RNA–Protein interactions for RNA: YPL253C

VIK1, Transcript of Protein that forms a kinesin-14 heterodimeric motor with Kar3p, yeast

Gene VIK1, Length 1,944 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
VIK1	YPL253C	YEL028W	P39989	153 aa		0.12	□□□□□ -2.39
VIK1	YPL253C	RTC4	P53850	401 aa		0.12	□□□□□ -2.39
VIK1	YPL253C	YDL241W	Q07738	123 aa		0.12	□□□□□ -2.39
VIK1	YPL253C	YOR214C	Q12282	236 aa		0.12	□□□□□ -2.39
VIK1	YPL253C	YLR412C-A	Q3E742	68 aa		0.12	□□□□□ -2.39
VIK1	YPL253C	YDL085C-A	Q3E7B7	68 aa	Known RBP	0.12	□□□□□ -2.39
VIK1	YPL253C	YOR381W-A	Q3E804	55 aa		0.12	□□□□□ -2.39
VIK1	YPL253C	FAS2	P19097	1887 aa	Known RBP	0.11	□□□□□ -2.39
VIK1	YPL253C	UBC8	P28263	218 aa		0.11	□□□□□ -2.39
VIK1	YPL253C	ATP7	P30902	174 aa		0.11	□□□□□ -2.39
VIK1	YPL253C	MOT1	P32333	1867 aa		0.11	□□□□□ -2.39
VIK1	YPL253C	UGX2	P32772	223 aa		0.11	□□□□□ -2.39
VIK1	YPL253C	YBL010C	P32788	280 aa		0.11	□□□□□ -2.39
VIK1	YPL253C	SHG1	P38337	142 aa		0.11	□□□□□ -2.39
VIK1	YPL253C	POG1	P40473	351 aa		0.11	□□□□□ -2.39
VIK1	YPL253C	GLR1	P41921	483 aa	Known RBP	0.11	□□□□□ -2.39
VIK1	YPL253C	FMP32	P43557	207 aa		0.11	□□□□□ -2.39
VIK1	YPL253C	JAC1	P53193	184 aa		0.11	□□□□□ -2.39
VIK1	YPL253C	HSK3	P69852	69 aa		0.11	□□□□□ -2.39
VIK1	YPL253C	YKR005C	Q02203	525 aa		0.11	□□□□□ -2.39
VIK1	YPL253C	CCW12	Q12127	133 aa		0.11	□□□□□ -2.39
VIK1	YPL253C	CMC4	Q3E7A9	73 aa		0.11	□□□□□ -2.39
VIK1	YPL253C	YPR014C	Q6B0W2	109 aa		0.11	□□□□□ -2.39
VIK1	YPL253C	SNF2	P22082	1703 aa		0.11	□□□□□ -2.39
VIK1	YPL253C	MAK31	P23059	88 aa		0.11	□□□□□ -2.39
VIK1	YPL253C	TMA22	P47089	198 aa	Predicted RBP	0.11	□□□□□ -2.39
VIK1	YPL253C	HOP2	P53187	214 aa		0.11	□□□□□ -2.39
VIK1	YPL253C	VPS28	Q02767	242 aa		0.11	□□□□□ -2.39
VIK1	YPL253C	THI74	Q04083	370 aa		0.11	□□□□□ -2.39
VIK1	YPL253C	PEX11	Q12462	236 aa		0.11	□□□□□ -2.39
VIK1	YPL253C	YRF1-3	P0CX14	1859 aa		0.1	□□□□□ -2.39
VIK1	YPL253C	YRF1-7	P0CX15	1859 aa		0.1	□□□□□ -2.39
VIK1	YPL253C	YRF1-6	P53819	1859 aa		0.1	□□□□□ -2.39
VIK1	YPL253C	STT4	P37297	1900 aa		0.1	□□□□□ -2.39
VIK1	YPL253C	RAD6	P06104	172 aa		0.1	□□□□□ -2.39
VIK1	YPL253C	YOL013W-A	P0C272	63 aa	Predicted RBP	0.1	□□□□□ -2.39
VIK1	YPL253C	RPL35A	P0CX84	120 aa	Known RBP	0.1	□□□□□ -2.39
VIK1	YPL253C	RPL35B	P0CX85	120 aa	Known RBP	0.1	□□□□□ -2.39
VIK1	YPL253C	RME1	P32338	300 aa	Known RBP	0.1	□□□□□ -2.39
VIK1	YPL253C	HSP150	P32478	413 aa		0.1	□□□□□ -2.39
VIK1	YPL253C	YKR070W	P36151	352 aa	Known RBP	0.1	□□□□□ -2.39
VIK1	YPL253C	SRP14	P38985	146 aa		0.1	□□□□□ -2.39
VIK1	YPL253C	YAR064W	P39563	99 aa		0.1	□□□□□ -2.39
VIK1	YPL253C	SEC72	P39742	193 aa	Known RBP	0.1	□□□□□ -2.39
VIK1	YPL253C	YEL073C	P39974	107 aa		0.1	□□□□□ -2.39
VIK1	YPL253C	YER121W	P40076	114 aa		0.1	□□□□□ -2.39
VIK1	YPL253C	DCV1	P43595	202 aa		0.1	□□□□□ -2.39
VIK1	YPL253C	SBH2	P52871	88 aa		0.1	□□□□□ -2.39
VIK1	YPL253C	GIM3	P53900	129 aa		0.1	□□□□□ -2.39
VIK1	YPL253C	YNL140C	P53910	189 aa		0.1	□□□□□ -2.39
VIK1	YPL253C	HPT1	Q04178	221 aa	Known RBP	0.1	□□□□□ -2.39
VIK1	YPL253C	FCY1	Q12178	158 aa		0.1	□□□□□ -2.39
VIK1	YPL253C	YMR030W-A	Q3E760	96 aa		0.1	□□□□□ -2.39
VIK1	YPL253C	URB1	P34241	1764 aa	Known RBP	0.1	□□□□□ -2.39
VIK1	YPL253C	INO4	P13902	151 aa		0.09	□□□□□ -2.39
VIK1	YPL253C	MRS4	P23500	304 aa		0.09	□□□□□ -2.39
VIK1	YPL253C	YCR001W	P25347	104 aa		0.09	□□□□□ -2.39
VIK1	YPL253C	RAD51	P25454	400 aa		0.09	□□□□□ -2.39
VIK1	YPL253C	TRR1	P29509	319 aa	Known RBP	0.09	□□□□□ -2.39
VIK1	YPL253C	YRA2	P36036	203 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.09	□□□□□ -2.39	not detected
VIK1	YPL253C	YGR269W	P40326	108 aa		0.09	□□□□□ -2.39
VIK1	YPL253C	CCC1	P47818	322 aa		0.09	□□□□□ -2.39
VIK1	YPL253C	PAC10	P48363	199 aa		0.09	□□□□□ -2.39
VIK1	YPL253C	ORM1	P53224	222 aa		0.09	□□□□□ -2.39
VIK1	YPL253C	TIM13	P53299	105 aa		0.09	□□□□□ -2.39
VIK1	YPL253C	YDC1	Q02896	317 aa		0.09	□□□□□ -2.39
VIK1	YPL253C	SYM1	Q06563	197 aa		0.09	□□□□□ -2.39
VIK1	YPL253C	YET3	Q07451	203 aa		0.09	□□□□□ -2.39
VIK1	YPL253C	TRM3	Q07527	1436 aa		0.09	□□□□□ -2.4
VIK1	YPL253C	UBI4	P0CG63	381 aa	Known RBP	0.09	□□□□□ -2.4
VIK1	YPL253C	PTC1	P35182	281 aa		0.09	□□□□□ -2.4
VIK1	YPL253C	YBR027C	P38220	110 aa		0.09	□□□□□ -2.4
VIK1	YPL253C	TRS20	P38334	175 aa		0.09	□□□□□ -2.4
VIK1	YPL253C	YPT31	P38555	223 aa	Known RBP	0.09	□□□□□ -2.4
VIK1	YPL253C	YEL014C	P39999	101 aa		0.09	□□□□□ -2.4
VIK1	YPL253C	MOB1	P40484	314 aa		0.09	□□□□□ -2.4
VIK1	YPL253C	YGL230C	P53074	147 aa		0.09	□□□□□ -2.4
VIK1	YPL253C	YGL101W	P53144	215 aa		0.09	□□□□□ -2.4
VIK1	YPL253C	HHT1	P61830	136 aa		0.09	□□□□□ -2.4
VIK1	YPL253C	LIP1	Q03579	150 aa		0.09	□□□□□ -2.4
VIK1	YPL253C	YML079W	Q03629	201 aa		0.09	□□□□□ -2.4
VIK1	YPL253C	ATG38	Q05789	226 aa	Known RBP	0.09	□□□□□ -2.4
VIK1	YPL253C	YPR114W	Q06107	315 aa		0.09	□□□□□ -2.4
VIK1	YPL253C	KEI1	Q06346	221 aa		0.09	□□□□□ -2.4
VIK1	YPL253C	YPR202W	Q08993	238 aa		0.09	□□□□□ -2.4
VIK1	YPL253C	YDL157C	Q12082	118 aa		0.09	□□□□□ -2.4
VIK1	YPL253C	ECM29	P38737	1868 aa		0.08	□□□□□ -2.4
VIK1	YPL253C	FMP49	A0A023PZB3	126 aa		0.08	□□□□□ -2.4
VIK1	YPL253C	SPS2	P08459	502 aa		0.08	□□□□□ -2.4
VIK1	YPL253C	SPT14	P32363	452 aa		0.08	□□□□□ -2.4
VIK1	YPL253C	UBC6	P33296	250 aa	Predicted RBP	0.08	□□□□□ -2.4
VIK1	YPL253C	HTD2	P38790	280 aa	Known RBP	0.08	□□□□□ -2.4
VIK1	YPL253C	EGD2	P38879	174 aa	Known RBP	0.08	□□□□□ -2.4
VIK1	YPL253C	HHY1	P39982	102 aa		0.08	□□□□□ -2.4
VIK1	YPL253C	YIL102C	P40488	101 aa		0.08	□□□□□ -2.4
VIK1	YPL253C	YJR015W	P47090	510 aa		0.08	□□□□□ -2.4
VIK1	YPL253C	NQM1	P53228	333 aa	Predicted RBP	0.08	□□□□□ -2.4
VIK1	YPL253C	YDR102C	Q03864	110 aa		0.08	□□□□□ -2.4
VIK1	YPL253C	GIM5	Q04493	163 aa		0.08	□□□□□ -2.4
VIK1	YPL253C	ATG10	Q07879	167 aa		0.08	□□□□□ -2.4

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