.54
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Cdk19Q8BWD8 501 aa11.7□□□□□ -0.54
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Fmn2Q9JL04 1578 aa11.7□□□□□ -0.54
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Abcc2Q8VI47 1543 aa11.7□□□□□ -0.54
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Q3TQI7 289 aaKnown RBP11.7□□□□□ -0.54
Clstn3-201ENSMUST00000008297 AampJ3QN89 436 aa11.7□□□□□ -0.54
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Map4k4P97820 1233 aaKnown RBP11.7□□□□□ -0.54
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Zranb1Q7M760 708 aa11.69□□□□□ -0.54
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Abcc1O35379 1528 aa11.69□□□□□ -0.54
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Cog6Q8R3I3 657 aa11.69□□□□□ -0.54
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Usp16Q99LG0 825 aa11.69□□□□□ -0.54
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Rusc2Q80U22 1514 aa11.69□□□□□ -0.54
Clstn3-201ENSMUST00000008297 FanciQ8K368 1330 aa11.69□□□□□ -0.54
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Tnnt1O88346 262 aa11.69□□□□□ -0.54
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Hsp90b1P08113 802 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Erich6bQ9D4S6 220 aa11.68□□□□□ -0.54
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Dot1lQ6XZL8 1540 aa11.68□□□□□ -0.54
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Sbno1Q689Z5 1390 aa11.68□□□□□ -0.54
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Rsph3aQ3UFY4 516 aa11.68□□□□□ -0.54
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Gm16486A0A1D5RMD1 1434 aa11.68□□□□□ -0.54
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Rlbp1Q9Z275 317 aa11.68□□□□□ -0.54
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Cfap74Q3UY96 1578 aa11.68□□□□□ -0.54
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Kif18aQ91WD7 886 aa11.67□□□□□ -0.54
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Kdm5cP41230 1554 aa11.67□□□□□ -0.54
Clstn3-201ENSMUST00000008297 SkilQ60665 675 aa11.67□□□□□ -0.54
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Cabp4Q8VHC5 271 aa11.67□□□□□ -0.54
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Lrriq1Q0P5X1 1673 aa11.67□□□□□ -0.54
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Abcc6Q9R1S7 1498 aa11.67□□□□□ -0.54
Clstn3-201ENSMUST00000008297 OvosQ3UU35 1456 aa11.66□□□□□ -0.54
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Cdc42bpaQ3UU96 1719 aa11.66□□□□□ -0.54
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Ssh1Q76I79 1042 aa11.66□□□□□ -0.54
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Edc4Q3UJB9 1406 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Kif21bQ9QXL1 1668 aa11.66□□□□□ -0.54
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Gnai1B2RSH2 354 aa11.66□□□□□ -0.54
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Maco1Q7TQE6 664 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
Clstn3-201ENSMUST00000008297 4933402E13RikQ9D4D2 429 aa11.66□□□□□ -0.54
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Gnai3Q9DC51 354 aa11.66□□□□□ -0.54
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Tarbp1E9Q368 1579 aa11.65□□□□□ -0.54
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Ak9G3UYQ4 1894 aa11.65□□□□□ -0.54
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Stk11ipQ3TAA7 1072 aa11.65□□□□□ -0.54
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Eif4g2Q62448 906 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Pdcl3Q8BVF2 240 aa11.65□□□□□ -0.54
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Fam208aQ69ZR9 1610 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Cc2d1aQ8K1A6 943 aa11.64□□□□□ -0.55
Clstn3-201ENSMUST00000008297 PalmQ9Z0P4 383 aa11.64□□□□□ -0.55
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Nek4Q9Z1J2 792 aa11.64□□□□□ -0.55
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Triml2E9PW10 424 aa11.64□□□□□ -0.55
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Taok2Q6ZQ29 1240 aa11.64□□□□□ -0.55
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Ric3Q8BPM6 367 aa11.64□□□□□ -0.55
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Mroh2aD3Z750 1679 aa11.64□□□□□ -0.55
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Ythdc1E9Q5K9 736 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Ccdc171E9Q1U1 1324 aa11.63□□□□□ -0.55
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Znf692Q3U381 531 aa11.63□□□□□ -0.55
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Pknox2Q8BG99 474 aa11.63□□□□□ -0.55
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Rrbp1Q99PL5 1605 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Ppip5k1A2ARP1 1436 aa11.63□□□□□ -0.55
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Usp19Q3UJD6 1360 aa11.61□□□□□ -0.55
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Pnmal2G3X9N3 661 aa11.61□□□□□ -0.55
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Tmc1Q8R4P5 757 aa11.61□□□□□ -0.55
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Cabp2Q9JLK4 216 aa11.61□□□□□ -0.55
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Ap3b2Q9JME5 1082 aa11.61□□□□□ -0.55
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Mast1Q9R1L5 1570 aa11.61□□□□□ -0.55
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Cgnl1Q6AW69 1298 aa11.61□□□□□ -0.55
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Trpm2Q91YD4 1506 aa11.61□□□□□ -0.55
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Gm21190A0A0G2JGJ6 266 aa11.6□□□□□ -0.55
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Mcm4P49717 862 aa11.6□□□□□ -0.55
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Tbc1d32Q3URV1 1296 aa11.6□□□□□ -0.55
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Tfip11Q9ERA6 838 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Plch2A2AP18 1501 aa11.6□□□□□ -0.55
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Rrp12Q6P5B0 1295 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Slc12a5Q91V14 1138 aa11.6□□□□□ -0.55
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Ppp1r3fQ9JIG4 799 aa11.6□□□□□ -0.55
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Ttc41Q692V3 1318 aa11.6□□□□□ -0.55
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Catsper2A2ARP9 588 aa11.6□□□□□ -0.55
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Casq1O09165 405 aa11.6□□□□□ -0.55
Clstn3-201ENSMUST00000008297 MpripP97434 1024 aa11.6□□□□□ -0.55
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Eif4g3Q80XI3 1579 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Aplp1Q03157 653 aa11.59□□□□□ -0.55
Clstn3-201ENSMUST00000008297 AatkQ80YE4 1365 aa11.59□□□□□ -0.55
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Rtn4Q99P72 1162 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 21.2 ms