RNA–Protein interactions for RNA: YGL197W

MDS3, Transcript of Putative component of the TOR regulatory pathway, yeastyeast

Gene MDS3, Length 4,464 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
MDS3YGL197W COX12Q01519 83 aa0.89□□□□□ -2.27
MDS3YGL197W YPR203WQ08994 102 aa0.89□□□□□ -2.27
MDS3YGL197W ATG41Q12048 136 aa0.89□□□□□ -2.27
MDS3YGL197W YPR011CQ12251 326 aa0.89□□□□□ -2.27
MDS3YGL197W FAS1P07149 2051 aaKnown RBP0.89□□□□□ -2.27
MDS3YGL197W YKL044WP36092 106 aa0.89□□□□□ -2.27
MDS3YGL197W YMR141CP40211 102 aa0.89□□□□□ -2.27
MDS3YGL197W MPC3P53311 146 aa0.89□□□□□ -2.27
MDS3YGL197W YNL146C-AQ3E7Z1 64 aa0.89□□□□□ -2.27
MDS3YGL197W YAL064WP39711 94 aa0.88□□□□□ -2.27
MDS3YGL197W YCR095W-AQ3E787 52 aa0.88□□□□□ -2.27
MDS3YGL197W YFL041W-AQ3E817 63 aa0.88□□□□□ -2.27
MDS3YGL197W COA2Q3E823 68 aa0.88□□□□□ -2.27
MDS3YGL197W YJL009WP47078 108 aa0.88□□□□□ -2.27
MDS3YGL197W MIC27P50945 234 aa0.88□□□□□ -2.27
MDS3YGL197W UPS3Q04006 179 aa0.88□□□□□ -2.27
MDS3YGL197W YPR153WQ06537 140 aa0.88□□□□□ -2.27
MDS3YGL197W YHR214C-EQ8TGK0 99 aa0.88□□□□□ -2.27
MDS3YGL197W UBC4P15731 148 aa0.88□□□□□ -2.27
MDS3YGL197W PAU7P39545 55 aa0.88□□□□□ -2.27
MDS3YGL197W VPS55P47111 140 aa0.88□□□□□ -2.27
MDS3YGL197W SOM1Q05676 74 aa0.88□□□□□ -2.27
MDS3YGL197W PAU20Q08322 120 aa0.88□□□□□ -2.27
MDS3YGL197W YOR385WQ08909 290 aa0.88□□□□□ -2.27
MDS3YGL197W YLR236CA0A023PZG4 107 aa0.87□□□□□ -2.27
MDS3YGL197W YOL014WQ08110 124 aa0.87□□□□□ -2.27
MDS3YGL197W IRC23Q08416 157 aa0.87□□□□□ -2.27
MDS3YGL197W VAM10Q08474 114 aa0.87□□□□□ -2.27
MDS3YGL197W YPR013CQ12145 317 aa0.87□□□□□ -2.27
MDS3YGL197W YIL102C-AQ2V2P5 75 aa0.87□□□□□ -2.27
MDS3YGL197W YGL194C-AQ2V2P6 80 aa0.87□□□□□ -2.27
MDS3YGL197W RPS22BQ3E7Y3 130 aaKnown RBP0.87□□□□□ -2.27
MDS3YGL197W YOL097W-AQ3E7Y9 61 aa0.87□□□□□ -2.27
MDS3YGL197W PAU19P0CE85 124 aa0.87□□□□□ -2.27
MDS3YGL197W PAU3P25610 124 aa0.87□□□□□ -2.27
MDS3YGL197W FPR2P32472 135 aa0.87□□□□□ -2.27
MDS3YGL197W YHR180WP38868 163 aa0.87□□□□□ -2.27
MDS3YGL197W PGU1P47180 361 aa0.87□□□□□ -2.27
MDS3YGL197W YER187WP40102 141 aa0.87□□□□□ -2.27
MDS3YGL197W AVO2Q04749 426 aa0.87□□□□□ -2.27
MDS3YGL197W CSI2Q08054 341 aa0.87□□□□□ -2.27
MDS3YGL197W YPL038W-AQ3E7B4 63 aa0.87□□□□□ -2.27
MDS3YGL197W PCC1Q3E833 88 aa0.87□□□□□ -2.27
MDS3YGL197W PAU16P35994 123 aa0.87□□□□□ -2.27
MDS3YGL197W YEL028WP39989 153 aa0.87□□□□□ -2.27
MDS3YGL197W PAU15P40585 124 aa0.87□□□□□ -2.27
MDS3YGL197W SMD3P43321 101 aaKnown RBP0.87□□□□□ -2.27
MDS3YGL197W OLI1P61829 76 aa0.87□□□□□ -2.27
MDS3YGL197W QCR9P22289 66 aa0.86□□□□□ -2.27
MDS3YGL197W AIM4P38305 123 aaPredicted RBP0.86□□□□□ -2.27
MDS3YGL197W YSY6P38374 65 aa0.86□□□□□ -2.27
MDS3YGL197W LSM6Q06406 86 aaKnown RBP0.86□□□□□ -2.27
MDS3YGL197W YFR032C-BQ8TGU2 87 aa0.86□□□□□ -2.27
MDS3YGL197W RPB7P34087 171 aa0.86□□□□□ -2.27
MDS3YGL197W PIR5P46999 287 aa0.86□□□□□ -2.27
MDS3YGL197W ICS3P47034 131 aa0.86□□□□□ -2.27
MDS3YGL197W COA4Q05809 96 aa0.86□□□□□ -2.27
MDS3YGL197W YPR145C-AQ2V2P0 78 aa0.86□□□□□ -2.27
MDS3YGL197W YKL023C-AQ2V2P3 75 aa0.86□□□□□ -2.27
MDS3YGL197W YDR381C-AQ3E6R5 114 aa0.86□□□□□ -2.27
MDS3YGL197W COX9P07255 59 aa0.86□□□□□ -2.27
MDS3YGL197W LST8P41318 303 aa0.86□□□□□ -2.27
MDS3YGL197W YFR035CP43608 114 aa0.86□□□□□ -2.27
MDS3YGL197W BRP1P53194 125 aa0.86□□□□□ -2.27
MDS3YGL197W YOR314WQ12506 109 aa0.86□□□□□ -2.27
MDS3YGL197W PAM17P36147 197 aa0.85□□□□□ -2.27
MDS3YGL197W MRX7P53869 86 aa0.85□□□□□ -2.27
MDS3YGL197W YMR082CQ04276 118 aa0.85□□□□□ -2.27
MDS3YGL197W YLR146W-AQ2V2P1 62 aa0.85□□□□□ -2.27
MDS3YGL197W POR2P40478 281 aa0.85□□□□□ -2.27
MDS3YGL197W IMP2P46972 177 aa0.85□□□□□ -2.27
MDS3YGL197W BSC4P53841 131 aa0.85□□□□□ -2.27
MDS3YGL197W MIM1Q08176 113 aa0.85□□□□□ -2.27
MDS3YGL197W MIC10Q96VH5 97 aa0.85□□□□□ -2.27
MDS3YGL197W PAU5P43575 122 aa0.85□□□□□ -2.27
MDS3YGL197W YDR274CP87283 123 aa0.85□□□□□ -2.27
MDS3YGL197W YOR268CQ08734 132 aa0.85□□□□□ -2.27
MDS3YGL197W KSH1Q8TGJ3 72 aa0.85□□□□□ -2.27
MDS3YGL197W YFR010W-AP0C5N0 62 aa0.85□□□□□ -2.27
MDS3YGL197W MGR2Q02889 113 aa0.85□□□□□ -2.27
MDS3YGL197W YHR213WP0CI67 198 aa0.84□□□□□ -2.27
MDS3YGL197W YHR173CP38864 112 aa0.84□□□□□ -2.27
MDS3YGL197W GAT4P40569 121 aa0.84□□□□□ -2.27
MDS3YGL197W YDR182W-AQ3E796 67 aa0.84□□□□□ -2.27
MDS3YGL197W YIL134C-AQ45U18 67 aa0.84□□□□□ -2.27
MDS3YGL197W MRPL31P14063 131 aaPredicted RBP0.84□□□□□ -2.27
MDS3YGL197W RPB9P27999 122 aa0.84□□□□□ -2.27
MDS3YGL197W POC4Q12245 148 aaPredicted RBP0.84□□□□□ -2.27
MDS3YGL197W ROX3P25046 220 aa0.84□□□□□ -2.28
MDS3YGL197W MPC2P38857 129 aa0.84□□□□□ -2.28
MDS3YGL197W RPL38P49167 78 aaKnown RBP0.84□□□□□ -2.28
MDS3YGL197W SGF11Q03067 99 aa0.84□□□□□ -2.28
MDS3YGL197W ICY1Q04329 127 aa0.84□□□□□ -2.28
MDS3YGL197W COX8P04039 78 aa0.83□□□□□ -2.28
MDS3YGL197W YEL067CP39978 195 aa0.83□□□□□ -2.28
MDS3YGL197W YLR194CQ05777 254 aa0.83□□□□□ -2.28
MDS3YGL197W YHR213W-BQ8TGK1 99 aa0.83□□□□□ -2.28
MDS3YGL197W HSP150P32478 413 aa0.83□□□□□ -2.28
MDS3YGL197W YAR064WP39563 99 aa0.83□□□□□ -2.28
MDS3YGL197W YEL014CP39999 101 aa0.83□□□□□ -2.28
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