RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000008088.8

Ttc9b-201, Transcript of Tetratricopeptide repeat protein 9B, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ttc9b, Length 2,052 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Arhgef28P97433 1693 aa26.4■■□□□ 1.82
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Ercc6l2Q9JIM3 1537 aa26.4■■□□□ 1.82
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Esx1O88933 382 aa26.39■■□□□ 1.82
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Gprasp1Q5U4C1 1347 aa26.39■■□□□ 1.81
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Cep170bQ80U49 1574 aa26.39■■□□□ 1.81
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Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Adamtsl3G3UXC7 1706 aa26.33■■□□□ 1.81
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Kank1E9Q238 1360 aa26.32■■□□□ 1.8
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Erbb3Q61526 1339 aa26.31■■□□□ 1.8
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Mink1Q9JM52 1308 aa26.31■■□□□ 1.8
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Ttc9b-201ENSMUST00000008088 KdrP35918 1367 aa26.27■■□□□ 1.8
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Kif16bB1AVY7 1312 aa26.25■■□□□ 1.79
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Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Scaf11E9PZM7 1456 aaKnown RBP26.23■■□□□ 1.79
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Asxl2Q8BZ32 1370 aa26.23■■□□□ 1.79
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Nrxn1Q9CS84 1514 aa26.23■■□□□ 1.79
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Kiaa1107Q80TK0 1369 aa26.21■■□□□ 1.79
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Plekhg1F6S200 1446 aa26.21■■□□□ 1.79
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Atp2b2Q9R0K7 1198 aa26.21■■□□□ 1.79
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Usp19Q3UJD6 1360 aa26.2■■□□□ 1.79
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Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Dip2aQ8BWT5 1523 aa26.18■■□□□ 1.78
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Ttc9b-201ENSMUST00000008088 P2rx7Q9Z1M0 595 aa26.16■■□□□ 1.78
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Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Txndc2Q6P902 515 aa26.15■■□□□ 1.78
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Psme1P97371 249 aa26.15■■□□□ 1.78
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Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Cald1E9QA15 768 aaKnown RBP26.13■■□□□ 1.77
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Nwd1A6H603 1563 aa26.13■■□□□ 1.77
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Ttc9b-201ENSMUST00000008088 GsdmaQ9EST1 446 aa26.07■■□□□ 1.76
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Ttc41Q692V3 1318 aa26.05■■□□□ 1.76
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Neurod2Q62414 383 aa26.05■■□□□ 1.76
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 FanciQ8K368 1330 aa26.04■■□□□ 1.76
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 MyclP10166 368 aa26.03■■□□□ 1.76
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Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Plekhh1Q80TI1 1356 aa26■■□□□ 1.75
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Iqsec2Q5DU25 1478 aa25.99■■□□□ 1.75
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Map3k19E9Q3S4 1311 aa25.98■■□□□ 1.75
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Cps1Q8C196 1500 aa25.95■■□□□ 1.74
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Dip2bQ3UH60 1574 aa25.95■■□□□ 1.74
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Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Atxn3Q9CVD2 355 aa25.85■■□□□ 1.73
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Idi2Q8BFZ6 227 aa25.84■■□□□ 1.73
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 PtpruB1AUH1 1446 aa25.83■■□□□ 1.73
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Apbb1Q9QXJ1 710 aa25.83■■□□□ 1.73
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Supt16hQ920B9 1047 aa25.82■■□□□ 1.72
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Bcl9Q9D219 1425 aa25.82■■□□□ 1.72
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