RNA–Protein interactions for RNA: YHR108W

GGA2, Transcript of Protein that regulates Arf1p, Arf2p to facilitate Golgi trafficking, yeast

Gene GGA2, Length 1,758 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
GGA2	YHR108W	MDM10	P18409	493 aa		6.55	□□□□□ -1.36
GGA2	YHR108W	PRS4	P38063	326 aa	Predicted RBP	6.55	□□□□□ -1.36
GGA2	YHR108W	TEM1	P38987	245 aa		6.55	□□□□□ -1.36
GGA2	YHR108W	PRE5	P40302	234 aa	Known RBP	6.55	□□□□□ -1.36
GGA2	YHR108W	AIM24	P47127	394 aa		6.55	□□□□□ -1.36
GGA2	YHR108W	YGR219W	P53307	113 aa		6.55	□□□□□ -1.36
GGA2	YHR108W	CNL1	Q06333	122 aa		6.55	□□□□□ -1.36
GGA2	YHR108W	FSF1	Q12029	327 aa	Known RBP	6.55	□□□□□ -1.36
GGA2	YHR108W	ATP5	P09457	212 aa		6.54	□□□□□ -1.36
GGA2	YHR108W	GSP1	P32835	219 aa	Known RBP	6.54	□□□□□ -1.36
GGA2	YHR108W	GSP2	P32836	220 aa	Known RBP	6.54	□□□□□ -1.36
GGA2	YHR108W	THG1	P53215	237 aa	Known RBP	6.54	□□□□□ -1.36
GGA2	YHR108W	YLR342W-A	Q3E810	57 aa		6.54	□□□□□ -1.36
GGA2	YHR108W	Q0297	Q9ZZV8	51 aa		6.54	□□□□□ -1.36
GGA2	YHR108W	SAE3	P89114	91 aa		6.54	□□□□□ -1.36
GGA2	YHR108W	UPS3	Q04006	179 aa		6.54	□□□□□ -1.36
GGA2	YHR108W	GTO3	Q04806	366 aa		6.54	□□□□□ -1.36
GGA2	YHR108W	YDL085C-A	Q3E7B7	68 aa	Known RBP	6.54	□□□□□ -1.36
GGA2	YHR108W	MIC12	P38341	106 aa		6.53	□□□□□ -1.36
GGA2	YHR108W	YJL028W	P47062	111 aa		6.53	□□□□□ -1.36
GGA2	YHR108W	CAB4	P53332	305 aa		6.53	□□□□□ -1.36
GGA2	YHR108W	ARC18	Q05933	178 aa	Known RBP	6.53	□□□□□ -1.36
GGA2	YHR108W	TPT1	Q12272	230 aa	Known RBP	6.52	□□□□□ -1.37
GGA2	YHR108W	SNF11	P38956	169 aa		6.52	□□□□□ -1.37
GGA2	YHR108W	PKR1	Q03880	122 aa	Known RBP	6.52	□□□□□ -1.37
GGA2	YHR108W	GEP3	Q08622	556 aa		6.52	□□□□□ -1.37
GGA2	YHR108W	BPH1	P25356	2167 aa		6.51	□□□□□ -1.37
GGA2	YHR108W	RPL12A	P0CX53	165 aa	Known RBP	6.51	□□□□□ -1.37
GGA2	YHR108W	RPL12B	P0CX54	165 aa		6.51	□□□□□ -1.37
GGA2	YHR108W	CMC1	P36064	111 aa		6.51	□□□□□ -1.37
GGA2	YHR108W	NCE103	P53615	221 aa		6.51	□□□□□ -1.37
GGA2	YHR108W	YOL160W	Q08321	113 aa		6.51	□□□□□ -1.37
GGA2	YHR108W	PRP8	P33334	2413 aa	Known RBP	6.5	□□□□□ -1.37
GGA2	YHR108W	RPL27A	P0C2H6	136 aa	Known RBP	6.5	□□□□□ -1.37
GGA2	YHR108W	RPL43A	P0CX25	92 aa	Known RBP	6.5	□□□□□ -1.37
GGA2	YHR108W	RPL43B	P0CX26	92 aa		6.5	□□□□□ -1.37
GGA2	YHR108W	BRP1	P53194	125 aa		6.5	□□□□□ -1.37
GGA2	YHR108W	YGR017W	P53210	297 aa		6.5	□□□□□ -1.37
GGA2	YHR108W	NAT5	Q08689	176 aa		6.5	□□□□□ -1.37
GGA2	YHR108W	INO2	P26798	304 aa		6.49	□□□□□ -1.37
GGA2	YHR108W	YNL200C	P40165	246 aa	Known RBP	6.49	□□□□□ -1.37
GGA2	YHR108W	YPI1	P43587	155 aa		6.49	□□□□□ -1.37
GGA2	YHR108W	GPI19	Q04082	140 aa		6.49	□□□□□ -1.37
GGA2	YHR108W	CPT1	P17898	393 aa		6.49	□□□□□ -1.37
GGA2	YHR108W	YER188W	P40103	239 aa		6.49	□□□□□ -1.37
GGA2	YHR108W	COX16	P47081	118 aa		6.49	□□□□□ -1.37
GGA2	YHR108W	YML122C	Q03207	126 aa		6.49	□□□□□ -1.37
GGA2	YHR108W	YMR181C	Q03231	154 aa		6.49	□□□□□ -1.37
GGA2	YHR108W	TIM22	Q12328	207 aa		6.49	□□□□□ -1.37
GGA2	YHR108W	HTL1	Q9URQ5	78 aa		6.49	□□□□□ -1.37
GGA2	YHR108W	TEL1	P38110	2787 aa		6.49	□□□□□ -1.37
GGA2	YHR108W	VMA16	P23968	213 aa		6.48	□□□□□ -1.37
GGA2	YHR108W	YNL194C	P40169	301 aa		6.48	□□□□□ -1.37
GGA2	YHR108W	GLC8	P41818	229 aa		6.48	□□□□□ -1.37
GGA2	YHR108W	MST27	P53176	234 aa		6.48	□□□□□ -1.37
GGA2	YHR108W	RPL15B	P54780	204 aa	Predicted RBP	6.48	□□□□□ -1.37
GGA2	YHR108W	YFL068W	P0CX99	160 aa		6.47	□□□□□ -1.37
GGA2	YHR108W	YLL066W-A	P0CY00	160 aa		6.47	□□□□□ -1.37
GGA2	YHR108W	YLL067W-A	P0CY01	160 aa		6.47	□□□□□ -1.37
GGA2	YHR108W	YHR140W	P38842	239 aa		6.47	□□□□□ -1.37
GGA2	YHR108W	HAC1	P41546	238 aa		6.47	□□□□□ -1.37
GGA2	YHR108W	LCB3	P47013	409 aa		6.47	□□□□□ -1.37
GGA2	YHR108W	VPS55	P47111	140 aa		6.47	□□□□□ -1.37
GGA2	YHR108W	TOS8	P53147	276 aa		6.47	□□□□□ -1.37
GGA2	YHR108W	SPG4	Q04438	115 aa		6.47	□□□□□ -1.37
GGA2	YHR108W	SRL1	Q08673	210 aa		6.47	□□□□□ -1.37
GGA2	YHR108W	YCR007C	P25354	239 aa		6.46	□□□□□ -1.37
GGA2	YHR108W	DIA1	P54005	336 aa		6.46	□□□□□ -1.37
GGA2	YHR108W	DPP1	Q05521	289 aa		6.46	□□□□□ -1.37
GGA2	YHR108W	YPL162C	Q12042	273 aa		6.46	□□□□□ -1.37
GGA2	YHR108W	YDL157C	Q12082	118 aa		6.46	□□□□□ -1.37
GGA2	YHR108W	POP3	P53833	195 aa	Predicted RBP	6.46	□□□□□ -1.38
GGA2	YHR108W	HOR7	Q05827	59 aa		6.46	□□□□□ -1.38
GGA2	YHR108W	MHR1	Q06630	226 aa		6.46	□□□□□ -1.38
GGA2	YHR108W	IZH3	Q07959	543 aa		6.46	□□□□□ -1.38
GGA2	YHR108W	YLR050C	Q12155	161 aa	Known RBP	6.46	□□□□□ -1.38
GGA2	YHR108W	MSL1	P40567	111 aa	Predicted RBP	6.45	□□□□□ -1.38
GGA2	YHR108W	YGL230C	P53074	147 aa		6.45	□□□□□ -1.38
GGA2	YHR108W	SPI1	P40092	148 aa		6.44	□□□□□ -1.38
GGA2	YHR108W	YJR096W	P47137	282 aa		6.44	□□□□□ -1.38
GGA2	YHR108W	PAU23	Q07987	124 aa		6.44	□□□□□ -1.38
GGA2	YHR108W	PAU17	Q12370	124 aa		6.44	□□□□□ -1.38
GGA2	YHR108W	YPR014C	Q6B0W2	109 aa		6.44	□□□□□ -1.38
GGA2	YHR108W	SEC11	P15367	167 aa		6.44	□□□□□ -1.38
GGA2	YHR108W	GRH1	Q04410	372 aa	Known RBP	6.44	□□□□□ -1.38
GGA2	YHR108W	MSC3	Q05812	728 aa		6.44	□□□□□ -1.38
GGA2	YHR108W	ATG39	Q06159	398 aa		6.44	□□□□□ -1.38
GGA2	YHR108W	HAP3	P13434	144 aa		6.43	□□□□□ -1.38
GGA2	YHR108W	YKR032W	P36127	104 aa		6.43	□□□□□ -1.38
GGA2	YHR108W	YIP3	P53633	176 aa		6.43	□□□□□ -1.38
GGA2	YHR108W	MEC1	P38111	2368 aa		6.42	□□□□□ -1.38
GGA2	YHR108W	RPL31A	P0C2H8	113 aa	Known RBP	6.42	□□□□□ -1.38
GGA2	YHR108W	RPB9	P27999	122 aa		6.42	□□□□□ -1.38
GGA2	YHR108W	FYV4	P38783	130 aa	Predicted RBP	6.42	□□□□□ -1.38
GGA2	YHR108W	PET8	P38921	284 aa		6.42	□□□□□ -1.38
GGA2	YHR108W	MRPL49	P40858	161 aa	Predicted RBP	6.42	□□□□□ -1.38
GGA2	YHR108W	YGR025W	P53216	100 aa		6.42	□□□□□ -1.38
GGA2	YHR108W	YIL014C-A	Q02598	104 aa		6.42	□□□□□ -1.38
GGA2	YHR108W	RRG8	Q06109	277 aa		6.42	□□□□□ -1.38
GGA2	YHR108W	SCS22	Q6Q595	175 aa		6.42	□□□□□ -1.38

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 27.8 ms