RNA–Protein interactions for RNA: Q0143

Q0143, Transcript of Dubious open reading frame, yeastyeast

Gene Q0143, Length 153 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
Q0143Q0143 YOR214CQ12282 236 aa-4.8□□□□□ -3.18
Q0143Q0143 LIP1Q03579 150 aa-4.81□□□□□ -3.18
Q0143Q0143 TRA1P38811 3744 aa-4.82□□□□□ -3.18
Q0143Q0143 CCW14O13547 238 aa-4.82□□□□□ -3.18
Q0143Q0143 YNL200CP40165 246 aaKnown RBP-4.82□□□□□ -3.18
Q0143Q0143 ICS3P47034 131 aa-4.82□□□□□ -3.18
Q0143Q0143 ERV25P54837 211 aaKnown RBP-4.82□□□□□ -3.18
Q0143Q0143 SYM1Q06563 197 aa-4.82□□□□□ -3.18
Q0143Q0143 ATG10Q07879 167 aa-4.83□□□□□ -3.18
Q0143Q0143 TRM3Q07527 1436 aa-4.83□□□□□ -3.18
Q0143Q0143 MATALPHA1P0CY06 175 aa-4.84□□□□□ -3.18
Q0143Q0143 HMLALPHA1P0CY07 175 aa-4.84□□□□□ -3.18
Q0143Q0143 MRS1P07266 363 aa-4.85□□□□□ -3.19
Q0143Q0143 YGL041W-AP0C5N3 154 aa-4.85□□□□□ -3.19
Q0143Q0143 AIM4P38305 123 aaPredicted RBP-4.85□□□□□ -3.19
Q0143Q0143 YOR385WQ08909 290 aa-4.85□□□□□ -3.19
Q0143Q0143 YPR014CQ6B0W2 109 aa-4.85□□□□□ -3.19
Q0143Q0143 CUP1-1P0CX80 61 aa-4.86□□□□□ -3.19
Q0143Q0143 CUP1-2P0CX81 61 aa-4.86□□□□□ -3.19
Q0143Q0143 VMA6P32366 345 aaKnown RBP-4.86□□□□□ -3.19
Q0143Q0143 YEL028WP39989 153 aa-4.86□□□□□ -3.19
Q0143Q0143 YNL019CP53975 284 aa-4.86□□□□□ -3.19
Q0143Q0143 LCL1Q02786 101 aa-4.86□□□□□ -3.19
Q0143Q0143 NHP6AP11632 93 aaKnown RBP-4.87□□□□□ -3.19
Q0143Q0143 PGA1P53896 198 aa-4.87□□□□□ -3.19
Q0143Q0143 YLR283WQ05867 314 aa-4.87□□□□□ -3.19
Q0143Q0143 YSF3P0C074 85 aaPredicted RBP-4.88□□□□□ -3.19
Q0143Q0143 YNL184CP53876 108 aa-4.88□□□□□ -3.19
Q0143Q0143 THP2O13539 261 aaKnown RBP-4.89□□□□□ -3.19
Q0143Q0143 NMT1P14743 455 aa-4.89□□□□□ -3.19
Q0143Q0143 MMS2P53152 137 aa-4.89□□□□□ -3.19
Q0143Q0143 YPR114WQ06107 315 aa-4.89□□□□□ -3.19
Q0143Q0143 YPR153WQ06537 140 aa-4.89□□□□□ -3.19
Q0143Q0143 RFU1Q08003 200 aa-4.89□□□□□ -3.19
Q0143Q0143 YGL101WP53144 215 aa-4.9□□□□□ -3.19
Q0143Q0143 COF1Q03048 143 aaKnown RBP-4.9□□□□□ -3.19
Q0143Q0143 SRL4Q03085 281 aa-4.9□□□□□ -3.19
Q0143Q0143 YHR213WP0CI67 198 aa-4.91□□□□□ -3.2
Q0143Q0143 THI74Q04083 370 aa-4.91□□□□□ -3.2
Q0143Q0143 FMC1P40491 155 aa-4.92□□□□□ -3.2
Q0143Q0143 TIM13P53299 105 aa-4.92□□□□□ -3.2
Q0143Q0143 YKL183C-AQ3E765 70 aa-4.92□□□□□ -3.2
Q0143Q0143 YBR121C-AP0C5L4 52 aa-4.93□□□□□ -3.2
Q0143Q0143 RCF2P53721 224 aa-4.93□□□□□ -3.2
Q0143Q0143 IRC19Q07843 230 aa-4.93□□□□□ -3.2
Q0143Q0143 FES1P38260 290 aa-4.94□□□□□ -3.2
Q0143Q0143 RTC3P38804 111 aaPredicted RBP-4.94□□□□□ -3.2
Q0143Q0143 MED11Q99278 115 aa-4.96□□□□□ -3.2
Q0143Q0143 APA2P22108 325 aa-4.97□□□□□ -3.21
Q0143Q0143 ANB1P19211 157 aa-4.98□□□□□ -3.21
Q0143Q0143 YBR016WP38216 128 aa-4.98□□□□□ -3.21
Q0143Q0143 TRS20P38334 175 aa-4.98□□□□□ -3.21
Q0143Q0143 YFR009W-AP0C5M9 85 aa-4.99□□□□□ -3.21
Q0143Q0143 RPL40AP0CH08 128 aaKnown RBP-4.99□□□□□ -3.21
Q0143Q0143 RPL40BP0CH09 128 aaKnown RBP-4.99□□□□□ -3.21
Q0143Q0143 UTP11P34247 250 aaPredicted RBP-4.99□□□□□ -3.21
Q0143Q0143 HUT1Q12520 339 aa-4.99□□□□□ -3.21
Q0143Q0143 SPA2P23201 1466 aaKnown RBP-5□□□□□ -3.21
Q0143Q0143 YNL194CP40169 301 aa-5□□□□□ -3.21
Q0143Q0143 MPD1Q12404 318 aaKnown RBP-5□□□□□ -3.21
Q0143Q0143 YNR064CP53750 290 aa-5.02□□□□□ -3.21
Q0143Q0143 AIM34Q03673 198 aa-5.02□□□□□ -3.21
Q0143Q0143 SRP102P36057 244 aaPredicted RBP-5.04□□□□□ -3.22
Q0143Q0143 PFY1P07274 126 aa-5.05□□□□□ -3.22
Q0143Q0143 IKI1P38874 309 aa-5.05□□□□□ -3.22
Q0143Q0143 YRB1P41920 201 aaKnown RBP-5.05□□□□□ -3.22
Q0143Q0143 GPI2P46961 280 aa-5.05□□□□□ -3.22
Q0143Q0143 TTI2P47168 421 aa-5.06□□□□□ -3.22
Q0143Q0143 PET117Q02771 107 aa-5.06□□□□□ -3.22
Q0143Q0143 CBT1P36038 271 aaPredicted RBP-5.07□□□□□ -3.22
Q0143Q0143 PLP1Q04004 230 aa-5.07□□□□□ -3.22
Q0143Q0143 NUF2P33895 451 aa-5.09□□□□□ -3.22
Q0143Q0143 VMA10P48836 114 aaKnown RBP-5.09□□□□□ -3.22
Q0143Q0143 RPO41P13433 1351 aaKnown RBP-5.1□□□□□ -3.23
Q0143Q0143 CWC23P52868 283 aaPredicted RBP-5.1□□□□□ -3.23
Q0143Q0143 YCR108CQ3E819 63 aa-5.1□□□□□ -3.23
Q0143Q0143 SRP21P32342 167 aa-5.12□□□□□ -3.23
Q0143Q0143 YGR240C-AQ3E786 66 aa-5.12□□□□□ -3.23
Q0143Q0143 VPS13Q07878 3144 aa-5.12□□□□□ -3.23
Q0143Q0143 HHO1P53551 258 aa-5.13□□□□□ -3.23
Q0143Q0143 YDR102CQ03864 110 aa-5.13□□□□□ -3.23
Q0143Q0143 OCA6Q12454 224 aa-5.13□□□□□ -3.23
Q0143Q0143 RAD9P14737 1309 aa-5.14□□□□□ -3.23
Q0143Q0143 MRS4P23500 304 aa-5.14□□□□□ -3.23
Q0143Q0143 YKL102CP34249 101 aa-5.14□□□□□ -3.23
Q0143Q0143 RAD17P48581 401 aa-5.14□□□□□ -3.23
Q0143Q0143 YOL024WQ08172 172 aa-5.14□□□□□ -3.23
Q0143Q0143 ATP14Q12349 124 aa-5.14□□□□□ -3.23
Q0143Q0143 SEC7P11075 2009 aaKnown RBP-5.16□□□□□ -3.23
Q0143Q0143 RIM15P43565 1770 aa-5.16□□□□□ -3.24
Q0143Q0143 RFA3P26755 122 aaKnown RBP-5.17□□□□□ -3.24
Q0143Q0143 YBL044WP38194 122 aa-5.17□□□□□ -3.24
Q0143Q0143 RUB1Q03919 77 aa-5.17□□□□□ -3.24
Q0143Q0143 SHH4Q06236 168 aa-5.17□□□□□ -3.24
Q0143Q0143 YDL085C-AQ3E7B7 68 aaKnown RBP-5.17□□□□□ -3.24
Q0143Q0143 URB1P34241 1764 aaKnown RBP-5.18□□□□□ -3.24
Q0143Q0143 PHS1P40857 217 aa-5.18□□□□□ -3.24
Q0143Q0143 NCB2Q92317 146 aa-5.18□□□□□ -3.24
Q0143Q0143 AHC2P25649 128 aa-5.19□□□□□ -3.24
Q0143Q0143 XPT1P47165 209 aa-5.19□□□□□ -3.24
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 35.4 ms