RNA–Protein interactions for RNA: YGR008C

STF2, Transcript of Protein involved in resistance to desiccation stress, yeast

Gene STF2, Length 255 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
STF2	YGR008C	ATG17	Q06410	417 aa		0.28	□□□□□ -2.36
STF2	YGR008C	YGL041W-A	P0C5N3	154 aa		0.27	□□□□□ -2.37
STF2	YGR008C	HOM6	P31116	359 aa	Known RBP	0.27	□□□□□ -2.37
STF2	YGR008C	SCM4	P32564	187 aa		0.27	□□□□□ -2.37
STF2	YGR008C	FMT1	P32785	401 aa		0.27	□□□□□ -2.37
STF2	YGR008C	PAN3	P36102	679 aa	Predicted RBP	0.27	□□□□□ -2.37
STF2	YGR008C	SPI1	P40092	148 aa		0.27	□□□□□ -2.37
STF2	YGR008C	DCV1	P43595	202 aa		0.27	□□□□□ -2.37
STF2	YGR008C	YGL193C	P53097	103 aa		0.27	□□□□□ -2.37
STF2	YGR008C	EST3	Q03096	181 aa		0.27	□□□□□ -2.37
STF2	YGR008C	AIM34	Q03673	198 aa		0.27	□□□□□ -2.37
STF2	YGR008C	YMD8	Q03697	442 aa		0.27	□□□□□ -2.37
STF2	YGR008C	VTI1	Q04338	217 aa		0.27	□□□□□ -2.37
STF2	YGR008C	TIM22	Q12328	207 aa		0.27	□□□□□ -2.37
STF2	YGR008C	YLL053C	P0CD98	152 aa		0.26	□□□□□ -2.37
STF2	YGR008C	COX7	P10174	60 aa		0.26	□□□□□ -2.37
STF2	YGR008C	CCA1	P21269	546 aa		0.26	□□□□□ -2.37
STF2	YGR008C	YCR023C	P25351	611 aa		0.26	□□□□□ -2.37
STF2	YGR008C	VAM7	P32912	316 aa		0.26	□□□□□ -2.37
STF2	YGR008C	YHL005C	P38752	130 aa		0.26	□□□□□ -2.37
STF2	YGR008C	YAL064W	P39711	94 aa		0.26	□□□□□ -2.37
STF2	YGR008C	YRB2	P40517	327 aa		0.26	□□□□□ -2.37
STF2	YGR008C	DGA1	Q08650	418 aa		0.26	□□□□□ -2.37
STF2	YGR008C	NSL1	Q12143	216 aa		0.26	□□□□□ -2.37
STF2	YGR008C	PAA1	Q12447	191 aa	Known RBP	0.26	□□□□□ -2.37
STF2	YGR008C	YGR121W-A	Q3E816	71 aa		0.26	□□□□□ -2.37
STF2	YGR008C	THP2	O13539	261 aa	Known RBP	0.25	□□□□□ -2.37
STF2	YGR008C	ATP6	P00854	259 aa		0.25	□□□□□ -2.37
STF2	YGR008C	COX9	P07255	59 aa		0.25	□□□□□ -2.37
STF2	YGR008C	CPT1	P17898	393 aa		0.25	□□□□□ -2.37
STF2	YGR008C	MRP49	P32388	137 aa		0.25	□□□□□ -2.37
STF2	YGR008C	VMA8	P32610	256 aa	Known RBP	0.25	□□□□□ -2.37
STF2	YGR008C	MIX23	P38162	196 aa		0.25	□□□□□ -2.37
STF2	YGR008C	COS8	P38723	381 aa		0.25	□□□□□ -2.37
STF2	YGR008C	RPF1	P38805	295 aa	Known RBP	0.25	□□□□□ -2.37
STF2	YGR008C	THO1	P40040	218 aa	Known RBP	0.25	□□□□□ -2.37
STF2	YGR008C	YIL163C	P40448	117 aa		0.25	□□□□□ -2.37
STF2	YGR008C	KEG1	P43614	200 aa		0.25	□□□□□ -2.37
STF2	YGR008C	KNH1	P50112	268 aa		0.25	□□□□□ -2.37
STF2	YGR008C	HST4	P53688	370 aa		0.25	□□□□□ -2.37
STF2	YGR008C	YNL019C	P53975	284 aa		0.25	□□□□□ -2.37
STF2	YGR008C	VBA1	Q04301	562 aa		0.25	□□□□□ -2.37
STF2	YGR008C	YPT6	Q99260	215 aa		0.25	□□□□□ -2.37
STF2	YGR008C	DDI2	P0CH63	225 aa		0.24	□□□□□ -2.37
STF2	YGR008C	DDI3	P0CH64	225 aa		0.24	□□□□□ -2.37
STF2	YGR008C	SEC59	P20048	519 aa		0.24	□□□□□ -2.37
STF2	YGR008C	PET18	P25362	215 aa		0.24	□□□□□ -2.37
STF2	YGR008C	VMA5	P31412	392 aa	Known RBP	0.24	□□□□□ -2.37
STF2	YGR008C	PDX3	P38075	228 aa	Known RBP	0.24	□□□□□ -2.37
STF2	YGR008C	YHR173C	P38864	112 aa		0.24	□□□□□ -2.37
STF2	YGR008C	ARC15	P40518	154 aa	RIP-Chip data	0.24	□□□□□ -2.37	not detected
STF2	YGR008C	OTU1	P43558	301 aa		0.24	□□□□□ -2.37
STF2	YGR008C	YGL034C	P53186	121 aa		0.24	□□□□□ -2.37
STF2	YGR008C	VHT1	P53241	593 aa		0.24	□□□□□ -2.37
STF2	YGR008C	YIF1	P53845	314 aa	Known RBP	0.24	□□□□□ -2.37
STF2	YGR008C	PMP3	P87284	55 aa		0.24	□□□□□ -2.37
STF2	YGR008C	TLG1	Q03322	224 aa		0.24	□□□□□ -2.37
STF2	YGR008C	HUG1	Q6Q5K6	68 aa		0.24	□□□□□ -2.37
STF2	YGR008C	STF1	P01098	86 aa		0.23	□□□□□ -2.37
STF2	YGR008C	ADH3	P07246	375 aa	Known RBP	0.23	□□□□□ -2.37
STF2	YGR008C	CSM1	P25651	190 aa		0.23	□□□□□ -2.37
STF2	YGR008C	YBL010C	P32788	280 aa		0.23	□□□□□ -2.37
STF2	YGR008C	YBR016W	P38216	128 aa		0.23	□□□□□ -2.37
STF2	YGR008C	RRF1	P38771	230 aa		0.23	□□□□□ -2.37
STF2	YGR008C	LIN1	P38852	340 aa	Predicted RBP	0.23	□□□□□ -2.37
STF2	YGR008C	VTC1	P40046	129 aa	RIP-Chip data	0.23	□□□□□ -2.37	not detected
STF2	YGR008C	RPA34	P47006	233 aa	Predicted RBP	0.23	□□□□□ -2.37
STF2	YGR008C	OST3	P48439	350 aa		0.23	□□□□□ -2.37
STF2	YGR008C	LST7	P53237	242 aa		0.23	□□□□□ -2.37
STF2	YGR008C	ATG41	Q12048	136 aa		0.23	□□□□□ -2.37
STF2	YGR008C	RDI1	Q12434	202 aa		0.23	□□□□□ -2.37
STF2	YGR008C	YBR200W-A	Q3E755	54 aa		0.23	□□□□□ -2.37
STF2	YGR008C	YER039C-A	P0CD97	72 aa		0.22	□□□□□ -2.37
STF2	YGR008C	PTP2	P29461	750 aa		0.22	□□□□□ -2.37
STF2	YGR008C	LAS1	P36146	502 aa	Predicted RBP	0.22	□□□□□ -2.37
STF2	YGR008C	RTC3	P38804	111 aa	Predicted RBP	0.22	□□□□□ -2.37
STF2	YGR008C	CWP2	P43497	92 aa		0.22	□□□□□ -2.37
STF2	YGR008C	GPI15	P53961	229 aa		0.22	□□□□□ -2.37
STF2	YGR008C	RGM1	Q00453	211 aa		0.22	□□□□□ -2.37
STF2	YGR008C	HNT1	Q04344	158 aa	Known RBP	0.22	□□□□□ -2.37
STF2	YGR008C	ODC2	Q99297	307 aa		0.22	□□□□□ -2.37
STF2	YGR008C	COX10	P21592	462 aa		0.21	□□□□□ -2.38
STF2	YGR008C	TIR2	P33890	251 aa		0.21	□□□□□ -2.38
STF2	YGR008C	SHB17	P36136	271 aa	Known RBP	0.21	□□□□□ -2.38
STF2	YGR008C	SFT2	P38166	215 aa		0.21	□□□□□ -2.38
STF2	YGR008C	TEM1	P38987	245 aa		0.21	□□□□□ -2.38
STF2	YGR008C	SMX2	P40204	77 aa	Known RBP	0.21	□□□□□ -2.38
STF2	YGR008C	YFR045W	P43617	309 aa		0.21	□□□□□ -2.38
STF2	YGR008C	DYN2	Q02647	92 aa		0.21	□□□□□ -2.38
STF2	YGR008C	NAT3	Q06504	195 aa		0.21	□□□□□ -2.38
STF2	YGR008C	AIM45	Q12480	344 aa	Known RBP	0.21	□□□□□ -2.38
STF2	YGR008C	YMR175W-A	Q3E766	64 aa		0.21	□□□□□ -2.38
STF2	YGR008C	ERG24	P32462	438 aa	Known RBP	0.2	□□□□□ -2.38
STF2	YGR008C	RPN12	P32496	274 aa		0.2	□□□□□ -2.38
STF2	YGR008C	ZRT1	P32804	376 aa		0.2	□□□□□ -2.38
STF2	YGR008C	SDS22	P36047	338 aa		0.2	□□□□□ -2.38
STF2	YGR008C	YBR137W	P38276	179 aa		0.2	□□□□□ -2.38
STF2	YGR008C	RPL13B	P40212	199 aa	Known RBP	0.2	□□□□□ -2.38
STF2	YGR008C	YJR111C	P47148	283 aa	Known RBP	0.2	□□□□□ -2.38
STF2	YGR008C	BXI1	P48558	297 aa		0.2	□□□□□ -2.38

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