RNA–Protein interactions for RNA: YOR343W-B

YOR343W-B, Transcript of Retrotransposon TYA Gag and TYB Pol genes, yeastyeast

Gene YOR343W-B, Length 5,313 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YOR343W-BYOR343W-B MOB1P40484 314 aa1.24□□□□□ -2.21
YOR343W-BYOR343W-B SPG1P50088 95 aa1.24□□□□□ -2.21
YOR343W-BYOR343W-B YDR274CP87283 123 aa1.24□□□□□ -2.21
YOR343W-BYOR343W-B CYC2P38909 366 aa1.24□□□□□ -2.21
YOR343W-BYOR343W-B UPS3Q04006 179 aa1.24□□□□□ -2.21
YOR343W-BYOR343W-B RPL30P14120 105 aaKnown RBP1.24□□□□□ -2.21
YOR343W-BYOR343W-B MRS4P23500 304 aa1.24□□□□□ -2.21
YOR343W-BYOR343W-B YNL019CP53975 284 aa1.24□□□□□ -2.21
YOR343W-BYOR343W-B DYN2Q02647 92 aa1.24□□□□□ -2.21
YOR343W-BYOR343W-B IRC19Q07843 230 aa1.24□□□□□ -2.21
YOR343W-BYOR343W-B ORM1P53224 222 aa1.24□□□□□ -2.21
YOR343W-BYOR343W-B SPC2Q04969 178 aa1.24□□□□□ -2.21
YOR343W-BYOR343W-B RFU1Q08003 200 aa1.23□□□□□ -2.21
YOR343W-BYOR343W-B HUT1Q12520 339 aa1.23□□□□□ -2.21
YOR343W-BYOR343W-B YML100W-AQ8TGT0 57 aa1.23□□□□□ -2.21
YOR343W-BYOR343W-B MPC1P53157 130 aaKnown RBP1.23□□□□□ -2.21
YOR343W-BYOR343W-B MET31Q03081 177 aa1.23□□□□□ -2.21
YOR343W-BYOR343W-B MIX17Q03667 156 aa1.23□□□□□ -2.21
YOR343W-BYOR343W-B MRPL44P19956 98 aa1.23□□□□□ -2.21
YOR343W-BYOR343W-B RPS1BP23248 255 aaKnown RBP1.23□□□□□ -2.21
YOR343W-BYOR343W-B RPS1AP33442 255 aaKnown RBP1.23□□□□□ -2.21
YOR343W-BYOR343W-B YPL067CQ02754 198 aa1.23□□□□□ -2.21
YOR343W-BYOR343W-B RIM9Q04734 239 aa1.23□□□□□ -2.21
YOR343W-BYOR343W-B CCW12Q12127 133 aa1.23□□□□□ -2.21
YOR343W-BYOR343W-B NOP1P15646 327 aaKnown RBP1.23□□□□□ -2.21
YOR343W-BYOR343W-B HTD2P38790 280 aaKnown RBP1.23□□□□□ -2.21
YOR343W-BYOR343W-B FIP1P45976 327 aa1.23□□□□□ -2.21
YOR343W-BYOR343W-B YGL235WP53071 178 aa1.23□□□□□ -2.21
YOR343W-BYOR343W-B ERV14P53173 138 aa1.23□□□□□ -2.21
YOR343W-BYOR343W-B EST3Q03096 181 aa1.23□□□□□ -2.21
YOR343W-BYOR343W-B PRM3Q08931 133 aa1.23□□□□□ -2.21
YOR343W-BYOR343W-B MET5P47169 1442 aa1.23□□□□□ -2.21
YOR343W-BYOR343W-B CIN5P40917 295 aa1.22□□□□□ -2.21
YOR343W-BYOR343W-B EMC4P53073 190 aa1.22□□□□□ -2.21
YOR343W-BYOR343W-B YMR321CQ04898 105 aa1.22□□□□□ -2.21
YOR343W-BYOR343W-B FYV12Q08559 129 aa1.22□□□□□ -2.21
YOR343W-BYOR343W-B GTT2Q12390 233 aa1.22□□□□□ -2.21
YOR343W-BYOR343W-B RPB11P38902 120 aa1.22□□□□□ -2.21
YOR343W-BYOR343W-B SPC3Q12133 184 aa1.22□□□□□ -2.21
YOR343W-BYOR343W-B RTR2Q12378 196 aa1.22□□□□□ -2.21
YOR343W-BYOR343W-B YOR304C-AO14468 76 aa1.22□□□□□ -2.21
YOR343W-BYOR343W-B SUA7P29055 345 aaPredicted RBP1.22□□□□□ -2.21
YOR343W-BYOR343W-B YEL067CP39978 195 aa1.22□□□□□ -2.21
YOR343W-BYOR343W-B HHO1P53551 258 aa1.22□□□□□ -2.21
YOR343W-BYOR343W-B IRC21Q04772 201 aa1.22□□□□□ -2.21
YOR343W-BYOR343W-B ELP6Q04868 273 aa1.22□□□□□ -2.21
YOR343W-BYOR343W-B UIP4Q08926 304 aa1.22□□□□□ -2.21
YOR343W-BYOR343W-B DDP1Q99321 188 aaKnown RBP1.22□□□□□ -2.21
YOR343W-BYOR343W-B RPL36BO14455 100 aaKnown RBP1.22□□□□□ -2.21
YOR343W-BYOR343W-B RPL36AP05745 100 aaPredicted RBP1.22□□□□□ -2.21
YOR343W-BYOR343W-B ADK1P07170 222 aaKnown RBP1.22□□□□□ -2.21
YOR343W-BYOR343W-B STF2P16965 84 aa1.22□□□□□ -2.21
YOR343W-BYOR343W-B CYB5P40312 120 aa1.22□□□□□ -2.21
YOR343W-BYOR343W-B YGR042WP53227 271 aa1.21□□□□□ -2.22
YOR343W-BYOR343W-B YNR077CP53758 84 aa1.21□□□□□ -2.22
YOR343W-BYOR343W-B APS2Q00381 147 aa1.21□□□□□ -2.22
YOR343W-BYOR343W-B GPI11Q06636 219 aa1.21□□□□□ -2.22
YOR343W-BYOR343W-B CSI2Q08054 341 aa1.21□□□□□ -2.22
YOR343W-BYOR343W-B TRM3Q07527 1436 aa1.21□□□□□ -2.22
YOR343W-BYOR343W-B AQY2P0CD90 149 aa1.21□□□□□ -2.22
YOR343W-BYOR343W-B HYP2P23301 157 aaKnown RBP1.21□□□□□ -2.22
YOR343W-BYOR343W-B SBH2P52871 88 aa1.21□□□□□ -2.22
YOR343W-BYOR343W-B RCF2P53721 224 aa1.21□□□□□ -2.22
YOR343W-BYOR343W-B YLR296WQ05898 108 aa1.21□□□□□ -2.22
YOR343W-BYOR343W-B SNT2P53127 1403 aa1.21□□□□□ -2.22
YOR343W-BYOR343W-B SEC59P20048 519 aa1.21□□□□□ -2.22
YOR343W-BYOR343W-B SRL3P36167 246 aa1.21□□□□□ -2.22
YOR343W-BYOR343W-B RAD50P12753 1312 aa1.21□□□□□ -2.22
YOR343W-BYOR343W-B YKR045CP36138 183 aa1.2□□□□□ -2.22
YOR343W-BYOR343W-B SLM6P38343 150 aa1.2□□□□□ -2.22
YOR343W-BYOR343W-B YEL028WP39989 153 aa1.2□□□□□ -2.22
YOR343W-BYOR343W-B FMN1Q03778 218 aa1.2□□□□□ -2.22
YOR343W-BYOR343W-B PRS3P38689 320 aaKnown RBP1.2□□□□□ -2.22
YOR343W-BYOR343W-B SNF11P38956 169 aa1.2□□□□□ -2.22
YOR343W-BYOR343W-B YLR179CQ06252 201 aaKnown RBP1.2□□□□□ -2.22
YOR343W-BYOR343W-B PAM17P36147 197 aa1.2□□□□□ -2.22
YOR343W-BYOR343W-B CSH1P38287 376 aa1.2□□□□□ -2.22
YOR343W-BYOR343W-B YIL102CP40488 101 aa1.2□□□□□ -2.22
YOR343W-BYOR343W-B FMP49A0A023PZB3 126 aa1.19□□□□□ -2.22
YOR343W-BYOR343W-B PIR1Q03178 341 aa1.19□□□□□ -2.22
YOR343W-BYOR343W-B TRX3P25372 127 aa1.19□□□□□ -2.22
YOR343W-BYOR343W-B YHR214C-EQ8TGK0 99 aa1.19□□□□□ -2.22
YOR343W-BYOR343W-B YCR050CP25630 102 aa1.19□□□□□ -2.22
YOR343W-BYOR343W-B YAL064WP39711 94 aa1.19□□□□□ -2.22
YOR343W-BYOR343W-B RGI1P40043 161 aaPredicted RBP1.19□□□□□ -2.22
YOR343W-BYOR343W-B HMRA2P0CY13 119 aa1.19□□□□□ -2.22
YOR343W-BYOR343W-B NMT1P14743 455 aa1.19□□□□□ -2.22
YOR343W-BYOR343W-B CPR5P35176 225 aa1.19□□□□□ -2.22
YOR343W-BYOR343W-B MRPL11P36521 249 aaPredicted RBP1.19□□□□□ -2.22
YOR343W-BYOR343W-B POR2P40478 281 aa1.19□□□□□ -2.22
YOR343W-BYOR343W-B SOL1P50278 321 aa1.19□□□□□ -2.22
YOR343W-BYOR343W-B FAB1P34756 2278 aa1.18□□□□□ -2.22
YOR343W-BYOR343W-B YGL041W-AP0C5N3 154 aa1.18□□□□□ -2.22
YOR343W-BYOR343W-B FYV5P25585 152 aa1.18□□□□□ -2.22
YOR343W-BYOR343W-B YPR202WQ08993 238 aa1.18□□□□□ -2.22
YOR343W-BYOR343W-B HAP2P06774 265 aa1.18□□□□□ -2.22
YOR343W-BYOR343W-B SFT2P38166 215 aa1.18□□□□□ -2.22
YOR343W-BYOR343W-B YDL157CQ12082 118 aa1.18□□□□□ -2.22
YOR343W-BYOR343W-B AIM36Q03798 255 aa1.18□□□□□ -2.22
YOR343W-BYOR343W-B YOL014WQ08110 124 aa1.18□□□□□ -2.22
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 101.5 ms