RNA–Protein interactions for RNA: YBR148W

YSW1, Transcript of Protein required for normal prospore membrane formation, yeast

Gene YSW1, Length 1,830 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YSW1	YBR148W	YER039C-A	P0CD97	72 aa		0.95	□□□□□ -2.26
YSW1	YBR148W	FUN14	P18411	198 aa		0.95	□□□□□ -2.26
YSW1	YBR148W	SFT2	P38166	215 aa		0.95	□□□□□ -2.26
YSW1	YBR148W	YFL051C	P43552	160 aa		0.95	□□□□□ -2.26
YSW1	YBR148W	YPR153W	Q06537	140 aa		0.95	□□□□□ -2.26
YSW1	YBR148W	COA3	Q3E7B2	85 aa		0.95	□□□□□ -2.26
YSW1	YBR148W	MYO2	P19524	1574 aa	Known RBP	0.94	□□□□□ -2.26
YSW1	YBR148W	AQY2	P0CD90	149 aa		0.94	□□□□□ -2.26
YSW1	YBR148W	YGL010W	P25338	174 aa		0.94	□□□□□ -2.26
YSW1	YBR148W	YKL044W	P36092	106 aa		0.94	□□□□□ -2.26
YSW1	YBR148W	ATG8	P38182	117 aa	RIP-Chip data	0.94	□□□□□ -2.26	not detected
YSW1	YBR148W	YBR242W	P38331	238 aa		0.94	□□□□□ -2.26
YSW1	YBR148W	SNF11	P38956	169 aa		0.94	□□□□□ -2.26
YSW1	YBR148W	RPL13B	P40212	199 aa	Known RBP	0.94	□□□□□ -2.26
YSW1	YBR148W	DCV1	P43595	202 aa		0.94	□□□□□ -2.26
YSW1	YBR148W	YGL230C	P53074	147 aa		0.94	□□□□□ -2.26
YSW1	YBR148W	GPI11	Q06636	219 aa		0.94	□□□□□ -2.26
YSW1	YBR148W	FCF2	Q12035	217 aa	Predicted RBP	0.94	□□□□□ -2.26
YSW1	YBR148W	RPL13A	Q12690	199 aa	Predicted RBP	0.94	□□□□□ -2.26
YSW1	YBR148W	YNL146C-A	Q3E7Z1	64 aa		0.94	□□□□□ -2.26
YSW1	YBR148W	RTC6	O14464	93 aa		0.94	□□□□□ -2.26
YSW1	YBR148W	YGL041W-A	P0C5N3	154 aa		0.94	□□□□□ -2.26
YSW1	YBR148W	RPL40A	P0CH08	128 aa	Known RBP	0.94	□□□□□ -2.26
YSW1	YBR148W	RPL40B	P0CH09	128 aa	Known RBP	0.94	□□□□□ -2.26
YSW1	YBR148W	NMT1	P14743	455 aa		0.94	□□□□□ -2.26
YSW1	YBR148W	ANB1	P19211	157 aa		0.94	□□□□□ -2.26
YSW1	YBR148W	YCL042W	P25572	119 aa		0.94	□□□□□ -2.26
YSW1	YBR148W	PAM16	P42949	149 aa		0.94	□□□□□ -2.26
YSW1	YBR148W	YPL067C	Q02754	198 aa		0.94	□□□□□ -2.26
YSW1	YBR148W	MET31	Q03081	177 aa		0.94	□□□□□ -2.26
YSW1	YBR148W	RAF1	Q06891	181 aa		0.94	□□□□□ -2.26
YSW1	YBR148W	MHF1	Q3E835	90 aa		0.94	□□□□□ -2.26
YSW1	YBR148W	QCR8	P08525	94 aa		0.93	□□□□□ -2.26
YSW1	YBR148W	SEC59	P20048	519 aa		0.93	□□□□□ -2.26
YSW1	YBR148W	YHR130C	P38834	111 aa		0.93	□□□□□ -2.26
YSW1	YBR148W	ERV14	P53173	138 aa		0.93	□□□□□ -2.26
YSW1	YBR148W	PAU12	P53343	120 aa		0.93	□□□□□ -2.26
YSW1	YBR148W	RCE1	Q03530	315 aa		0.93	□□□□□ -2.26
YSW1	YBR148W	GPI19	Q04082	140 aa		0.93	□□□□□ -2.26
YSW1	YBR148W	YOR097C	Q12274	175 aa	Predicted RBP	0.93	□□□□□ -2.26
YSW1	YBR148W	GTT2	Q12390	233 aa		0.93	□□□□□ -2.26
YSW1	YBR148W	GSC2	P40989	1895 aa		0.93	□□□□□ -2.26
YSW1	YBR148W	MRPL44	P19956	98 aa		0.92	□□□□□ -2.26
YSW1	YBR148W	YCR101C	P25607	182 aa		0.92	□□□□□ -2.26
YSW1	YBR148W	GSP1	P32835	219 aa	Known RBP	0.92	□□□□□ -2.26
YSW1	YBR148W	HSP10	P38910	106 aa		0.92	□□□□□ -2.26
YSW1	YBR148W	TDA2	P40045	126 aa		0.92	□□□□□ -2.26
YSW1	YBR148W	YFR035C	P43608	114 aa		0.92	□□□□□ -2.26
YSW1	YBR148W	BRP1	P53194	125 aa		0.92	□□□□□ -2.26
YSW1	YBR148W	NAT5	Q08689	176 aa		0.92	□□□□□ -2.26
YSW1	YBR148W	YPR203W	Q08994	102 aa		0.92	□□□□□ -2.26
YSW1	YBR148W	ACC1	Q00955	2233 aa	Known RBP	0.92	□□□□□ -2.26
YSW1	YBR148W	SPP41	P38904	1435 aa		0.92	□□□□□ -2.26
YSW1	YBR148W	SNT2	P53127	1403 aa		0.92	□□□□□ -2.26
YSW1	YBR148W	VAR1	P02381	398 aa		0.92	□□□□□ -2.26
YSW1	YBR148W	HAP2	P06774	265 aa		0.92	□□□□□ -2.26
YSW1	YBR148W	PAU21	P0CE86	164 aa		0.92	□□□□□ -2.26
YSW1	YBR148W	PAU22	P0CE87	164 aa		0.92	□□□□□ -2.26
YSW1	YBR148W	UTP11	P34247	250 aa	Predicted RBP	0.92	□□□□□ -2.26
YSW1	YBR148W	AIM4	P38305	123 aa	Predicted RBP	0.92	□□□□□ -2.26
YSW1	YBR148W	RGI1	P40043	161 aa	Predicted RBP	0.92	□□□□□ -2.26
YSW1	YBR148W	YIL014C-A	Q02598	104 aa		0.92	□□□□□ -2.26
YSW1	YBR148W	SEN15	Q04675	128 aa		0.92	□□□□□ -2.26
YSW1	YBR148W	FYV7	Q12247	151 aa		0.92	□□□□□ -2.26
YSW1	YBR148W	OCA6	Q12454	224 aa		0.92	□□□□□ -2.26
YSW1	YBR148W	YGL014C-A	P0C5N1	53 aa		0.91	□□□□□ -2.26
YSW1	YBR148W	PRE1	P22141	198 aa	Known RBP	0.91	□□□□□ -2.26
YSW1	YBR148W	EMP24	P32803	203 aa	Known RBP	0.91	□□□□□ -2.26
YSW1	YBR148W	ECM31	P38122	312 aa		0.91	□□□□□ -2.26
YSW1	YBR148W	YBR027C	P38220	110 aa		0.91	□□□□□ -2.26
YSW1	YBR148W	AIM18	P38884	321 aa		0.91	□□□□□ -2.26
YSW1	YBR148W	RPS12	P48589	143 aa	Known RBP	0.91	□□□□□ -2.26
YSW1	YBR148W	VAM10	Q08474	114 aa		0.91	□□□□□ -2.26
YSW1	YBR148W	RTR2	Q12378	196 aa		0.91	□□□□□ -2.26
YSW1	YBR148W	KTI11	Q3E840	82 aa		0.91	□□□□□ -2.26
YSW1	YBR148W	HAP3	P13434	144 aa		0.9	□□□□□ -2.27
YSW1	YBR148W	PAU2	P32612	120 aa		0.9	□□□□□ -2.27
YSW1	YBR148W	YLR194C	Q05777	254 aa		0.9	□□□□□ -2.27
YSW1	YBR148W	MED11	Q99278	115 aa		0.9	□□□□□ -2.27
YSW1	YBR148W	BUD4	P47136	1447 aa		0.9	□□□□□ -2.27
YSW1	YBR148W	UBR2	Q07963	1872 aa		0.9	□□□□□ -2.27
YSW1	YBR148W	YCR099C	P25657	155 aa		0.89	□□□□□ -2.27
YSW1	YBR148W	MRPL15	P36523	253 aa		0.89	□□□□□ -2.27
YSW1	YBR148W	PAU24	P38155	120 aa		0.89	□□□□□ -2.27
YSW1	YBR148W	YHL037C	P38733	133 aa		0.89	□□□□□ -2.27
YSW1	YBR148W	PRM3	Q08931	133 aa		0.89	□□□□□ -2.27
YSW1	YBR148W	YPL225W	Q08971	146 aa	Known RBP	0.89	□□□□□ -2.27
YSW1	YBR148W	TY1B-H	O13535	1793 aa		0.89	□□□□□ -2.27
YSW1	YBR148W	YHR212W-A	P0CX91	67 aa		0.89	□□□□□ -2.27
YSW1	YBR148W	MRPL11	P36521	249 aa	Predicted RBP	0.89	□□□□□ -2.27
YSW1	YBR148W	LST8	P41318	303 aa		0.89	□□□□□ -2.27
YSW1	YBR148W	MPC1	P53157	130 aa	Known RBP	0.89	□□□□□ -2.27
YSW1	YBR148W	YMR122C	Q03879	124 aa		0.89	□□□□□ -2.27
YSW1	YBR148W	FIT1	Q04433	528 aa		0.89	□□□□□ -2.27
YSW1	YBR148W	MDS3	P53094	1487 aa		0.88	□□□□□ -2.27
YSW1	YBR148W	RPL33A	P05744	107 aa	Known RBP	0.88	□□□□□ -2.27
YSW1	YBR148W	YHR213W	P0CI67	198 aa		0.88	□□□□□ -2.27
YSW1	YBR148W	YEA6	P39953	335 aa		0.88	□□□□□ -2.27
YSW1	YBR148W	SED1	Q01589	338 aa		0.88	□□□□□ -2.27
YSW1	YBR148W	YMR103C	Q04436	120 aa		0.88	□□□□□ -2.27

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