RNA–Protein interactions for RNA: YMR241W

YHM2, Transcript of Citrate and oxoglutarate carrier protein, yeast

Gene YHM2, Length 945 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YHM2	YMR241W	PAU6	P0CE90	120 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YHM2	YMR241W	PAU18	P0CE91	120 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YHM2	YMR241W	PAU8	P0CE92	120 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YHM2	YMR241W	PAU11	P0CE93	120 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YHM2	YMR241W	NOP1	P15646	327 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
YHM2	YMR241W	BGL2	P15703	313 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
YHM2	YMR241W	RPL16A	P26784	199 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
YHM2	YMR241W	HMX1	P32339	317 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YHM2	YMR241W	PAU13	P38725	120 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YHM2	YMR241W	HAM1	P47119	197 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
YHM2	YMR241W	HHO1	P53551	258 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YHM2	YMR241W	PAU10	Q03050	120 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YHM2	YMR241W	YMR253C	Q04835	414 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YHM2	YMR241W	MSC3	Q05812	728 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YHM2	YMR241W	PAU20	Q08322	120 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YHM2	YMR241W	POC4	Q12245	148 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
YHM2	YMR241W	RAX2	Q12465	1220 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YHM2	YMR241W	PAU9	Q3E770	120 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YHM2	YMR241W	HTB1	P02293	131 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
YHM2	YMR241W	RPL43A	P0CX25	92 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
YHM2	YMR241W	RPL43B	P0CX26	92 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YHM2	YMR241W	RPL14A	P36105	138 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
YHM2	YMR241W	RPL14B	P38754	138 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
YHM2	YMR241W	MIC27	P50945	234 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YHM2	YMR241W	TIM21	P53220	239 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YHM2	YMR241W	SNO1	Q03144	224 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YHM2	YMR241W	TEL1	P38110	2787 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YHM2	YMR241W	ADH3	P07246	375 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
YHM2	YMR241W	CUP1-1	P0CX80	61 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YHM2	YMR241W	CUP1-2	P0CX81	61 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YHM2	YMR241W	TOM40	P23644	387 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
YHM2	YMR241W	RAD23	P32628	398 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
YHM2	YMR241W	ALK2	P32789	676 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
YHM2	YMR241W	YJR015W	P47090	510 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YHM2	YMR241W	MIX17	Q03667	156 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YHM2	YMR241W	YMR007W	Q03675	126 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YHM2	YMR241W	AVO2	Q04749	426 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YHM2	YMR241W	CTR3	Q06686	241 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YHM2	YMR241W	CSI2	Q08054	341 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YHM2	YMR241W	RAD28	Q12021	506 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YHM2	YMR241W	TOR1	P35169	2470 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YHM2	YMR241W	RPL23A	P0CX41	137 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
YHM2	YMR241W	RPL23B	P0CX42	137 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
YHM2	YMR241W	FPR2	P32472	135 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YHM2	YMR241W	ATG8	P38182	117 aa	RIP-Chip data	4.9	□□□□□ -1.63	not detected
YHM2	YMR241W	DER1	P38307	211 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YHM2	YMR241W	TRS20	P38334	175 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YHM2	YMR241W	YIR020C	P40575	100 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YHM2	YMR241W	PHS1	P40857	217 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YHM2	YMR241W	IGD1	P43598	195 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YHM2	YMR241W	LST7	P53237	242 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YHM2	YMR241W	ATC1	Q04005	294 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YHM2	YMR241W	SHH3	Q04487	196 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YHM2	YMR241W	ADH6	Q04894	360 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
YHM2	YMR241W	ATP16	Q12165	160 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YHM2	YMR241W	PAA1	Q12447	191 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
YHM2	YMR241W	RPB3	P16370	318 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
YHM2	YMR241W	PHO85	P17157	305 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YHM2	YMR241W	MRPS9	P38120	278 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YHM2	YMR241W	YBL071C	P38185	102 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YHM2	YMR241W	YIL012W	P40551	113 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YHM2	YMR241W	VMA21	P41806	77 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YHM2	YMR241W	YHP1	Q04116	353 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YHM2	YMR241W	GEP5	Q12393	293 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YHM2	YMR241W	YAR068W	P39564	161 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YHM2	YMR241W	GTT1	P40582	234 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YHM2	YMR241W	LST8	P41318	303 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YHM2	YMR241W	LOC1	P43586	204 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
YHM2	YMR241W	ATO3	Q12359	275 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YHM2	YMR241W	YPR145C-A	Q2V2P0	78 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YHM2	YMR241W	RPS22A	P0C0W1	130 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
YHM2	YMR241W	YPT31	P38555	223 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
YHM2	YMR241W	HSP10	P38910	106 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YHM2	YMR241W	PAU15	P40585	124 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YHM2	YMR241W	NSE4	P43124	402 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YHM2	YMR241W	MGA1	P53050	456 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YHM2	YMR241W	YLR118C	Q12354	227 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YHM2	YMR241W	SNU23	Q12368	194 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
YHM2	YMR241W	YMR316C-A	I2HB70	103 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YHM2	YMR241W	CDC7	P06243	507 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YHM2	YMR241W	PET494	P07390	489 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
YHM2	YMR241W	HSP12	P22943	109 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
YHM2	YMR241W	NTF2	P33331	125 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
YHM2	YMR241W	SDH4	P37298	181 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YHM2	YMR241W	CYB5	P40312	120 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YHM2	YMR241W	DAN1	P47178	298 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YHM2	YMR241W	YPS5	P53057	165 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YHM2	YMR241W	SDH7	Q04401	133 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YHM2	YMR241W	LOA1	Q06508	300 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YHM2	YMR241W	Q0297	Q9ZZV8	51 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YHM2	YMR241W	VMA11	P32842	164 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YHM2	YMR241W	RPS0A	P32905	252 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
YHM2	YMR241W	RRT1	P38192	103 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YHM2	YMR241W	CSH1	P38287	376 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YHM2	YMR241W	DOG2	P38773	246 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YHM2	YMR241W	DOG1	P38774	246 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YHM2	YMR241W	BDH1	P39714	382 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YHM2	YMR241W	DSK2	P48510	373 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YHM2	YMR241W	YGR026W	P53217	278 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YHM2	YMR241W	DAD3	P69850	94 aa		4.85	□□□□□ -1.63

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