RNA–Protein interactions for RNA: YKR059W

TIF1, Transcript of Translation initiation factor eIF4A, yeast

Gene TIF1, Length 1,188 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TIF1	YKR059W	JAC1	P53193	184 aa		4.77	□□□□□ -1.65
TIF1	YKR059W	ORM1	P53224	222 aa		4.77	□□□□□ -1.65
TIF1	YKR059W	DID2	P69771	204 aa		4.77	□□□□□ -1.65
TIF1	YKR059W	YMR099C	Q03161	297 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
TIF1	YKR059W	YML122C	Q03207	126 aa		4.77	□□□□□ -1.65
TIF1	YKR059W	NEJ1	Q06148	342 aa		4.77	□□□□□ -1.65
TIF1	YKR059W	ATG40	Q99325	256 aa		4.77	□□□□□ -1.65
TIF1	YKR059W	SEC4	P07560	215 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
TIF1	YKR059W	SEC22	P22214	214 aa		4.76	□□□□□ -1.65
TIF1	YKR059W	ARO7	P32178	256 aa		4.76	□□□□□ -1.65
TIF1	YKR059W	YBL081W	P38180	368 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
TIF1	YKR059W	DER1	P38307	211 aa		4.76	□□□□□ -1.65
TIF1	YKR059W	VPS55	P47111	140 aa		4.76	□□□□□ -1.65
TIF1	YKR059W	HSK3	P69852	69 aa		4.76	□□□□□ -1.65
TIF1	YKR059W	HOR7	Q05827	59 aa		4.76	□□□□□ -1.65
TIF1	YKR059W	PRM3	Q08931	133 aa		4.76	□□□□□ -1.65
TIF1	YKR059W	YOR283W	Q12040	230 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
TIF1	YKR059W	TIM22	Q12328	207 aa		4.76	□□□□□ -1.65
TIF1	YKR059W	ATO3	Q12359	275 aa		4.76	□□□□□ -1.65
TIF1	YKR059W	YPL229W	Q99395	206 aa		4.76	□□□□□ -1.65
TIF1	YKR059W	SEN2	P16658	377 aa		4.75	□□□□□ -1.65
TIF1	YKR059W	MAG1	P22134	296 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
TIF1	YKR059W	ERG24	P32462	438 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
TIF1	YKR059W	ACP1	P32463	125 aa		4.75	□□□□□ -1.65
TIF1	YKR059W	SRL3	P36167	246 aa		4.75	□□□□□ -1.65
TIF1	YKR059W	PAU24	P38155	120 aa		4.75	□□□□□ -1.65
TIF1	YKR059W	YER076C	P40049	302 aa		4.75	□□□□□ -1.65
TIF1	YKR059W	ADH3	P07246	375 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
TIF1	YKR059W	FCY2	P17064	533 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TIF1	YKR059W	PRE7	P23724	241 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
TIF1	YKR059W	AUA1	P32450	94 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TIF1	YKR059W	GNA1	P43577	159 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
TIF1	YKR059W	YNL184C	P53876	108 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TIF1	YKR059W	GRH1	Q04410	372 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
TIF1	YKR059W	DGK1	Q12382	290 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TIF1	YKR059W	PET20	Q99373	253 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TIF1	YKR059W	SFK1	P35735	353 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TIF1	YKR059W	POP7	P38291	140 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TIF1	YKR059W	ERG25	P53045	309 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TIF1	YKR059W	CAB4	P53332	305 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TIF1	YKR059W	YOL160W	Q08321	113 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TIF1	YKR059W	CDC7	P06243	507 aa		4.72	□□□□□ -1.65
TIF1	YKR059W	COX10	P21592	462 aa		4.72	□□□□□ -1.65
TIF1	YKR059W	AHC2	P25649	128 aa		4.72	□□□□□ -1.65
TIF1	YKR059W	PAU2	P32612	120 aa		4.72	□□□□□ -1.65
TIF1	YKR059W	UMP1	P38293	148 aa		4.72	□□□□□ -1.65
TIF1	YKR059W	YBR285W	P38354	144 aa		4.72	□□□□□ -1.65
TIF1	YKR059W	COS8	P38723	381 aa		4.72	□□□□□ -1.65
TIF1	YKR059W	YAR068W	P39564	161 aa		4.72	□□□□□ -1.65
TIF1	YKR059W	BDH1	P39714	382 aa		4.72	□□□□□ -1.65
TIF1	YKR059W	MRPL49	P40858	161 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
TIF1	YKR059W	YHP1	Q04116	353 aa		4.72	□□□□□ -1.65
TIF1	YKR059W	FCY1	Q12178	158 aa		4.72	□□□□□ -1.65
TIF1	YKR059W	IES3	Q12345	250 aa		4.72	□□□□□ -1.65
TIF1	YKR059W	YBL112C	Q3E7Y4	105 aa		4.72	□□□□□ -1.65
TIF1	YKR059W	TDA8	Q6B2U8	126 aa		4.72	□□□□□ -1.65
TIF1	YKR059W	YEL045C	P32616	141 aa		4.71	□□□□□ -1.66
TIF1	YKR059W	GLE2	P40066	365 aa		4.71	□□□□□ -1.66
TIF1	YKR059W	YPD1	Q07688	167 aa		4.71	□□□□□ -1.66
TIF1	YKR059W	REP2	P03872	296 aa		4.7	□□□□□ -1.66
TIF1	YKR059W	YPR170W-B	P0C5R9	85 aa		4.7	□□□□□ -1.66
TIF1	YKR059W	CUP2	P15315	225 aa		4.7	□□□□□ -1.66
TIF1	YKR059W	GRX2	P17695	143 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
TIF1	YKR059W	YKR041W	P36134	250 aa		4.7	□□□□□ -1.66
TIF1	YKR059W	MSA2	P36157	363 aa		4.7	□□□□□ -1.66
TIF1	YKR059W	YBR242W	P38331	238 aa		4.7	□□□□□ -1.66
TIF1	YKR059W	RPF1	P38805	295 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
TIF1	YKR059W	NVJ1	P38881	321 aa		4.7	□□□□□ -1.66
TIF1	YKR059W	DIE2	P50076	525 aa		4.7	□□□□□ -1.66
TIF1	YKR059W	AIM34	Q03673	198 aa		4.7	□□□□□ -1.66
TIF1	YKR059W	LPP1	Q04396	274 aa		4.7	□□□□□ -1.66
TIF1	YKR059W	UTP30	P36144	274 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
TIF1	YKR059W	RFC2	P40348	353 aa		4.69	□□□□□ -1.66
TIF1	YKR059W	YGR050C	P53231	118 aa		4.69	□□□□□ -1.66
TIF1	YKR059W	FIT1	Q04433	528 aa		4.69	□□□□□ -1.66
TIF1	YKR059W	YMR252C	Q04814	134 aa		4.69	□□□□□ -1.66
TIF1	YKR059W	SCW10	Q04951	389 aa		4.69	□□□□□ -1.66
TIF1	YKR059W	SHH4	Q06236	168 aa		4.69	□□□□□ -1.66
TIF1	YKR059W	RDI1	Q12434	202 aa		4.69	□□□□□ -1.66
TIF1	YKR059W	YOL085C	Q99345	113 aa		4.69	□□□□□ -1.66
TIF1	YKR059W	SNX4	P47057	423 aa		4.68	□□□□□ -1.66
TIF1	YKR059W	VMA10	P48836	114 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
TIF1	YKR059W	SOL1	P50278	321 aa		4.68	□□□□□ -1.66
TIF1	YKR059W	UBC12	P52491	188 aa		4.68	□□□□□ -1.66
TIF1	YKR059W	ALG9	P53868	555 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
TIF1	YKR059W	HAL1	Q01766	294 aa		4.68	□□□□□ -1.66
TIF1	YKR059W	SMD1	Q02260	146 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66
TIF1	YKR059W	YLR031W	Q07978	186 aa		4.68	□□□□□ -1.66
TIF1	YKR059W	PRR2	Q12310	699 aa		4.68	□□□□□ -1.66
TIF1	YKR059W	YPR014C	Q6B0W2	109 aa		4.68	□□□□□ -1.66
TIF1	YKR059W	MBF1	O14467	151 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
TIF1	YKR059W	HIS3	P06633	220 aa		4.67	□□□□□ -1.66
TIF1	YKR059W	HYM1	P32464	399 aa		4.67	□□□□□ -1.66
TIF1	YKR059W	YRA2	P36036	203 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.67	□□□□□ -1.66	not detected
TIF1	YKR059W	MPC2	P38857	129 aa		4.67	□□□□□ -1.66
TIF1	YKR059W	RBL2	P48606	106 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
TIF1	YKR059W	RPL9B	P51401	191 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
TIF1	YKR059W	GRX5	Q02784	150 aa		4.67	□□□□□ -1.66
TIF1	YKR059W	HNT1	Q04344	158 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
TIF1	YKR059W	YHR139C-A	O13536	103 aa		4.66	□□□□□ -1.66

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