RNA–Protein interactions for RNA: YJL134W

LCB3, Transcript of Long-chain base-1-phosphate phosphatase, yeast

Gene LCB3, Length 1,230 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
LCB3	YJL134W	MRPL20	P22354	195 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
LCB3	YJL134W	OST3	P48439	350 aa		4.99	□□□□□ -1.61
LCB3	YJL134W	GLO1	P50107	326 aa		4.99	□□□□□ -1.61
LCB3	YJL134W	UBC7	Q02159	165 aa		4.99	□□□□□ -1.61
LCB3	YJL134W	YMR317W	Q04893	1140 aa		4.99	□□□□□ -1.61
LCB3	YJL134W	CYC3	P06182	269 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LCB3	YJL134W	RPL31B	P0C2H9	113 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
LCB3	YJL134W	FZF1	P32805	299 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LCB3	YJL134W	PRS4	P38063	326 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
LCB3	YJL134W	AME1	P38313	324 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LCB3	YJL134W	MBB1	P39534	108 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LCB3	YJL134W	POR2	P40478	281 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LCB3	YJL134W	YFR045W	P43617	309 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LCB3	YJL134W	DAD4	P69851	72 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LCB3	YJL134W	DAD1	Q12248	94 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LCB3	YJL134W	LSO2	Q3E772	92 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
LCB3	YJL134W	MRPL31	P14063	131 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
LCB3	YJL134W	YMR141C	P40211	102 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LCB3	YJL134W	TDA4	P47153	279 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LCB3	YJL134W	SDS23	P53172	527 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LCB3	YJL134W	ERV14	P53173	138 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LCB3	YJL134W	IZH1	Q03419	316 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LCB3	YJL134W	YCR024C-B	Q3E7Z8	88 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LCB3	YJL134W	SEC4	P07560	215 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
LCB3	YJL134W	PAU7	P39545	55 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LCB3	YJL134W	GLE2	P40066	365 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LCB3	YJL134W	RPA43	P46669	326 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LCB3	YJL134W	AIM24	P47127	394 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LCB3	YJL134W	YGR219W	P53307	113 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LCB3	YJL134W	POM33	Q12164	279 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LCB3	YJL134W	YER190C-B	P0CX94	160 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LCB3	YJL134W	YEL077W-A	P0CX95	160 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LCB3	YJL134W	YGR296C-B	P0CX96	160 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LCB3	YJL134W	YPL283W-B	P0CX97	160 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LCB3	YJL134W	YPR204C-A	P0CX98	160 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LCB3	YJL134W	ZRT1	P32804	376 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LCB3	YJL134W	SEC72	P39742	193 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
LCB3	YJL134W	YER134C	P40081	178 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LCB3	YJL134W	CAB4	P53332	305 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LCB3	YJL134W	DUG3	P53871	357 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LCB3	YJL134W	CSM4	Q08955	156 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LCB3	YJL134W	WIP1	Q2V2P8	89 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LCB3	YJL134W	RPL23A	P0CX41	137 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
LCB3	YJL134W	RPL23B	P0CX42	137 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
LCB3	YJL134W	FUN14	P18411	198 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LCB3	YJL134W	INO2	P26798	304 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LCB3	YJL134W	SCM4	P32564	187 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LCB3	YJL134W	CMC1	P36064	111 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LCB3	YJL134W	MIC12	P38341	106 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LCB3	YJL134W	YPI1	P43587	155 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LCB3	YJL134W	YGL118C	P53132	145 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LCB3	YJL134W	TOS8	P53147	276 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LCB3	YJL134W	YMR181C	Q03231	154 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LCB3	YJL134W	GTO3	Q04806	366 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LCB3	YJL134W	SRL1	Q08673	210 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LCB3	YJL134W	UTP23	Q12339	254 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
LCB3	YJL134W	YLR342W-A	Q3E810	57 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LCB3	YJL134W	MRPL44	P19956	98 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LCB3	YJL134W	SNF11	P38956	169 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LCB3	YJL134W	YER188W	P40103	239 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LCB3	YJL134W	CDC40	P40968	455 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
LCB3	YJL134W	YGR017W	P53210	297 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LCB3	YJL134W	THG1	P53215	237 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
LCB3	YJL134W	SPG4	Q04438	115 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LCB3	YJL134W	GEP3	Q08622	556 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LCB3	YJL134W	RPB9	P27999	122 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LCB3	YJL134W	GSP1	P32835	219 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
LCB3	YJL134W	GSP2	P32836	220 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
LCB3	YJL134W	YNL194C	P40169	301 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LCB3	YJL134W	VPS55	P47111	140 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LCB3	YJL134W	YML122C	Q03207	126 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LCB3	YJL134W	UPS3	Q04006	179 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LCB3	YJL134W	HOR7	Q05827	59 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LCB3	YJL134W	FSF1	Q12029	327 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
LCB3	YJL134W	FYV7	Q12247	151 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LCB3	YJL134W	MDM10	P18409	493 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LCB3	YJL134W	VMA16	P23968	213 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LCB3	YJL134W	PAU16	P35994	123 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LCB3	YJL134W	TEM1	P38987	245 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LCB3	YJL134W	ARC18	Q05933	178 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
LCB3	YJL134W	YOL160W	Q08321	113 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LCB3	YJL134W	YER145C-A	A0A023PYF4	145 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LCB3	YJL134W	RPL15A	P05748	204 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
LCB3	YJL134W	PRE5	P40302	234 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
LCB3	YJL134W	LCB3	P47013	409 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LCB3	YJL134W	COX16	P47081	118 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LCB3	YJL134W	RPL15B	P54780	204 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
LCB3	YJL134W	GPI19	Q04082	140 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LCB3	YJL134W	CNL1	Q06333	122 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LCB3	YJL134W	RPL27A	P0C2H6	136 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
LCB3	YJL134W	RPL12A	P0CX53	165 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
LCB3	YJL134W	RPL12B	P0CX54	165 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LCB3	YJL134W	CPT1	P17898	393 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LCB3	YJL134W	YKL102C	P34249	101 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LCB3	YJL134W	YNL200C	P40165	246 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
LCB3	YJL134W	YJL028W	P47062	111 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LCB3	YJL134W	TIM22	Q12328	207 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LCB3	YJL134W	URA2	P07259	2214 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
LCB3	YJL134W	YCR041W	P37265	110 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LCB3	YJL134W	YHR140W	P38842	239 aa		4.88	□□□□□ -1.63

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