RNA–Protein interactions for RNA: YMR001C-A

YMR001C-A, Transcript of Putative protein of unknown function, yeastyeast

Gene YMR001C-A, Length 231 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YMR001C-AYMR001C-A YGR025WP53216 100 aa-1.99□□□□□ -2.73
YMR001C-AYMR001C-A DAD1Q12248 94 aa-1.99□□□□□ -2.73
YMR001C-AYMR001C-A PAU2P32612 120 aa-2□□□□□ -2.73
YMR001C-AYMR001C-A GIM4P40005 111 aaKnown RBP-2□□□□□ -2.73
YMR001C-AYMR001C-A YER187WP40102 141 aa-2□□□□□ -2.73
YMR001C-AYMR001C-A SFT1P43682 97 aa-2□□□□□ -2.73
YMR001C-AYMR001C-A TDA2P40045 126 aa-2.01□□□□□ -2.73
YMR001C-AYMR001C-A SAE3P89114 91 aa-2.01□□□□□ -2.73
YMR001C-AYMR001C-A SSN2P38931 1420 aa-2.01□□□□□ -2.73
YMR001C-AYMR001C-A PDX3P38075 228 aaKnown RBP-2.02□□□□□ -2.73
YMR001C-AYMR001C-A SPC24Q04477 213 aa-2.02□□□□□ -2.73
YMR001C-AYMR001C-A GTT1P40582 234 aa-2.03□□□□□ -2.73
YMR001C-AYMR001C-A MRX7P53869 86 aa-2.03□□□□□ -2.73
YMR001C-AYMR001C-A PAU19P0CE85 124 aa-2.04□□□□□ -2.74
YMR001C-AYMR001C-A PAU3P25610 124 aa-2.04□□□□□ -2.74
YMR001C-AYMR001C-A YHR138CP38841 114 aaPredicted RBP-2.04□□□□□ -2.74
YMR001C-AYMR001C-A RSM18P40033 138 aa-2.04□□□□□ -2.74
YMR001C-AYMR001C-A ICY1Q04329 127 aa-2.04□□□□□ -2.74
YMR001C-AYMR001C-A YGL204CP53089 101 aa-2.07□□□□□ -2.74
YMR001C-AYMR001C-A RPS20P38701 121 aaKnown RBP-2.08□□□□□ -2.74
YMR001C-AYMR001C-A HKR1P41809 1802 aa-2.09□□□□□ -2.74
YMR001C-AYMR001C-A MRP17P28778 131 aa-2.1□□□□□ -2.75
YMR001C-AYMR001C-A YCR099CP25657 155 aa-2.11□□□□□ -2.75
YMR001C-AYMR001C-A SRB8P25648 1427 aa-2.11□□□□□ -2.75
YMR001C-AYMR001C-A YRF1-1P0CX20 1796 aa-2.11□□□□□ -2.75
YMR001C-AYMR001C-A YRF1-5P0CX21 1796 aa-2.11□□□□□ -2.75
YMR001C-AYMR001C-A YRF1-8P0CX22 1796 aa-2.11□□□□□ -2.75
YMR001C-AYMR001C-A TOR1P35169 2470 aa-2.12□□□□□ -2.75
YMR001C-AYMR001C-A YLR118CQ12354 227 aa-2.12□□□□□ -2.75
YMR001C-AYMR001C-A YIR021W-AQ3E739 70 aa-2.12□□□□□ -2.75
YMR001C-AYMR001C-A YLR419WQ06698 1435 aaKnown RBP-2.12□□□□□ -2.75
YMR001C-AYMR001C-A MYO2P19524 1574 aaKnown RBP-2.12□□□□□ -2.75
YMR001C-AYMR001C-A BUD4P47136 1447 aa-2.13□□□□□ -2.75
YMR001C-AYMR001C-A PAU15P40585 124 aa-2.13□□□□□ -2.75
YMR001C-AYMR001C-A YDR278CQ05612 105 aa-2.13□□□□□ -2.75
YMR001C-AYMR001C-A PAU20Q08322 120 aa-2.13□□□□□ -2.75
YMR001C-AYMR001C-A YLR361C-AQ3E795 98 aa-2.13□□□□□ -2.75
YMR001C-AYMR001C-A NTE1Q04958 1679 aa-2.15□□□□□ -2.75
YMR001C-AYMR001C-A SRB6P32570 121 aa-2.15□□□□□ -2.75
YMR001C-AYMR001C-A SMD2Q06217 110 aaKnown RBP-2.15□□□□□ -2.75
YMR001C-AYMR001C-A BPH1P25356 2167 aa-2.16□□□□□ -2.75
YMR001C-AYMR001C-A MIX14Q04341 121 aa-2.16□□□□□ -2.76
YMR001C-AYMR001C-A COX7P10174 60 aa-2.17□□□□□ -2.76
YMR001C-AYMR001C-A PAU16P35994 123 aa-2.18□□□□□ -2.76
YMR001C-AYMR001C-A YLR365WQ7LIF2 110 aa-2.18□□□□□ -2.76
YMR001C-AYMR001C-A TIM8P57744 87 aa-2.2□□□□□ -2.76
YMR001C-AYMR001C-A SNA2P56508 79 aa-2.21□□□□□ -2.76
YMR001C-AYMR001C-A ECM12O13529 151 aa-2.22□□□□□ -2.76
YMR001C-AYMR001C-A VMA21P41806 77 aa-2.22□□□□□ -2.76
YMR001C-AYMR001C-A TY1B-BRQ12193 1756 aa-2.23□□□□□ -2.77
YMR001C-AYMR001C-A AIM19P40502 157 aa-2.23□□□□□ -2.77
YMR001C-AYMR001C-A NKP2Q06162 153 aa-2.23□□□□□ -2.77
YMR001C-AYMR001C-A YNR034W-AQ3E841 98 aa-2.23□□□□□ -2.77
YMR001C-AYMR001C-A RPB11P38902 120 aa-2.24□□□□□ -2.77
YMR001C-AYMR001C-A HUR1P45820 110 aa-2.24□□□□□ -2.77
YMR001C-AYMR001C-A YCR095W-AQ3E787 52 aa-2.25□□□□□ -2.77
YMR001C-AYMR001C-A PAU6P0CE90 120 aa-2.27□□□□□ -2.77
YMR001C-AYMR001C-A PAU18P0CE91 120 aa-2.27□□□□□ -2.77
YMR001C-AYMR001C-A SWC7Q06707 132 aa-2.27□□□□□ -2.77
YMR001C-AYMR001C-A MIC10Q96VH5 97 aa-2.27□□□□□ -2.77
YMR001C-AYMR001C-A YMR001C-AQ8TGS9 76 aa-2.28□□□□□ -2.77
YMR001C-AYMR001C-A BPT1P14772 1559 aa-2.28□□□□□ -2.77
YMR001C-AYMR001C-A Q0032Q9ZZX7 96 aa-2.29□□□□□ -2.78
YMR001C-AYMR001C-A PAU1P0CE88 120 aa-2.3□□□□□ -2.78
YMR001C-AYMR001C-A PAU14P0CE89 120 aa-2.3□□□□□ -2.78
YMR001C-AYMR001C-A PAU8P0CE92 120 aa-2.3□□□□□ -2.78
YMR001C-AYMR001C-A PAU11P0CE93 120 aa-2.3□□□□□ -2.78
YMR001C-AYMR001C-A BUD23P25627 275 aaPredicted RBP-2.3□□□□□ -2.78
YMR001C-AYMR001C-A MRP49P32388 137 aa-2.3□□□□□ -2.78
YMR001C-AYMR001C-A PAU13P38725 120 aa-2.3□□□□□ -2.78
YMR001C-AYMR001C-A YAR029WP39549 74 aa-2.3□□□□□ -2.78
YMR001C-AYMR001C-A PAU10Q03050 120 aa-2.3□□□□□ -2.78
YMR001C-AYMR001C-A PAU9Q3E770 120 aa-2.3□□□□□ -2.78
YMR001C-AYMR001C-A YBL044WP38194 122 aa-2.31□□□□□ -2.78
YMR001C-AYMR001C-A RGI1P40043 161 aaPredicted RBP-2.31□□□□□ -2.78
YMR001C-AYMR001C-A YNL042W-BQ3E7Z2 85 aa-2.31□□□□□ -2.78
YMR001C-AYMR001C-A MMS1Q06211 1407 aa-2.32□□□□□ -2.78
YMR001C-AYMR001C-A APS2Q00381 147 aa-2.32□□□□□ -2.78
YMR001C-AYMR001C-A TY1B-PR2P0C2J0 1756 aa-2.34□□□□□ -2.78
YMR001C-AYMR001C-A DNF3Q12674 1656 aa-2.34□□□□□ -2.78
YMR001C-AYMR001C-A TOM6P33448 61 aa-2.35□□□□□ -2.79
YMR001C-AYMR001C-A YBL071CP38185 102 aa-2.36□□□□□ -2.79
YMR001C-AYMR001C-A EDC1P53080 175 aaPredicted RBP-2.36□□□□□ -2.79
YMR001C-AYMR001C-A RTR2Q12378 196 aa-2.37□□□□□ -2.79
YMR001C-AYMR001C-A YLR099W-AQ3E798 87 aa-2.37□□□□□ -2.79
YMR001C-AYMR001C-A ROX3P25046 220 aa-2.38□□□□□ -2.79
YMR001C-AYMR001C-A PAU4P53427 120 aa-2.39□□□□□ -2.79
YMR001C-AYMR001C-A YBR201C-AQ2V2Q3 67 aa-2.4□□□□□ -2.79
YMR001C-AYMR001C-A SDH6Q3E785 79 aa-2.4□□□□□ -2.79
YMR001C-AYMR001C-A VMA7P39111 118 aa-2.41□□□□□ -2.8
YMR001C-AYMR001C-A YLR042CQ07990 161 aa-2.41□□□□□ -2.8
YMR001C-AYMR001C-A PAU5P43575 122 aa-2.42□□□□□ -2.8
YMR001C-AYMR001C-A DYN2Q02647 92 aa-2.42□□□□□ -2.8
YMR001C-AYMR001C-A TLG1Q03322 224 aa-2.43□□□□□ -2.8
YMR001C-AYMR001C-A SPC2Q04969 178 aa-2.43□□□□□ -2.8
YMR001C-AYMR001C-A FMP27Q06179 2628 aa-2.43□□□□□ -2.8
YMR001C-AYMR001C-A TY1B-DR5P0C2I2 1755 aa-2.44□□□□□ -2.8
YMR001C-AYMR001C-A TY1B-DR6P0C2I3 1755 aa-2.44□□□□□ -2.8
YMR001C-AYMR001C-A TY1B-LR2P0C2I5 1755 aa-2.44□□□□□ -2.8
YMR001C-AYMR001C-A TY1B-PR1P0C2I9 1755 aaKnown RBP-2.44□□□□□ -2.8
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 42.7 ms