RNA–Protein interactions for RNA: YPR119W

CLB2, Transcript of B-type cyclin involved in cell cycle progression, yeast

Gene CLB2, Length 1,476 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cellular bud .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CLB2	YPR119W	YHR173C	P38864	112 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CLB2	YPR119W	SHO1	P40073	367 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CLB2	YPR119W	NIP7	Q08962	181 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CLB2	YPR119W	PRP46	Q12417	451 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CLB2	YPR119W	FOL3	Q12676	427 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CLB2	YPR119W	YKL023C-A	Q2V2P3	75 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CLB2	YPR119W	YOR192C-C	Q3E736	78 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CLB2	YPR119W	NAG1	Q8TGN9	163 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CLB2	YPR119W	GLT1	Q12680	2145 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CLB2	YPR119W	CDC43	P18898	376 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CLB2	YPR119W	HSP12	P22943	109 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CLB2	YPR119W	YKL044W	P36092	106 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CLB2	YPR119W	OYE3	P41816	400 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CLB2	YPR119W	ATG4	P53867	494 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CLB2	YPR119W	RDL2	Q08742	149 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CLB2	YPR119W	ISD11	Q6Q560	94 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CLB2	YPR119W	CYC3	P06182	269 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CLB2	YPR119W	MDM10	P18409	493 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CLB2	YPR119W	MCH2	P36032	473 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CLB2	YPR119W	MED6	P38782	295 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CLB2	YPR119W	EOS1	P53938	366 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CLB2	YPR119W	DYN2	Q02647	92 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CLB2	YPR119W	YDL218W	Q07629	317 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CLB2	YPR119W	AYT1	Q12226	474 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CLB2	YPR119W	BOL1	Q3E793	110 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CLB2	YPR119W	APS1	P35181	156 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CLB2	YPR119W	YHR130C	P38834	111 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CLB2	YPR119W	PAU7	P39545	55 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CLB2	YPR119W	MST28	P39552	234 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CLB2	YPR119W	YJL213W	P40896	331 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CLB2	YPR119W	YFL065C	P43539	102 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CLB2	YPR119W	YPI1	P43587	155 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CLB2	YPR119W	OST2	P46964	130 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CLB2	YPR119W	UBC13	P52490	153 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CLB2	YPR119W	ECM18	Q04623	453 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CLB2	YPR119W	TIM18	Q08749	192 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CLB2	YPR119W	YPR203W	Q08994	102 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CLB2	YPR119W	YGL258W-A	Q3E740	77 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CLB2	YPR119W	YMR316C-A	I2HB70	103 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CLB2	YPR119W	MXR2	P25566	168 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CLB2	YPR119W	NHP2	P32495	156 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CLB2	YPR119W	RPS27A	P35997	82 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CLB2	YPR119W	RPS27B	P38711	82 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CLB2	YPR119W	YER079W	P40052	210 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CLB2	YPR119W	YIL029C	P40538	142 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CLB2	YPR119W	GZF3	P42944	551 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CLB2	YPR119W	LCL3	P53153	274 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CLB2	YPR119W	ATG33	Q06485	197 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CLB2	YPR119W	GEP3	Q08622	556 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CLB2	YPR119W	MPD1	Q12404	318 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CLB2	YPR119W	MRS3	P10566	314 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CLB2	YPR119W	MRPL31	P14063	131 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CLB2	YPR119W	CPT1	P17898	393 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CLB2	YPR119W	TOM40	P23644	387 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CLB2	YPR119W	ROX3	P25046	220 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CLB2	YPR119W	TDA7	P53882	636 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CLB2	YPR119W	SUR7	P54003	302 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CLB2	YPR119W	SNP1	Q00916	300 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CLB2	YPR119W	TRS23	Q03784	219 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CLB2	YPR119W	RAV2	Q03956	351 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CLB2	YPR119W	UPS1	Q05776	175 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CLB2	YPR119W	LIP2	Q06005	328 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CLB2	YPR119W	IRC25	Q07951	179 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CLB2	YPR119W	YIR021W-A	Q3E739	70 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CLB2	YPR119W	VPS63	O13549	108 aa		4.9	□□□□□ -1.62
CLB2	YPR119W	VAR1	P02381	398 aa		4.9	□□□□□ -1.62
CLB2	YPR119W	RPL27B	P0C2H7	136 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
CLB2	YPR119W	IMP1	P28627	190 aa		4.9	□□□□□ -1.62
CLB2	YPR119W	RML2	P32611	393 aa		4.9	□□□□□ -1.62
CLB2	YPR119W	YKR073C	P36153	106 aa		4.9	□□□□□ -1.62
CLB2	YPR119W	YGP1	P38616	354 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
CLB2	YPR119W	YER181C	P40097	107 aa		4.9	□□□□□ -1.62
CLB2	YPR119W	YPL073C	P40323	161 aa		4.9	□□□□□ -1.62
CLB2	YPR119W	OST1	P41543	476 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
CLB2	YPR119W	GTO3	Q04806	366 aa		4.9	□□□□□ -1.62
CLB2	YPR119W	YMR31	P19955	123 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CLB2	YPR119W	COX10	P21592	462 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CLB2	YPR119W	YPS1	P32329	569 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CLB2	YPR119W	SNF11	P38956	169 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CLB2	YPR119W	YFR045W	P43617	309 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CLB2	YPR119W	MRX11	Q03079	207 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CLB2	YPR119W	MIX17	Q03667	156 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CLB2	YPR119W	YHP1	Q04116	353 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CLB2	YPR119W	FIT2	Q08906	153 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CLB2	YPR119W	YCR023C	P25351	611 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CLB2	YPR119W	FPR2	P32472	135 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CLB2	YPR119W	FZF1	P32805	299 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CLB2	YPR119W	SPC29	P33419	253 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CLB2	YPR119W	SFT2	P38166	215 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CLB2	YPR119W	TOM7	P53507	60 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CLB2	YPR119W	YDR042C	Q03205	200 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CLB2	YPR119W	GRE1	Q08969	168 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CLB2	YPR119W	RPS16A	P0CX51	143 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CLB2	YPR119W	RPS16B	P0CX52	143 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CLB2	YPR119W	REC104	P33323	182 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CLB2	YPR119W	YKR041W	P36134	250 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CLB2	YPR119W	YIP3	P53633	176 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CLB2	YPR119W	ATG21	Q02887	496 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CLB2	YPR119W	HPA2	Q06592	156 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CLB2	YPR119W	MSL5	Q12186	476 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.88	□□□□□ -1.63	not detected

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