RNA–Protein interactions for RNA: YDL013W

SLX5, Transcript of Subunit of the Slx5-Slx8 SUMO-targeted ubiquitin ligase complex, yeast

Gene SLX5, Length 1,860 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SLX5	YDL013W	MIM1	Q08176	113 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SLX5	YDL013W	RPS8A	P0CX39	200 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SLX5	YDL013W	RPS8B	P0CX40	200 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SLX5	YDL013W	YBL059W	P34224	193 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SLX5	YDL013W	TES1	P41903	349 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SLX5	YDL013W	YGL118C	P53132	145 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SLX5	YDL013W	SWT21	P53873	357 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SLX5	YDL013W	LPP1	Q04396	274 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SLX5	YDL013W	FPR2	P32472	135 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SLX5	YDL013W	YFR032C-B	Q8TGU2	87 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SLX5	YDL013W	PAU2	P32612	120 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SLX5	YDL013W	YEL028W	P39989	153 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SLX5	YDL013W	SIM1	P40472	476 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SLX5	YDL013W	BRP1	P53194	125 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SLX5	YDL013W	MDM35	O60200	86 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SLX5	YDL013W	SOD1	P00445	154 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SLX5	YDL013W	TIM12	P32830	109 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SLX5	YDL013W	IGO1	P53897	168 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SLX5	YDL013W	YDR274C	P87283	123 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SLX5	YDL013W	YMR181C	Q03231	154 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SLX5	YDL013W	YHR214C-D	P0CX93	97 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SLX5	YDL013W	PBA1	Q05778	276 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SLX5	YDL013W	AGA2	P32781	87 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SLX5	YDL013W	YIL014C-A	Q02598	104 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SLX5	YDL013W	RPL42A	P0CX27	106 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
SLX5	YDL013W	RPL42B	P0CX28	106 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
SLX5	YDL013W	PCP1	P53259	346 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SLX5	YDL013W	NRM1	P53718	249 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SLX5	YDL013W	YHP1	Q04116	353 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SLX5	YDL013W	FAB1	P34756	2278 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SLX5	YDL013W	MRPL27	P36526	146 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SLX5	YDL013W	YSY6	P38374	65 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SLX5	YDL013W	PET8	P38921	284 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SLX5	YDL013W	YOL014W	Q08110	124 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SLX5	YDL013W	YMR316C-A	I2HB70	103 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SLX5	YDL013W	RPL26A	P05743	127 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SLX5	YDL013W	YHR180W	P38868	163 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SLX5	YDL013W	BSC1	Q12140	328 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SLX5	YDL013W	YER145C-A	A0A023PYF4	145 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SLX5	YDL013W	HHF1	P02309	103 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SLX5	YDL013W	FYV5	P25585	152 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SLX5	YDL013W	FPR1	P20081	114 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SLX5	YDL013W	ROX3	P25046	220 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SLX5	YDL013W	EDC2	P40023	145 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SLX5	YDL013W	LST8	P41318	303 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SLX5	YDL013W	BEM2	P39960	2167 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SLX5	YDL013W	PIS1	P06197	220 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SLX5	YDL013W	YHL005C	P38752	130 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SLX5	YDL013W	DSE2	P38844	325 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SLX5	YDL013W	YPL261C	Q08976	102 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SLX5	YDL013W	YHR173C	P38864	112 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SLX5	YDL013W	PPT2	Q12036	173 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SLX5	YDL013W	CRC1	Q12289	327 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SLX5	YDL013W	COX9	P07255	59 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SLX5	YDL013W	NCA3	P46955	337 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SLX5	YDL013W	YLR111W	Q12528	110 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SLX5	YDL013W	YOR381W-A	Q3E804	55 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SLX5	YDL013W	IMP2	P46972	177 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SLX5	YDL013W	YOR343C	Q12484	108 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SLX5	YDL013W	PFY1	P07274	126 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SLX5	YDL013W	RPS22A	P0C0W1	130 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SLX5	YDL013W	MET31	Q03081	177 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SLX5	YDL013W	IRC23	Q08416	157 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SLX5	YDL013W	VTC1	P40046	129 aa	RIP-Chip data	4.83	□□□□□ -1.64	not detected
SLX5	YDL013W	YBL008W-A	Q3E821	79 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SLX5	YDL013W	HOT13	P36078	116 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SLX5	YDL013W	ECO1	P43605	281 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SLX5	YDL013W	YOL118C	Q08259	102 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SLX5	YDL013W	YOR314W	Q12506	109 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SLX5	YDL013W	TOR2	P32600	2474 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
SLX5	YDL013W	YAL065C	O13511	128 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SLX5	YDL013W	QCR10	P37299	77 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SLX5	YDL013W	FYV12	Q08559	129 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SLX5	YDL013W	YDR246W-A	Q3E763	66 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SLX5	YDL013W	YBR209W	P38311	105 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SLX5	YDL013W	SPI1	P40092	148 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SLX5	YDL013W	IRA2	P19158	3079 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SLX5	YDL013W	YCR025C	P25352	136 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SLX5	YDL013W	AGA1	P32323	725 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SLX5	YDL013W	YCR041W	P37265	110 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SLX5	YDL013W	AIM4	P38305	123 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
SLX5	YDL013W	CTR2	P38865	189 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SLX5	YDL013W	ERI1	P62651	68 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
SLX5	YDL013W	YGR121W-A	Q3E816	71 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SLX5	YDL013W	FMP27	Q06179	2628 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SLX5	YDL013W	SRX1	P36077	127 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SLX5	YDL013W	YPR011C	Q12251	326 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SLX5	YDL013W	TIM22	Q12328	207 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SLX5	YDL013W	CDC39	P25655	2108 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
SLX5	YDL013W	YAR023C	D6VPM8	179 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SLX5	YDL013W	ATP15	P21306	62 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SLX5	YDL013W	YCR043C	P25361	127 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SLX5	YDL013W	AIM19	P40502	157 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SLX5	YDL013W	YFL051C	P43552	160 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SLX5	YDL013W	COA2	Q3E823	68 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SLX5	YDL013W	MTC6	P38849	526 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SLX5	YDL013W	CRH1	P53301	507 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SLX5	YDL013W	LIP1	Q03579	150 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SLX5	YDL013W	YLR162W	Q06235	118 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SLX5	YDL013W	YML122C	Q03207	126 aa		4.77	□□□□□ -1.65

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