RNA–Protein interactions for RNA: YKL050C

YKL050C, Transcript of Protein of unknown function, yeastyeast

Gene YKL050C, Length 2,769 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YKL050CYKL050C TAR1Q8TGM6 124 aa2.4□□□□□ -2.02
YKL050CYKL050C MRPL38P35996 138 aaPredicted RBP2.4□□□□□ -2.03
YKL050CYKL050C IRC21Q04772 201 aa2.39□□□□□ -2.03
YKL050CYKL050C YOR314WQ12506 109 aa2.39□□□□□ -2.03
YKL050CYKL050C AIM4P38305 123 aaPredicted RBP2.39□□□□□ -2.03
YKL050CYKL050C VPS55P47111 140 aa2.39□□□□□ -2.03
YKL050CYKL050C YKL065W-AQ2V2P2 73 aa2.39□□□□□ -2.03
YKL050CYKL050C COX12Q01519 83 aa2.38□□□□□ -2.03
YKL050CYKL050C YBL071CP38185 102 aa2.38□□□□□ -2.03
YKL050CYKL050C YSF3P0C074 85 aaPredicted RBP2.38□□□□□ -2.03
YKL050CYKL050C MRX7P53869 86 aa2.38□□□□□ -2.03
YKL050CYKL050C YER188C-AP0C0V2 99 aa2.36□□□□□ -2.03
YKL050CYKL050C PAU6P0CE90 120 aa2.36□□□□□ -2.03
YKL050CYKL050C PAU18P0CE91 120 aa2.36□□□□□ -2.03
YKL050CYKL050C MPC2P38857 129 aa2.36□□□□□ -2.03
YKL050CYKL050C YIL102C-AQ2V2P5 75 aa2.36□□□□□ -2.03
YKL050CYKL050C YGL041C-BQ3E750 60 aa2.36□□□□□ -2.03
YKL050CYKL050C YAL065CO13511 128 aa2.36□□□□□ -2.03
YKL050CYKL050C PDX3P38075 228 aaKnown RBP2.35□□□□□ -2.03
YKL050CYKL050C TIM12P32830 109 aa2.34□□□□□ -2.03
YKL050CYKL050C YEL008WP40001 126 aa2.34□□□□□ -2.03
YKL050CYKL050C BSC4P53841 131 aa2.34□□□□□ -2.03
YKL050CYKL050C MRPL31P14063 131 aaPredicted RBP2.34□□□□□ -2.04
YKL050CYKL050C QCR9P22289 66 aa2.33□□□□□ -2.04
YKL050CYKL050C AIM19P40502 157 aa2.33□□□□□ -2.04
YKL050CYKL050C YGR121W-AQ3E816 71 aa2.33□□□□□ -2.04
YKL050CYKL050C YPR096CO13587 100 aa2.33□□□□□ -2.04
YKL050CYKL050C CCW12Q12127 133 aa2.33□□□□□ -2.04
YKL050CYKL050C YGR035W-AQ45U48 73 aa2.33□□□□□ -2.04
YKL050CYKL050C PAU4P53427 120 aa2.32□□□□□ -2.04
YKL050CYKL050C LCL2Q08045 131 aa2.32□□□□□ -2.04
YKL050CYKL050C COX19Q3E731 98 aa2.32□□□□□ -2.04
YKL050CYKL050C PAU1P0CE88 120 aa2.32□□□□□ -2.04
YKL050CYKL050C PAU14P0CE89 120 aa2.32□□□□□ -2.04
YKL050CYKL050C PAU8P0CE92 120 aa2.32□□□□□ -2.04
YKL050CYKL050C PAU11P0CE93 120 aa2.32□□□□□ -2.04
YKL050CYKL050C PAU13P38725 120 aa2.32□□□□□ -2.04
YKL050CYKL050C PAU10Q03050 120 aa2.32□□□□□ -2.04
YKL050CYKL050C PRM7Q12459 698 aa2.32□□□□□ -2.04
YKL050CYKL050C PAU9Q3E770 120 aa2.32□□□□□ -2.04
YKL050CYKL050C COA3Q3E7B2 85 aa2.32□□□□□ -2.04
YKL050CYKL050C YBR219CP38317 127 aa2.31□□□□□ -2.04
YKL050CYKL050C YHR173CP38864 112 aa2.31□□□□□ -2.04
YKL050CYKL050C YLR162WQ06235 118 aa2.31□□□□□ -2.04
YKL050CYKL050C YDR010CQ12426 110 aa2.31□□□□□ -2.04
YKL050CYKL050C YDR210WQ03482 75 aa2.3□□□□□ -2.04
YKL050CYKL050C YGR240C-AQ3E786 66 aa2.3□□□□□ -2.04
YKL050CYKL050C YNL146C-AQ3E7Z1 64 aa2.3□□□□□ -2.04
YKL050CYKL050C MRPS12P53732 153 aa2.29□□□□□ -2.04
YKL050CYKL050C FPR2P32472 135 aa2.28□□□□□ -2.04
YKL050CYKL050C SPI1P40092 148 aa2.28□□□□□ -2.04
YKL050CYKL050C RPS11AP0CX47 156 aaKnown RBP2.27□□□□□ -2.05
YKL050CYKL050C RPS11BP0CX48 156 aaKnown RBP2.27□□□□□ -2.05
YKL050CYKL050C YSY6P38374 65 aa2.27□□□□□ -2.05
YKL050CYKL050C PAU20Q08322 120 aa2.27□□□□□ -2.05
YKL050CYKL050C NOP10Q6Q547 58 aaPredicted RBP2.27□□□□□ -2.05
YKL050CYKL050C YIL156W-BQ2V2P4 73 aa2.27□□□□□ -2.05
YKL050CYKL050C YJL009WP47078 108 aa2.26□□□□□ -2.05
YKL050CYKL050C GIS2P53849 153 aaKnown RBP RIP-Chip data2.25□□□□□ -2.05 RIP-Chip
YKL050CYKL050C ERI1P62651 68 aaKnown RBP2.25□□□□□ -2.05
YKL050CYKL050C PAU7P39545 55 aa2.24□□□□□ -2.05
YKL050CYKL050C SIP18P50263 79 aa2.24□□□□□ -2.05
YKL050CYKL050C YKL023C-AQ2V2P3 75 aa2.24□□□□□ -2.05
YKL050CYKL050C NCE101Q02820 53 aa2.23□□□□□ -2.05
YKL050CYKL050C YHR086W-AQ3E746 53 aa2.22□□□□□ -2.05
YKL050CYKL050C YDR246W-AQ3E763 66 aa2.22□□□□□ -2.05
YKL050CYKL050C YNL122CP53921 115 aaPredicted RBP2.21□□□□□ -2.06
YKL050CYKL050C YLR255CO13574 117 aa2.2□□□□□ -2.06
YKL050CYKL050C YDL022C-AP0C5L6 82 aa2.19□□□□□ -2.06
YKL050CYKL050C YMR007WQ03675 126 aa2.19□□□□□ -2.06
YKL050CYKL050C AQY2P0CD90 149 aa2.18□□□□□ -2.06
YKL050CYKL050C YOR072WQ08486 104 aa2.18□□□□□ -2.06
YKL050CYKL050C AUA1P32450 94 aa2.18□□□□□ -2.06
YKL050CYKL050C YNL042W-BQ3E7Z2 85 aa2.18□□□□□ -2.06
YKL050CYKL050C SHU1P38751 150 aa2.16□□□□□ -2.06
YKL050CYKL050C LCL1Q02786 101 aa2.16□□□□□ -2.06
YKL050CYKL050C YDL012CQ12489 107 aa2.16□□□□□ -2.06
YKL050CYKL050C YDR182W-AQ3E796 67 aa2.16□□□□□ -2.06
YKL050CYKL050C YMR122W-AQ3E842 84 aa2.16□□□□□ -2.06
YKL050CYKL050C YKL018C-AQ3E7A7 99 aa2.16□□□□□ -2.06
YKL050CYKL050C SMX2P40204 77 aaKnown RBP2.15□□□□□ -2.06
YKL050CYKL050C SGF11Q03067 99 aa2.15□□□□□ -2.07
YKL050CYKL050C ATP17Q06405 101 aa2.15□□□□□ -2.07
YKL050CYKL050C YBR032WP38223 100 aa2.14□□□□□ -2.07
YKL050CYKL050C YBR201C-AQ2V2Q3 67 aa2.14□□□□□ -2.07
YKL050CYKL050C MGR2Q02889 113 aa2.13□□□□□ -2.07
YKL050CYKL050C YHR212W-AP0CX91 67 aa2.13□□□□□ -2.07
YKL050CYKL050C YCR001WP25347 104 aa2.13□□□□□ -2.07
YKL050CYKL050C HUB1Q6Q546 73 aa2.13□□□□□ -2.07
YKL050CYKL050C Q0032Q9ZZX7 96 aa2.13□□□□□ -2.07
YKL050CYKL050C YAR064WP39563 99 aa2.12□□□□□ -2.07
YKL050CYKL050C ATP18P81450 59 aa2.12□□□□□ -2.07
YKL050CYKL050C YOR034C-AQ3E735 80 aa2.12□□□□□ -2.07
YKL050CYKL050C RPL39P04650 51 aa2.12□□□□□ -2.07
YKL050CYKL050C MVB12P42939 101 aa2.12□□□□□ -2.07
YKL050CYKL050C YOL097W-AQ3E7Y9 61 aa2.12□□□□□ -2.07
YKL050CYKL050C HUG1Q6Q5K6 68 aa2.11□□□□□ -2.07
YKL050CYKL050C RPS30AP0CX33 63 aaKnown RBP2.11□□□□□ -2.07
YKL050CYKL050C RPS30BP0CX34 63 aaKnown RBP2.11□□□□□ -2.07
YKL050CYKL050C YNL190WP53872 204 aa2.1□□□□□ -2.07
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 16 ms