RNA–Protein interactions for RNA: YOL003C

PFA4, Transcript of Palmitoyltransferase with autoacylation activity, yeastyeast

Gene PFA4, Length 1,137 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PFA4YOL003C YCT1Q12235 531 aa3.21□□□□□ -1.9
PFA4YOL003C YOR032W-AQ8TGS1 66 aa3.21□□□□□ -1.9
PFA4YOL003C FLO9P39712 1322 aa3.2□□□□□ -1.9
PFA4YOL003C CSF1Q12150 2958 aa3.2□□□□□ -1.9
PFA4YOL003C TDH1P00360 332 aaKnown RBP3.2□□□□□ -1.9
PFA4YOL003C CDC28P00546 298 aaKnown RBP3.2□□□□□ -1.9
PFA4YOL003C RPL25P04456 142 aaKnown RBP3.2□□□□□ -1.9
PFA4YOL003C MRS4P23500 304 aa3.2□□□□□ -1.9
PFA4YOL003C OCH1P31755 480 aa3.2□□□□□ -1.9
PFA4YOL003C ECM31P38122 312 aa3.2□□□□□ -1.9
PFA4YOL003C PRS3P38689 320 aaKnown RBP3.2□□□□□ -1.9
PFA4YOL003C YHL044WP38727 235 aa3.2□□□□□ -1.9
PFA4YOL003C RPL13BP40212 199 aaKnown RBP3.2□□□□□ -1.9
PFA4YOL003C YJL144WP47009 104 aa3.2□□□□□ -1.9
PFA4YOL003C YJR056CP47115 236 aa3.2□□□□□ -1.9
PFA4YOL003C SLX9P53251 210 aaPredicted RBP3.2□□□□□ -1.9
PFA4YOL003C HHT1P61830 136 aa3.2□□□□□ -1.9
PFA4YOL003C YOR186WQ08560 144 aa3.2□□□□□ -1.9
PFA4YOL003C GRE1Q08969 168 aa3.2□□□□□ -1.9
PFA4YOL003C USB1Q12208 290 aaKnown RBP3.2□□□□□ -1.9
PFA4YOL003C RPL13AQ12690 199 aaPredicted RBP3.2□□□□□ -1.9
PFA4YOL003C TOR2P32600 2474 aaKnown RBP3.19□□□□□ -1.9
PFA4YOL003C YCR025CP25352 136 aa3.19□□□□□ -1.9
PFA4YOL003C PEX4P29340 183 aa3.19□□□□□ -1.9
PFA4YOL003C ERG2P32352 222 aa3.19□□□□□ -1.9
PFA4YOL003C RPB7P34087 171 aa3.19□□□□□ -1.9
PFA4YOL003C YBR096WP38256 230 aa3.19□□□□□ -1.9
PFA4YOL003C ERV15P38312 142 aa3.19□□□□□ -1.9
PFA4YOL003C SHG1P38337 142 aa3.19□□□□□ -1.9
PFA4YOL003C IKI1P38874 309 aa3.19□□□□□ -1.9
PFA4YOL003C PGD1P40356 397 aa3.19□□□□□ -1.9
PFA4YOL003C POG1P40473 351 aa3.19□□□□□ -1.9
PFA4YOL003C NSE4P43124 402 aa3.19□□□□□ -1.9
PFA4YOL003C MRX5P47007 382 aa3.19□□□□□ -1.9
PFA4YOL003C MOG1P47123 218 aa3.19□□□□□ -1.9
PFA4YOL003C YGR026WP53217 278 aa3.19□□□□□ -1.9
PFA4YOL003C MRPS17Q03246 237 aaPredicted RBP3.19□□□□□ -1.9
PFA4YOL003C YDR209CQ03480 137 aa3.19□□□□□ -1.9
PFA4YOL003C DXO1Q06349 442 aa3.19□□□□□ -1.9
PFA4YOL003C SDO1Q07953 250 aaKnown RBP3.19□□□□□ -1.9
PFA4YOL003C ZEO1Q08245 113 aa3.19□□□□□ -1.9
PFA4YOL003C YOR015WQ12169 119 aa3.19□□□□□ -1.9
PFA4YOL003C YDL180WQ12301 547 aa3.19□□□□□ -1.9
PFA4YOL003C COX19Q3E731 98 aa3.19□□□□□ -1.9
PFA4YOL003C YLR365WQ7LIF2 110 aa3.19□□□□□ -1.9
PFA4YOL003C Q0144Q9ZZW2 109 aa3.19□□□□□ -1.9
PFA4YOL003C IPP1P00817 287 aaKnown RBP3.18□□□□□ -1.9
PFA4YOL003C YEA4P40004 342 aa3.18□□□□□ -1.9
PFA4YOL003C SPC25P40014 221 aa3.18□□□□□ -1.9
PFA4YOL003C FLX1P40464 311 aa3.18□□□□□ -1.9
PFA4YOL003C YJR012CP47087 207 aa3.18□□□□□ -1.9
PFA4YOL003C SOL1P50278 321 aa3.18□□□□□ -1.9
PFA4YOL003C HHO1P53551 258 aa3.18□□□□□ -1.9
PFA4YOL003C DIA1P54005 336 aa3.18□□□□□ -1.9
PFA4YOL003C YPL077CQ02831 240 aa3.18□□□□□ -1.9
PFA4YOL003C YMR279CQ03263 540 aa3.18□□□□□ -1.9
PFA4YOL003C YMR090WQ04304 227 aaKnown RBP3.18□□□□□ -1.9
PFA4YOL003C FIT1Q04433 528 aa3.18□□□□□ -1.9
PFA4YOL003C ECM18Q04623 453 aa3.18□□□□□ -1.9
PFA4YOL003C ARC18Q05933 178 aaKnown RBP3.18□□□□□ -1.9
PFA4YOL003C RFU1Q08003 200 aa3.18□□□□□ -1.9
PFA4YOL003C YPL278CQ08990 100 aa3.18□□□□□ -1.9
PFA4YOL003C SNU23Q12368 194 aaPredicted RBP3.18□□□□□ -1.9
PFA4YOL003C AGC1Q12482 902 aa3.18□□□□□ -1.9
PFA4YOL003C COA2Q3E823 68 aa3.18□□□□□ -1.9
PFA4YOL003C HUG1Q6Q5K6 68 aa3.18□□□□□ -1.9
PFA4YOL003C YCR101CP25607 182 aa3.17□□□□□ -1.9
PFA4YOL003C MRPL39P36533 70 aa3.17□□□□□ -1.9
PFA4YOL003C SDH4P37298 181 aa3.17□□□□□ -1.9
PFA4YOL003C ATG8P38182 117 aaRIP-Chip data3.17□□□□□ -1.9not detected
PFA4YOL003C SLM6P38343 150 aa3.17□□□□□ -1.9
PFA4YOL003C PRS2P38620 318 aaKnown RBP3.17□□□□□ -1.9
PFA4YOL003C GTT1P40582 234 aa3.17□□□□□ -1.9
PFA4YOL003C VMA21P41806 77 aa3.17□□□□□ -1.9
PFA4YOL003C TMA23Q03525 211 aa3.17□□□□□ -1.9
PFA4YOL003C YMR082CQ04276 118 aa3.17□□□□□ -1.9
PFA4YOL003C YMR253CQ04835 414 aa3.17□□□□□ -1.9
PFA4YOL003C YOL118CQ08259 102 aa3.17□□□□□ -1.9
PFA4YOL003C ATG5Q12380 294 aa3.17□□□□□ -1.9
PFA4YOL003C MPD1Q12404 318 aaKnown RBP3.17□□□□□ -1.9
PFA4YOL003C YPR145C-AQ2V2P0 78 aa3.17□□□□□ -1.9
PFA4YOL003C YOR192C-CQ3E736 78 aa3.17□□□□□ -1.9
PFA4YOL003C YPR108W-AQ3E7B3 70 aa3.17□□□□□ -1.9
PFA4YOL003C ATG40Q99325 256 aa3.17□□□□□ -1.9
PFA4YOL003C RPL35AP0CX84 120 aaKnown RBP3.16□□□□□ -1.9
PFA4YOL003C RPL35BP0CX85 120 aaKnown RBP3.16□□□□□ -1.9
PFA4YOL003C IMP1P28627 190 aa3.16□□□□□ -1.9
PFA4YOL003C YBR292CP38357 123 aa3.16□□□□□ -1.9
PFA4YOL003C PCL7P40186 285 aa3.16□□□□□ -1.9
PFA4YOL003C CCS1P40202 249 aaKnown RBP3.16□□□□□ -1.9
PFA4YOL003C RCE1Q03530 315 aa3.16□□□□□ -1.9
PFA4YOL003C RIM9Q04734 239 aa3.16□□□□□ -1.9
PFA4YOL003C YPD1Q07688 167 aa3.16□□□□□ -1.9
PFA4YOL003C PAM18Q07914 168 aa3.16□□□□□ -1.9
PFA4YOL003C IRA2P19158 3079 aa3.16□□□□□ -1.9
PFA4YOL003C ADH3P07246 375 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.91
PFA4YOL003C RPB3P16370 318 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.91
PFA4YOL003C APA2P22108 325 aa3.15□□□□□ -1.91
PFA4YOL003C SPO13P23624 291 aa3.15□□□□□ -1.91
PFA4YOL003C ALK2P32789 676 aaPredicted RBP3.15□□□□□ -1.91
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