RNA–Protein interactions for RNA: YKL125W

RRN3, Transcript of Protein required for transcription of rDNA by RNA polymerase I, yeastyeast

Gene RRN3, Length 1,884 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RRN3YKL125W YOL085CQ99345 113 aa3.82□□□□□ -1.8
RRN3YKL125W RPS11AP0CX47 156 aaKnown RBP3.81□□□□□ -1.8
RRN3YKL125W RPS11BP0CX48 156 aaKnown RBP3.81□□□□□ -1.8
RRN3YKL125W YCR043CP25361 127 aa3.81□□□□□ -1.8
RRN3YKL125W YDR010CQ12426 110 aa3.81□□□□□ -1.8
RRN3YKL125W SPC1P46965 94 aa3.81□□□□□ -1.8
RRN3YKL125W YKL097CP34245 136 aa3.8□□□□□ -1.8
RRN3YKL125W WWM1P43582 211 aaKnown RBP3.8□□□□□ -1.8
RRN3YKL125W YLL006W-AQ3E814 58 aa3.79□□□□□ -1.8
RRN3YKL125W SOM1Q05676 74 aa3.79□□□□□ -1.8
RRN3YKL125W YPR013CQ12145 317 aa3.79□□□□□ -1.8
RRN3YKL125W YCR095W-AQ3E787 52 aa3.79□□□□□ -1.8
RRN3YKL125W POR2P40478 281 aa3.78□□□□□ -1.8
RRN3YKL125W SIP18P50263 79 aa3.78□□□□□ -1.8
RRN3YKL125W YNL042W-BQ3E7Z2 85 aa3.78□□□□□ -1.8
RRN3YKL125W COX14P39103 70 aa3.77□□□□□ -1.81
RRN3YKL125W YPR010C-AA5Z2X5 72 aa3.77□□□□□ -1.81
RRN3YKL125W YIL102CP40488 101 aa3.77□□□□□ -1.81
RRN3YKL125W YMR105W-AQ8TGS8 64 aa3.77□□□□□ -1.81
RRN3YKL125W YMR122W-AQ3E842 84 aa3.76□□□□□ -1.81
RRN3YKL125W YER084WP40057 128 aa3.75□□□□□ -1.81
RRN3YKL125W MRPS8Q03799 155 aa3.75□□□□□ -1.81
RRN3YKL125W MRX7P53869 86 aa3.75□□□□□ -1.81
RRN3YKL125W YGL149WP53116 101 aa3.74□□□□□ -1.81
RRN3YKL125W YBR219CP38317 127 aa3.73□□□□□ -1.81
RRN3YKL125W HUB1Q6Q546 73 aa3.73□□□□□ -1.81
RRN3YKL125W YOL013W-AP0C272 63 aaPredicted RBP3.73□□□□□ -1.81
RRN3YKL125W COX23P38824 151 aa3.73□□□□□ -1.81
RRN3YKL125W YIL046W-AQ3E7Z4 54 aa3.73□□□□□ -1.81
RRN3YKL125W AQY2P0CD90 149 aa3.72□□□□□ -1.81
RRN3YKL125W FPR1P20081 114 aaKnown RBP3.72□□□□□ -1.81
RRN3YKL125W CCW12Q12127 133 aa3.72□□□□□ -1.81
RRN3YKL125W TMC1Q08422 150 aaPredicted RBP3.71□□□□□ -1.82
RRN3YKL125W YJL197C-AP0C5P0 93 aa3.71□□□□□ -1.82
RRN3YKL125W YLR157W-DP0CE99 70 aa3.71□□□□□ -1.82
RRN3YKL125W YCR001WP25347 104 aa3.71□□□□□ -1.82
RRN3YKL125W VAM10Q08474 114 aa3.71□□□□□ -1.82
RRN3YKL125W YMR001C-AQ8TGS9 76 aa3.71□□□□□ -1.82
RRN3YKL125W EDC2P40023 145 aaPredicted RBP3.7□□□□□ -1.82
RRN3YKL125W YIL086CP40503 102 aa3.7□□□□□ -1.82
RRN3YKL125W YDR524C-BQ3E6R4 66 aa3.7□□□□□ -1.82
RRN3YKL125W BSC4P53841 131 aa3.69□□□□□ -1.82
RRN3YKL125W SDH6Q3E785 79 aa3.69□□□□□ -1.82
RRN3YKL125W RPL39P04650 51 aa3.69□□□□□ -1.82
RRN3YKL125W ATP17Q06405 101 aa3.69□□□□□ -1.82
RRN3YKL125W YAR023CD6VPM8 179 aa3.68□□□□□ -1.82
RRN3YKL125W SNA2P56508 79 aa3.68□□□□□ -1.82
RRN3YKL125W ECM19Q06011 112 aa3.68□□□□□ -1.82
RRN3YKL125W YHR213W-BQ8TGK1 99 aa3.67□□□□□ -1.82
RRN3YKL125W RTC6O14464 93 aa3.67□□□□□ -1.82
RRN3YKL125W LCL2Q08045 131 aa3.67□□□□□ -1.82
RRN3YKL125W YPL278CQ08990 100 aa3.67□□□□□ -1.82
RRN3YKL125W YBL008W-AQ3E821 79 aa3.66□□□□□ -1.82
RRN3YKL125W RPL29P05747 59 aaPredicted RBP3.65□□□□□ -1.82
RRN3YKL125W YHR125WP38831 101 aa3.65□□□□□ -1.82
RRN3YKL125W YDL241WQ07738 123 aa3.64□□□□□ -1.83
RRN3YKL125W YBR027CP38220 110 aa3.64□□□□□ -1.83
RRN3YKL125W YJL133C-AQ3E7A3 74 aa3.64□□□□□ -1.83
RRN3YKL125W YOR011W-AQ3E807 68 aa3.63□□□□□ -1.83
RRN3YKL125W YNL162W-AQ3E7A8 72 aa3.62□□□□□ -1.83
RRN3YKL125W PMP3P87284 55 aa3.62□□□□□ -1.83
RRN3YKL125W YNL146C-AQ3E7Z1 64 aa3.61□□□□□ -1.83
RRN3YKL125W IGD1P43598 195 aa3.6□□□□□ -1.83
RRN3YKL125W YNL122CP53921 115 aaPredicted RBP3.6□□□□□ -1.83
RRN3YKL125W AUA1P32450 94 aa3.6□□□□□ -1.83
RRN3YKL125W URA2P07259 2214 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
RRN3YKL125W MVB12P42939 101 aa3.58□□□□□ -1.84
RRN3YKL125W YBR230W-AQ3E762 66 aa3.58□□□□□ -1.84
RRN3YKL125W IRA2P19158 3079 aa3.58□□□□□ -1.84
RRN3YKL125W YGL014C-AP0C5N1 53 aa3.57□□□□□ -1.84
RRN3YKL125W Q0032Q9ZZX7 96 aa3.57□□□□□ -1.84
RRN3YKL125W YJL127C-BQ3E828 52 aa3.56□□□□□ -1.84
RRN3YKL125W YCR041WP37265 110 aa3.55□□□□□ -1.84
RRN3YKL125W HFA1P32874 2273 aa3.54□□□□□ -1.84
RRN3YKL125W YAR064WP39563 99 aa3.54□□□□□ -1.84
RRN3YKL125W SGF11Q03067 99 aa3.54□□□□□ -1.84
RRN3YKL125W YCL048W-AQ2V2Q2 79 aa3.54□□□□□ -1.84
RRN3YKL125W YDR210WQ03482 75 aa3.52□□□□□ -1.85
RRN3YKL125W YDL012CQ12489 107 aa3.52□□□□□ -1.85
RRN3YKL125W YLR307C-AQ3E825 87 aa3.51□□□□□ -1.85
RRN3YKL125W YBL039W-BP0C268 59 aa3.5□□□□□ -1.85
RRN3YKL125W TOM1Q03280 3268 aa3.49□□□□□ -1.85
RRN3YKL125W YER078W-AQ3E7A2 54 aa3.49□□□□□ -1.85
RRN3YKL125W DDR2P89113 61 aa3.47□□□□□ -1.85
RRN3YKL125W RPC10P40422 70 aa3.47□□□□□ -1.85
RRN3YKL125W CMC4Q3E7A9 73 aa3.46□□□□□ -1.86
RRN3YKL125W YCL042WP25572 119 aa3.45□□□□□ -1.86
RRN3YKL125W HOR7Q05827 59 aa3.45□□□□□ -1.86
RRN3YKL125W YHR007C-AQ07074 71 aa3.44□□□□□ -1.86
RRN3YKL125W TAR1Q8TGM6 124 aa3.44□□□□□ -1.86
RRN3YKL125W COX8P04039 78 aa3.41□□□□□ -1.86
RRN3YKL125W RDS3Q06835 107 aaPredicted RBP3.41□□□□□ -1.86
RRN3YKL125W GIS2P53849 153 aaKnown RBP RIP-Chip data3.4□□□□□ -1.87not detected
RRN3YKL125W YBR201C-AQ2V2Q3 67 aa3.4□□□□□ -1.87
RRN3YKL125W YOR072WQ08486 104 aa3.39□□□□□ -1.87
RRN3YKL125W RPL43AP0CX25 92 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
RRN3YKL125W RPL43BP0CX26 92 aa3.39□□□□□ -1.87
RRN3YKL125W YEL014CP39999 101 aa3.39□□□□□ -1.87
RRN3YKL125W YJR128WP47162 119 aa3.39□□□□□ -1.87
RRN3YKL125W YOL097W-AQ3E7Y9 61 aa3.39□□□□□ -1.87
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