RNA–Protein interactions for RNA: YMR118C

SHH3, Transcript of Putative mitochondrial inner membrane protein of unknown function, yeast

Gene SHH3, Length 591 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SHH3	YMR118C	YOR304C-A	O14468	76 aa		2.78	□□□□□ -1.96
SHH3	YMR118C	PFY1	P07274	126 aa		2.78	□□□□□ -1.96
SHH3	YMR118C	HMRA2	P0CY13	119 aa		2.78	□□□□□ -1.96
SHH3	YMR118C	YKL070W	P36087	169 aa		2.78	□□□□□ -1.96
SHH3	YMR118C	RPL32	P38061	130 aa	Known RBP	2.78	□□□□□ -1.96
SHH3	YMR118C	OXA1	P39952	402 aa		2.78	□□□□□ -1.96
SHH3	YMR118C	NRM1	P53718	249 aa		2.78	□□□□□ -1.96
SHH3	YMR118C	HPA2	Q06592	156 aa		2.78	□□□□□ -1.96
SHH3	YMR118C	GAT3	Q07928	141 aa		2.78	□□□□□ -1.96
SHH3	YMR118C	YPL261C	Q08976	102 aa		2.78	□□□□□ -1.96
SHH3	YMR118C	YOR097C	Q12274	175 aa	Predicted RBP	2.78	□□□□□ -1.96
SHH3	YMR118C	FOL3	Q12676	427 aa	Predicted RBP	2.78	□□□□□ -1.96
SHH3	YMR118C	ISD11	Q6Q560	94 aa		2.78	□□□□□ -1.96
SHH3	YMR118C	YMR105W-A	Q8TGS8	64 aa		2.78	□□□□□ -1.96
SHH3	YMR118C	UTH1	P36135	365 aa		2.77	□□□□□ -1.97
SHH3	YMR118C	YKR045C	P36138	183 aa		2.77	□□□□□ -1.97
SHH3	YMR118C	YEL067C	P39978	195 aa		2.77	□□□□□ -1.97
SHH3	YMR118C	YNL217W	P40152	326 aa		2.77	□□□□□ -1.97
SHH3	YMR118C	TOS6	P48560	102 aa		2.77	□□□□□ -1.97
SHH3	YMR118C	EOS1	P53938	366 aa		2.77	□□□□□ -1.97
SHH3	YMR118C	UBC7	Q02159	165 aa		2.77	□□□□□ -1.97
SHH3	YMR118C	YTH1	Q06102	208 aa	Predicted RBP	2.77	□□□□□ -1.97
SHH3	YMR118C	LSM6	Q06406	86 aa	Known RBP	2.77	□□□□□ -1.97
SHH3	YMR118C	MSA1	Q08471	629 aa		2.77	□□□□□ -1.97
SHH3	YMR118C	TIM22	Q12328	207 aa		2.77	□□□□□ -1.97
SHH3	YMR118C	COA3	Q3E7B2	85 aa		2.77	□□□□□ -1.97
SHH3	YMR118C	COX10	P21592	462 aa		2.76	□□□□□ -1.97
SHH3	YMR118C	RPA12	P32529	125 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
SHH3	YMR118C	KTI12	P34253	313 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
SHH3	YMR118C	YJL027C	P47063	138 aa	Predicted RBP	2.76	□□□□□ -1.97
SHH3	YMR118C	YIP3	P53633	176 aa		2.76	□□□□□ -1.97
SHH3	YMR118C	YNR077C	P53758	84 aa		2.76	□□□□□ -1.97
SHH3	YMR118C	YDR034W-B	Q6Q5X2	51 aa		2.76	□□□□□ -1.97
SHH3	YMR118C	IGO2	Q9P305	131 aa		2.76	□□□□□ -1.97
SHH3	YMR118C	ADH5	P38113	351 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
SHH3	YMR118C	YHR130C	P38834	111 aa		2.75	□□□□□ -1.97
SHH3	YMR118C	GLE2	P40066	365 aa		2.75	□□□□□ -1.97
SHH3	YMR118C	SPI1	P40092	148 aa		2.75	□□□□□ -1.97
SHH3	YMR118C	YFR057W	P43625	151 aa		2.75	□□□□□ -1.97
SHH3	YMR118C	YMR181C	Q03231	154 aa		2.75	□□□□□ -1.97
SHH3	YMR118C	SNA4	Q07549	140 aa		2.75	□□□□□ -1.97
SHH3	YMR118C	YDL009C	Q12210	107 aa		2.75	□□□□□ -1.97
SHH3	YMR118C	JID1	Q12350	301 aa		2.75	□□□□□ -1.97
SHH3	YMR118C	YDL022C-A	P0C5L6	82 aa		2.74	□□□□□ -1.97
SHH3	YMR118C	AGA1	P32323	725 aa		2.74	□□□□□ -1.97
SHH3	YMR118C	MRPL38	P35996	138 aa	Predicted RBP	2.74	□□□□□ -1.97
SHH3	YMR118C	CTR2	P38865	189 aa		2.74	□□□□□ -1.97
SHH3	YMR118C	VHS2	P40463	436 aa		2.74	□□□□□ -1.97
SHH3	YMR118C	YNL046W	P53956	172 aa		2.74	□□□□□ -1.97
SHH3	YMR118C	AIM11	P87275	137 aa		2.74	□□□□□ -1.97
SHH3	YMR118C	YPL080C	Q02826	108 aa		2.74	□□□□□ -1.97
SHH3	YMR118C	YLR194C	Q05777	254 aa		2.74	□□□□□ -1.97
SHH3	YMR118C	IRC23	Q08416	157 aa		2.74	□□□□□ -1.97
SHH3	YMR118C	YOR008C-A	Q3E7B9	74 aa		2.74	□□□□□ -1.97
SHH3	YMR118C	FAB1	P34756	2278 aa		2.73	□□□□□ -1.97
SHH3	YMR118C	RPL42A	P0CX27	106 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
SHH3	YMR118C	RPL42B	P0CX28	106 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
SHH3	YMR118C	KRE1	P17260	313 aa		2.73	□□□□□ -1.97
SHH3	YMR118C	YCR085W	P25650	117 aa		2.73	□□□□□ -1.97
SHH3	YMR118C	VTC1	P40046	129 aa	RIP-Chip data	2.73	□□□□□ -1.97	not detected
SHH3	YMR118C	YER085C	P40058	173 aa		2.73	□□□□□ -1.97
SHH3	YMR118C	YER121W	P40076	114 aa		2.73	□□□□□ -1.97
SHH3	YMR118C	POR2	P40478	281 aa		2.73	□□□□□ -1.97
SHH3	YMR118C	SGN1	P40561	250 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.73	□□□□□ -1.97	not detected
SHH3	YMR118C	YFL051C	P43552	160 aa		2.73	□□□□□ -1.97
SHH3	YMR118C	GLO1	P50107	326 aa		2.73	□□□□□ -1.97
SHH3	YMR118C	DUO1	P53168	247 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
SHH3	YMR118C	YNL234W	P53857	426 aa		2.73	□□□□□ -1.97
SHH3	YMR118C	SED1	Q01589	338 aa		2.73	□□□□□ -1.97
SHH3	YMR118C	AIM34	Q03673	198 aa		2.73	□□□□□ -1.97
SHH3	YMR118C	YOL160W	Q08321	113 aa		2.73	□□□□□ -1.97
SHH3	YMR118C	MSL5	Q12186	476 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.73	□□□□□ -1.97	not detected
SHH3	YMR118C	CCW14	O13547	238 aa		2.72	□□□□□ -1.97
SHH3	YMR118C	RPS8A	P0CX39	200 aa	Known RBP	2.72	□□□□□ -1.97
SHH3	YMR118C	RPS8B	P0CX40	200 aa	Known RBP	2.72	□□□□□ -1.97
SHH3	YMR118C	IES6	P32617	166 aa		2.72	□□□□□ -1.97
SHH3	YMR118C	MRPL49	P40858	161 aa	Predicted RBP	2.72	□□□□□ -1.97
SHH3	YMR118C	FIP1	P45976	327 aa		2.72	□□□□□ -1.97
SHH3	YMR118C	ABF2	Q02486	183 aa		2.72	□□□□□ -1.97
SHH3	YMR118C	RRG8	Q06109	277 aa		2.72	□□□□□ -1.97
SHH3	YMR118C	PBP4	Q07362	185 aa	Known RBP	2.72	□□□□□ -1.97
SHH3	YMR118C	MRPL23	Q12487	163 aa	Predicted RBP	2.72	□□□□□ -1.97
SHH3	YMR118C	YIR021W-A	Q3E739	70 aa		2.72	□□□□□ -1.97
SHH3	YMR118C	YAL063C-A	Q3E791	96 aa		2.72	□□□□□ -1.97
SHH3	YMR118C	YFL041W-A	Q3E817	63 aa		2.72	□□□□□ -1.97
SHH3	YMR118C	TOM1	Q03280	3268 aa		2.72	□□□□□ -1.97
SHH3	YMR118C	TAO3	P40468	2376 aa		2.71	□□□□□ -1.98
SHH3	YMR118C	PHO85	P17157	305 aa		2.71	□□□□□ -1.98
SHH3	YMR118C	ATP15	P21306	62 aa		2.71	□□□□□ -1.98
SHH3	YMR118C	LDB16	P25587	256 aa		2.71	□□□□□ -1.98
SHH3	YMR118C	TOA2	P32774	122 aa		2.71	□□□□□ -1.98
SHH3	YMR118C	YHL037C	P38733	133 aa		2.71	□□□□□ -1.98
SHH3	YMR118C	DSE2	P38844	325 aa		2.71	□□□□□ -1.98
SHH3	YMR118C	LCB3	P47013	409 aa		2.71	□□□□□ -1.98
SHH3	YMR118C	YGR219W	P53307	113 aa		2.71	□□□□□ -1.98
SHH3	YMR118C	FCY1	Q12178	158 aa		2.71	□□□□□ -1.98
SHH3	YMR118C	PRM7	Q12459	698 aa		2.71	□□□□□ -1.98
SHH3	YMR118C	YPL229W	Q99395	206 aa		2.71	□□□□□ -1.98
SHH3	YMR118C	RPL28	P02406	149 aa	Known RBP	2.7	□□□□□ -1.98
SHH3	YMR118C	RPL18A	P0CX49	186 aa	Known RBP	2.7	□□□□□ -1.98

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