RNA–Protein interactions for RNA: YJL139C

YUR1, Transcript of Mannosyltransferase involved in protein N-glycosylation, yeast

Gene YUR1, Length 1,287 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YUR1	YJL139C	GAT3	Q07928	141 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YUR1	YJL139C	QCR8	P08525	94 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YUR1	YJL139C	BET1	P22804	142 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YUR1	YJL139C	YRA2	P36036	203 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.89	□□□□□ -1.63	not detected
YUR1	YJL139C	YBR209W	P38311	105 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YUR1	YJL139C	YNL194C	P40169	301 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YUR1	YJL139C	KEG1	P43614	200 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YUR1	YJL139C	YGL260W	P53056	76 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YUR1	YJL139C	YLR412C-A	Q3E742	68 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YUR1	YJL139C	YBR200W-A	Q3E755	54 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YUR1	YJL139C	GCN1	P33892	2672 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
YUR1	YJL139C	YHR022C	P38763	256 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YUR1	YJL139C	CTR2	P38865	189 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YUR1	YJL139C	POR2	P40478	281 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YUR1	YJL139C	YMR175W-A	Q3E766	64 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YUR1	YJL139C	TEL1	P38110	2787 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YUR1	YJL139C	YGR164W	P53291	111 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YUR1	YJL139C	PPT2	Q12036	173 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YUR1	YJL139C	YDL009C	Q12210	107 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YUR1	YJL139C	YLR285C-A	Q3E771	56 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YUR1	YJL139C	KSH1	Q8TGJ3	72 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YUR1	YJL139C	TOR1	P35169	2470 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YUR1	YJL139C	YBR056W-A	I2HB52	66 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YUR1	YJL139C	KRE9	P39005	276 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YUR1	YJL139C	ARC15	P40518	154 aa	RIP-Chip data	4.86	□□□□□ -1.63	not detected
YUR1	YJL139C	RGM1	Q00453	211 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YUR1	YJL139C	HAL1	Q01766	294 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YUR1	YJL139C	IRC21	Q04772	201 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YUR1	YJL139C	PBP4	Q07362	185 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
YUR1	YJL139C	YOL085C	Q99345	113 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YUR1	YJL139C	YGR025W	P53216	100 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YUR1	YJL139C	YMR320W	Q04897	101 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YUR1	YJL139C	UBC4	P15731	148 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YUR1	YJL139C	YLR156W	P0CE96	114 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YUR1	YJL139C	YLR159W	P0CE97	114 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YUR1	YJL139C	YLR161W	P0CE98	114 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YUR1	YJL139C	YJR107C-A	P0CT86	78 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YUR1	YJL139C	AIM4	P38305	123 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
YUR1	YJL139C	YEL008W	P40001	126 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YUR1	YJL139C	YDR246W-A	Q3E763	66 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YUR1	YJL139C	YGL088W	P53151	121 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YUR1	YJL139C	YNL046W	P53956	172 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YUR1	YJL139C	CCW12	Q12127	133 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YUR1	YJL139C	YOR034C-A	Q3E735	80 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YUR1	YJL139C	YOR020W-A	Q3E824	90 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YUR1	YJL139C	SED1	Q01589	338 aa		4.81	□□□□□ -1.64
YUR1	YJL139C	YLR281C	Q05863	155 aa		4.81	□□□□□ -1.64
YUR1	YJL139C	PRP8	P33334	2413 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
YUR1	YJL139C	YLR236C	A0A023PZG4	107 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YUR1	YJL139C	YHL037C	P38733	133 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YUR1	YJL139C	MIG3	P39943	394 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YUR1	YJL139C	RSM19	P53733	91 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
YUR1	YJL139C	ATP20	Q12233	115 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YUR1	YJL139C	TRA1	P38811	3744 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YUR1	YJL139C	YFL019C	P43576	117 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YUR1	YJL139C	WWM1	P43582	211 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
YUR1	YJL139C	SFT1	P43682	97 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YUR1	YJL139C	SPS100	P13130	326 aa		4.78	□□□□□ -1.64
YUR1	YJL139C	EDC1	P53080	175 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
YUR1	YJL139C	YNL277W-A	Q3E7Z0	62 aa		4.78	□□□□□ -1.64
YUR1	YJL139C	YCR041W	P37265	110 aa		4.77	□□□□□ -1.65
YUR1	YJL139C	YAR029W	P39549	74 aa		4.77	□□□□□ -1.65
YUR1	YJL139C	RPR2	P40571	144 aa		4.77	□□□□□ -1.65
YUR1	YJL139C	ATP18	P81450	59 aa		4.77	□□□□□ -1.65
YUR1	YJL139C	YKL183C-A	Q3E765	70 aa		4.77	□□□□□ -1.65
YUR1	YJL139C	YOR011W-A	Q3E807	68 aa		4.77	□□□□□ -1.65
YUR1	YJL139C	TDA8	Q6B2U8	126 aa		4.77	□□□□□ -1.65
YUR1	YJL139C	ERI1	P62651	68 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
YUR1	YJL139C	SRL1	Q08673	210 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YUR1	YJL139C	YCL048W-A	Q2V2Q2	79 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YUR1	YJL139C	YNL146C-A	Q3E7Z1	64 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YUR1	YJL139C	MEC1	P38111	2368 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YUR1	YJL139C	COX14	P39103	70 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YUR1	YJL139C	YER135C	P40082	130 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YUR1	YJL139C	YFR035C	P43608	114 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YUR1	YJL139C	YMR295C	Q03559	197 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YUR1	YJL139C	SPG4	Q04438	115 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YUR1	YJL139C	YLL006W-A	Q3E814	58 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YUR1	YJL139C	GAT4	P40569	121 aa		4.74	□□□□□ -1.65
YUR1	YJL139C	MPC3	P53311	146 aa		4.74	□□□□□ -1.65
YUR1	YJL139C	ICY1	Q04329	127 aa		4.74	□□□□□ -1.65
YUR1	YJL139C	YAL065C	O13511	128 aa		4.73	□□□□□ -1.65
YUR1	YJL139C	YCR043C	P25361	127 aa		4.73	□□□□□ -1.65
YUR1	YJL139C	RPL38	P49167	78 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
YUR1	YJL139C	PMP3	P87284	55 aa		4.73	□□□□□ -1.65
YUR1	YJL139C	YPR013C	Q12145	317 aa		4.73	□□□□□ -1.65
YUR1	YJL139C	YOR314W	Q12506	109 aa		4.73	□□□□□ -1.65
YUR1	YJL139C	RSM18	P40033	138 aa		4.71	□□□□□ -1.66
YUR1	YJL139C	TDA2	P40045	126 aa		4.71	□□□□□ -1.66
YUR1	YJL139C	YDR182W-A	Q3E796	67 aa		4.71	□□□□□ -1.66
YUR1	YJL139C	NOP10	Q6Q547	58 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.66
YUR1	YJL139C	VAM10	Q08474	114 aa		4.7	□□□□□ -1.66
YUR1	YJL139C	TSC3	Q3E790	80 aa		4.7	□□□□□ -1.66
YUR1	YJL139C	RRT15	Q3E811	62 aa		4.7	□□□□□ -1.66
YUR1	YJL139C	RPL36B	O14455	100 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
YUR1	YJL139C	RPL26A	P05743	127 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
YUR1	YJL139C	RPL36A	P05745	100 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
YUR1	YJL139C	RPL26B	P53221	127 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
YUR1	YJL139C	YFR009W-A	P0C5M9	85 aa		4.68	□□□□□ -1.66
YUR1	YJL139C	YBR219C	P38317	127 aa		4.68	□□□□□ -1.66

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