RNA–Protein interactions for RNA: YOR099W

KTR1, Transcript of Alpha-1,2-mannosyltransferase, yeast

Gene KTR1, Length 1,182 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
KTR1	YOR099W	Q0297	Q9ZZV8	51 aa		4.97	□□□□□ -1.61
KTR1	YOR099W	SEC4	P07560	215 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
KTR1	YOR099W	RPL43A	P0CX25	92 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
KTR1	YOR099W	RPL43B	P0CX26	92 aa		4.96	□□□□□ -1.62
KTR1	YOR099W	ZRT1	P32804	376 aa		4.96	□□□□□ -1.62
KTR1	YOR099W	PRS4	P38063	326 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
KTR1	YOR099W	PAU7	P39545	55 aa		4.96	□□□□□ -1.62
KTR1	YOR099W	YER134C	P40081	178 aa		4.96	□□□□□ -1.62
KTR1	YOR099W	YMR141C	P40211	102 aa		4.96	□□□□□ -1.62
KTR1	YOR099W	POR2	P40478	281 aa		4.96	□□□□□ -1.62
KTR1	YOR099W	AIM24	P47127	394 aa		4.96	□□□□□ -1.62
KTR1	YOR099W	YGR219W	P53307	113 aa		4.96	□□□□□ -1.62
KTR1	YOR099W	CSM4	Q08955	156 aa		4.96	□□□□□ -1.62
KTR1	YOR099W	GCN1	P33892	2672 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
KTR1	YOR099W	CDC40	P40968	455 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
KTR1	YOR099W	ATG33	Q06485	197 aa		4.95	□□□□□ -1.62
KTR1	YOR099W	WIP1	Q2V2P8	89 aa		4.95	□□□□□ -1.62
KTR1	YOR099W	RPL23A	P0CX41	137 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
KTR1	YOR099W	RPL23B	P0CX42	137 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
KTR1	YOR099W	MDM10	P18409	493 aa		4.94	□□□□□ -1.62
KTR1	YOR099W	MIC12	P38341	106 aa		4.94	□□□□□ -1.62
KTR1	YOR099W	SEC72	P39742	193 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
KTR1	YOR099W	YGL118C	P53132	145 aa		4.94	□□□□□ -1.62
KTR1	YOR099W	CAB4	P53332	305 aa		4.94	□□□□□ -1.62
KTR1	YOR099W	FSF1	Q12029	327 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
KTR1	YOR099W	FYV7	Q12247	151 aa		4.94	□□□□□ -1.62
KTR1	YOR099W	UTP23	Q12339	254 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
KTR1	YOR099W	YLR342W-A	Q3E810	57 aa		4.94	□□□□□ -1.62
KTR1	YOR099W	INO2	P26798	304 aa		4.93	□□□□□ -1.62
KTR1	YOR099W	GSP1	P32835	219 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
KTR1	YOR099W	GSP2	P32836	220 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
KTR1	YOR099W	YKL102C	P34249	101 aa		4.93	□□□□□ -1.62
KTR1	YOR099W	PAU16	P35994	123 aa		4.93	□□□□□ -1.62
KTR1	YOR099W	SNF11	P38956	169 aa		4.93	□□□□□ -1.62
KTR1	YOR099W	TEM1	P38987	245 aa		4.93	□□□□□ -1.62
KTR1	YOR099W	PRE5	P40302	234 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
KTR1	YOR099W	THG1	P53215	237 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
KTR1	YOR099W	YML122C	Q03207	126 aa		4.93	□□□□□ -1.62
KTR1	YOR099W	UPS3	Q04006	179 aa		4.93	□□□□□ -1.62
KTR1	YOR099W	URM1	P40554	99 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
KTR1	YOR099W	YMR181C	Q03231	154 aa		4.92	□□□□□ -1.62
KTR1	YOR099W	GTO3	Q04806	366 aa		4.92	□□□□□ -1.62
KTR1	YOR099W	CNL1	Q06333	122 aa		4.92	□□□□□ -1.62
KTR1	YOR099W	YOL160W	Q08321	113 aa		4.92	□□□□□ -1.62
KTR1	YOR099W	GEP3	Q08622	556 aa		4.92	□□□□□ -1.62
KTR1	YOR099W	RPL12A	P0CX53	165 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
KTR1	YOR099W	RPL12B	P0CX54	165 aa		4.91	□□□□□ -1.62
KTR1	YOR099W	CPT1	P17898	393 aa		4.91	□□□□□ -1.62
KTR1	YOR099W	CMC1	P36064	111 aa		4.91	□□□□□ -1.62
KTR1	YOR099W	YPI1	P43587	155 aa		4.91	□□□□□ -1.62
KTR1	YOR099W	YJL028W	P47062	111 aa		4.91	□□□□□ -1.62
KTR1	YOR099W	ARC18	Q05933	178 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
KTR1	YOR099W	SRL1	Q08673	210 aa		4.91	□□□□□ -1.62
KTR1	YOR099W	ATP5	P09457	212 aa		4.9	□□□□□ -1.63
KTR1	YOR099W	RPL27A	P0C2H6	136 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
KTR1	YOR099W	YPT53	P36019	220 aa		4.9	□□□□□ -1.63
KTR1	YOR099W	YER188W	P40103	239 aa		4.9	□□□□□ -1.63
KTR1	YOR099W	YNL200C	P40165	246 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
KTR1	YOR099W	YNL194C	P40169	301 aa		4.9	□□□□□ -1.63
KTR1	YOR099W	LCB3	P47013	409 aa		4.9	□□□□□ -1.63
KTR1	YOR099W	VPS55	P47111	140 aa		4.9	□□□□□ -1.63
KTR1	YOR099W	TOS8	P53147	276 aa		4.9	□□□□□ -1.63
KTR1	YOR099W	BRP1	P53194	125 aa		4.9	□□□□□ -1.63
KTR1	YOR099W	YGR017W	P53210	297 aa		4.9	□□□□□ -1.63
KTR1	YOR099W	SPG4	Q04438	115 aa		4.9	□□□□□ -1.63
KTR1	YOR099W	TPT1	Q12272	230 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
KTR1	YOR099W	YDL085C-A	Q3E7B7	68 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
KTR1	YOR099W	RPL15B	P54780	204 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
KTR1	YOR099W	SAE3	P89114	91 aa		4.89	□□□□□ -1.63
KTR1	YOR099W	PKR1	Q03880	122 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
KTR1	YOR099W	GPI19	Q04082	140 aa		4.89	□□□□□ -1.63
KTR1	YOR099W	HOR7	Q05827	59 aa		4.89	□□□□□ -1.63
KTR1	YOR099W	NAT5	Q08689	176 aa		4.89	□□□□□ -1.63
KTR1	YOR099W	TIM22	Q12328	207 aa		4.89	□□□□□ -1.63
KTR1	YOR099W	VMA16	P23968	213 aa		4.88	□□□□□ -1.63
KTR1	YOR099W	RPB9	P27999	122 aa		4.88	□□□□□ -1.63
KTR1	YOR099W	YHR140W	P38842	239 aa		4.88	□□□□□ -1.63
KTR1	YOR099W	COX16	P47081	118 aa		4.88	□□□□□ -1.63
KTR1	YOR099W	MST27	P53176	234 aa		4.88	□□□□□ -1.63
KTR1	YOR099W	IZH3	Q07959	543 aa		4.88	□□□□□ -1.63
KTR1	YOR099W	TEL1	P38110	2787 aa		4.87	□□□□□ -1.63
KTR1	YOR099W	YER145C-A	A0A023PYF4	145 aa		4.87	□□□□□ -1.63
KTR1	YOR099W	CUP1-1	P0CX80	61 aa		4.87	□□□□□ -1.63
KTR1	YOR099W	CUP1-2	P0CX81	61 aa		4.87	□□□□□ -1.63
KTR1	YOR099W	YFL068W	P0CX99	160 aa		4.87	□□□□□ -1.63
KTR1	YOR099W	YLL066W-A	P0CY00	160 aa		4.87	□□□□□ -1.63
KTR1	YOR099W	YLL067W-A	P0CY01	160 aa		4.87	□□□□□ -1.63
KTR1	YOR099W	SPI1	P40092	148 aa		4.87	□□□□□ -1.63
KTR1	YOR099W	YGR025W	P53216	100 aa		4.87	□□□□□ -1.63
KTR1	YOR099W	POP3	P53833	195 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
KTR1	YOR099W	DIA1	P54005	336 aa		4.87	□□□□□ -1.63
KTR1	YOR099W	HTL1	Q9URQ5	78 aa		4.87	□□□□□ -1.63
KTR1	YOR099W	MST28	P39552	234 aa		4.86	□□□□□ -1.63
KTR1	YOR099W	HAC1	P41546	238 aa		4.86	□□□□□ -1.63
KTR1	YOR099W	YJR096W	P47137	282 aa		4.86	□□□□□ -1.63
KTR1	YOR099W	YIP3	P53633	176 aa		4.86	□□□□□ -1.63
KTR1	YOR099W	DPP1	Q05521	289 aa		4.86	□□□□□ -1.63
KTR1	YOR099W	ATG39	Q06159	398 aa		4.86	□□□□□ -1.63
KTR1	YOR099W	YDL157C	Q12082	118 aa		4.86	□□□□□ -1.63
KTR1	YOR099W	YPR013C	Q12145	317 aa		4.86	□□□□□ -1.63

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