RNA–Protein interactions for RNA: YNL093W

YPT53, Transcript of Stress-induced Rab family GTPase, yeastyeast

Gene YPT53, Length 663 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YPT53YNL093W UTR5P32630 166 aa3.18□□□□□ -1.9
YPT53YNL093W MSA2P36157 363 aa3.18□□□□□ -1.9
YPT53YNL093W SWD3P38123 315 aa3.18□□□□□ -1.9
YPT53YNL093W MIX23P38162 196 aa3.18□□□□□ -1.9
YPT53YNL093W VTC1P40046 129 aaRIP-Chip data3.18□□□□□ -1.9not detected
YPT53YNL093W HYR1P40581 163 aaKnown RBP3.18□□□□□ -1.9
YPT53YNL093W DIM1P41819 318 aaKnown RBP3.18□□□□□ -1.9
YPT53YNL093W DSK2P48510 373 aa3.18□□□□□ -1.9
YPT53YNL093W RSM19P53733 91 aaPredicted RBP3.18□□□□□ -1.9
YPT53YNL093W PIN3Q06449 215 aa3.18□□□□□ -1.9
YPT53YNL093W FYV12Q08559 129 aa3.18□□□□□ -1.9
YPT53YNL093W PCC1Q3E833 88 aa3.18□□□□□ -1.9
YPT53YNL093W MHF1Q3E835 90 aa3.18□□□□□ -1.9
YPT53YNL093W YNR034W-AQ3E841 98 aa3.18□□□□□ -1.9
YPT53YNL093W SUS1Q6WNK7 96 aa3.18□□□□□ -1.9
YPT53YNL093W YLR365WQ7LIF2 110 aa3.18□□□□□ -1.9
YPT53YNL093W NAG1Q8TGN9 163 aa3.18□□□□□ -1.9
YPT53YNL093W ENV10Q99382 181 aa3.18□□□□□ -1.9
YPT53YNL093W GPI18P38211 433 aa3.17□□□□□ -1.9
YPT53YNL093W SNF11P38956 169 aa3.17□□□□□ -1.9
YPT53YNL093W YAR068WP39564 161 aa3.17□□□□□ -1.9
YPT53YNL093W KNH1P50112 268 aa3.17□□□□□ -1.9
YPT53YNL093W PIR3Q03180 325 aa3.17□□□□□ -1.9
YPT53YNL093W YDR102CQ03864 110 aa3.17□□□□□ -1.9
YPT53YNL093W CSI2Q08054 341 aa3.17□□□□□ -1.9
YPT53YNL093W POC4Q12245 148 aaPredicted RBP3.17□□□□□ -1.9
YPT53YNL093W YIL134C-AQ45U18 67 aa3.17□□□□□ -1.9
YPT53YNL093W COX4P04037 155 aa3.16□□□□□ -1.9
YPT53YNL093W ATP15P21306 62 aa3.16□□□□□ -1.9
YPT53YNL093W YAL064WP39711 94 aa3.16□□□□□ -1.9
YPT53YNL093W YJL028WP47062 111 aa3.16□□□□□ -1.9
YPT53YNL093W YNR064CP53750 290 aa3.16□□□□□ -1.9
YPT53YNL093W CYT2Q00873 224 aa3.16□□□□□ -1.9
YPT53YNL093W GPI19Q04082 140 aa3.16□□□□□ -1.9
YPT53YNL093W ELP6Q04868 273 aa3.16□□□□□ -1.9
YPT53YNL093W IRC25Q07951 179 aa3.16□□□□□ -1.9
YPT53YNL093W NAT5Q08689 176 aa3.16□□□□□ -1.9
YPT53YNL093W YOR385WQ08909 290 aa3.16□□□□□ -1.9
YPT53YNL093W TIM22Q12328 207 aa3.16□□□□□ -1.9
YPT53YNL093W ATO3Q12359 275 aa3.16□□□□□ -1.9
YPT53YNL093W YMR175W-AQ3E766 64 aa3.16□□□□□ -1.9
YPT53YNL093W ATG40Q99325 256 aa3.16□□□□□ -1.9
YPT53YNL093W PDR5P33302 1511 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.9
YPT53YNL093W DOP1Q03921 1698 aa3.15□□□□□ -1.9
YPT53YNL093W YAR023CD6VPM8 179 aa3.15□□□□□ -1.91
YPT53YNL093W YHR138CP38841 114 aaPredicted RBP3.15□□□□□ -1.91
YPT53YNL093W FLX1P40464 311 aa3.15□□□□□ -1.91
YPT53YNL093W YDR042CQ03205 200 aa3.15□□□□□ -1.91
YPT53YNL093W MRPS8Q03799 155 aa3.15□□□□□ -1.91
YPT53YNL093W NMA1Q06178 401 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.91
YPT53YNL093W SEC7P11075 2009 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.91
YPT53YNL093W BCK1Q01389 1478 aa3.15□□□□□ -1.91
YPT53YNL093W USO1P25386 1790 aa3.15□□□□□ -1.91
YPT53YNL093W VTH1P40438 1549 aa3.14□□□□□ -1.91
YPT53YNL093W VTH2P40890 1549 aa3.14□□□□□ -1.91
YPT53YNL093W HSP26P15992 214 aaKnown RBP RIP-Chip data3.14□□□□□ -1.91not detected
YPT53YNL093W TOM6P33448 61 aa3.14□□□□□ -1.91
YPT53YNL093W TDA2P40045 126 aa3.14□□□□□ -1.91
YPT53YNL093W YNL208WP40159 199 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
YPT53YNL093W PEP8P40335 379 aa3.14□□□□□ -1.91
YPT53YNL093W HUR1P45820 110 aa3.14□□□□□ -1.91
YPT53YNL093W YLR296WQ05898 108 aa3.14□□□□□ -1.91
YPT53YNL093W BSC1Q12140 328 aa3.14□□□□□ -1.91
YPT53YNL093W YDR119W-AQ2V2P9 66 aa3.14□□□□□ -1.91
YPT53YNL093W YAL063C-AQ3E791 96 aa3.14□□□□□ -1.91
YPT53YNL093W VMA9Q3E7B6 73 aa3.14□□□□□ -1.91
YPT53YNL093W MSB2P32334 1306 aa3.14□□□□□ -1.91
YPT53YNL093W RPA190P10964 1664 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
YPT53YNL093W CHC1P22137 1653 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
YPT53YNL093W SPO14P36126 1683 aa3.14□□□□□ -1.91
YPT53YNL093W RKR1Q04781 1562 aa3.13□□□□□ -1.91
YPT53YNL093W RPB9P27999 122 aa3.13□□□□□ -1.91
YPT53YNL093W YEL045CP32616 141 aa3.13□□□□□ -1.91
YPT53YNL093W YKL044WP36092 106 aa3.13□□□□□ -1.91
YPT53YNL093W ATG8P38182 117 aaRIP-Chip data3.13□□□□□ -1.91not detected
YPT53YNL093W ATX1P38636 73 aa3.13□□□□□ -1.91
YPT53YNL093W LIP1Q03579 150 aa3.13□□□□□ -1.91
YPT53YNL093W YLR363W-AQ3E747 85 aa3.13□□□□□ -1.91
YPT53YNL093W RRP5Q05022 1729 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
YPT53YNL093W MAK31P23059 88 aa3.12□□□□□ -1.91
YPT53YNL093W YKR045CP36138 183 aa3.12□□□□□ -1.91
YPT53YNL093W ECM34P38728 170 aa3.12□□□□□ -1.91
YPT53YNL093W YHL042WP38729 150 aa3.12□□□□□ -1.91
YPT53YNL093W VMA21P41806 77 aa3.12□□□□□ -1.91
YPT53YNL093W POP3P53833 195 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
YPT53YNL093W YDR274CP87283 123 aa3.12□□□□□ -1.91
YPT53YNL093W YHP1Q04116 353 aa3.12□□□□□ -1.91
YPT53YNL093W RIM9Q04734 239 aa3.12□□□□□ -1.91
YPT53YNL093W AVO2Q04749 426 aa3.12□□□□□ -1.91
YPT53YNL093W YPR145C-AQ2V2P0 78 aa3.12□□□□□ -1.91
YPT53YNL093W ODC2Q99297 307 aa3.12□□□□□ -1.91
YPT53YNL093W DUR1,2P32528 1835 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
YPT53YNL093W NTE1Q04958 1679 aa3.11□□□□□ -1.91
YPT53YNL093W TIM9O74700 87 aa3.11□□□□□ -1.91
YPT53YNL093W RPL22AP05749 121 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
YPT53YNL093W YCR043CP25361 127 aa3.11□□□□□ -1.91
YPT53YNL093W YCR022CP25620 114 aa3.11□□□□□ -1.91
YPT53YNL093W YNL198CP40166 100 aa3.11□□□□□ -1.91
YPT53YNL093W ARC15P40518 154 aaRIP-Chip data3.11□□□□□ -1.91not detected
YPT53YNL093W ATP19P81451 68 aa3.11□□□□□ -1.91
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