RNA–Protein interactions for RNA: YAL059W

ECM1, Transcript of Pre-ribosomal factor involved in 60S ribosomal protein subunit export, yeast

Gene ECM1, Length 639 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ECM1	YAL059W	BAT2	P47176	376 aa	Known RBP	3.67	□□□□□ -1.82
ECM1	YAL059W	GRX5	Q02784	150 aa		3.67	□□□□□ -1.82
ECM1	YAL059W	RPS19A	P07280	144 aa	Known RBP	3.66	□□□□□ -1.82
ECM1	YAL059W	RPS19B	P07281	144 aa	Predicted RBP	3.66	□□□□□ -1.82
ECM1	YAL059W	HAP3	P13434	144 aa		3.66	□□□□□ -1.82
ECM1	YAL059W	FLX1	P40464	311 aa		3.66	□□□□□ -1.82
ECM1	YAL059W	PAM16	P42949	149 aa		3.66	□□□□□ -1.82
ECM1	YAL059W	KEI1	Q06346	221 aa		3.66	□□□□□ -1.82
ECM1	YAL059W	ATG10	Q07879	167 aa		3.66	□□□□□ -1.82
ECM1	YAL059W	GEA2	P39993	1459 aa	Known RBP	3.66	□□□□□ -1.82
ECM1	YAL059W	YCR099C	P25657	155 aa		3.65	□□□□□ -1.83
ECM1	YAL059W	FZF1	P32805	299 aa		3.65	□□□□□ -1.83
ECM1	YAL059W	MID2	P36027	376 aa		3.65	□□□□□ -1.83
ECM1	YAL059W	TVP23	P38962	199 aa		3.65	□□□□□ -1.83
ECM1	YAL059W	SMD3	P43321	101 aa	Known RBP	3.65	□□□□□ -1.83
ECM1	YAL059W	YFR045W	P43617	309 aa		3.65	□□□□□ -1.83
ECM1	YAL059W	LSM8	P47093	109 aa	Known RBP	3.65	□□□□□ -1.83
ECM1	YAL059W	CSI2	Q08054	341 aa		3.65	□□□□□ -1.83
ECM1	YAL059W	YPR063C	Q12160	140 aa		3.65	□□□□□ -1.83
ECM1	YAL059W	PRE1	P22141	198 aa	Known RBP	3.64	□□□□□ -1.83
ECM1	YAL059W	YEL045C	P32616	141 aa		3.64	□□□□□ -1.83
ECM1	YAL059W	YET1	P35723	206 aa		3.64	□□□□□ -1.83
ECM1	YAL059W	YMR103C	Q04436	120 aa		3.64	□□□□□ -1.83
ECM1	YAL059W	IRC23	Q08416	157 aa		3.64	□□□□□ -1.83
ECM1	YAL059W	YOR268C	Q08734	132 aa		3.64	□□□□□ -1.83
ECM1	YAL059W	FEX1	Q08913	375 aa		3.64	□□□□□ -1.83
ECM1	YAL059W	FEX2	Q08991	375 aa		3.64	□□□□□ -1.83
ECM1	YAL059W	YCR075W-A	Q3E830	75 aa		3.64	□□□□□ -1.83
ECM1	YAL059W	SCS22	Q6Q595	175 aa		3.64	□□□□□ -1.83
ECM1	YAL059W	FAS1	P07149	2051 aa	Known RBP	3.63	□□□□□ -1.83
ECM1	YAL059W	YOL162W	P0CF19	215 aa		3.63	□□□□□ -1.83
ECM1	YAL059W	TMA19	P35691	167 aa	Known RBP	3.63	□□□□□ -1.83
ECM1	YAL059W	YAL064W	P39711	94 aa		3.63	□□□□□ -1.83
ECM1	YAL059W	DOC1	P53068	250 aa		3.63	□□□□□ -1.83
ECM1	YAL059W	YOR381W-A	Q3E804	55 aa		3.63	□□□□□ -1.83
ECM1	YAL059W	GEA1	P47102	1408 aa	Predicted RBP	3.62	□□□□□ -1.83
ECM1	YAL059W	PEX4	P29340	183 aa		3.62	□□□□□ -1.83
ECM1	YAL059W	CLB6	P32943	380 aa		3.62	□□□□□ -1.83
ECM1	YAL059W	SRL3	P36167	246 aa		3.62	□□□□□ -1.83
ECM1	YAL059W	ERV15	P38312	142 aa		3.62	□□□□□ -1.83
ECM1	YAL059W	ATP19	P81451	68 aa		3.62	□□□□□ -1.83
ECM1	YAL059W	YOR376W-A	Q3E805	51 aa		3.62	□□□□□ -1.83
ECM1	YAL059W	ADE6	P38972	1358 aa	Known RBP	3.62	□□□□□ -1.83
ECM1	YAL059W	YHR180W	P38868	163 aa		3.61	□□□□□ -1.83
ECM1	YAL059W	CCS1	P40202	249 aa	Known RBP	3.61	□□□□□ -1.83
ECM1	YAL059W	THG1	P53215	237 aa	Known RBP	3.61	□□□□□ -1.83
ECM1	YAL059W	YHP1	Q04116	353 aa		3.61	□□□□□ -1.83
ECM1	YAL059W	GTT2	Q12390	233 aa		3.61	□□□□□ -1.83
ECM1	YAL059W	RPL13A	Q12690	199 aa	Predicted RBP	3.61	□□□□□ -1.83
ECM1	YAL059W	MED11	Q99278	115 aa		3.61	□□□□□ -1.83
ECM1	YAL059W	YHL042W	P38729	150 aa		3.6	□□□□□ -1.83
ECM1	YAL059W	YFR035C	P43608	114 aa		3.6	□□□□□ -1.83
ECM1	YAL059W	SCP1	Q08873	200 aa		3.6	□□□□□ -1.83
ECM1	YAL059W	YOR385W	Q08909	290 aa		3.6	□□□□□ -1.83
ECM1	YAL059W	TY1B-BR	Q12193	1756 aa		3.6	□□□□□ -1.83
ECM1	YAL059W	RSF2	P46974	1380 aa		3.6	□□□□□ -1.83
ECM1	YAL059W	CAT8	P39113	1433 aa		3.6	□□□□□ -1.83
ECM1	YAL059W	COX5B	P00425	151 aa		3.59	□□□□□ -1.83
ECM1	YAL059W	RPL33B	P41056	107 aa	Known RBP	3.59	□□□□□ -1.83
ECM1	YAL059W	PIR1	Q03178	341 aa		3.59	□□□□□ -1.83
ECM1	YAL059W	MZM1	Q03429	123 aa	Predicted RBP	3.59	□□□□□ -1.83
ECM1	YAL059W	PIN3	Q06449	215 aa		3.59	□□□□□ -1.83
ECM1	YAL059W	RIF1	P29539	1916 aa		3.58	□□□□□ -1.84
ECM1	YAL059W	YFL012W	P43580	148 aa		3.58	□□□□□ -1.84
ECM1	YAL059W	YNR077C	P53758	84 aa		3.58	□□□□□ -1.84
ECM1	YAL059W	UPS3	Q04006	179 aa		3.58	□□□□□ -1.84
ECM1	YAL059W	YMR090W	Q04304	227 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
ECM1	YAL059W	FIT1	Q04433	528 aa		3.58	□□□□□ -1.84
ECM1	YAL059W	SOM1	Q05676	74 aa		3.58	□□□□□ -1.84
ECM1	YAL059W	YPR174C	Q06616	221 aa	Predicted RBP	3.58	□□□□□ -1.84
ECM1	YAL059W	RAF1	Q06891	181 aa		3.58	□□□□□ -1.84
ECM1	YAL059W	TMC1	Q08422	150 aa	Predicted RBP	3.58	□□□□□ -1.84
ECM1	YAL059W	YGL194C-A	Q2V2P6	80 aa		3.58	□□□□□ -1.84
ECM1	YAL059W	ATG40	Q99325	256 aa		3.58	□□□□□ -1.84
ECM1	YAL059W	LTE1	P07866	1435 aa		3.57	□□□□□ -1.84
ECM1	YAL059W	MYO1	P08964	1928 aa		3.57	□□□□□ -1.84
ECM1	YAL059W	RPS23A	P0CX29	145 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
ECM1	YAL059W	RPS23B	P0CX30	145 aa		3.57	□□□□□ -1.84
ECM1	YAL059W	QCR10	P37299	77 aa		3.57	□□□□□ -1.84
ECM1	YAL059W	SNU13	P39990	126 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
ECM1	YAL059W	PDR10	P51533	1564 aa		3.57	□□□□□ -1.84
ECM1	YAL059W	ERG25	P53045	309 aa		3.57	□□□□□ -1.84
ECM1	YAL059W	SCM4	P32564	187 aa		3.56	□□□□□ -1.84
ECM1	YAL059W	YHR130C	P38834	111 aa		3.56	□□□□□ -1.84
ECM1	YAL059W	YPR013C	Q12145	317 aa		3.56	□□□□□ -1.84
ECM1	YAL059W	YOR015W	Q12169	119 aa		3.56	□□□□□ -1.84
ECM1	YAL059W	TY3B-I	Q7LHG5	1498 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
ECM1	YAL059W	INO4	P13902	151 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ECM1	YAL059W	MIG1	P27705	504 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ECM1	YAL059W	ECM31	P38122	312 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ECM1	YAL059W	YEL067C	P39978	195 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ECM1	YAL059W	YIL059C	P40520	121 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ECM1	YAL059W	PIR5	P46999	287 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ECM1	YAL059W	KNH1	P50112	268 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ECM1	YAL059W	YML079W	Q03629	201 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ECM1	YAL059W	IRC19	Q07843	230 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ECM1	YAL059W	ATG41	Q12048	136 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ECM1	YAL059W	YLR236C	A0A023PZG4	107 aa		3.54	□□□□□ -1.84
ECM1	YAL059W	YDL241W	Q07738	123 aa		3.54	□□□□□ -1.84
ECM1	YAL059W	MRPL44	P19956	98 aa		3.53	□□□□□ -1.84

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