RNA–Protein interactions for RNA: YNL207W

RIO2, Essential serine kinase involved in the processing of 20S pre-rRNA, yeast

Gene RIO2, Length 1,278 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RIO2	YNL207W	NCE101	Q02820	53 aa		0.45	□□□□□ -2.34
RIO2	YNL207W	HOR7	Q05827	59 aa		0.45	□□□□□ -2.34
RIO2	YNL207W	NKP2	Q06162	153 aa		0.45	□□□□□ -2.34
RIO2	YNL207W	ACP1	P32463	125 aa		0.44	□□□□□ -2.34
RIO2	YNL207W	POP7	P38291	140 aa		0.44	□□□□□ -2.34
RIO2	YNL207W	YGL204C	P53089	101 aa		0.44	□□□□□ -2.34
RIO2	YNL207W	TVP18	Q04767	167 aa		0.44	□□□□□ -2.34
RIO2	YNL207W	SPC2	Q04969	178 aa		0.44	□□□□□ -2.34
RIO2	YNL207W	YGL041C-B	Q3E750	60 aa		0.44	□□□□□ -2.34
RIO2	YNL207W	YGR240C-A	Q3E786	66 aa		0.44	□□□□□ -2.34
RIO2	YNL207W	RPL39	P04650	51 aa		0.43	□□□□□ -2.34
RIO2	YNL207W	RPL22A	P05749	121 aa	Known RBP	0.43	□□□□□ -2.34
RIO2	YNL207W	SEC59	P20048	519 aa		0.43	□□□□□ -2.34
RIO2	YNL207W	YCR099C	P25657	155 aa		0.43	□□□□□ -2.34
RIO2	YNL207W	HYM1	P32464	399 aa		0.43	□□□□□ -2.34
RIO2	YNL207W	VPS55	P47111	140 aa		0.43	□□□□□ -2.34
RIO2	YNL207W	YGR042W	P53227	271 aa		0.43	□□□□□ -2.34
RIO2	YNL207W	COX12	Q01519	83 aa		0.43	□□□□□ -2.34
RIO2	YNL207W	CNL1	Q06333	122 aa		0.43	□□□□□ -2.34
RIO2	YNL207W	SLO1	Q3E784	85 aa		0.43	□□□□□ -2.34
RIO2	YNL207W	DYN2	Q02647	92 aa		0.42	□□□□□ -2.34
RIO2	YNL207W	ARL3	Q02804	198 aa		0.42	□□□□□ -2.34
RIO2	YNL207W	SGF11	Q03067	99 aa		0.42	□□□□□ -2.34
RIO2	YNL207W	NHP10	Q03435	203 aa		0.42	□□□□□ -2.34
RIO2	YNL207W	ENV10	Q99382	181 aa		0.42	□□□□□ -2.34
RIO2	YNL207W	MRP49	P32388	137 aa		0.41	□□□□□ -2.34
RIO2	YNL207W	VMA7	P39111	118 aa		0.41	□□□□□ -2.34
RIO2	YNL207W	SAE3	P89114	91 aa		0.41	□□□□□ -2.34
RIO2	YNL207W	LCL1	Q02786	101 aa		0.41	□□□□□ -2.34
RIO2	YNL207W	YDR010C	Q12426	110 aa		0.41	□□□□□ -2.34
RIO2	YNL207W	SFT1	P43682	97 aa		0.4	□□□□□ -2.35
RIO2	YNL207W	APS2	Q00381	147 aa		0.4	□□□□□ -2.35
RIO2	YNL207W	YIL014C-A	Q02598	104 aa		0.4	□□□□□ -2.35
RIO2	YNL207W	SPC24	Q04477	213 aa		0.4	□□□□□ -2.35
RIO2	YNL207W	FRQ1	Q06389	190 aa		0.4	□□□□□ -2.35
RIO2	YNL207W	WIP1	Q2V2P8	89 aa		0.4	□□□□□ -2.35
RIO2	YNL207W	YLR361C-A	Q3E795	98 aa		0.4	□□□□□ -2.35
RIO2	YNL207W	YMR105W-A	Q8TGS8	64 aa		0.4	□□□□□ -2.35
RIO2	YNL207W	YOR304C-A	O14468	76 aa		0.39	□□□□□ -2.35
RIO2	YNL207W	RPB11	P38902	120 aa		0.39	□□□□□ -2.35
RIO2	YNL207W	YOR343C	Q12484	108 aa		0.39	□□□□□ -2.35
RIO2	YNL207W	YLR099W-A	Q3E798	87 aa		0.39	□□□□□ -2.35
RIO2	YNL207W	YDR034C-A	P0C289	58 aa		0.38	□□□□□ -2.35
RIO2	YNL207W	YKL044W	P36092	106 aa		0.38	□□□□□ -2.35
RIO2	YNL207W	TDA2	P40045	126 aa		0.38	□□□□□ -2.35
RIO2	YNL207W	SPC1	P46965	94 aa		0.38	□□□□□ -2.35
RIO2	YNL207W	AIM11	P87275	137 aa		0.38	□□□□□ -2.35
RIO2	YNL207W	RUB1	Q03919	77 aa		0.38	□□□□□ -2.35
RIO2	YNL207W	GPI19	Q04082	140 aa		0.38	□□□□□ -2.35
RIO2	YNL207W	YLR118C	Q12354	227 aa		0.38	□□□□□ -2.35
RIO2	YNL207W	MHF2	Q3E829	80 aa		0.38	□□□□□ -2.35
RIO2	YNL207W	ADK1	P07170	222 aa	Known RBP	0.37	□□□□□ -2.35
RIO2	YNL207W	SNF11	P38956	169 aa		0.37	□□□□□ -2.35
RIO2	YNL207W	YEA6	P39953	335 aa		0.37	□□□□□ -2.35
RIO2	YNL207W	RGI1	P40043	161 aa	Predicted RBP	0.37	□□□□□ -2.35
RIO2	YNL207W	YLR042C	Q07990	161 aa		0.37	□□□□□ -2.35
RIO2	YNL207W	YIR021W-A	Q3E739	70 aa		0.37	□□□□□ -2.35
RIO2	YNL207W	YCR075W-A	Q3E830	75 aa		0.37	□□□□□ -2.35
RIO2	YNL207W	SRB6	P32570	121 aa		0.36	□□□□□ -2.35
RIO2	YNL207W	LHP1	P33399	275 aa	Known RBP	0.36	□□□□□ -2.35
RIO2	YNL207W	YHR130C	P38834	111 aa		0.36	□□□□□ -2.35
RIO2	YNL207W	YAR029W	P39549	74 aa		0.36	□□□□□ -2.35
RIO2	YNL207W	YER137C	P40083	148 aa	Known RBP	0.36	□□□□□ -2.35
RIO2	YNL207W	CYB5	P40312	120 aa		0.36	□□□□□ -2.35
RIO2	YNL207W	VMA21	P41806	77 aa		0.36	□□□□□ -2.35
RIO2	YNL207W	PAM16	P42949	149 aa		0.36	□□□□□ -2.35
RIO2	YNL207W	FYV7	Q12247	151 aa		0.36	□□□□□ -2.35
RIO2	YNL207W	DAD1	Q12248	94 aa		0.36	□□□□□ -2.35
RIO2	YNL207W	TIM12	P32830	109 aa		0.35	□□□□□ -2.35
RIO2	YNL207W	GTT1	P40582	234 aa		0.35	□□□□□ -2.35
RIO2	YNL207W	SNN1	P48232	102 aa		0.35	□□□□□ -2.35
RIO2	YNL207W	TOM7	P53507	60 aa		0.35	□□□□□ -2.35
RIO2	YNL207W	ZEO1	Q08245	113 aa		0.35	□□□□□ -2.35
RIO2	YNL207W	YPL225W	Q08971	146 aa	Known RBP	0.35	□□□□□ -2.35
RIO2	YNL207W	YPL261C	Q08976	102 aa		0.35	□□□□□ -2.35
RIO2	YNL207W	YLR363W-A	Q3E747	85 aa		0.35	□□□□□ -2.35
RIO2	YNL207W	YOR376W-A	Q3E805	51 aa		0.35	□□□□□ -2.35
RIO2	YNL207W	PCC1	Q3E833	88 aa		0.35	□□□□□ -2.35
RIO2	YNL207W	OST5	Q92316	86 aa		0.35	□□□□□ -2.35
RIO2	YNL207W	PAU19	P0CE85	124 aa		0.34	□□□□□ -2.36
RIO2	YNL207W	RPS11A	P0CX47	156 aa	Known RBP	0.34	□□□□□ -2.36
RIO2	YNL207W	RPS11B	P0CX48	156 aa	Known RBP	0.34	□□□□□ -2.36
RIO2	YNL207W	HMRA2	P0CY13	119 aa		0.34	□□□□□ -2.36
RIO2	YNL207W	PAU3	P25610	124 aa		0.34	□□□□□ -2.36
RIO2	YNL207W	YHR138C	P38841	114 aa	Predicted RBP	0.34	□□□□□ -2.36
RIO2	YNL207W	YER187W	P40102	141 aa		0.34	□□□□□ -2.36
RIO2	YNL207W	GNA1	P43577	159 aa	Predicted RBP	0.34	□□□□□ -2.36
RIO2	YNL207W	YGR164W	P53291	111 aa		0.34	□□□□□ -2.36
RIO2	YNL207W	RPL22B	P56628	122 aa	Known RBP	0.34	□□□□□ -2.36
RIO2	YNL207W	YOR289W	Q12012	251 aa	Predicted RBP	0.34	□□□□□ -2.36
RIO2	YNL207W	YLR285C-A	Q3E771	56 aa		0.34	□□□□□ -2.36
RIO2	YNL207W	YBR072C-A	Q3E794	53 aa		0.34	□□□□□ -2.36
RIO2	YNL207W	YLR365W	Q7LIF2	110 aa		0.34	□□□□□ -2.36
RIO2	YNL207W	YPR010C-A	A5Z2X5	72 aa		0.33	□□□□□ -2.36
RIO2	YNL207W	YER039C-A	P0CD97	72 aa		0.33	□□□□□ -2.36
RIO2	YNL207W	BUD23	P25627	275 aa	Predicted RBP	0.33	□□□□□ -2.36
RIO2	YNL207W	PAU2	P32612	120 aa		0.33	□□□□□ -2.36
RIO2	YNL207W	MRPL38	P35996	138 aa	Predicted RBP	0.33	□□□□□ -2.36
RIO2	YNL207W	COX23	P38824	151 aa		0.33	□□□□□ -2.36
RIO2	YNL207W	AIM19	P40502	157 aa		0.33	□□□□□ -2.36

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 107.3 ms