RNA–Protein interactions for RNA: YDR069C

DOA4, Transcript of Ubiquitin hydrolase, yeastyeast

Gene DOA4, Length 2,781 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DOA4YDR069C YLR112WQ12130 139 aa2.5□□□□□ -2.01
DOA4YDR069C YAL065CO13511 128 aa2.49□□□□□ -2.01
DOA4YDR069C RSM18P40033 138 aa2.49□□□□□ -2.01
DOA4YDR069C YIL029CP40538 142 aa2.49□□□□□ -2.01
DOA4YDR069C MGR2Q02889 113 aa2.49□□□□□ -2.01
DOA4YDR069C YKL065W-AQ2V2P2 73 aa2.49□□□□□ -2.01
DOA4YDR069C YPR108W-AQ3E7B3 70 aa2.49□□□□□ -2.01
DOA4YDR069C SPS100P13130 326 aa2.49□□□□□ -2.01
DOA4YDR069C LST8P41318 303 aa2.49□□□□□ -2.01
DOA4YDR069C YNR077CP53758 84 aa2.49□□□□□ -2.01
DOA4YDR069C YMR181CQ03231 154 aa2.49□□□□□ -2.01
DOA4YDR069C YPL261CQ08976 102 aa2.49□□□□□ -2.01
DOA4YDR069C YOR314WQ12506 109 aa2.49□□□□□ -2.01
DOA4YDR069C YDR246W-AQ3E763 66 aa2.49□□□□□ -2.01
DOA4YDR069C RPB9P27999 122 aa2.49□□□□□ -2.01
DOA4YDR069C FPR2P32472 135 aa2.49□□□□□ -2.01
DOA4YDR069C MPC2P38857 129 aa2.49□□□□□ -2.01
DOA4YDR069C YIL163CP40448 117 aa2.49□□□□□ -2.01
DOA4YDR069C YHP1Q04116 353 aa2.49□□□□□ -2.01
DOA4YDR069C ICY1Q04329 127 aa2.49□□□□□ -2.01
DOA4YDR069C YLR111WQ12528 110 aa2.49□□□□□ -2.01
DOA4YDR069C CCH1P50077 2039 aa2.48□□□□□ -2.01
DOA4YDR069C YFL051CP43552 160 aa2.48□□□□□ -2.01
DOA4YDR069C TOS8P53147 276 aa2.48□□□□□ -2.01
DOA4YDR069C YGR050CP53231 118 aa2.48□□□□□ -2.01
DOA4YDR069C YOL118CQ08259 102 aa2.48□□□□□ -2.01
DOA4YDR069C YPR064WQ12492 139 aa2.48□□□□□ -2.01
DOA4YDR069C MXR2P25566 168 aa2.48□□□□□ -2.01
DOA4YDR069C LDB16P25587 256 aa2.48□□□□□ -2.01
DOA4YDR069C MRPL39P36533 70 aa2.48□□□□□ -2.01
DOA4YDR069C RPL32P38061 130 aaKnown RBP2.48□□□□□ -2.01
DOA4YDR069C YHR022CP38763 256 aa2.48□□□□□ -2.01
DOA4YDR069C MIG3P39943 394 aa2.48□□□□□ -2.01
DOA4YDR069C SPG3Q04398 127 aaPredicted RBP2.48□□□□□ -2.01
DOA4YDR069C YPR011CQ12251 326 aa2.48□□□□□ -2.01
DOA4YDR069C YML100W-AQ8TGT0 57 aa2.48□□□□□ -2.01
DOA4YDR069C CCW14O13547 238 aa2.47□□□□□ -2.01
DOA4YDR069C TIM12P32830 109 aa2.47□□□□□ -2.01
DOA4YDR069C MSA2P36157 363 aa2.47□□□□□ -2.01
DOA4YDR069C YEL073CP39974 107 aa2.47□□□□□ -2.01
DOA4YDR069C DCV1P43595 202 aa2.47□□□□□ -2.01
DOA4YDR069C YMR295CQ03559 197 aa2.47□□□□□ -2.01
DOA4YDR069C YDR182W-AQ3E796 67 aa2.47□□□□□ -2.01
DOA4YDR069C HSP12P22943 109 aaKnown RBP2.47□□□□□ -2.01
DOA4YDR069C YEL067CP39978 195 aa2.47□□□□□ -2.01
DOA4YDR069C NCA3P46955 337 aa2.47□□□□□ -2.01
DOA4YDR069C ICS3P47034 131 aa2.47□□□□□ -2.01
DOA4YDR069C EAF6P47128 113 aa2.47□□□□□ -2.01
DOA4YDR069C YOL160WQ08321 113 aa2.47□□□□□ -2.01
DOA4YDR069C YAL064W-BO13512 126 aa2.46□□□□□ -2.02
DOA4YDR069C PET8P38921 284 aa2.46□□□□□ -2.02
DOA4YDR069C TIM17P39515 158 aa2.46□□□□□ -2.02
DOA4YDR069C YFL019CP43576 117 aa2.46□□□□□ -2.02
DOA4YDR069C PBA1Q05778 276 aa2.46□□□□□ -2.02
DOA4YDR069C YLR162WQ06235 118 aa2.46□□□□□ -2.02
DOA4YDR069C TMC1Q08422 150 aaPredicted RBP2.46□□□□□ -2.02
DOA4YDR069C CRC1Q12289 327 aa2.46□□□□□ -2.02
DOA4YDR069C TIM22Q12328 207 aa2.46□□□□□ -2.02
DOA4YDR069C AIM4P38305 123 aaPredicted RBP2.46□□□□□ -2.02
DOA4YDR069C DSE2P38844 325 aa2.46□□□□□ -2.02
DOA4YDR069C KEG1P43614 200 aa2.46□□□□□ -2.02
DOA4YDR069C TOS6P48560 102 aa2.46□□□□□ -2.02
DOA4YDR069C YCR043CP25361 127 aa2.45□□□□□ -2.02
DOA4YDR069C YGR018CP53211 109 aa2.45□□□□□ -2.02
DOA4YDR069C SWS2P53937 143 aa2.45□□□□□ -2.02
DOA4YDR069C YEL045CP32616 141 aa2.45□□□□□ -2.02
DOA4YDR069C YDR274CP87283 123 aa2.45□□□□□ -2.02
DOA4YDR069C YGR121W-AQ3E816 71 aa2.45□□□□□ -2.02
DOA4YDR069C HUG1Q6Q5K6 68 aa2.45□□□□□ -2.02
DOA4YDR069C YHR214C-EQ8TGK0 99 aa2.45□□□□□ -2.02
DOA4YDR069C RPL26AP05743 127 aaKnown RBP2.44□□□□□ -2.02
DOA4YDR069C PCP1P53259 346 aa2.44□□□□□ -2.02
DOA4YDR069C NRM1P53718 249 aa2.44□□□□□ -2.02
DOA4YDR069C YLR194CQ05777 254 aa2.44□□□□□ -2.02
DOA4YDR069C RRT15Q3E811 62 aa2.44□□□□□ -2.02
DOA4YDR069C YBL081WP38180 368 aaKnown RBP2.44□□□□□ -2.02
DOA4YDR069C TDA2P40045 126 aa2.44□□□□□ -2.02
DOA4YDR069C SPG4Q04438 115 aa2.44□□□□□ -2.02
DOA4YDR069C AGA1P32323 725 aa2.44□□□□□ -2.02
DOA4YDR069C YGL088WP53151 121 aa2.44□□□□□ -2.02
DOA4YDR069C YLR012CQ07927 99 aa2.44□□□□□ -2.02
DOA4YDR069C FIT2Q08906 153 aa2.44□□□□□ -2.02
DOA4YDR069C RPL36BO14455 100 aaKnown RBP2.43□□□□□ -2.02
DOA4YDR069C RPL36AP05745 100 aaPredicted RBP2.43□□□□□ -2.02
DOA4YDR069C RPS14AP06367 137 aaKnown RBP2.43□□□□□ -2.02
DOA4YDR069C RPS14BP39516 138 aaKnown RBP2.43□□□□□ -2.02
DOA4YDR069C IMP2P46972 177 aa2.43□□□□□ -2.02
DOA4YDR069C MPC3P53311 146 aa2.43□□□□□ -2.02
DOA4YDR069C YGL258W-AQ3E740 77 aa2.43□□□□□ -2.02
DOA4YDR069C NAG1Q8TGN9 163 aa2.43□□□□□ -2.02
DOA4YDR069C YPS5P53057 165 aa2.43□□□□□ -2.02
DOA4YDR069C SRL1Q08673 210 aa2.43□□□□□ -2.02
DOA4YDR069C ATP20Q12233 115 aa2.43□□□□□ -2.02
DOA4YDR069C YHL037CP38733 133 aa2.42□□□□□ -2.02
DOA4YDR069C PET191Q02772 108 aa2.42□□□□□ -2.02
DOA4YDR069C IRC19Q07843 230 aa2.42□□□□□ -2.02
DOA4YDR069C RNH203Q12338 110 aa2.42□□□□□ -2.02
DOA4YDR069C ERI1P62651 68 aaKnown RBP2.42□□□□□ -2.02
DOA4YDR069C YOR381W-AQ3E804 55 aa2.42□□□□□ -2.02
DOA4YDR069C YER145C-AA0A023PYF4 145 aa2.41□□□□□ -2.02
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 17 ms