RNA–Protein interactions for RNA: YER128W

VFA1, Transcript of Protein that interacts with Vps4p and has a role in vacuolar sorting, yeastyeast

Gene VFA1, Length 612 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VFA1YER128W DDR48P18899 430 aaKnown RBP2.69□□□□□ -1.98
VFA1YER128W LDB16P25587 256 aa2.69□□□□□ -1.98
VFA1YER128W YAL064WP39711 94 aa2.69□□□□□ -1.98
VFA1YER128W YNL200CP40165 246 aaKnown RBP2.69□□□□□ -1.98
VFA1YER128W SIM1P40472 476 aa2.69□□□□□ -1.98
VFA1YER128W ICS3P47034 131 aa2.69□□□□□ -1.98
VFA1YER128W BRP1P53194 125 aa2.69□□□□□ -1.98
VFA1YER128W YHR214C-DP0CX93 97 aa2.68□□□□□ -1.98
VFA1YER128W RPB9P27999 122 aa2.68□□□□□ -1.98
VFA1YER128W YER135CP40082 130 aa2.68□□□□□ -1.98
VFA1YER128W YGR018CP53211 109 aa2.68□□□□□ -1.98
VFA1YER128W SPG3Q04398 127 aaPredicted RBP2.68□□□□□ -1.98
VFA1YER128W PBA1Q05778 276 aa2.68□□□□□ -1.98
VFA1YER128W YPL261CQ08976 102 aa2.68□□□□□ -1.98
VFA1YER128W TDA8Q6B2U8 126 aa2.68□□□□□ -1.98
VFA1YER128W RPL26AP05743 127 aaKnown RBP2.67□□□□□ -1.98
VFA1YER128W RPL15AP05748 204 aaKnown RBP2.67□□□□□ -1.98
VFA1YER128W PIS1P06197 220 aaKnown RBP2.67□□□□□ -1.98
VFA1YER128W ROX3P25046 220 aa2.67□□□□□ -1.98
VFA1YER128W YEL045CP32616 141 aa2.67□□□□□ -1.98
VFA1YER128W TIM12P32830 109 aa2.67□□□□□ -1.98
VFA1YER128W YHL005CP38752 130 aa2.67□□□□□ -1.98
VFA1YER128W DSE2P38844 325 aa2.67□□□□□ -1.98
VFA1YER128W WWM1P43582 211 aaKnown RBP2.67□□□□□ -1.98
VFA1YER128W NRM1P53718 249 aa2.67□□□□□ -1.98
VFA1YER128W YMR181CQ03231 154 aa2.67□□□□□ -1.98
VFA1YER128W MZM1Q03429 123 aaPredicted RBP2.67□□□□□ -1.98
VFA1YER128W YOR268CQ08734 132 aa2.67□□□□□ -1.98
VFA1YER128W SPS100P13130 326 aa2.66□□□□□ -1.98
VFA1YER128W QCR9P22289 66 aa2.66□□□□□ -1.98
VFA1YER128W YCR025CP25352 136 aa2.66□□□□□ -1.98
VFA1YER128W AIM4P38305 123 aaPredicted RBP2.66□□□□□ -1.98
VFA1YER128W YHR173CP38864 112 aa2.66□□□□□ -1.98
VFA1YER128W YHR180WP38868 163 aa2.66□□□□□ -1.98
VFA1YER128W YDR274CP87283 123 aa2.66□□□□□ -1.98
VFA1YER128W YHP1Q04116 353 aa2.66□□□□□ -1.98
VFA1YER128W YOL118CQ08259 102 aa2.66□□□□□ -1.98
VFA1YER128W PPT2Q12036 173 aa2.66□□□□□ -1.98
VFA1YER128W YOR343CQ12484 108 aa2.66□□□□□ -1.98
VFA1YER128W YOR381W-AQ3E804 55 aa2.66□□□□□ -1.98
VFA1YER128W YMR316C-AI2HB70 103 aa2.65□□□□□ -1.99
VFA1YER128W MDM35O60200 86 aa2.65□□□□□ -1.99
VFA1YER128W PFY1P07274 126 aa2.65□□□□□ -1.99
VFA1YER128W RPS8AP0CX39 200 aaKnown RBP2.65□□□□□ -1.99
VFA1YER128W RPS8BP0CX40 200 aaKnown RBP2.65□□□□□ -1.99
VFA1YER128W FUN19P28003 413 aaPredicted RBP2.65□□□□□ -1.99
VFA1YER128W CTR2P38865 189 aa2.65□□□□□ -1.99
VFA1YER128W AIM19P40502 157 aa2.65□□□□□ -1.99
VFA1YER128W YFL051CP43552 160 aa2.65□□□□□ -1.99
VFA1YER128W CRH1P53301 507 aa2.65□□□□□ -1.99
VFA1YER128W MET31Q03081 177 aa2.65□□□□□ -1.99
VFA1YER128W IRC23Q08416 157 aa2.65□□□□□ -1.99
VFA1YER128W YOR314WQ12506 109 aa2.65□□□□□ -1.99
VFA1YER128W COA2Q3E823 68 aa2.65□□□□□ -1.99
VFA1YER128W YPR096CO13587 100 aa2.64□□□□□ -1.99
VFA1YER128W RPL23AP0CX41 137 aaKnown RBP2.64□□□□□ -1.99
VFA1YER128W RPL23BP0CX42 137 aaKnown RBP2.64□□□□□ -1.99
VFA1YER128W FYV5P25585 152 aa2.64□□□□□ -1.99
VFA1YER128W YKL097CP34245 136 aa2.64□□□□□ -1.99
VFA1YER128W SPI1P40092 148 aa2.64□□□□□ -1.99
VFA1YER128W ECO1P43605 281 aa2.64□□□□□ -1.99
VFA1YER128W NCA3P46955 337 aa2.64□□□□□ -1.99
VFA1YER128W PCP1P53259 346 aa2.64□□□□□ -1.99
VFA1YER128W YMR254CQ04838 102 aa2.64□□□□□ -1.99
VFA1YER128W YBR209WP38311 105 aa2.63□□□□□ -1.99
VFA1YER128W MTC6P38849 526 aa2.63□□□□□ -1.99
VFA1YER128W YIL163CP40448 117 aa2.63□□□□□ -1.99
VFA1YER128W LST8P41318 303 aa2.63□□□□□ -1.99
VFA1YER128W IMP2P46972 177 aa2.63□□□□□ -1.99
VFA1YER128W YFR032C-BQ8TGU2 87 aa2.63□□□□□ -1.99
VFA1YER128W FLO1P32768 1537 aa2.63□□□□□ -1.99
VFA1YER128W YAL065CO13511 128 aa2.62□□□□□ -1.99
VFA1YER128W HHF1P02309 103 aaKnown RBP2.62□□□□□ -1.99
VFA1YER128W QCR10P37299 77 aa2.62□□□□□ -1.99
VFA1YER128W PET8P38921 284 aa2.62□□□□□ -1.99
VFA1YER128W YPI1P43587 155 aa2.62□□□□□ -1.99
VFA1YER128W YOL014WQ08110 124 aa2.62□□□□□ -1.99
VFA1YER128W YKL065W-AQ2V2P2 73 aa2.62□□□□□ -1.99
VFA1YER128W FLO9P39712 1322 aa2.62□□□□□ -1.99
VFA1YER128W AGA1P32323 725 aa2.61□□□□□ -1.99
VFA1YER128W YHR022CP38763 256 aa2.61□□□□□ -1.99
VFA1YER128W MPC2P38857 129 aa2.61□□□□□ -1.99
VFA1YER128W EDC2P40023 145 aaPredicted RBP2.61□□□□□ -1.99
VFA1YER128W MPC3P53311 146 aa2.61□□□□□ -1.99
VFA1YER128W YLR162WQ06235 118 aa2.61□□□□□ -1.99
VFA1YER128W YDR246W-AQ3E763 66 aa2.61□□□□□ -1.99
VFA1YER128W OST5Q92316 86 aa2.61□□□□□ -1.99
VFA1YER128W PAU7P39545 55 aa2.6□□□□□ -1.99
VFA1YER128W DCV1P43595 202 aa2.6□□□□□ -1.99
VFA1YER128W ERI1P62651 68 aaKnown RBP2.6□□□□□ -1.99
VFA1YER128W ATP19P81451 68 aa2.6□□□□□ -1.99
VFA1YER128W YMR007WQ03675 126 aa2.6□□□□□ -1.99
VFA1YER128W ATP20Q12233 115 aa2.6□□□□□ -1.99
VFA1YER128W TIM22Q12328 207 aa2.6□□□□□ -1.99
VFA1YER128W YGR121W-AQ3E816 71 aa2.6□□□□□ -1.99
VFA1YER128W YBL008W-AQ3E821 79 aa2.6□□□□□ -1.99
VFA1YER128W YER188C-AP0C0V2 99 aa2.59□□□□□ -1.99
VFA1YER128W UTH1P36135 365 aa2.59□□□□□ -1.99
VFA1YER128W VTC1P40046 129 aaRIP-Chip data2.59□□□□□ -1.99not detected
VFA1YER128W YGR269WP40326 108 aa2.59□□□□□ -1.99
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