RNA–Protein interactions for RNA: YPR024W

YME1, Transcript of Catalytic subunit of the i-AAA protease complex, yeast

Gene YME1, Length 2,244 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YME1	YPR024W	ERP1	Q05359	219 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
YME1	YPR024W	FCF2	Q12035	217 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
YME1	YPR024W	NCE102	Q12207	173 aa	RIP-Chip data	4.81	□□□□□ -1.64	not detected
YME1	YPR024W	COX19	Q3E731	98 aa		4.81	□□□□□ -1.64
YME1	YPR024W	SCS22	Q6Q595	175 aa		4.81	□□□□□ -1.64
YME1	YPR024W	YDR157W	A0A023PZE8	133 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YME1	YPR024W	CPR1	P14832	162 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
YME1	YPR024W	LSB5	P25369	354 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YME1	YPR024W	LSM2	P38203	95 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
YME1	YPR024W	PAU15	P40585	124 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YME1	YPR024W	CTR3	Q06686	241 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YME1	YPR024W	YDL085C-A	Q3E7B7	68 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
YME1	YPR024W	YLL053C	P0CD98	152 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YME1	YPR024W	YMR31	P19955	123 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YME1	YPR024W	SUA7	P29055	345 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
YME1	YPR024W	SPS18	P32572	300 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YME1	YPR024W	YPT10	P38146	199 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YME1	YPR024W	FIG1	P38224	298 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YME1	YPR024W	SLM6	P38343	150 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YME1	YPR024W	YEA6	P39953	335 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YME1	YPR024W	NSA2	P40078	261 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
YME1	YPR024W	YFL051C	P43552	160 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YME1	YPR024W	HIT1	P46973	164 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YME1	YPR024W	WIP1	Q2V2P8	89 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YME1	YPR024W	CSF1	Q12150	2958 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YME1	YPR024W	SAL1	D6W196	494 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YME1	YPR024W	HAP3	P13434	144 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YME1	YPR024W	ERG2	P32352	222 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YME1	YPR024W	YEA4	P40004	342 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YME1	YPR024W	ERG25	P53045	309 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YME1	YPR024W	HSK3	P69852	69 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YME1	YPR024W	GAT3	Q07928	141 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YME1	YPR024W	YOR029W	Q12243	111 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YME1	YPR024W	YOP1	Q12402	180 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YME1	YPR024W	YPR170W-B	P0C5R9	85 aa		4.78	□□□□□ -1.64
YME1	YPR024W	ATP10	P18496	279 aa		4.78	□□□□□ -1.64
YME1	YPR024W	SOR1	P35497	357 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
YME1	YPR024W	GON7	P46984	123 aa		4.78	□□□□□ -1.64
YME1	YPR024W	YDL186W	P48568	277 aa		4.78	□□□□□ -1.64
YME1	YPR024W	APJ1	P53940	528 aa		4.78	□□□□□ -1.64
YME1	YPR024W	RIM9	Q04734	239 aa		4.78	□□□□□ -1.64
YME1	YPR024W	TDA6	Q06466	467 aa		4.78	□□□□□ -1.64
YME1	YPR024W	SOR2	Q07786	357 aa		4.78	□□□□□ -1.64
YME1	YPR024W	ERV2	Q12284	196 aa		4.78	□□□□□ -1.64
YME1	YPR024W	RNH203	Q12338	110 aa		4.78	□□□□□ -1.64
YME1	YPR024W	BOL1	Q3E793	110 aa		4.78	□□□□□ -1.64
YME1	YPR024W	ALK2	P32789	676 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
YME1	YPR024W	MNS1	P32906	549 aa		4.78	□□□□□ -1.64
YME1	YPR024W	YHR138C	P38841	114 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
YME1	YPR024W	SPC25	P40014	221 aa		4.78	□□□□□ -1.64
YME1	YPR024W	HUG1	Q6Q5K6	68 aa		4.78	□□□□□ -1.64
YME1	YPR024W	YBR292C	P38357	123 aa		4.77	□□□□□ -1.65
YME1	YPR024W	GEP7	P53171	287 aa		4.77	□□□□□ -1.65
YME1	YPR024W	MSO1	P53604	210 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
YME1	YPR024W	YMR090W	Q04304	227 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
YME1	YPR024W	NAT3	Q06504	195 aa		4.77	□□□□□ -1.65
YME1	YPR024W	SLO1	Q3E784	85 aa		4.77	□□□□□ -1.65
YME1	YPR024W	RPA43	P46669	326 aa		4.77	□□□□□ -1.65
YME1	YPR024W	TTI2	P47168	421 aa		4.77	□□□□□ -1.65
YME1	YPR024W	YPL080C	Q02826	108 aa		4.77	□□□□□ -1.65
YME1	YPR024W	YPL264C	Q08980	353 aa		4.77	□□□□□ -1.65
YME1	YPR024W	YOS1	Q3E834	85 aa		4.77	□□□□□ -1.65
YME1	YPR024W	POR1	P04840	283 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
YME1	YPR024W	CDC43	P18898	376 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YME1	YPR024W	ROX3	P25046	220 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YME1	YPR024W	MTR2	P34232	184 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
YME1	YPR024W	YPT31	P38555	223 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
YME1	YPR024W	UBC11	P52492	156 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YME1	YPR024W	SBH2	P52871	88 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YME1	YPR024W	SED1	Q01589	338 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YME1	YPR024W	IZH1	Q03419	316 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YME1	YPR024W	YMR082C	Q04276	118 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YME1	YPR024W	RAX2	Q12465	1220 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YME1	YPR024W	UTR5	P32630	166 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YME1	YPR024W	YKL075C	P36083	450 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YME1	YPR024W	HSP10	P38910	106 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YME1	YPR024W	TMA23	Q03525	211 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YME1	YPR024W	LPP1	Q04396	274 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YME1	YPR024W	PRR2	Q12310	699 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YME1	YPR024W	BLM10	P43583	2143 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YME1	YPR024W	YJL028W	P47062	111 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YME1	YPR024W	MGA1	P53050	456 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YME1	YPR024W	RPL21A	Q02753	160 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
YME1	YPR024W	TSA2	Q04120	196 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YME1	YPR024W	RPL21B	Q12672	160 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
YME1	YPR024W	YOR192C-C	Q3E736	78 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YME1	YPR024W	YPL229W	Q99395	206 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YME1	YPR024W	GPI18	P38211	433 aa		4.74	□□□□□ -1.65
YME1	YPR024W	YHL044W	P38727	235 aa		4.74	□□□□□ -1.65
YME1	YPR024W	RPF1	P38805	295 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
YME1	YPR024W	YER134C	P40081	178 aa		4.74	□□□□□ -1.65
YME1	YPR024W	MIC26	P50087	233 aa		4.74	□□□□□ -1.65
YME1	YPR024W	YTH1	Q06102	208 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
YME1	YPR024W	YDL157C	Q12082	118 aa		4.74	□□□□□ -1.65
YME1	YPR024W	RFM1	Q12192	310 aa		4.74	□□□□□ -1.65
YME1	YPR024W	TPT1	Q12272	230 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
YME1	YPR024W	YPS3	Q12303	508 aa		4.74	□□□□□ -1.65
YME1	YPR024W	YLR118C	Q12354	227 aa		4.74	□□□□□ -1.65
YME1	YPR024W	COA6	Q3E846	104 aa		4.74	□□□□□ -1.65
YME1	YPR024W	PRS4	P38063	326 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 24.2 ms